SAXSdb — 5e2q

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dipeptidyl peptidase 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–726	突变：C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S	angiotensin-II × 1 （P01019） MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 M sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344 M potassium phosphate dibasic monohydrate	分辨率 2.40 Å R-free 0.247

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5E2Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3FVY Crystal structure of human Dipeptidyl Peptidase III 提交 2009-01-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–726（726 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；20% PEG3350. 0.2M MgForm, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 1.90 Å R-free 0.219
3T6B Structure of human DPPIII in complex with the opioid peptide Tynorphin, at 2.4 Angstroms 提交 2011-07-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–726（726 aa）	突变：E451A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic, pH 8.2, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.258
3T6B Structure of human DPPIII in complex with the opioid peptide Tynorphin, at 2.4 Angstroms 提交 2011-07-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–726（726 aa）	突变：E451A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic, pH 8.2, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.258
3T6J Structure of human DPPIII in complex with the opioid peptide Tynorphin, at 3.0 Angstroms 提交 2011-07-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–726（726 aa）	突变：E451A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic, pH 8.2, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 2.98 Å R-free 0.268
5E33 Structure of human DPP3 in complex with met-enkephalin 提交 2015-10-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–726（726 aa）	突变：C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phospahte dibasic, pH- 8.2	分辨率 1.84 Å R-free 0.224
5E3A Structure of human DPP3 in complex with opioid peptide leu-enkephalin 提交 2015-10-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–726（726 aa）	突变：C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056M SODIUM PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 1.344M POTASSIUM PHOSPHATE DIBASIC	分辨率 2.05 Å R-free 0.260
5E3C Structure of human DPP3 in complex with hemorphin like opioid peptide IVYPW 提交 2015-10-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–726（726 aa）	突变：C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic	分辨率 2.77 Å R-free 0.253
5EGY Structure of ligand free human DPP3 in closed form. 提交 2015-10-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–726（726 aa）	突变：C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344M Potassium phosphate dibasic, pH- 8.2, 293K	分辨率 2.74 Å R-free 0.254
5EHH Structure of human DPP3 in complex with endomorphin-2. 提交 2015-10-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–726（726 aa）片段：UNP residues 1-726	突变：C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293.15 K；0.056 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344 M Potassium phosphate dibasic, pH-8.2.	分辨率 2.38 Å R-free 0.237
7OUP Structure of human DPP3 in complex with a hydroxyethylene transition state peptidomimetic 提交 2021-06-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–737（737 aa）	突变：E451A	ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 M sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344 M potassium phosphate dibasic monohydrate	分辨率 2.65 Å R-free 0.253

共 9 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DPP3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–726； UniProt 1–726

angiotensin-II

物种未注明

UniProt P01019

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 34–41	片段：UNP residues 34-41	Dipeptidyl peptidase 3 × 1 （Q9NY33） MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 M sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.344 M potassium phosphate dibasic monohydrate	分辨率 2.40 Å R-free 0.247

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5E2Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1N9U Differences and Similarities in Solution Structures of Angiotensin I & II: Implication for Structure-Function Relationship 提交 2002-11-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 34–43（10 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 298 K；压力 ambient NMR样品组成 2.5 mM; DMSO-d6 \| DMSO-d6	分辨率未提供
1N9V Differences and Similarities in Solution Structures of Angiotensin I & II: Implication for Structure-Function Relationship. 提交 2002-11-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 34–41（8 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 298 K；压力 ambient NMR样品组成 2.5 mM; DMSO-d6 \| DMSO-d6	分辨率未提供
2JP8 Angiotensin 1-7 提交 2007-04-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 P 34–40（7 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 2.9；278 K；离子强度（mmCIF原始值）12；压力 ambient NMR样品组成 12.0 mM angiotensin, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2WXW Crystal structure of human angiotensinogen 提交 2009-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 34–485（452 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；2-2.5N NACL, 0.2M CACL2, 0.1M TRIS-HCL, PH8	分辨率 3.30 Å R-free 0.318
2X0B Crystal structure of human angiotensinogen complexed with renin 提交 2009-12-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 34–485（452 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；1.6-2.2M AS, 0.1M MES, PH6	分辨率 4.33 Å R-free 0.334
2X0B Crystal structure of human angiotensinogen complexed with renin 提交 2009-12-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 34–485（452 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；1.6-2.2M AS, 0.1M MES, PH6	分辨率 4.33 Å R-free 0.334
2X0B Crystal structure of human angiotensinogen complexed with renin 提交 2009-12-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 34–485（452 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；1.6-2.2M AS, 0.1M MES, PH6	分辨率 4.33 Å R-free 0.334
2X0B Crystal structure of human angiotensinogen complexed with renin 提交 2009-12-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 34–485（452 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；1.6-2.2M AS, 0.1M MES, PH6	分辨率 4.33 Å R-free 0.334
4AA1 Crystal structure of ANCE in complex with Angiotensin-II 提交 2011-11-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 34–41（8 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M HEPES 7.5, 1.3 M SODIUM CITRATE	分辨率 1.99 Å R-free 0.211
4APH Human angiotensin-converting enzyme in complex with angiotensin-II 提交 2012-04-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 34–41（8 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ACT ACETATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.7；50MM SODIUM ACETATE PH 4.7, 16% PEG4000, 10UM ZNSO4	分辨率 1.99 Å R-free 0.240
4FYS Human aminopeptidase N (CD13) in complex with angiotensin IV 提交 2012-07-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 36–41（6 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion；pH 5；295 K；2M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, 10% glycerol, pH 5.0, hanging drop vapor diffusion, temperature 295K	分辨率 2.01 Å R-free 0.198
5M3X Crystal structure of human angiotensin I-deleted angiotensinogen 提交 2016-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 44–485（442 aa）	突变：N137Q, N271Q, N295Q, C232S, C308S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.7M Ammonium Sulfate, 0.1M Citric Acid, pH3.6	分辨率 2.63 Å R-free 0.282
5M3X Crystal structure of human angiotensin I-deleted angiotensinogen 提交 2016-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 44–485（442 aa）	突变：N137Q, N271Q, N295Q, C232S, C308S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1.7M Ammonium Sulfate, 0.1M Citric Acid, pH3.6	分辨率 2.63 Å R-free 0.282
5M3Y Crystal structure of human glycosylated angiotensinogen 提交 2016-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 34–485（452 aa）	突变：N137Q, N271Q, N295Q, C232S, C308S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；2.0M Ammonium Sulfate, 0.1M Bicine, pH9.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.189
6I3F Crystal structure of the complex of human angiotensinogen and renin at 2.55 Angstrom 提交 2018-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 34–485（452 aa）	突变：N137Q, N271Q, N295Q,C232S,C308S	SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；1.76M Ammonium sulfate 0.1M Tris, pH7.6	分辨率 2.55 Å R-free 0.234
6I3I Crystal structure of reactive center loop (RCL) cleaved angiotensinogen 提交 2018-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 34–485（452 aa）	突变：N137Q,N271Q,N295Q,C232S,C308S	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.5M ammonium sulfate, 0.1M Tris pH8.5 12% glycerol	分辨率 2.97 Å R-free 0.237
6OS0 Structure of synthetic nanobody-stabilized angiotensin II type 1 receptor bound to angiotensin II 提交 2019-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 34–41（8 aa）片段：residues 34-41	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.6；293 K；Protein complex was reconstituted with a 10:1 (w/w) mixture of monoolein and cholesterol. Crystals were grown in 100 mM Tris pH 7.6, 10 mM MgCl2, 25-26% PEG 300	分辨率 2.90 Å R-free 0.318

共 13 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANGT_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–8； UniProt 34–41

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5e2q
沉积日期 deposition_date	2015-10-01
结构标题 title	Structure of human DPP3 in complex with angiotensin-II
关键词 keywords	Complex, Peptidase, Zinc-hydrolase, hydrolase; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.46 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.16 Å
零角强度 I(0) i0	107113000.00
分子量 molecular_weight	82416.0 kDa
排除体积 excluded_volume	103460 Å³
包络体积 envelope_volume	119340 Å³
水化壳体积 shell_volume	37606 Å³
包络直径 envelope_diameter	85.0 Å
壳层 Rg shell_rg	34.10 Å
包络 Rg envelope_rg	25.30 Å
形状 Rg shape_rg	25.14 Å
总 Rg total_rg	26.13 Å
总原子数 total_atoms	5827
残基数 n_residues	733
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	80.8 Å
Rg (实空间) rg_real	26.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.40 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0710e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.4200e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.33 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	107100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8982
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	35.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.126
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.472
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	47470000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.913; Stabil: 0.997; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.965

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Dipeptidyl peptidase 3
分子量 formula_weight	81548.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.14.4
突变 mutation	C19S, E207C, E451A, S491C, C519S, C654S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6000

MADTQYILPNDIGVSSLDSREAFRLLSPTERLYAYHLSRAAWYGGLAVLLQTSPEAPYIYALLSRLFRAQDPDQLRQHALAEGLTEEEYQAFLVYAAGVYSNMGNYKSFGDTKFVPNLPKEKLERVILGSEAAQQHPEEVRGLWQTCGELMFSLEPRLRHLGLGKEGITTYFSGNCTMEDAKLAQDFLDSQNLSAYNTRLFKEVDGCGKPYYEVRLASVLGSEPSLDSEVTSKLKSYEFRGSPFQVTRGDYAPILQKVVEQLEKAKAYAANSHQGQMLAQYIESFTQGSIEAHKRGSRFWIQDKGPIVESYIGFIESYRDPFGSRGEFEGFVAVVNKAMSAKFERLVASAEQLLKELPWPPTFEKDKFLTPDFTSLDVLTFAGSGIPAGINIPNYDDLRQTEGFKNVSLGNVLAVAYATQREKLTFLEEDDKDLYILWKGPSFDVQVGLHALLGHGSGKLFVQDEKGAFNFDQETVINPETGEQIQSWYRCGETWDSKFSTIASSYEECRAESVGLYLSLHPQVLEIFGFEGADAEDVIYVNWLNMVRAGLLALEFYTPEAFNWRQAHMQARFVILRVLLEAGEGLVTITPTTGSDGRPDARVRLDRSKIRSVGKPALERFLRRLQVLKSTGDVAGGRALYEGYATVTDAPPESFLTLRDTVLLRKESRKLIVQPNTRLEGSDVQLLEYEASAAGLIRSFSERFPEDGPELEEILTQLATADARFW

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	angiotensin-II
分子量 formula_weight	1048.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

DRVYIHPF

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	165

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5e2qA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	540 — Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	5e2qA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2600 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	119.131 Å
晶胞边长 b length_b	105.922 Å
晶胞边长 c length_c	64.846 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.91 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.404 Å
最低分辨率 resolution_low	45.330 Å
R 因子 r_factor	0.2083
R_work r_work	0.2062
R_free r_free	0.2473

fit	/app/data/saxs_computation/e2/5e2q/5e2q.fit
pddf	/app/data/pr_computation/e2/5e2q/5e2q.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/e2/5e2q/5e2q.dat

Structure of human DPP3 in complex with angiotensin-II

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dipeptidyl peptidase 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

angiotensin-II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)