Transthyretin
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 26–147 链 B； UniProt 26–147 链 C； UniProt 26–147 链 D； UniProt 26–147 | 未记录 | IPJ 4-hydroxy-chalcone × 3 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Protein: 5mg/ML in 0.05 M NaCl, 0.025 M Na acetate, pH 5.5 and 0.001 M 4-hydroxychalcone Reservoir: 30% PEG4K, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5 4 boosts (5 M NaCl) Cryoprotectant: CryoSol SM1, 25% PEG 4K, 0.1 M (Na acetate, ADA, Bicine) Buffer 20% acid / 80% basic 0.01 M ligand. | 分辨率 2.50 Å R-free 0.245 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 | 链 E； UniProt 26–147 链 F； UniProt 26–147 链 G； UniProt 26–147 链 H； UniProt 26–147 | 未记录 | IPJ 4-hydroxy-chalcone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Protein: 5mg/ML in 0.05 M NaCl, 0.025 M Na acetate, pH 5.5 and 0.001 M 4-hydroxychalcone Reservoir: 30% PEG4K, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5 4 boosts (5 M NaCl) Cryoprotectant: CryoSol SM1, 25% PEG 4K, 0.1 M (Na acetate, ADA, Bicine) Buffer 20% acid / 80% basic 0.01 M ligand. | 分辨率 2.50 Å R-free 0.245 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 5EZP | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BM7 HUMAN TRANSTHYRETIN (PREALBUMIN) COMPLEX WITH FLUFENAMIC ACID (2-[[3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO] BENZOIC ACID) 提交 1998-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | FLF 2-[[3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO] BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4；pH 7.4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1BMZ HUMAN TRANSTHYRETIN (PREALBUMIN) 提交 1998-07-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–143（114 aa）
链 B
30–143（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4；pH 7.4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 1BMZ HUMAN TRANSTHYRETIN (PREALBUMIN) 提交 1998-07-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–143（114 aa）
链 B
30–143（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.4；pH 7.4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 1BZ8 TRANSTHYRETIN (DEL VAL122) 提交 1998-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：TRINUCLEOTIDE DELETION VARIANT DELVAL122 突变：TRINUCLEOTIDE DELETION VARIANT DELVAL122 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.277 |
| 1BZD TERTIARY STRUCTURES OF THREE AMYLOIDOGENIC TRANSTHYRETIN VARIANTS AND IMPLICATIONS FOR AMYLOID FIBRIL FORMATION 提交 1998-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：G6S 突变：G6S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；PURIFIED PROTEIN (20MG/ML IN 25MM MONOBASIC SODIUM PHOSPHATE BUFFER, 0.15M NACL) WAS CRYSTALLIZED FROM 2M AMMONIUM SULFATE, 100MM CITRATE BUFFER, PH 5.5 AT ROOM TEMPERATURE.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.265 |
| 1BZE TERTIARY STRUCTURES OF THREE AMYLOIDOGENIC TRANSTHYRETIN VARIANTS AND IMPLICATIONS FOR AMYLOID FIBRIL FORMATION 提交 1998-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：M119T 突变：M119T | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；PURIFIED PROTEIN (10MG/ML IN TRIS BUFFER, PH 7.5) WAS CRYSTALLIZED FROM 2M AMMONIUM SULFATE, 100MM CITRATE BUFFER, PH 5.5 AT ROOM TEMPERATURE.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.273 |
| 1DVQ CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN 提交 2000-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；potassium chloride, potassium phosphate, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 1DVS CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH RESVERATROL 提交 2000-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | STL RESVERATROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；potassium chloride, potassium phosphate, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 1DVT CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH FLURBIPROFEN 提交 2000-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | FLP FLURBIPROFEN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；potassium chloride, potassium phosphate, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 1DVU CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH DIBENZOFURAN-4,6-DICARBOXYLIC ACID 提交 2000-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | DBF DIBENZOFURAN-4,6-DICARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；potassium chloride, potassium phosphate, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 1DVX CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH DICLOFENAC 提交 2000-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；potassium chloride
potassium phosphate
ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.215 |
| 1DVY CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH N-(M-TRIFLUOROMETHYLPHENYL) PHENOXAZINE-4,6-DICARBOXYLIC ACID 提交 2000-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | BPD N-(M-TRIFLUOROMETHYLPHENYL) PHENOXAZINE-4,6-DICARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；potassium chloride, potassium phosphate, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.203 |
| 1DVZ CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH O-TRIFLUOROMETHYLPHENYL ANTHRANILIC ACID 提交 2000-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–124（124 aa）
链 B
1–124（124 aa）
|
未记录 | OFL O-TRIFLUOROMETHYLPHENYL ANTHRANILIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；potassium chloride,
potassium phosphate,
ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.200 |
| 1E3F Structure of human transthyretin complexed with bromophenols: a new mode of binding 提交 2000-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–145（125 aa）
链 B
21–145（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 1E4H Structure of human transthyretin complexed with bromophenols: a new mode of binding 提交 2000-07-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 PBR PENTABROMOPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.235 |
| 1E5A Structure of human transthyretin complexed with bromophenols: a new mode of binding 提交 2000-07-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | TBP 2,4,6-TRIBROMOPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.50
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.262 |
| 1ETA THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL 30-->MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 1
21–147（127 aa）
链 2
21–147（127 aa）
|
未记录 | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1ETA THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL 30-->MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 1
21–147（127 aa）
链 2
21–147（127 aa）
|
未记录 | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1ETB THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL 30-->MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 1
21–147（127 aa）
链 2
21–147（127 aa）
|
未记录 | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1ETB THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL 30-->MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 1
21–147（127 aa）
链 2
21–147（127 aa）
|
未记录 | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1F41 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TRANSTHYRETIN AT 1.5A RESOLUTION 提交 2000-06-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；40% PEG 550MME, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.216 |
| 1F86 TRANSTHYRETIN THR119MET PROTEIN STABILISATION 提交 2000-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：THR119MET 突变：THR119MET | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；277 K；sodium citrate, 1,2,3 heptanetriol, ammonium sulphate, glycerol, methanol, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.177 |
| 1F86 TRANSTHYRETIN THR119MET PROTEIN STABILISATION 提交 2000-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：THR119MET 突变：THR119MET | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；277 K；sodium citrate, 1,2,3 heptanetriol, ammonium sulphate, glycerol, methanol, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.177 |
| 1FH2 TRANSTHYRETIN STABILITY AS A KEY FACTOR IN AMYLOIDOGENESIS 提交 2000-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30M/T119M 突变：V30M/T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；287 K；Ammonium Sulphate, Citrate Buffer, Glycerol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 1FHN TRANSTHYRETIN STABILITY AS A KEY FACTOR IN AMYLOIDOGENESIS 提交 2000-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：T119M 突变：T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.9；287 K；Ammonium Sulphate, Citrate Buffer, Glycerol, pH 4.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.180 |
| 1G1O CRYSTAL STRUCTURE OF THE HIGHLY AMYLOIDOGENIC TRANSTHYRETIN MUTANT TTR G53S/E54D/L55S 提交 2000-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：G53S,E54D,L55S 突变：G53S,E54D,L55S 突变：G53S,E54D,L55S 突变：G53S,E54D,L55S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 5000 MME, sodium citrate, ammonium sulphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.290 |
| 1GKO An Engineered Transthyretin Monomer that is Non-amyloidogenic - Unless Partially Denatured 提交 2001-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8.8；0.2 M MGCL2, 0.1 M TRIS BUFFER, PH 8.5, 30% W/V POLYETHYLENE GLYCOL 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.269 |
| 1ICT MONOCLINIC FORM OF HUMAN TRANSTHYRETIN COMPLEXED WITH THYROXINE (T4) 提交 2001-04-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
HANGMAN HANGING DROP CRYSTALLIZATION METHOD；pH 4.9；293 K；55% AMMONIUM SULFATE; 0.1 M PHOSPHATE BUFFER, pH 4.9, HANGMAN HANGING DROP CRYSTALLIZATION METHOD, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.289 |
| 1ICT MONOCLINIC FORM OF HUMAN TRANSTHYRETIN COMPLEXED WITH THYROXINE (T4) 提交 2001-04-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
HANGMAN HANGING DROP CRYSTALLIZATION METHOD；pH 4.9；293 K；55% AMMONIUM SULFATE; 0.1 M PHOSPHATE BUFFER, pH 4.9, HANGMAN HANGING DROP CRYSTALLIZATION METHOD, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.289 |
| 1III CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSTHYRETIN MUTANT TTR Y114C-DATA COLLECTED AT ROOM TEMPERATURE 提交 2001-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
链 B
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
|
突变：Y114C 突变：Y114C | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；2M ammonium sulphate, 0.1M sodium citrate, 2% PEG 200, 1% BME, pH 5.0,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K, temperature 298.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 1IIK CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRANSTHYRETIN MUTANT TTR Y114C-DATA COLLECTED AT CRYO TEMPERATURE 提交 2001-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
链 B
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
|
突变：Y114C 突变：Y114C | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；40% PEG 550 monomethyl ether, 0.1M sodium citrate, 0.1M ammonium sulphate, 0.1% BME,
pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K, temperature 298.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.239 |
| 1IJN Crystal structure of the transthyretin mutant TTR C10A/Y114C 提交 2001-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
链 B
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
|
突变：C10A/Y114C 突变：C10A/Y114C | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；40% PEG 550 monomethyl ether, 0.1M sodium citrate, 0.1M ammonium sulphate, 0.1% BME,
pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.237 |
| 1IJN Crystal structure of the transthyretin mutant TTR C10A/Y114C 提交 2001-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
链 B
21–147（127 aa）
片段：TRANSTHYRETIN
|
突变：C10A/Y114C 突变：C10A/Y114C | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；40% PEG 550 monomethyl ether, 0.1M sodium citrate, 0.1M ammonium sulphate, 0.1% BME,
pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.237 |
| 1QAB The structure of human retinol binding protein with its carrier protein transthyretin reveals interaction with the carboxy terminus of RBP 提交 1999-02-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | RTL RETINOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.403 |
| 1QWH a covalent dimer of transthyretin that affects the amyloid pathway 提交 2003-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–147（117 aa）
链 B
31–147（117 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；PEG 4000, 0.2 M Magnesium Nitrate , pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.222 |
| 1RLB RETINOL BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH TRANSTHYRETIN 提交 1995-02-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–127（127 aa）
链 B
1–127（127 aa）
链 C
1–127（127 aa）
链 D
1–127（127 aa）
|
未记录 | REA RETINOIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.10 Å |
| 1SOK Crystal structure of the transthyretin mutant A108Y/L110E solved in space group p21212 提交 2004-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A108Y, L110E 突变：A108Y, L110E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；291 K；Tris, peg550mme, ammonium sulfate, sodium citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.00
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.242 |
| 1SOQ Crystal structure of the transthyretin mutant A108Y/L110E solved in space group C2 提交 2004-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A108Y, L110E 突变：A108Y, L110E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；291 K；Tris, PEG550MME, ammonium sulfate, sodium citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.00
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 1SOQ Crystal structure of the transthyretin mutant A108Y/L110E solved in space group C2 提交 2004-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：A108Y, L110E 突变：A108Y, L110E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；291 K；Tris, PEG550MME, ammonium sulfate, sodium citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.00
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 1SOQ Crystal structure of the transthyretin mutant A108Y/L110E solved in space group C2 提交 2004-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：A108Y, L110E 突变：A108Y, L110E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；291 K；Tris, PEG550MME, ammonium sulfate, sodium citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.00
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.246 |
| 1THA MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION. STRUCTURAL ASPECTS OF 3,3'-DIIODO-L-THYRONINE BINDING TO HUMAN SERUM TRANSTHYRETIN 提交 1991-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–127（127 aa）
链 B
1–127（127 aa）
|
未记录 | T33 3,3'-DEIODO-THYROXINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1THC CRYSTAL STRUCTURE DETERMINATION AT 2.3A OF HUMAN TRANSTHYRETIN-3',5'-DIBROMO-2',4,4',6-TETRA-HYDROXYAURONE COMPLEX 提交 1992-04-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–127（127 aa）
链 B
1–127（127 aa）
|
未记录 | FL9 3',5'-DIBROMO-2',4,4',6'-TETRAHYDROXY AURONE × 8 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1TLM STRUCTURAL ASPECTS OF INOTROPIC BIPYRIDINE BINDING: CRYSTAL STRUCTURE DETERMINATION TO 1.9 ANGSTROMS OF THE HUMAN SERUM TRANSTHYRETIN-MILRINONE COMPLEX 提交 1992-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–127（127 aa）
链 B
1–127（127 aa）
|
未记录 | MIL MILRINONE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 1TSH TERTIARY STRUCTURES OF THREE AMYLOIDOGENIC TRANSTHYRETIN VARIANTS AND IMPLICATIONS FOR AMYLOID FIBRIL FORMATION 提交 1996-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：VARIANT A60T 突变：VARIANT A60T | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；PURIFIED PROTEIN (20MG/ML IN 25MM MONOBASIC SODIUM PHOSPHATE BUFFER, 0.15M NACL) WAS CRYSTALLIZED FROM 2.5M AMMONIUM SULFATE, 100MM CITRATE BUFFER, PH 5.5 AT ROOM TEMPERATURE.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.248 |
| 1TT6 The orthorhombic crystal structure of transthyretin in complex with diethylstilbestrol 提交 2004-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 DES DIETHYLSTILBESTROL × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；Sodium Acetate (0.2M), Ammonium Sulfate (2.4M), glycerol (7%), pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 1TTA THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL30MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1TTB THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL30MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1TTC THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL30MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1TTR TRANSTHYRETIN-V/122/I CARDIOMYOPATHIC MUTANT 提交 1996-04-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V122I 突变：V122I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.3；pH 5.3
|
分辨率 1.90 Å |
| 1TTR TRANSTHYRETIN-V/122/I CARDIOMYOPATHIC MUTANT 提交 1996-04-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V122I 突变：V122I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.3；pH 5.3
|
分辨率 1.90 Å |
| 1TYR TRANSTHYRETIN COMPLEX WITH RETINOIC ACID 提交 1995-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1TYR TRANSTHYRETIN COMPLEX WITH RETINOIC ACID 提交 1995-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 9CR (9cis)-retinoic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1TZ8 The monoclinic crystal structure of transthyretin in complex with diethylstilbestrol 提交 2004-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 2 DES DIETHYLSTILBESTROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；Sodium Acetate (0.2M), Ammonium Sulfate (2.4M), glycerol (7%), pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.221 |
| 1TZ8 The monoclinic crystal structure of transthyretin in complex with diethylstilbestrol 提交 2004-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 DES DIETHYLSTILBESTROL × 2 CO3 CARBONATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；Sodium Acetate (0.2M), Ammonium Sulfate (2.4M), glycerol (7%), pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.221 |
| 1TZ8 The monoclinic crystal structure of transthyretin in complex with diethylstilbestrol 提交 2004-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 DES DIETHYLSTILBESTROL × 4 CO3 CARBONATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；Sodium Acetate (0.2M), Ammonium Sulfate (2.4M), glycerol (7%), pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.221 |
| 1U21 transthyretin with tethered inhibitor on one monomer. 提交 2004-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | P2C 2-[(3,5-DICHLORO-4-TRIOXIDANYLPHENYL)AMINO]BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 4000, calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.239 |
| 1X7S The X-ray crystallographic structure of the amyloidogenic variant TTR Tyr78Phe 提交 2004-08-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：Y78F 突变：Y78F | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；287 K；Ammonium Sulfate, Glycerol, Sodium Acetate, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.238 |
| 1X7T Structure of TTR R104H: a non-amyloidogenic variant with protective clinical effects 提交 2004-08-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：R104H 突变：R104H | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；287 K；Ammonium Sulfate, Glycerol, Sodium Acetate, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 1Y1D Crystal structure of transthyretin in complex with iododiflunisal 提交 2004-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | FHI 2',4'-DIFLUORO-4-HYDROXY-5-IODO-1,1'-BIPHENYL-3-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；287 K；0.2M sodium citrate, 2.4M ammonium sulfate, 6% glycerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 1Z7J Human transthyretin (also called prealbumin) complex with 3, 3',5,5'-tetraiodothyroacetic acid (t4ac) 提交 2005-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | T4A 3,3',5,5'-TETRAIODOTHYROACETIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；48% ammonium sulfate, 0.l M phosphate buffer, pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4.0K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.217 |
| 1ZCR Crystal structure of human Transthyretin with bound iodide 提交 2005-04-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；Ammonium sulphate, 0.4M NaI, sodium citrate, PEG 200, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.238 |
| 1ZD6 Crystal structure of human transthyretin with bound chloride 提交 2005-04-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；ammonium sulphate, sodium citrate, polyethyleneglycol, sodium chloride, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 2B14 The crystal structure of 2,4-dinitrophenol in complex with the amyloidogenic variant Transthyretin Leu 55 Pro 提交 2005-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P | DNF 2,4-DINITROPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；287 K；PEG550, Hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.239 |
| 2B15 The crystal structure of 2,4-dinitrophenol in complex with human transthyretin 提交 2005-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 DNF 2,4-DINITROPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；287 K；ammonium sulfate, glycerol, sodium acetate, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.218 |
| 2B16 The crystal structure of 2,4-dinitrophenol in complex with the amyloidogenic variant Transthyretin Tyr78Phe 提交 2005-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：Y78F 突变：Y78F | DNF 2,4-DINITROPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；Ammonium Sulfate, glycerol, sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.236 |
| 2B77 Human transthyretin (TTR) complexed with Diflunisal analogues- TTR.2',4'-DICHLORO-4-HYDROXY-1,1'-BIPHENYL-3-CARBOXYLIC ACID 提交 2005-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 3CA 2',4'-DICHLORO-4-HYDROXY-1,1'-BIPHENYL-3-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, 0.35-0.50 M ammonium sulfate - crystals were soaked with the inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.238 |
| 2B9A Human transthyretin (TTR) complexed with diflunisal analogues- TTR.3',5'-difluorobiphenyl-4-carboxylic acid 提交 2005-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | FBC 3',5'-DIFLUOROBIPHENYL-4-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；ammonium sulfate, 100 mM KCL, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, soaked with the inhibitor, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.246 |
| 2F7I Human transthyretin (TTR) complexed with diflunisal analogues- TTR. 2',6'-Difluorobiphenyl-4-carboxylic Acid 提交 2005-11-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 26C 2',6'-DIFLUOROBIPHENYL-4-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；AMMONIUM SULFATE, 100 MM KCL, 1 MM EDTA, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, SOAKED WITH THE INHIBITOR, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 2F8I Human transthyretin (TTR) complexed with Benzoxazole 提交 2005-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 205 2-(2,6-DICHLOROPHENYL)-1,3-BENZOXAZOLE-6-CARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1 MM EDTA, 100 mM KCL, 10 MM SODIUM R 0.35 M AMMONIUM SULFATE - CRYSTALS WERE SOAKED WITH THE INHIBITOR, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 7.00
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.246 |
| 2F8I Human transthyretin (TTR) complexed with Benzoxazole 提交 2005-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 205 2-(2,6-DICHLOROPHENYL)-1,3-BENZOXAZOLE-6-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1 MM EDTA, 100 mM KCL, 10 MM SODIUM R 0.35 M AMMONIUM SULFATE - CRYSTALS WERE SOAKED WITH THE INHIBITOR, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 7.00
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.246 |
| 2FBR Human transthyretin (TTR) complexed with bivalant amyloid inhibitor (4 carbon linker) 提交 2005-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 44C 4'-(4-{4-[(2-CARBOXYPHENYL)AMINO]PHENOXY}BUTOXY)-1,1'-BIPHENYL-4-CARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；TTR bivalent inhibitor complexes of 1:1 stoichiometry resulting from coassembly at 5-7 mg/mL (95-133 microM in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, 0.35-0.50 M ammonium sulfate equilibrated against 2 M ammonium sulfate, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.224 |
| 2FLM Human transthyretin (TTR) complexed with bivalant amyloid inhibitor (6 carbon linker) 提交 2006-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6CA 4'-{6-[4-(2-CARBOXYPHENYLAMINO)-PHENOXY]-HEXYLOXY}-BIPHENYL-4-CARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.234 |
| 2G3X Crystal structure of Transthyretin mutant I84S at acidic pH 提交 2006-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：I84S 突变：I84S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；15% PEG monomethyl ether, 0.1M ammonium sulphate, 50mM sodium acetate pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.241 |
| 2G3Z Crystal structure of Transthyretin mutant I84A at low pH 提交 2006-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：I84A 突变：I84A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；15% PEG monomethyl ether, 0.1M ammonium sulphate, 50mM sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.245 |
| 2G4E Crystal structure of transthyretin mutant I84A at neutral pH 提交 2006-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：I84A 突变：I84A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M CaCl2, 14% PEG 400, 7.5% PEG 1500, 0.05M sodium Hepes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.246 |
| 2G4G Crystal structure of human transthyretin at pH 4.6 提交 2006-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；15% PEG monomethyl ether, 0.1M ammonium sulphate, 50mM sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.233 |
| 2G5U Human Transthyretin (TTR) Complexed with Hydroxylated polychlorinated Biphenyl-4,4'-dihydroxy-3,3',5,5'-tetrachlorobiphenyl 提交 2006-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | PCQ 3,5,3',5'-TETRACHLORO-BIPHENYL-4,4'-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Crystals of recombinant WT TTR were obtained from protein solutions at 5 mg/ml (in 100 mM KCl, 100 mM phosphate [pH 7.4], 1 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drop experiments. The TTR ligand complexes were prepared from crystals soaked for 2 weeks with a 10-fold molar excess , pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 2G9K Human Transthyretin (TTR) Complexed with Hydroxylated polychlorinated Biphenyl-4-hydroxy-2',3,3',4',5-Pentachlorobiphenyl 提交 2006-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | NE1 2',3,3',4',5-PENTACHLOROBIPHENYL-4-OL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: CRYSTALS OF RECOMBINANT WT TTR WERE
OBTAINED FROM PROTEIN SOLUTIONS AT 5 MG/ML (IN 100 MM KCL, 100
MM PHOSPHATE [PH 7.4], 1 M AMMONIUM SULFATE) EQUILIBRATED
AGAINST 2 M AMMONIUM SULFATE IN HANGING DROP EXPERIMENTS. THE
TTR LIGAND COMPLEXES WERE PREPARED FROM CRYSTALS SOAKED FOR 2
WEEKS WITH A 10-FOLD MOLAR EXCESS , pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.257 |
| 2GAB Human Transthyretin (TTR) Complexed with Hydroxylated polychlorinated Biphenyl-4-hydroxy-3,3',5,4'-tetrachlorobiphenyl 提交 2006-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | NE2 3,3',4',5-TETRACHLOROBIPHENYL-4-OL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: CRYSTALS OF RECOMBINANT WT TTR WERE
OBTAINED FROM PROTEIN SOLUTIONS AT 5 MG/ML (IN 100 MM KCL, 100
MM PHOSPHATE [PH 7.4], 1 M AMMONIUM SULFATE) EQUILIBRATED
AGAINST 2 M AMMONIUM SULFATE IN HANGING DROP EXPERIMENTS. THE
TTR LIGAND COMPLEXES WERE PREPARED FROM CRYSTALS SOAKED FOR 2
WEEKS WITH A 10-FOLD MOLAR EXCESS , PH 7.00, VAPOR DIFFUSION,
HANGING DROP, TEMPERATURE 298K , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.238 |
| 2H4E Crystal structure of Cys10 sulfonated transthyretin 提交 2006-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；0.2M sodium acetate, 2.0 M ammonium sulphate, 6 % glycerol, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.198 |
| 2M5N Atomic-resolution structure of a cross-beta protofilament 提交 2013-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 A
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 B
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 C
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 D
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 E
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 F
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 G
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 H
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 I
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 J
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 K
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 L
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 M
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 N
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 O
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
链 P
125–135（11 aa）
片段：UNP residues 125-135
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 2；压力 ambient
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] TTR(105-115), 10% acetonitrile/water solution | 10% acetonitrile/water solution
|
分辨率未提供 |
| 2NBO Solution structure of the F87M/L110M variant of transthyretin in the monomeric state 提交 2016-03-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
21–147（127 aa）
|
突变：F107M, L130M | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 50
NMR样品组成
0.3-0.7 mM [U-13C; U-15N] M-TTR, 50 mM MES, 100 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-13C; U-15N] M-TTR, 50 mM MES, 100 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 0.1 mM DSS, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NBP Solution structure of the T119M variant of transthyretin in its monomeric state 提交 2016-03-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
21–147（127 aa）
|
突变：F107M, L130M, T139M | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.6-1.2 mM [U-13C; U-15N] T119M M-TTR, 50 mM MES, 100 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NOY Crystal structure of transthyretin mutant I84S at PH 7.5 提交 2006-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：I84S 突变：I84S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M CaCl2, 14%(w/v) PEG 400, 7.5%(w/v) PEG 1500, 0.05M sodium Hepes (pH 7.5), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.251 |
| 2PAB STRUCTURE OF PREALBUMIN, SECONDARY, TERTIARY AND QUATERNARY INTERACTIONS DETERMINED BY FOURIER REFINEMENT AT 1.8 ANGSTROMS 提交 1977-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–127（127 aa）
链 B
1–127（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 2PAB STRUCTURE OF PREALBUMIN, SECONDARY, TERTIARY AND QUATERNARY INTERACTIONS DETERMINED BY FOURIER REFINEMENT AT 1.8 ANGSTROMS 提交 1977-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–127（127 aa）
链 B
1–127（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 2QEL Crystal structure of the highly amyloidogenic transthyretin mutant TTR G53S/E54D/L55S- heated protein 提交 2007-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：G53S,E54D,L55S 突变：G53S,E54D,L55S 突变：G53S,E54D,L55S 突变：G53S,E54D,L55S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1M Tris, 2.4M Ammonium sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.289 |
| 2QGB Human transthyretin (TTR) in Apo-form 提交 2007-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.188 |
| 2QGC Human transthyretin (TTR) complexed with 2-(3,5-Dimethyl-4-hydroxyphenyl)benzoxazole 提交 2007-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | MR4 4-(1,3-BENZOXAZOL-2-YL)-2,6-DIMETHYLPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.174 |
| 2QGD Human transthyretin (TTR) complexed with 2-(3,5-Dibromo-4-hydroxyphenyl)benzoxazole 提交 2007-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | MR5 4-(1,3-BENZOXAZOL-2-YL)-2,6-DIBROMOPHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.199 |
| 2QGE Human transthyretin (TTR) complexed with 2-(3,5-Dimethylphenyl)benzoxazole 提交 2007-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | MR6 2-(3,5-DIMETHYLPHENYL)-1,3-BENZOXAZOLE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.200 |
| 2ROX TRANSTHYRETIN (ALSO CALLED PREALBUMIN) COMPLEX WITH THYROXINE (T4) 提交 1996-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 2ROY TRANSTHYRETIN (ALSO CALLED PREALBUMIN) COMPLEX WITH 3',5'-DINITRO-N-ACETYL-L-THYRONINE 提交 1996-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | P28 3',5'-DINITRO-N-ACETYL-L-THYRONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2TRH TERTIARY STRUCTURES OF THREE AMYLOIDOGENIC TRANSTHYRETIN VARIANTS AND IMPLICATIONS FOR AMYLOID FIBRIL FORMATION 提交 1996-10-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：VARIANT R10C 突变：VARIANT R10C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；PURIFIED PROTEIN (20MG/ML IN 100MM TRIS BUFFER, PH 7.5) WAS CRYSTALLIZED FROM\\ 2.25M AMMONIUM SULFATE, 100MM CITRATE BUFFER, PH 5.5 AT ROOM TEMPERATURE.\\, pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.299 |
| 2TRY TERTIARY STRUCTURES OF THREE AMYLOIDOGENIC TRANSTHYRETIN VARIANTS AND IMPLICATIONS FOR AMYLOID FIBRIL FORMATION 提交 1996-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：VARIANT S77Y 突变：VARIANT S77Y | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；PURIFIED PROTEIN (25MG/ML IN 100MM TRIS BUFFER, PH 7.5) WAS CRYSTALLIZED FROM 1.5M AMMONIUM SULFATE, 100MM CITRATE BUFFER, PH 5.5, AT ROOM TEMPERATURE., pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.310 |
| 2WQA Complex of TTR and RBP4 and Oleic Acid 提交 2009-08-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 11 OLA OLEIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.85 Å R-free 0.253 |
| 3A4D Crystal structure of Human Transthyretin (wild-type) 提交 2009-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；200mM citrate, 3M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 3A4E Crystal structure of Human Transthyretin (E54G) 提交 2009-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；200 mM citrate, 3M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.238 |
| 3A4F Crystal Structure of Human Transthyretin (E54K) 提交 2009-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；200mM citrate, 3M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.223 |
| 3B56 Crystal structure of transthyretin in complex with 3,5-diiodosalicylic acid 提交 2007-10-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | DIU 2-HYDROXY-3,5-DIIODO-BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；287 K；200mM acetate buffer, 2.2M ammonium sulfate, 7% glycerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.214 |
| 3BSZ Crystal structure of the transthyretin-retinol binding protein-Fab complex 提交 2007-12-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | RTL RETINOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；2.35M ammonium phosphate, 10mM sodium citrate, 10mM beta-mercaptoethanol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.38 Å R-free 0.312 |
| 3BT0 Crystal structure of transthyretin variant V20S 提交 2007-12-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V20S 突变：V20S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；0.066M CaCl2, 19% (w/v) PEG 400, 0.13M sodium Hepes , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.229 |
| 3CBR Crystal structure of human Transthyretin (TTR) at pH3.5 提交 2008-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；289 K；5-7 mg/ml protein, 0.1 M sodium acetate, 20 % PEG 3350, 0.3-0.5 M ammonium sulfate equilibrated against 2.0M ammonium sulfate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.260 |
| 3CFM Crystal structure of the apo form of human wild-type transthyretin 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Mother liquor: 100 mM tris pH 7.5, 100 mM KCl, 20 % v/v PEG 400; drop 1 uL mother liquor + 1 uL TTR 10 mg/mL; crystals appeared in about 5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.218 |
| 3CFM Crystal structure of the apo form of human wild-type transthyretin 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Mother liquor: 100 mM tris pH 7.5, 100 mM KCl, 20 % v/v PEG 400; drop 1 uL mother liquor + 1 uL TTR 10 mg/mL; crystals appeared in about 5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.218 |
| 3CFN Crystal structure of human transthyretin in complex with 1-anilino-8-naphthalene sulfonate 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
|
未记录 | 2AN 8-ANILINO-1-NAPHTHALENE SULFONATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；mother liquor: 100 mM Tris, pH 7.5, 100 mM KCl, 20 % v/v PEG 400; drop consisting of 1 uL mother liquor and 1 uL wtTTR 10 mg/mL; crystals appeared in about 5 days; complex obtained by soaking in mother liquor supplemented with saturating amount of ligand., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.245 |
| 3CFN Crystal structure of human transthyretin in complex with 1-anilino-8-naphthalene sulfonate 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residue 30-147
|
未记录 | 2AN 8-ANILINO-1-NAPHTHALENE SULFONATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；mother liquor: 100 mM Tris, pH 7.5, 100 mM KCl, 20 % v/v PEG 400; drop consisting of 1 uL mother liquor and 1 uL wtTTR 10 mg/mL; crystals appeared in about 5 days; complex obtained by soaking in mother liquor supplemented with saturating amount of ligand., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.245 |
| 3CFQ Crystal structure of human wild-type transthyretin in complex with diclofenac 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
|
未记录 | DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；mother liquor: 100 mM Tris, pH7.5, 100 mM KCl, 20 % v/v PEG400; drop: 1 uL mother liquor + 1 uL wtTTR 10 mg/mL; crystals appeared in 5 days; complexes obtained by soaking in mother liquor supplemented with saturating amount of diclofenac, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.249 |
| 3CFQ Crystal structure of human wild-type transthyretin in complex with diclofenac 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
|
未记录 | DIF 2-[2,6-DICHLOROPHENYL)AMINO]BENZENEACETIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；mother liquor: 100 mM Tris, pH7.5, 100 mM KCl, 20 % v/v PEG400; drop: 1 uL mother liquor + 1 uL wtTTR 10 mg/mL; crystals appeared in 5 days; complexes obtained by soaking in mother liquor supplemented with saturating amount of diclofenac, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.249 |
| 3CFT Crystal structure of human transthyretin in complex with 1-amino-5-naphthalene sulfonate 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
|
未记录 | 5NS 5-aminonaphthalene-1-sulfonic acid × 6 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.87 Å R-free 0.239 |
| 3CFT Crystal structure of human transthyretin in complex with 1-amino-5-naphthalene sulfonate 提交 2008-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
链 B
30–147（118 aa）
片段：UNP residues 30-147
|
未记录 | 5NS 5-aminonaphthalene-1-sulfonic acid × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.87 Å R-free 0.239 |
| 3CN0 Human transthyretin (TTR) in complex with 3,5-Dimethyl-4-hydroxystilbene 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ1 2,6-dimethyl-4-[(E)-2-phenylethenyl]phenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6
and co-crystallized at room temperature using the vapor diffusion sitting
drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol
at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M
sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.189 |
| 3CN0 Human transthyretin (TTR) in complex with 3,5-Dimethyl-4-hydroxystilbene 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ1 2,6-dimethyl-4-[(E)-2-phenylethenyl]phenol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6
and co-crystallized at room temperature using the vapor diffusion sitting
drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol
at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M
sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.189 |
| 3CN1 Human transthyretin (TTR) in complex with 3,5-Dibromo-4-hydroxystilbene 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ2 2,6-dibromo-4-[(E)-2-phenylethenyl]phenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were
frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate,
pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.188 |
| 3CN1 Human transthyretin (TTR) in complex with 3,5-Dibromo-4-hydroxystilbene 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ2 2,6-dibromo-4-[(E)-2-phenylethenyl]phenol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were
frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate,
pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.188 |
| 3CN2 Human transthyretin (TTR) in complex with 3,5-Dibromo-4-hydroxybiphenyl 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ3 3,5-dibromobiphenyl-4-ol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were
frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate,
pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.197 |
| 3CN2 Human transthyretin (TTR) in complex with 3,5-Dibromo-4-hydroxybiphenyl 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ3 3,5-dibromobiphenyl-4-ol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were
frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate,
pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.197 |
| 3CN3 Human transthyretin (TTR) in complex with 1,3-Dibromo-2-hydroxy-5-phenoxybenzene 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ4 2,6-dibromo-4-phenoxyphenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were
frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate,
pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 3CN3 Human transthyretin (TTR) in complex with 1,3-Dibromo-2-hydroxy-5-phenoxybenzene 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ4 2,6-dibromo-4-phenoxyphenol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were
frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate,
pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 3CN4 Human transthyretin (TTR) in complex with N-(3,5-Dibromo-4-hydroxyphenyl)benzamide 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ5 N-(3,5-dibromo-4-hydroxyphenyl)benzamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen
using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5,
containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.202 |
| 3CN4 Human transthyretin (TTR) in complex with N-(3,5-Dibromo-4-hydroxyphenyl)benzamide 提交 2008-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LJ5 N-(3,5-dibromo-4-hydroxyphenyl)benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl,
at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor
diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M
sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen
using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5,
containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP,
temperature 298.0K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.202 |
| 3CXF Crystal structure of transthyretin variant Y114H 提交 2008-04-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：Y114H 突变：Y114H | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；0.066M CaCl2, 19 % (w/v) PEG 400, 0.13M sodium Hepes, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 3CXF Crystal structure of transthyretin variant Y114H 提交 2008-04-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：Y114H 突变：Y114H | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；0.066M CaCl2, 19 % (w/v) PEG 400, 0.13M sodium Hepes, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 3D2T Human transthyretin (ttr) complexed with diflunisal 提交 2008-05-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1FL 5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-2-HYDROXY-BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；5-7 mg/ml protein, in 0.3 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM KCL, 1 MM EDTA, 10 MM SODIUM PHOSPHATE equilibrated against 2 M ammonium sulfate; SOAKED WITH THE INHIBITOR., pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.235 |
| 3D7P Crystal structure of human Transthyretin (TTR) at pH 4.0 提交 2008-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；289 K；TTR pH 4.0 crystals were grown in the presence of 0.1 M sodium acetate (pH 4.0), 100 mM KCl, 1 mM EDTA and 0.3-0.5 M ammonium sulfate which was equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.249 |
| 3DGD Crystal structure of the F87M/L110M mutant of human transthyretin at pH 4.6 提交 2008-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：Y 突变：Y 突变：Y 突变：Y | ZN ZINC ION × 15 ACT ACETATE ION × 12 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；ZINC ACETATE 0.2 M, SODIUM CITRATE 0.1 M, AMMONIUM SULFATE 2,0M, PH 4,6; CRYSTALS WERE SOAKED IN MOTHER LIQUOR SUPPLEMENTED WITH 10 % GLYCEROL BEFORE FREEZING IN LIQUID NITROGEN, PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K, pH 4.60
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.202 |
| 3DID Crystal structure of the F87M/L110M mutant of human transthyretin at pH 4.6 soaked 提交 2008-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：Y 突变：Y 突变：Y 突变：Y | ZN ZINC ION × 12 ACT ACETATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；ZINC ACETATE 0.2 M, SODIUM CITRATE 0.1 M, AMMONIUM SULFATE 2,0M, PH 4,6; CRYSTALS WERE SOAKED IN MOTHER LIQUOR SUPPLEMENTED WITH 10 % GLYCEROL BEFORE FREEZING IN LIQUID NITROGEN, pH 4.60, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.242 |
| 3DJR CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN VARIANT L58H at neutral pH 提交 2008-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：L58H 突变：L58H | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；32% PEG 400, 0.05-0.2M CaCl2, 0.1M NaHepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.228 |
| 3DJS Crystal structure of transthyretin variant L58H at acidic pH 提交 2008-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：L58H 突变：L58H | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；295 K；32% PEG 2000, 0.1M NaAc, 0.2M Am2SO4 , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 3DJT Crystal structure of transthyretin variant V30M at acidic pH 提交 2008-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；295 K；32% PEG 2000, 0.1M NaAc, 0.2M Am2SO4
, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 3DJZ Crystal structure of transthyretin variant L55P at neutral pH 提交 2008-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；32% PEG 400, 0.05-0.2M CaCl2, 0.1M NaHepes , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.219 |
| 3DK0 Crystal structure of transthyretin variant L55P at acidic pH 提交 2008-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；295 K；32% PEG 400, 0.05-0.2M CaCl2, 0.1M NaHepes , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.223 |
| 3DK2 Crystal structure of transthyretin variant Y114H at acidic pH 提交 2008-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：Y114H 突变：Y114H | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；295 K；Na Citrate 0.1 M, Ammonium sulfate 2M , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.247 |
| 3DO4 Crystal structure of transthyretin variant T60A at acidic pH 提交 2008-07-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 D
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
|
突变：T60A 突变：T60A 突变：T60A 突变：T60A | ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；298 K；15% PEG 4000, 0.05M NaAcetate, 0.1M AmmoniumAcetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.267 |
| 3DO4 Crystal structure of transthyretin variant T60A at acidic pH 提交 2008-07-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
突变：T60A 突变：T60A 突变：T60A 突变：T60A | ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；298 K；15% PEG 4000, 0.05M NaAcetate, 0.1M AmmoniumAcetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.267 |
| 3ESN Human transthyretin (TTR) complexed with N-(3,5-Dibromo-4-hydroxyphenyl)-2,6-dimethylbenzamide 提交 2008-10-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | DZ1 N-(3,5-dibromo-4-hydroxyphenyl)-2,6-dimethylbenzamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.202 |
| 3ESO Human transthyretin (TTR) complexed with N-(3,5-Dibromo-4-hydroxyphenyl)-2,5-dichlorobenzamide 提交 2008-10-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | DZ2 2,5-dichloro-N-(3,5-dibromo-4-hydroxyphenyl)benzamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.204 |
| 3ESP Human transthyretin (TTR) complexed with N-(3,5-Dibromo-4-hydroxyphenyl)-3,5-dimethyl-4-hydroxybenzamide 提交 2008-10-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | DZ3 N-(3,5-dibromo-4-hydroxyphenyl)-4-hydroxy-3,5-dimethylbenzamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.201 |
| 3FC8 Crystal structure of transthyretin in complex with iododiflunisal-betaAlaOMe 提交 2008-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
链 B
21–144（124 aa）
|
未记录 | IFA METHYL N-[(2',4'-DIFLUORO-4-HYDROXY-5-IODOBIPHENYL-3-YL)CARBONYL]-BETA-ALANINATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；287 K；2.0 M ammonium sulfate, 7% glycerol and 0.2 M sodium acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.210 |
| 3FCB Crystal structure of transthyretin in complex with iododiflunisal-betaAlaOH 提交 2008-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
链 B
21–144（124 aa）
|
未记录 | IFB N-[(2',4'-DIFLUORO-4-HYDROXY-5-IODOBIPHENYL-3-YL)CARBONYL]-BETA-ALANINE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；287 K；2.2 M ammonium sulphate, 7% glycerol and 0.2 M sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.226 |
| 3GLZ Human Transthyretin (TTR) complexed with(E)-3-(2-(trifluoromethyl)benzylideneaminooxy)propanoic acid (inhibitor 11) 提交 2009-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 1BD 3-[({(1E)-[2-(trifluoromethyl)phenyl]methylidene}amino)oxy]propanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a tenfold molar excess of ligand for more than two weeks., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.273 |
| 3GLZ Human Transthyretin (TTR) complexed with(E)-3-(2-(trifluoromethyl)benzylideneaminooxy)propanoic acid (inhibitor 11) 提交 2009-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 1BD 3-[({(1E)-[2-(trifluoromethyl)phenyl]methylidene}amino)oxy]propanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a tenfold molar excess of ligand for more than two weeks., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.273 |
| 3GPS Crystal structure of the F87M/L110M mutant of human transthyretin at pH 5.5 提交 2009-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 C
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 D
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M | ZN ZINC ION × 12 ACT ACETATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；ZINC ACETATE 0.2 M, SODIUM CITRATE 0.1 M, AMMONIUM SULFATE 2,0M, CRYSTALS WERE SOAKED IN MOTHER LIQUOR SUPPLEMENTED WITH 10 % GLYCEROL BEFORE FREEZING IN LIQUID NITROGEN, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.254 |
| 3GRB Crystal structure of the F87M/L110M mutant of human transthyretin at pH 6.5 提交 2009-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 C
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 D
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M | ZN ZINC ION × 12 GOL GLYCEROL × 7 ACT ACETATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；ZINC ACETATE 0.2 M, SODIUM CITRATE 0.1 M, AMMONIUM SULFATE 2,0M, PH 6.5; CRYSTALS WERE SOAKED IN MOTHER LIQUOR SUPPLEMENTED WITH 10 % GLYCEROL BEFORE FREEZING IN LIQUID NITROGEN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.260 |
| 3GRG Crystal structure of the F87M/L110M mutant of human transthyretin at pH 7.5 提交 2009-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 C
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 D
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M 突变：F87M,L110M | ZN ZINC ION × 12 ACT ACETATE ION × 7 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；ZINC ACETATE 0.2 M, SODIUM CITRATE 0.1 M, AMMONIUM SULFATE 2,0M, PH 7.5; CRYSTALS WERE SOAKED IN MOTHER LIQUOR SUPPLEMENTED WITH 10 % GLYCEROL BEFORE FREEZING IN LIQUID NITROGEN, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.255 |
| 3GS0 Human transthyretin (TTR) complexed with (S)-3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)-2-methylpropanoic acid (inhibitor 16) 提交 2009-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 6BD (2S)-3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]-2-methylpropanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. All TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a ten fold molar excess of ligand for more than three weeks., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.269 |
| 3GS0 Human transthyretin (TTR) complexed with (S)-3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)-2-methylpropanoic acid (inhibitor 16) 提交 2009-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 6BD (2S)-3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]-2-methylpropanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. All TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a ten fold molar excess of ligand for more than three weeks., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.269 |
| 3GS4 Human transthyretin (TTR) complexed with 3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)propanoic acid (inhibitor 15) 提交 2009-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 7BD 3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]propanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. All TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a ten fold molar excess of ligand for more than three weeks. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.278 |
| 3GS4 Human transthyretin (TTR) complexed with 3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)propanoic acid (inhibitor 15) 提交 2009-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 7BD 3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]propanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. All TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a ten fold molar excess of ligand for more than three weeks. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.278 |
| 3GS7 Human transthyretin (TTR) complexed with (E)-3-(2-methoxybenzylideneaminooxy)propanoic acid (inhibitor 13) 提交 2009-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 8BD 3-({[(1Z)-(2-methoxyphenyl)methylidene]amino}oxy)propanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. All TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a ten fold molar excess of ligand for more than three weeks.
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 3GS7 Human transthyretin (TTR) complexed with (E)-3-(2-methoxybenzylideneaminooxy)propanoic acid (inhibitor 13) 提交 2009-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21 to 147
|
未记录 | 8BD 3-({[(1Z)-(2-methoxyphenyl)methylidene]amino}oxy)propanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；290 K；Crystals of wt-TTR were obtained from 5-7 mg/mL protein solutions (in 100 mM KCl, 1 mM EDTA, 10 mM sodium phosphate, pH 7.0, 0.3 M ammonium sulfate) equilibrated against 2 M ammonium sulfate in hanging drops. All TTR:ligand complexes were prepared from crystals soaked with a ten fold molar excess of ligand for more than three weeks.
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 3HJ0 Transthyretin in complex with a covalent small molecule kinetic stabilizer 提交 2009-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 30-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 30-147
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A93 4-fluorophenyl 3-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]benzoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.182 |
| 3I9A Crystal structure of human transthyretin variant A25T - #1 提交 2009-07-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A25T 突变：A25T | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL 5 mg/mL TTR + 1 uL well solution composed by 0.1 M Hepes sodium pH 7.5, 28 % PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate (Hampton's Crystal Screen I#14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.227 |
| 3I9I Crystal structure of human transthyretin variant A25T - #2 提交 2009-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
突变：A45T 突变：A45T | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes sodium pH 7.5, 28 % PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate (Hampton's Crystal Screen I#14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 3I9I Crystal structure of human transthyretin variant A25T - #2 提交 2009-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
突变：A45T 突变：A45T | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes sodium pH 7.5, 28 % PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate (Hampton's Crystal Screen I#14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 3I9P Crystal structure of human transthyretin - wild type 提交 2009-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL 5 mg/mL wtTTR + 1 uL well solution - 0.1 M Hepes sodium pH 7.5, 28 % PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate (Hampton's Crystal Screen I #14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.255 |
| 3I9P Crystal structure of human transthyretin - wild type 提交 2009-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；1 uL 5 mg/mL wtTTR + 1 uL well solution - 0.1 M Hepes sodium pH 7.5, 28 % PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate (Hampton's Crystal Screen I #14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.255 |
| 3IMR Transthyretin in complex with (E)-2,6-dibromo-4-(2,6-dichlorostyryl)phenol 提交 2009-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IW1 2,6-dibromo-4-[(E)-2-(2,6-dichlorophenyl)ethenyl]phenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 3IMS Transthyretin in complex with 2,6-dibromo-4-(2,6-dichlorophenethyl)phenol 提交 2009-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IW2 2,6-dibromo-4-[2-(2,6-dichlorophenyl)ethyl]phenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.197 |
| 3IMT Transthyretin in complex with (E)-4-(4-aminostyryl)-2,6-dibromophenol 提交 2009-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IW3 4-[(E)-2-(4-aminophenyl)ethenyl]-2,6-dibromophenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.190 |
| 3IMU Transthyretin in complex with (E)-4-(3-aminostyryl)-2,6-dibromoaniline 提交 2009-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IW4 4-[(E)-2-(3-aminophenyl)ethenyl]-2,6-dibromoaniline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.191 |
| 3IMV Transthyretin in complex with (E)-4-(4-aminostyryl)-2,6-dibromoaniline 提交 2009-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IW5 4-[(E)-2-(4-aminophenyl)ethenyl]-2,6-dibromoaniline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.201 |
| 3IMW Transthyretin in complex with (E)-2,6-dibromo-4-(2,6-dimethoxystyryl)aniline 提交 2009-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IW6 2,6-dibromo-4-[(E)-2-(2,6-dimethoxyphenyl)ethenyl]aniline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.196 |
| 3IPB Human Transthyretin (TTR) complexed with a palindromic bivalent amyloid inhibitor (11 carbon linker). 提交 2009-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | JZD 2,2'-{undecane-1,11-diylbis[oxy(3,5-dichlorobenzene-4,1-diyl)imino]}dibenzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；25-
32% v/v PEG550-monomethyl ether, 70 mM NaAc buffer pH 4-5 and 100 mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.229 |
| 3IPE Human Transthyretin (TTR) complexed with a palindromic bivalent amyloid inhibitor (7 carbon linker). 提交 2009-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | JZE 2,2'-{heptane-1,7-diylbis[oxy(3,5-dichlorobenzene-4,1-diyl)imino]}dibenzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；298 K；25-
32% v/v PEG550-monomethyl ether, 70 mM NaAc buffer pH 4-5 and 100 mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.196 |
| 3KGS V30M mutant human transthyretin (TTR) (apoV30M) pH 7.5 提交 2009-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 20-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 20-147
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.248 |
| 3KGT V30M mutant human transthyretin (TTR) complexed with genistein (V30M:GEN) pH 7.5 提交 2009-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
突变：V30M 突变：V30M | GEN GENISTEIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.241 |
| 3KGU Wild type human transthyretin (TTR) complexed with genistein (TTRwt:GEN) pH 7.5 提交 2009-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | GEN GENISTEIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 3M1O Human Transthyretin (TTR) complexed with 2-((3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)amino)benzoic acid 提交 2010-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CJZ 2-[(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)amino]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25- 32% V/V PEG550-MONOMETHYL ETHER, 70 MM NAAC BUFFER PH 4-5 AND 100 MM NACL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.171 |
| 3NEE Wild type human transthyretin (TTR) complexed with GC-1 (TTRwt:GC-1) 提交 2010-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
|
未记录 | B72 {4-[4-hydroxy-3-(1-methylethyl)benzyl]-3,5-dimethylphenoxy}acetic acid × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.217 |
| 3NEO Wild type human transthyretin (TTR) complexed with GC-24 (TTRwt:GC-24) 提交 2010-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
|
未记录 | G24 [4-(3-BENZYL-4-HYDROXYBENZYL)-3,5-DIMETHYLPHENOXY]ACETIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 3NES V30M mutant human transthyretin (TTR) complexed with GC-1 (V30M:GC-1) 提交 2010-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
|
突变：V30M 突变：V30M | B72 {4-[4-hydroxy-3-(1-methylethyl)benzyl]-3,5-dimethylphenoxy}acetic acid × 4 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 3NEX V30M mutant human transthyretin (TTR) complexed with GC-24 (V30M:GC-24) 提交 2010-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP RESIDUES 30-145
|
突变：V30M 突变：V30M | GOL GLYCEROL × 4 G24 [4-(3-BENZYL-4-HYDROXYBENZYL)-3,5-DIMETHYLPHENOXY]ACETIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5, 28% PEG 400, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 3NG5 Crystal Structure of V30M transthyretin complexed with (-)-epigallocatechin gallate (EGCG) 提交 2010-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | KDH (2R,3R)-5,7-dihydroxy-2-(3,4,5-trihydroxyphenyl)-3,4-dihydro-2H-chromen-3-yl 3,4,5-trihydroxybenzoate × 6 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.3；293 K；200MM CITRATE, 3M AMMONIUM SULFATE, pH 5.3, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 3OZK Crystal structure of human transthyretin variant A25T in complex with thyroxine (T4) 提交 2010-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A25T 突变：A25T | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes sodium pH 7.5, 28% PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, complex obtained by soaking crystal with ligand.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 3OZL Crystal structure of human transthyretin variant A25T in complex with flufenamic acid. 提交 2010-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A25T 突变：A25T | FLF 2-[[3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO] BENZOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes sodium pH 7.5, 28% PEG 400, 0.2 calcium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, soaking for 1 h with ligand.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 3P3R Transthyretin in complex with (3,4-dihydroxy-5-nitrophenyl)(2-fluorophenyl)methanone 提交 2010-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 3M1 (3,4-dihydroxy-5-nitrophenyl)(2-fluorophenyl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.180 |
| 3P3S Human transthyretin (TTR) complexed with (Z)-5-(3,5-dibromo-4-hydroxybenzylidene)-imino-1-methylimidazolidin-4-one 提交 2010-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 3M2 (5Z)-2-amino-5-(3,5-dibromo-4-hydroxybenzylidene)-1-methyl-1,5-dihydro-4H-imidazol-4-one × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 3P3T Human transthyretin (TTR) complexed with 4-(3-(2-flourophenoxy)propyl)-3,5-dimethyl-1H-pyrazole 提交 2010-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 3M3 4-[3-(2-fluorophenoxy)propyl]-3,5-dimethyl-1H-pyrazole × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.199 |
| 3P3U Human transthyretin (TTR) complexed with 5-(2-ethoxyphenyl)-3-(pyridin-4-yl)-1,2,4-oxadiazole 提交 2010-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 3M4 4-[5-(2-ethoxyphenyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyridine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 3SSG Structure of transthyretin L55P in complex with Zn 提交 2011-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
突变：L55P | ZN ZINC ION × 8 CAC CACODYLATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；287 K；3% w/v PEG 8000, 0.1M cacodylate pH 6.5, 5 mM Zn acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 3TCT Structure of wild-type TTR in complex with tafamidis 提交 2011-08-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：unp residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：unp residues 21-147
|
未记录 | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE WT-TTR WAS CONCENTRATED TO 4 MG/ML IN 10 MM NAPI, 100 MM KCL, AT PH 7.6 AND CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH INHIBITORS USING THE VAPOR-DIFFUSION SITTING DROP METHOD, CRYSTALS WERE GROWN FROM 1.395 M SODIUM CITRATE, 3.5% V/V GLYCEROL AT PH 5.5. THE CRYSTALS WERE FROZEN USING A CRYO-PROTECTANT SOLUTION OF 1.395 M SODIUM CITRATE, PH 5.5, CONTAINING 10% V/V GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 298.0K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.192 |
| 3TFB Transthyretin natural mutant A25T 提交 2011-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
突变：A45T 突变：A45T | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2 and 28% PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.239 |
| 3U2I X-ray crystal structure of human Transthyretin at room temperature 提交 2011-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
32–147（116 aa）
片段：UNP residues 32-147
链 B
32–147（116 aa）
片段：UNP residues 32-147
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；2.0M tri-ammonium citrate(pD7.4), 0.4M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 3U2J Neutron crystal structure of human Transthyretin 提交 2011-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
32–147（116 aa）
片段：UNP residues 32-147
链 B
32–147（116 aa）
片段：UNP residues 32-147
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
NEUTRON DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；1.85M tri-ammonium citrate, pD7.4, 0.4M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 3W3B Crystal structure of wild-type human transthyretin 提交 2012-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 4ABQ CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LIGAND C-1 提交 2011-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
链 B
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
|
未记录 | 4V2 3-(5-MERCAPTO-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL)-PHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.242 |
| 4ABU CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LIGAND C-2 提交 2011-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
链 B
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
|
未记录 | FT1 4-(2,4-dichlorophenoxy)-3-hydroxybenzaldehyde × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.254 |
| 4ABV CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LIGAND C-3 提交 2011-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
链 B
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
|
未记录 | FT2 5-(chloromethyl)-2-(2,4-dichlorophenoxy)phenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.246 |
| 4ABW Crystal Structure of Transthyretin in Complex With Ligand C-6 提交 2011-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
链 B
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
|
未记录 | 42M [4-(2,4-dinitrophenoxy)-3-methoxyphenyl]methanol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.257 |
| 4AC2 CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LIGAND C-7 提交 2011-12-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
链 B
21–144（124 aa）
片段：RESIDUES 21-144
|
未记录 | 43F 2,4-DICHLORO-1-[4-(CHLOROMETHYL)-2-METHOXYPHENOXY]BENZENE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.236 |
| 4AC4 CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LIGAND C-18 提交 2011-12-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | HKA 3-METHOXY-4-PHENOXYBENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.258 |
| 4ACT CRYSTAL STRUCTURE OF TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LIGAND C-17 提交 2011-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | FT0 3-hydroxy-4-phenoxybenzaldehyde × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.265 |
| 4ANK Crystallographic study of novel transthyretin ligands exhibiting negative-cooperativity between two T4 binding sites. 提交 2012-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；POTASSIUM CHLORIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, AMMONIUM SULFATE, PH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.250 |
| 4D7B Structure of human transthyretin in complex with Tolcapone 提交 2014-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | TCW Tolcapone × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.15 Å R-free 0.201 |
| 4DER Crystal Structure of the Wild Type TTR Binding Apigenin (TTRwt:API) 提交 2012-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
未记录 | AGI 5,7-dihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-4H-chromen-4-one × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 28% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 4DES Crystal Structure of the Wild Type TTR Binding Chrysin (TTRwt:CHR) 提交 2012-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
未记录 | 57D chrysin × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 28% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.226 |
| 4DET Crystal Structure of the Wild Type TTR Binding Kaempferol (TTRwt:KAE) 提交 2012-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
未记录 | KMP 3,5,7-TRIHYDROXY-2-(4-HYDROXYPHENYL)-4H-CHROMEN-4-ONE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 28% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.223 |
| 4DEU Crystal Structure of the Wild Type TTR Binding Naringenin (TTRwt:NAR) 提交 2012-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 NAR NARINGENIN × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 28% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.213 |
| 4DEW Crystal Structure of the Wild Type TTR Binding Luteolin (TTRwt:LUT) 提交 2012-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | LU2 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-4H-chromen-4-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M calcium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 28% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.199 |
| 4FI6 Kinetic Stabilization of transthyretin through covalent modification of K15 by 3-(5-(3,5-dichlorophenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)-benzenesulfonamide 提交 2012-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 0U7 3-[5-(3,5-dichlorophenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzenesulfonyl fluoride × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The wt-TTR was concentrated to 4 mg/ml in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method, crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at ph 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 m sodium citrate, ph 5.5, containing 10% v/v glycerol, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.182 |
| 4FI7 Kinetic Stabilization of transthyretin through covalent modification of K15 by 3-(5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)-benzenesulfonamide 提交 2012-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 0UA 3-[5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzenesulfonyl fluoride × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The wt-TTR was concentrated to 4 mg/ml in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method, crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at ph 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 m sodium citrate, ph 5.5, containing 10% v/v glycerol, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.205 |
| 4FI8 Kinetic Stabilization of transthyretin through covalent modification of K15 by 4-bromo-3-(5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)-benzenesulfonamide 提交 2012-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 0UC 4-bromo-3-[5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]benzenesulfonyl fluoride × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The wt-TTR was concentrated to 4 mg/ml in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method, crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at ph 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 m sodium citrate, ph 5.5, containing 10% v/v glycerol, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.197 |
| 4HIQ The Structure of V122I Mutant Transthyretin in Complex with AG10 提交 2012-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V122I 突变：V122I | 16V 3-[3-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)propoxy]-4-fluorobenzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；THE WT-TTR WAS CONCENTRATED TO 4 MG/ML IN 10 MM NAPI, 100 MM KCL, AT PH 7.6 AND CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH INHIBITORS USING THE VAPOR-DIFFUSION SITTING DROP METHOD, CRYSTALS WERE GROWN FROM 1.395 M SODIUM CITRATE, 3.5% V/V GLYCEROL AT PH 5.5. THE CRYSTALS WERE FROZEN USING A CRYO-PROTECTANT SOLUTION OF 1.395 M SODIUM CITRATE, PH 5.5, CONTAINING 10% V/V GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.186 |
| 4HIS The Structure of V122I Mutant Transthyretin in Complex with Tafamidis 提交 2012-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V122I 突变：V122I | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；THE WT-TTR WAS CONCENTRATED TO 4 MG/ML IN 10 MM NAPI, 100 MM KCL, AT PH 7.6 AND CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH INHIBITORS USING THE VAPOR-DIFFUSION SITTING DROP METHOD, CRYSTALS WERE GROWN FROM 1.395 M SODIUM CITRATE, 3.5% V/V GLYCEROL AT PH 5.5. THE CRYSTALS WERE FROZEN USING A CRYO-PROTECTANT SOLUTION OF 1.395 M SODIUM CITRATE, PH 5.5, CONTAINING 10% V/V GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.172 |
| 4HJS Kinetic stabilization of transthyretin through covalent modification of K15 by (E)-N-(4-(4-hydroxy-3,5-dimethylstyryl)ethanesulfonamide 提交 2012-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | 18J N-{4-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]phenyl}ethanesulfonamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；THE WT-TTR WAS CONCENTRATED TO 4 MG/ML IN 10 MM NAPI, 100 MM KCL, AT PH 7.6 AND CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH INHIBITORS USING THE VAPOR-DIFFUSION SITTING DROP METHOD, CRYSTALS WERE GROWN FROM 1.395 M SODIUM CITRATE, 3.5% V/V GLYCEROL AT PH 5.5. THE CRYSTALS WERE FROZEN USING A CRYO-PROTECTANT SOLUTION OF 1.395 M SODIUM CITRATE, PH 5.5, CONTAINING 10% V/V GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.224 |
| 4HJT Kinetic stabilization of transthyretin through covalent modification of K15 by (E)-N-(4-(4-hydroxy-3,5-dimethylstyryl)phenyl)propionamide 提交 2012-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 18A N-{4-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]phenyl}propanamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；THE WT-TTR WAS CONCENTRATED TO 4 MG/ML IN 10 MM NAPI, 100 MM KCL, AT PH 7.6 AND CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH INHIBITORS USING THE VAPOR-DIFFUSION SITTING DROP METHOD, CRYSTALS WERE GROWN FROM 1.395 M SODIUM CITRATE, 3.5% V/V GLYCEROL AT PH 5.5. THE CRYSTALS WERE FROZEN USING A CRYO-PROTECTANT SOLUTION OF 1.395 M SODIUM CITRATE, PH 5.5, CONTAINING 10% V/V GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.187 |
| 4HJU Transthyretin in complex with (E)-N-(3-(4-hydroxy-3,5-dimethylstyryl)phenyl)acrylamide 提交 2012-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 16L N-{3-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]phenyl}prop-2-enamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；THE WT-TTR WAS CONCENTRATED TO 4 MG/ML IN 10 MM NAPI, 100 MM KCL, AT PH 7.6 AND CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH INHIBITORS USING THE VAPOR-DIFFUSION SITTING DROP METHOD, CRYSTALS WERE GROWN FROM 1.395 M SODIUM CITRATE, 3.5% V/V GLYCEROL AT PH 5.5. THE CRYSTALS WERE FROZEN USING A CRYO-PROTECTANT SOLUTION OF 1.395 M SODIUM CITRATE, PH 5.5, CONTAINING 10% V/V GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.188 |
| 4I85 Crystal structure of transthyretin in complex with CHF5074 at neutral pH 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：Transthyretin (unp residues 21-147)
链 B
21–147（127 aa）
片段：Transthyretin (unp residues 21-147)
|
未记录 | H50 1-(3',4'-dichloro-2-fluorobiphenyl-4-yl)cyclopropanecarboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M KCl, 0.05 M sodium phosphate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.230 |
| 4I87 Crystal structure of TTR variant I84S in complex with CHF5074 at acidic pH 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：Transthyretin (unp residues 21-147)
链 B
21–147（127 aa）
片段：Transthyretin (unp residues 21-147)
|
突变：I84S 突变：I84S | H50 1-(3',4'-dichloro-2-fluorobiphenyl-4-yl)cyclopropanecarboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；15% (w/v) PEG 2000 monomethylether, 0.1 M
ammonium sulfate, 0.05 M sodium acetate buffer, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.211 |
| 4I89 Crystal structure of transthyretin in complex with diflunisal at acidic pH 提交 2012-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：Transthyretin (unp residues 21-147)
链 B
21–147（127 aa）
片段：Transthyretin (unp residues 21-147)
|
突变：I84S 突变：I84S | 1FL 5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-2-HYDROXY-BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；15% (w/v) PEG 2000 monomethylether, 0.1 M ammonium sulfate, 0.05 M sodium acetate buffer, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.222 |
| 4IIZ Crystal structure of wild-type human transthyretin in complex with lumiracoxib 提交 2012-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LUR {2-[(2-chloro-6-fluorophenyl)amino]-5-methylphenyl}acetic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 4IK6 Crystal structure of human transthyretin in complex with lumiracoxib 提交 2012-12-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LUR {2-[(2-chloro-6-fluorophenyl)amino]-5-methylphenyl}acetic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.2M Calcium chloride, 0.1M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 4IK7 Crystal structure of human transthyretin in complex with indomethacin 提交 2012-12-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IMN INDOMETHACIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.2M Calcium chloride, 0.1M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.244 |
| 4IKI Crystal structure of wild-type human transthyretin in complex with indomethacin 提交 2012-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IMN INDOMETHACIN × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；10mg/mL wtTTR, 22% peg 400, 100mM Tris pH 7.4, 100mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 4IKJ Crystal structure of wild-type human transthyretin in complex with sulindac 提交 2012-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SUZ [(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-{4-[methylsulfinyl]benzylidene}-1H-inden-3-yl]acetic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；10mg/mL wtTTR, 0.2M Calcium chloride, 0.1M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400 (Hampton Research's Crystal Screen I, #14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 4IKK Crystal structure of wild-type human transthyretin in complex with sulindac 提交 2012-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SUZ [(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-{4-[methylsulfinyl]benzylidene}-1H-inden-3-yl]acetic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；10mg/mL wtTTR, 0.2M Calcium chloride, 0.1M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400
(Hampton Research's Crystal Screen I, #14), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 4IKL Crystal structure of wild-type human transthyretin in complex with sulindac 提交 2012-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SUZ [(1Z)-5-fluoro-2-methyl-1-{4-[methylsulfinyl]benzylidene}-1H-inden-3-yl]acetic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；10mg/mL wtTTR, 22% peg 400, 100mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.244 |
| 4KY2 Transthyretin in complex with the fluorescent folding sensor (E)-7-hydroxy-3-(4-hydroxy-3,5-dimethylstyryl)-4-methyl-2H-chromen-2-one 提交 2013-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1W3 7-hydroxy-3-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]-4-methyl-2H-chromen-2-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.174 |
| 4L1S Covalent modification of transthyretin K15 by yielding the fluorescent conjugate (E)-3-(dimethylamino)-5-(4-hydroxy-3,5-dimethylstyryl)benzamide 提交 2013-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1W4 S-(4-fluorophenyl) 3-(dimethylamino)-5-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]benzenecarbothioate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The wt-TTR was concentrated to 4 mg/ml in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method, crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at ph 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 m sodium citrate, ph 5.5, containing 10% v/v glycerol, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.185 |
| 4L1T Transthyretin in complex with (E)-3-(dimethylamino)-5-(4-hydroxy-3,5-dimethylstyryl)benzoic acid 提交 2013-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1WZ 3-(dimethylamino)-5-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.188 |
| 4MAS High Resolution Structure of Wild Type Human Transthyretin in Complex with 3,3',5,5'-tetrachloro-[1,1'-biphenyl]-4,4'diol 提交 2013-08-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | PCQ 3,5,3',5'-TETRACHLORO-BIPHENYL-4,4'-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；4 mg/ML wt-TTR in 10 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, pH 7.6, co-crystallized with inhibitor, crystallization solution: 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol, pH 5.5, cryoprotectant: 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, 10% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.173 |
| 4MRB Wild Type Human Transthyretin pH 7.5 提交 2013-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；100mM HEPES, 200mM CaCl2, 28% PEG400 v/v, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.209 |
| 4MRC Human Transthyretin Ser52Pro Mutant 提交 2013-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
22–147（126 aa）
片段：UNP residues 22-147
链 B
22–147（126 aa）
片段：UNP residues 22-147
|
突变：S52P 突变：S52P | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；100mM HEPES, 200mM CaCl2, 28% PEG400 v/v, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.228 |
| 4N85 Crystal structure of human transthyretin 提交 2013-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；34-40% PEG 400, 0.4M CaCl2, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.239 |
| 4N86 Crystal structure of human transthyretin complexed with glabridin 提交 2013-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | GBJ 4-[(3R)-8,8-dimethyl-3,4-dihydro-2H,8H-pyrano[2,3-f]chromen-3-yl]benzene-1,3-diol × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；34.2% PEG 400, 0.36M CaCl2, 0.09M HEPES, 1mM glabridin, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.259 |
| 4N87 Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with glabridin 提交 2013-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | GBJ 4-[(3R)-8,8-dimethyl-3,4-dihydro-2H,8H-pyrano[2,3-f]chromen-3-yl]benzene-1,3-diol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；32% PEG 400, 0.4M CaCl2, 0.1M HEPES, 0.5mM Glabridin, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.253 |
| 4PM1 Human transthyretin (TTR) complexed with 16-alpha-bromo-estradiol 提交 2014-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | ESZ (14beta,16alpha,17alpha)-16-bromoestra-1,3,5(10)-triene-3,17-diol × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；Protein: 5 mg/ml TTR dialysed against 0.1 M NaCl, 0.05M Na acetate, pH 5.5.
Precipitant:: 70% (30% PEG 4000, 0.2M imidazole malate, pH 6.0) 30% (18% monomethyl PEG 2000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5).
Cryoprotectant: 40% (25 % diethylene glycol + 12.5 % MPD + 37.5 % 2,3-butanediol + 12.5 % 1,4-dioxane) 50% (12.5% MPEG 5K, 25% MPEG 550) 0.1 M (mixed Na propionate, Na cacodylate, Bis-Tris-propane 50% at pH 4.0 and 50% pH 9.5)
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.211 |
| 4PME Human transthyretin (TTR) complexed with ferulic acid and curcumin. 提交 2014-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–146（118 aa）
片段：UNP residues 29-145
链 B
29–146（118 aa）
片段：UNP residues 29-145
|
未记录 | CUR (1Z,4Z,6E)-5-hydroxy-1,7-bis(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)hepta-1,4,6-trien-3-one × 2 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 FER 3-(4-HYDROXY-3-METHOXYPHENYL)-2-PROPENOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；protein: 5 mg/ml dialysed in 0.1 M NaCl, 0.05 M NaAc, pH 5.5 with 5 milli-M curcumin.
precipitant:: 45% MPEG 2,000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 7.5.
Cryoprotectant: 40% mixed (25% dioxane, 25% DMSO, 12.5% ethylene glycol, 12.5% 1,2-propanediol, 12.5% glycerol, 12.5% 2,3-butanediol), 50% (25% MPEG 5000, 0.1 M mixed (Na acetate, ADA, Bicine buffer: 40% pH 4.0 / 60% pH 9.0)
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.207 |
| 4PME Human transthyretin (TTR) complexed with ferulic acid and curcumin. 提交 2014-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
29–146（118 aa）
片段：UNP residues 29-145
链 B
29–146（118 aa）
片段：UNP residues 29-145
|
未记录 | CUR (1Z,4Z,6E)-5-hydroxy-1,7-bis(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)hepta-1,4,6-trien-3-one × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FER 3-(4-HYDROXY-3-METHOXYPHENYL)-2-PROPENOIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；protein: 5 mg/ml dialysed in 0.1 M NaCl, 0.05 M NaAc, pH 5.5 with 5 milli-M curcumin.
precipitant:: 45% MPEG 2,000, 0.1 M sodium cacodylate, pH 7.5.
Cryoprotectant: 40% mixed (25% dioxane, 25% DMSO, 12.5% ethylene glycol, 12.5% 1,2-propanediol, 12.5% glycerol, 12.5% 2,3-butanediol), 50% (25% MPEG 5000, 0.1 M mixed (Na acetate, ADA, Bicine buffer: 40% pH 4.0 / 60% pH 9.0)
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.207 |
| 4PMF Human transthyretin (TTR) complexed with curcumin 提交 2014-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–145（117 aa）
片段：UNP residues 29-146
链 B
29–145（117 aa）
片段：UNP residues 29-146
|
未记录 | CUR (1Z,4Z,6E)-5-hydroxy-1,7-bis(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)hepta-1,4,6-trien-3-one × 4 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Precipitant: 40% MPEG 2,000, 1% dioxane, 0.1 M sodium cacodylate, pH 7.5.
Cryoprotectant: 40% mixed (25% dioxane, 25% DMSO, 12.5% ethylene glycol, 12.5% 1,2-propanediol, 12.5% glycerol, 12.5% 2,3-butanediol) 50% (25% MPEG 5K, 0.1 M mixed (sodium acetate, ADA, bicine 20% pH 4 and 80% pH 9), 3 milli-M Curcumin for 20 min
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.209 |
| 4PVL X-ray structure of human transthyretin (TTR) at room temperature to 1.9A resolution 提交 2014-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；2.15M SODIUM MALONATE, 23MG/ML PROTEIN, 100UL DROP, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.201 |
| 4PVM Neutron structure of human transthyretin (TTR) at room temperature to 2.0A resolution (Laue) 提交 2014-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；2.15M SODIUM MALONATE, 23MG/ML PROTEIN, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率未提供 |
| 4PVN Neutron structure of human transthyretin (TTR) at room temperature to 2.3A resolution (monochromatic) 提交 2014-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；2.15M SODIUM MALONATE, 23MG/ML PROTEIN, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率未提供 |
| 4PWE Crystal structure of V30M mutant human transthyretin 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.4M CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.228 |
| 4PWF Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with ferulic acid phenethyl ester 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PWF 2-phenylethyl (2E)-3-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)prop-2-enoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 4mM ferulic acid phenethyl ester, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 4PWG Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with caffeic acid ethyl ester 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 0XR ethyl (2E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoate × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 12mM caffeic acid ethyl ester, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 4PWH Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with caffeic acid 1,1-dimethylallyl ester 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PWH 3-methylbut-2-en-1-yl (2E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoate × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 9mM caffeic acid 1,1-dimethylallyl ester, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 4PWI Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with rosmarinic acid 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | ROA (2R)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)-2-{[(2E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoyl]oxy}propanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 9mM rosmarinic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.231 |
| 4PWJ Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with nordihydroguaiaretic acid 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 30Z 4-[(2R,3S)-3-[(3,4-DIHYDROXYPHENYL)METHYL]-2-METHYLBUTYL]BENZENE-1,2-DIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 8mM nordihydroguaiaretic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.219 |
| 4PWK Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with dihydroguaiaretic acid 提交 2014-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PWK 4,4'-[(2R,3R)-2,3-dimethylbutane-1,4-diyl]bis(2-methoxyphenol) × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 6mM dihydroguaiaretic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.231 |
| 4QRF Crystal structure of V30M mutant human transthyretin complexed with caffeic acid phenethyl ester 提交 2014-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | QAP 2-phenylethyl (2E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；10-30% PEG400, 0.1M HEPES, 0.2M CaCl2, 1mM caffeic acid phenethyl ester, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.256 |
| 4QXV CRYSTAL STRUCTURE of HUMAN TRANSTHYRETIN IN COMPLEX WITH LUTEOLIN AT 1.1 A RESOLUTION 提交 2014-07-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | LU2 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-4H-chromen-4-one × 4 GOL GLYCEROL × 6 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；291 K；WT-TTR CONCENTRATION WAS 5 MG/ML IN 10 MM SODIUMPHOSPHATE PH 7.6, 100 MM POTASSIUMCLORIDE. WT-TTR WAS CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH 5 MOLAR EXCESS OF LUTEOLIN IN 3.5% V/V GLYCEROL AND 1.3-1.6 M SODIUM CITRATE AT PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.152 |
| 4QYA Crystal structure of human transthyretin variant V30M in complex with luteolin 提交 2014-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
突变：V30M 突变：V30M | LU2 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-4H-chromen-4-one × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；V30M-TTR CONCENTRATION WAS 5 MG/ML IN 10 MM SODIUMPHOSPHATE, PH 7.6, 100 MM POTASSIUMCLORIDE. V30M-TTR WAS CO-CRYSTALLIZED AT ROOM TEMPERATURE WITH 5 MOLAR EXCESS OF LUTEOLIN IN 3.5% V/V GLYCEROL AND 1.3-1.6 M SODIUM CITRATE AT PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.198 |
| 4TKW Crystal Structure of Human Transthyretin Leu55Pro Mutant 提交 2014-05-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：L55P 突变：L55P | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 4TL4 Crystal Structure of Human Transthyretin Val30Met Mutant 提交 2014-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 4TL5 Crystal Structure of Human Transthyretin Ser85Pro Mutant 提交 2014-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：S85P 突变：S85P | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.198 |
| 4TLK Crystal Structure of Human Transthyretin Ser85Pro/Glu92Pro Mutant 提交 2014-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：S85P, E92P 突变：S85P, E92P | NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.201 |
| 4TLS Crystal Structure of Human Transthyretin Glu92Pro Mutant 提交 2014-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：E92P 突变：E92P | PO4 PHOSPHATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.192 |
| 4TLT Crystal structure of human transthyretin 提交 2014-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.232 |
| 4TLU Crystal Structure of Human Transthyretin Ala108Trp Mutant 提交 2014-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：A108W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A108W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.213 |
| 4TM9 Crystal Structure of Human Transthyretin Thr119Trp Mutant 提交 2014-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：T119W 突变：T119W | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 4TNE Crystal Structure of Human Transthyretin Thr119Tyr Mutant 提交 2014-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：T119Y 突变：T119Y | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.201 |
| 4TNF Crystal Structure of Human Transthyretin Lys15Trp Mutant 提交 2014-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：K15W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K15W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.213 |
| 4TNG Crystal Structure of Human Transthyretin Thr119Met Mutant 提交 2014-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
链 B
29–147（119 aa）
片段：UNP residues 29-147
|
突变：T119M 突变：T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.200 |
| 4TQ8 Dual binding mode for 3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)propanoic acid binding to Human transthyretin (TTR) 提交 2014-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 7BD 3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]propanoic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；293 K；Protein: 5 mg/ml 1 milli-M ligand
Precipitant: 60% (30% PEG-4K, 0.2 M imidazole
malate, pH 6.0) 40% (24% MPEG-5K, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5)
Drops: 1 micro-L protein-ligand complex 1 micro-L precipitant.
Cryoprotectant:: 40% (12.5 % diethylene glycol + 12.5 % ethylene glycol + 12.5 % glycerol + 12.5 % 1,2-propanediol + 12.5 % DMSO + 12.5 % 1,4-dioxane), 25% MPEG 5K, 0.1 M sodium propionate, sodium cacodylate, Bis-Tris-propane(65% component A pH 4; 35% B pH 9.5 and 1 milli-M ligand.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.210 |
| 4TQH Human transthyretin (TTR) complexed with 3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)ethanoic acid 提交 2014-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | ES8 [(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]acetic acid × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；293 K；protein: 5 mg/ml 0.05 M NaCl, 0.05 M Na acetate, pH 5.5 with 1 milli-M ligand.
Precipitant: 60% (30% PEG-4K, 0.2 M imidazole malate, pH 6.0) and 40% (24% MPEG-5K, 0.1M sodium acetate, pH 5.5).
Cryoprotectant: 40% (25 % diethylene glycol, 12.5 % MPD, 37.5 % 2,3-butanediol, 12.5 % 1,4-dioxane), 12.5% MPEG 5K, 25% MPEG 550, 100 mM (sodium propionate, sodium cacodylate, Bis-Tris-propane(50% component A pH 4; 50% B pH 9.5) and 1 mM ligand.
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.222 |
| 4TQI Human transthyretin (TTR) complexed with 3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)propanoic acid in a dual binding mode 提交 2014-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6BD (2S)-3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]-2-methylpropanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；293 K；protein: TTR 10 mg/ml + ligand 0.66 milli-M in 0.1 M NaCl, 0.05 M Na acetate, pH 5.5.
Precipitant: 70% (30% PEG-4K, 0.2 M imidazole malate, pH 6.0) and 30% (12% MPEG-5K, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5).
Cryoprotectant: 40% (25 % diethylene glycol, 12.5 % MPD, 37.5 % 2,3-butanediol, 12.5 % 1,4-dioxane), 10% PEG 10K, 0.1 M (mixed sodium propionate, sodium cacodylate, Bis-Tris-propane) (65% component A pH 4; 35% B pH 9.5)
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.208 |
| 4TQP Human transthyretin (TTR) complexed with (R)-3-(9H-fluoren-9-ylideneaminooxy)-2-methyl-N-(methylsulfonyl) propionamide in a dual binding mode 提交 2014-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 48R (2R)-3-[(9H-fluoren-9-ylideneamino)oxy]-2-methyl-N-(methylsulfonyl)propanamide × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；293 K；Protein: 5 mg/ml in 0.05 M NaCl, 0.05 M sodium acetate, pH 5.5.
Precipitant: 60% (30% PEG-4K, 0.2 M imidazole malate, pH 6.0) and 40% (MPEG-5K, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5).
Cryoprotectant: 40% (25 % diethylene glycol, 12.5 % MPD, 37.5 % 2,3-butanediol, 12.5 % 1,4-dioxane), 12.5% MPEG 5K, 25% MPEG 550, 0.1 M (sodium propionate, sodium cacodylate, Bis-Tris-propane: 50% component A pH 4; 50% B pH 9.5) with 1 milli-M ligand.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.198 |
| 4WNJ Crystal structure of Transthyretin-quercetin complex 提交 2014-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 QUE 3,5,7,3',4'-PENTAHYDROXYFLAVONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Protein (5 mg/ml) in 20 mM sodium phosphate at pH 7. The reservoir solution was 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M KCl, 0.05 M sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.193 |
| 4WNS Crystal structure of Transthyretin complexed with pterostilbene 提交 2014-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 3RL Pterostilbene × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；The protein (5 mg/ml) was in 20 mM sodium phosphate at pH 7. Reservoir solution: 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M KCl, 0.05 M sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.186 |
| 4WO0 Crystal structure of transthyretin in complex with apigenin 提交 2014-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | AGI 5,7-dihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-4H-chromen-4-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；The protein (5 mg/ml) was in 20 mM sodium phosphate at pH 7. The reservoir solution was 2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M KCl, 0.05 M sodium phosphate, pH 7.0.
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.206 |
| 4Y9B Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with alpha-mangostin 提交 2015-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | MKS 1,3,6-trihydroxy-7-methoxy-2,8-bis(3-methylbut-2-en-1-yl)-9H-xanthen-9-one × 4 CL CHLORIDE ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；16% PEG400, 0.1M NaOAc, 0.2 M CaCl2
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.235 |
| 4Y9C Crystal structure of V30M mutated transthyretin with bromide in complex with alpha-mangostin 提交 2015-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | MKS 1,3,6-trihydroxy-7-methoxy-2,8-bis(3-methylbut-2-en-1-yl)-9H-xanthen-9-one × 4 BR BROMIDE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；20% PEG400, 0.092 M MES, 0.1 M KBr
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.240 |
| 4Y9E Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with gamma-mangostin 提交 2015-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | MKT 1,3,6,7-tetrahydroxy-2,8-bis(3-methylbut-2-en-1-yl)-9H-xanthen-9-one × 4 CL CHLORIDE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；16% PEG400, 0.1 M NaOAc, 0.2 M CaCl2
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.219 |
| 4Y9F Crystal structure of V30M mutated transthyretin with bromide in complex with gamma-mangostin 提交 2015-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | MKT 1,3,6,7-tetrahydroxy-2,8-bis(3-methylbut-2-en-1-yl)-9H-xanthen-9-one × 4 BR BROMIDE ION × 16 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；20% PEG400, 0.092 M MES, 0.1 M KBr
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.221 |
| 4Y9G Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with 3-isomangostin 提交 2015-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | MKU 5,9-dihydroxy-8-methoxy-2,2-dimethyl-7-(3-methylbut-2-en-1-yl)-3,4-dihydro-2H,6H-pyrano[3,2-b]xanthen-6-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；16% PEG400, 0.1 M NaOAc, 0.2 M CaCl2
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.258 |
| 4YDM High resolution crystal structure of human transthyretin bound to ligand and conjugates of 3-(5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)phenyl fluorosulfate 提交 2015-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 4AJ 2,6-dichloro-4-[5-(3-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]phenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor-diffusion sitting drop method. Crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 M sodium citrate, pH 5.5, containing 10% v/v glycerol
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.172 |
| 4YDN High resolution crystal structure of human transthyretin bound to ligand and conjugates of 4-(5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)phenyl fluorosulfate 提交 2015-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2WN 4-[5-(3,5-dichloro-4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]phenyl sulfurofluoridate × 4 4B8 2,6-dichloro-4-[5-(4-hydroxyphenyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl]phenol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；The wt-TTR was concentrated to 4 mg/ml in 10 mM NaPi, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature with inhibitors using the vapor-diffusion sitting drop method, crystals were grown from 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at ph 5.5. The crystals were frozen using a cryo-protectant solution of 1.395 m sodium citrate, ph 5.5, containing 10% v/v glycerol, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298.0
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.195 |
| 5A6I V122I Transthyretin structure in complex with Tolcalpone 提交 2015-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
|
突变：YES | TCW Tolcapone × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.86 Å R-free 0.271 |
| 5AKS Transthyretin binding heterogeneity and anti-amyloidogenic activity of natural polyphenols and their metabolites: resveratrol-3-O- glucuronide 提交 2015-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 R3X Resveratrol-3-O-glucuronide × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS OF WT HUMAN TTR- LIGAND COMPLEXES WERE OBTAINED AT ROOM TEMPERATURE IN ABOUT ONE WEEK BY CO-CRYSTALLIZATION, USING THE HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE PROTEIN (5 MG/ML), IN 20 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7, WAS INCUBATED WITH A FOUR-FOLD MOLAR EXCESS OF LIGANDS SOLUBILIZED IN DMSO. DROPS WERE FORMED BY MIXING EQUAL VOLUMES OF THE SOLUTION CONTAINING LIGAND-TTR COMPLEXES AND OF THE RESERVOIR/PRECIPITANT SOLUTION (2.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M KCL, 0.03 M SODIUM PHOSPHATE, PH 7.0).
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.188 |
| 5AKT Transthyretin binding heterogeneity and anti-amyloidogenic activity of natural polyphenols and their metabolites: resveratrol-4'-O- glucuronide 提交 2015-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 R4G Resveratrol-4'-O-glucuronide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS OF WT HUMAN TTR- LIGAND COMPLEXES WERE OBTAINED AT ROOM TEMPERATURE IN ABOUT ONE WEEK BY CO-CRYSTALLIZATION, USING THE HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE PROTEIN (5 MG/ML), IN 20 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7, WAS INCUBATED WITH A FOUR-FOLD MOLAR EXCESS OF LIGANDS SOLUBILIZED IN DMSO. DROPS WERE FORMED BY MIXING EQUAL VOLUMES OF THE SOLUTION CONTAINING LIGAND-TTR COMPLEXES AND OF THE RESERVOIR/PRECIPITANT SOLUTION (2.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M KCL, 0.03 M SODIUM PHOSPHATE, PH 7.0).
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.195 |
| 5AKV Transthyretin binding heterogeneity and anti-amyloidogenic activity of natural polyphenols and their metabolites: genistein-7-O- glucuronide 提交 2015-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
|
未记录 | G7G Genistein-7-O-glucuronide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS OF WT HUMAN TTR- LIGAND COMPLEXES WERE OBTAINED AT ROOM TEMPERATURE IN ABOUT ONE WEEK BY CO-CRYSTALLIZATION, USING THE HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE PROTEIN (5 MG/ML), IN 20 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7, WAS INCUBATED WITH A FOUR-FOLD MOLAR EXCESS OF LIGANDS SOLUBILIZED IN DMSO. DROPS WERE FORMED BY MIXING EQUAL VOLUMES OF THE SOLUTION CONTAINING LIGAND-TTR COMPLEXES AND OF THE RESERVOIR/PRECIPITANT SOLUTION (2.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M KCL, 0.03 M SODIUM PHOSPHATE, PH 7.0).
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.200 |
| 5AL0 Transthyretin binding heterogeneity and anti-amyloidogenic activity of natural polyphenols and their metabolites: resveratrol-3-O-sulfate 提交 2015-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 R3S RESVERATROL-3-O-SULFATE × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS OF WT HUMAN TTR- LIGAND COMPLEXES WERE OBTAINED AT ROOM TEMPERATURE IN ABOUT ONE WEEK BY CO-CRYSTALLIZATION, USING THE HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE PROTEIN (5 MG/ML), IN 20 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7, WAS INCUBATED WITH A FOUR-FOLD MOLAR EXCESS OF LIGANDS SOLUBILIZED IN DMSO. DROPS WERE FORMED BY MIXING EQUAL VOLUMES OF THE SOLUTION CONTAINING LIGAND-TTR COMPLEXES AND OF THE RESERVOIR/PRECIPITANT SOLUTION (2.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M KCL, 0.03 M SODIUM PHOSPHATE, PH 7.0).
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.209 |
| 5AL8 Transthyretin binding heterogeneity and anti-amyloidogenic activity of natural polyphenols and their metabolites: daidzein-7-O- glucuronide 提交 2015-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-147
|
未记录 | D75 DAIDZEIN-7-O-GLUCURONIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS OF WT HUMAN TTR- LIGAND COMPLEXES WERE OBTAINED AT ROOM TEMPERATURE IN ABOUT ONE WEEK BY CO-CRYSTALLIZATION, USING THE HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE PROTEIN (5 MG/ML), IN 20 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7, WAS INCUBATED WITH A FOUR-FOLD MOLAR EXCESS OF LIGANDS SOLUBILIZED IN DMSO. DROPS WERE FORMED BY MIXING EQUAL VOLUMES OF THE SOLUTION CONTAINING LIGAND-TTR COMPLEXES AND OF THE RESERVOIR/PRECIPITANT SOLUTION (2.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M KCL, 0.03 M SODIUM PHOSPHATE, PH 7.0).
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 5AYT Crystal structure of transthyretin in complex with L6 提交 2015-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | L6Y 2-oxidanyl-6-(phenylcarbonyl)benzo[de]isoquinoline-1,3-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；18% polyethylene glycol 400, 0.1 M HEPES-NaOH, 0.2 M CaCl2, 1 mM L6
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.209 |
| 5BOJ Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with Gemfibrozil 提交 2015-05-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | 4TX 5-(2,5-dimethylphenoxy)-2,2-dimethylpentanoic acid × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；TTRwt was dialyzed against 10 mM sodium phosphate with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg/ml. The resevoir contained 1.3-1.6 M sodium citrate and 3.5% glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.212 |
| 5CLX X-ray structure of perdeuterated TTR mutant - S52P at 1.28A resolution 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：S52P 突变：S52P | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2.1M di-sodium malonate
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.176 |
| 5CLY X-ray structure of TTR mutant - S52P at 1.23A resolution 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：residues 21-147
|
突变：S52P 突变：S52P | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2.5M di-sodium malonate
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.186 |
| 5CLZ X-ray structure of TTR mutant - T119M at 1.22A resolution 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
突变：T119M 突变：T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；2.1M di-sodium malonate
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.197 |
| 5CM1 X-ray structure of perdeuterated TTR mutant - T119M at 1.22A 提交 2015-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
突变：T119M 突变：T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；2.4M di-sodium malonate
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.196 |
| 5CN3 X-ray structure of wild-type TTR at 1.30A resolution 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；2.15M di-sodium malonate
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.180 |
| 5CNH X-ray structure of perdeuterated wild-type TTR at 1.42A resolution 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：UNP residues 21-147
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2.4M di-sodium malonate
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.198 |
| 5CR1 Crystal structure of TTR/resveratrol/T4 complex 提交 2015-07-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
未记录 | T44 3,5,3',5'-TETRAIODO-L-THYRONINE × 2 STL RESVERATROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；The protein (5 mg/ml), in 20 mM sodium phosphate, pH 7 was incubated with a reservoir solution containing 2.2 M ammonium sulphate, 0.1 M KCl, 0.03 M sodium phosphate, pH 7.0.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.193 |
| 5DEJ Transthyretin natural mutant A19D 提交 2015-08-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
突变：A19D 突变：A19D | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2 and 28% PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.207 |
| 5DEJ Transthyretin natural mutant A19D 提交 2015-08-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 30-145
|
突变：A19D 突变：A19D | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2 and 28% PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.207 |
| 5DWP Crystal Structure of human transthyretin (TTR) processed with the CrystalDirect automated mounting and cryo-cooling technology 提交 2015-09-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 31-145
链 B
30–145（116 aa）
片段：UNP residues 31-145
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium citrate,
1.6 M ammonium sulfate,
pH=5.0
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.196 |
| 5E23 Human transthyretin (TTR) complexed with (2,7-Dibromo-fluoren-9-ylideneaminooxy)-acetic acid 提交 2015-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | L32 {[(2,7-dibromo-9H-fluoren-9-ylidene)amino]oxy}acetic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Protein: 10mg/ml in .1 M NaCl, .050 M Na acetate, pH 5.5.
Complex: 3 micro-L TTR + 3 micro-L 0.02% azide + 1 micro-L inhibitor (.001 M)
Precipitant: 18% PEG4K, 9% PEG10K, 0.12 M imidazole malate pH 6.0, 0.04 M ammonium acetate, pH 4.5.
Cryoprotectant: 10 % diethylene glycol + 5 % MPD + 15 % 2,3-butanediol + 5 % 1,4-dioxane, 12.5% MPEG 5K, 0.1 M mixed ( Na acetate, ADA, Bicine) 60% pH 4 / 40% pH 9)
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.197 |
| 5E4A Human transthyretin (TTR) complexed with (2,7-Dichloro-fluoren-9-ylideneaminooxy)-acetic acid. 提交 2015-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
10–146（137 aa）
链 B
10–146（137 aa）
|
未记录 | 5JW {[(2,7-dichloro-9H-fluoren-9-ylidene)amino]oxy}acetic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Protein: TTR at 5 mg/ml + 1.6 milli-M inhibitor.
Precipitant: 18% PEG4K, 0.08M imidazole
malate, pH 6.0 and 13.5% PEG10K, 0.06M ammonium acetate, pH 4.5
Cryoprotectant: 10% diethylene glycol + 5% MPD + 15% 2,3-butanediol + 5% 1,4-dioxane, 25% MPEG 5K, 0.1 M mixed (Na acetate, ADA, Bicine - 60% at pH 4/40% at pH 10)
1 milli-M inhibitor.
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.192 |
| 5E4O Human transthyretin (TTR) complexed with (Z)-((3,4-Dichloro-phenyl)-methyleneaminooxy)-acetic acid 提交 2015-10-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–146（117 aa）
片段：UNP residues 30-146
链 B
30–146（117 aa）
片段：UNP residues 30-146
|
未记录 | L57 ({(Z)-[(3,4-dichlorophenyl)(phenyl)methylidene]amino}oxy)acetic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Protein: 5mg/ml TTR and 1 milli-M inhibitor.
Precipitant: 25% PEG4K, 0.2M imidazole malate, pH 6.0. Slow dessication over 18 months, rehydrated over 4 hours.
Cryoprotectant: 40% CryoSol SM1, 25% MPEG 5K, 0.1M (Na acetate, ADA, Bicine, 80% pH 4.0/20% pH 9.0)
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 5EN3 Crystal structure of human transthyretin in complex with luteolin-Cl at 1.25 A resolution 提交 2015-11-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 7LU 2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]-7-chloranyl-5-oxidanyl-chromen-4-one × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；Purified TTR was dialyzed against 10 mM Naphosphate buffer with 100 mM KCl, pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. Crystallization solution contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5% glycerol.
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.158 |
| 5FO2 Structure of human transthyretin mutant A108I 提交 2015-11-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 28% PEG400, 0.2M CACL2
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.215 |
| 5FW6 Structure of human transthyretin mutant A108V 提交 2016-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.30 Å R-free 0.203 |
| 5FW6 Structure of human transthyretin mutant A108V 提交 2016-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
链 B
21–147（127 aa）
片段：RESIDUES 21-147
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.30 Å R-free 0.203 |
| 5FW7 Structure of human transthyretin mutant A109V 提交 2016-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.20 Å R-free 0.185 |
| 5FW8 Structure of human transthyretin mutant E89K 提交 2016-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å R-free 0.204 |
| 5FW8 Structure of human transthyretin mutant E89K 提交 2016-02-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å R-free 0.204 |
| 5H0V Crystal structure of H88A mutated human transthyretin 提交 2016-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
链 B
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
链 C
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
链 D
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
|
突变：H88A 突变：H88A 突变：H88A 突变：H88A | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；16% (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol, 0.2 M MgCl2, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.209 |
| 5H0W Crystal structure of H88F mutated human transthyretin 提交 2016-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
|
突变：H88F | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 25% glycerol, 0.1 M MES
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 5H0X Crystal structure of H88S mutated human transthyretin 提交 2016-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
链 B
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
|
突变：H88S 突变：H88S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 25% glycerol, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.253 |
| 5H0Y Crystal structure of H88Y mutated human transthyretin 提交 2016-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
|
突变：H88Y | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；2.0 M ammonium sulfate, 25% glycerol, 0.1 M MES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 5H0Z Crystal structure of P113A mutated human transthyretin 提交 2016-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–147（117 aa）
片段：UNP residues 31-147
|
突变：P113A | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；1.6 M Ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.257 |
| 5HJG Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with Tetrabromobisphenol A (TBBPA) 提交 2016-01-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | XDI 4,4'-propane-2,2-diylbis(2,6-dibromophenol) × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.182 |
| 5IHH Crystal structure of human transthyretin in complex with luteolin-MeO at 1.35 A resolution 提交 2016-02-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6B5 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5-hydroxy-7-methoxy-4H-1-chromen-4-one × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. 7MeOLut was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.166 |
| 5JID Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with Perfluorooctanoic acid (PFOA) 提交 2016-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 8PF pentadecafluorooctanoic acid × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. PFOA was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter.
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.163 |
| 5JIM Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with Perfluoroktansulfonsyra (PFOS) 提交 2016-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | P8S heptadecafluoro-1-octanesulfonic acid × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. PFOS was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter.
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.158 |
| 5JIQ Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with 2,2',4,4'-tetrahydroxybenzophenone (BP2) 提交 2016-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 27M bis(2,4-dihydroxyphenyl)methanone × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. BP2 was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent
glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.168 |
| 5K1J Human TTR altered by a rhenium tris-carbonyl Pyta-C8 derivative 提交 2016-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 6 RE RHENIUM × 4 IMD IMIDAZOLE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；protein: 10 mg/ml Dialysed in 100 milli-M NaCl, 50 milli-M sodium acetate, pH 5.5
precipitant: 21% polyethylene glycol 4,000 (PEG4K), 0.14 M imidazole malate, pH 6.0
cryosoak: 40% SM2 (12.5 % ethylene glycol, 12.5 % glycerol, 12.5 %
1,2-propanediol, 25 % DMSO and 37.5% 1,4-dioxane) 50% PEG 8K and 0.2 milli-M of rhenium tris-carbonyl Pyta-C8 derivative.
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.222 |
| 5K1N Human TTR altered by a rhenium tris-carbonyl Pyta-C12 derivative 提交 2016-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–147（118 aa）
链 B
30–147（118 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 RE RHENIUM × 6 ACT ACETATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；protein: 10 mg/ml Dialysed in 100 milli-M NaCl, 50 milli-M sodium acetate, pH 5.5
precipitant: 21% polyethylene glycol 4,000 (PEG4K), 0.14 M imidazole malate, pH 6.0 + 3.6% polyethylene glycol monomethyl ether (MPEG5K), 30 mM sodium
acetate pH 5.5
cryosoak: 40% SM3 (25 % diethylene glycol + 25 % ethylene glycol + 25 % glycerol + 25 % 1,4-dioxane) 50% PEG 8K and 0.5 milli-M of rhenium tris-carbonyl Pyta-C12 derivative.
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.224 |
| 5L4F Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with 2,6-Dinitro-p-cresol (DNPC) 提交 2016-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6J1 2,6-Dinitro-p-cresol × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. DNPC was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.194 |
| 5L4I Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with Clonixin 提交 2016-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6J3 2-(3-chloro-2-methylanilino)pyridine-3-carboxylic acid × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. Clonixin was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.179 |
| 5L4J Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with 4,4'-Dihydroxydiphenyl sulfone (Bisphenol S, BPS) 提交 2016-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6JD 4-(4-hydroxyphenyl)sulfonylphenol × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. BPS was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.216 |
| 5L4M Crystal Structure of Human Transthyretin in Complex with 3,5,6-Trichloro-2-pyridinyloxyacetic acid (Triclopyr) 提交 2016-05-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | SBK Triclopyr × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodium phosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. Triclopyr was added at 5 x molar excess to the protein. The reservoir contained 1.3 to 1.6 M sodium citrate and 3.5 percent glycerol at pH 5.5. Drop size 3 plus 3 microliter
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.198 |
| 5LLL Crystal structure of DACM wild type Transthyretin 提交 2016-07-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M CaCl2
0.1 M HEPES sodium pH 7.5
28% v/v PEG 400
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.217 |
| 5LLV Crystal structure of DACM F87M/L110M Transthyretin mutant 提交 2016-07-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.2 M CaCl2
0.1 M Sodium Acetate pH 4.6
20% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 5N5Q Human TTR altered conformation from soaking in iron chloride. 提交 2017-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 6 FFE [bis(oxidanyl)-[tetrakis(oxidanyl)ferriooxy]ferrio]oxy-pentakis(oxidanyl)iron × 2 FE FE (III) ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；protein: 10 mg/ml Dialysed in 100 milli-M NaCl, 50 milli-M sodium acetate, pH 5.5 precipitant: 27 % polyethylene glycol 4,000, 0.2 M imidazole malate, pH 6.0. cryosoak: 40%
SM3 (, 25 % MPEG 5K, 25 %
diethylene glycol + 25 % ethylene glycol + 25 % glycerol + 25 % 1,4-dioxane) 25 % MPEG 5K,
0.1 M CHC (citric acid, HEPES, CHES: 90 % acid /10 % basic), 30 mM FeCl2, 2 h soak.
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.253 |
| 5N62 Human TTR crystals soaked in manganese chloride. 提交 2017-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–146（117 aa）
链 B
30–146（117 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；protein: 10 mg/ml Dialysed in 100 milli-M NaCl, 50 milli-M sodium acetate, pH 5.5 precipitant: 26% polyethylene glycol 4,000 (PEG4K), 0.16 M imidazole malate, pH 6.0 cryosoak: 40 % CM7 (12.5 % di-ethylene glycol + 12.5 % ethylene glycol + 12.5 % glycerol + 25 % 1,2-propanediol + 12.5 % DMSO), 25 % MPEG 5K, 5 mM MnCl2, 10 min soak.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 5N7C Human TTR altered conformation from soaking in CuCl2. 提交 2017-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–147（118 aa）
链 B
30–147（118 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；protein: 10 mg/ml Dialysed in 100 milli-M NaCl, 50 milli-M sodium acetate, pH 5.5 Precipitant: 21 % PEG4K, .14 M imidazole malate, pH 6.0, 3.6% MPEG 5K, 0.03 M sodium acetate, pH 5.5 cryosoak: 40% CM1 (12.5 % di-ethylene glycol + 12.5 % MPD + 37.5 % 1,2-propanediol + 12.5 % DMSO ), 25 % MPEG 5K,0.1 M CHC (citric acid, HEPES, CHES) 90 % acid at pH 4.0 / 10 % basic at pH 10.0), 30 min soak.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.254 |
| 5NFE Neutron structure of human transthyretin (TTR) T119M mutant at room temperature to 1.85A resolution 提交 2017-03-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.9M sodium malonate pD5.9, 40mg/ml protein
|
分辨率未提供 |
| 5NFW Neutron structure of human transthyretin (TTR) S52P mutant at room temperature to 1.8A resolution (quasi-Laue) 提交 2017-03-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9M sodium malonate pD 6.4, 25mg/ml protein
|
分辨率未提供 |
| 5OQ0 Crystal structure of transthyretin mutant 87-110-117 提交 2017-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
|
突变：F87M/L110M/S117E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium phosphate (pH 7.5), 2.2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.267 |
| 5TTR LEU 55 PRO TRANSTHYRETIN CRYSTAL STRUCTURE 提交 1998-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å |
| 5TTR LEU 55 PRO TRANSTHYRETIN CRYSTAL STRUCTURE 提交 1998-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P 突变：L55P 突变：L55P | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å |
| 5TTR LEU 55 PRO TRANSTHYRETIN CRYSTAL STRUCTURE 提交 1998-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å |
| 5TZL Structure of transthyretin in complex with the kinetic stabilizer 201 提交 2016-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IIH 4-(7-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)-2,6-diiodophenol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；WT-TTR at 4 mg/mL and five-fold molar excess compound 201 crystallized from solution containing 1.395 M sodium citrate, 3.5% v/v glycerol at pH 5.5. Crystals cryoprotected by addition of 10% (v/v) glycerol.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.167 |
| 5U48 Wild-type Transthyretin in complex with 5-[(1E)-2-(4-Boronic acid)ethenyl]-1,3-benzenediol 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | S4B {4-[(E)-2-(3,5-dihydroxyphenyl)ethenyl]phenyl}boronic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% glycerol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.205 |
| 5U49 Wild-type Transthyretin in complex with 5-[(1E)-2-(2-Chloro-4-hydroxyphenyl)ethenyl]-1,3-benzenediol 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
|
未记录 | S2L 5-[(E)-2-(2-chloro-4-hydroxyphenyl)ethenyl]benzene-1,3-diol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.275 |
| 5U4A Wild-type Transthyretin in complex with 5-[(1E)-2-(2-Chloro-4-boronic acid)ethenyl]-1,3-benzenediol 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 7VG {3-chloro-4-[(E)-2-(3,5-dihydroxyphenyl)ethenyl]phenyl}boronic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.276 |
| 5U4B Wild-type Transthyretin in complex with 3-[(1E)-2-(4-Hydroxyphenyl)ethenyl]benzoic Acid 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | XOS 3-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.207 |
| 5U4C Wild-type Transthyretin in complex with 3-[(1E)-2-(4-Boronic acid)ethenyl]benzoic Acid 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | XBS 3-[(E)-2-(4-boronophenyl)ethenyl]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 5U4D Wild-type Transthyretin in complex with 3-[(1E)-2-(2-Chloro-4-hydroxyphenyl)ethenyl]benzoic Acid 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | XLO 3-[(E)-2-(2-chloro-4-hydroxyphenyl)ethenyl]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.243 |
| 5U4E Wild-type Transthyretin in complex with 3-[(1E)-2-(2-Chloro-4-boronic acid)ethenyl]benzoic Acid 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | XLB 3-[(E)-2-(4-borono-2-chlorophenyl)ethenyl]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.198 |
| 5U4F Wild-type Transthyretin in complex with 1,1'-(1E)-(1,2-Ethenediyl)bis[2-chloro-4-boronic acid]benzene 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | IWW [(E)-ethene-1,2-diylbis(3-chloro-4,1-phenylene)]diboronic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.220 |
| 5U4G Wild-type Transthyretin in complex with 2-Boronic Acid-1-[(1E)-2-(3-boronic acid)ethenyl]-4-chlorobenzene 提交 2016-12-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 7UV (3-{(E)-2-[2-chloro-4-(hydroxyboranyl)phenyl]ethenyl}phenyl)boronic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M Sodium Citrate, 3.0% Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 6D0W Structure of human transthyretin complex with analgesic inhibitor 提交 2018-04-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | FQ7 2-[(3,5-dichlorophenyl)amino]benzoic acid × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M MES, pH 5.5, PEG 4K, 150 mM AmSO4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.261 |
| 6E6Z Structure of Wild Type Human Transthyretin in Complex with Tafamidis 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
未记录 | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 6E70 Structure of Wild Type Human Transthyretin in Complex with Diflunisal 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
未记录 | 1FL 5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-2-HYDROXY-BENZOIC ACID × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.229 |
| 6E71 Structure of Human Transthyretin Val30Met/Thr119Met Mutant 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：V30M,T119M 突变：V30M,T119M | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris, 30% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 6E72 Structure of Human Transthyretin Val30Met Mutant in Complex with Tafamidis 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：V30M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V30M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.2M Lithium Sulfate Monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.205 |
| 6E73 Structure of Human Transthyretin Val30Met Mutant in Complex with Diflunisal 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 1FL 5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-2-HYDROXY-BENZOIC ACID × 4 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% (W/V) PEG-1000, 0.1M Imidazole, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 6E74 Structure of Human Transthyretin Leu55Pro Mutant in Complex with Tafamidis 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：L55P 突变：L55P | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.05 M calcium chloride dihydrate, 0.1 M Bis-Tris, 30% PEG monomethyl ether 550
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.209 |
| 6E75 Structure of Human Transthyretin Asp38Ala Mutant 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：D38A 突变：D38A | ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；30% (v/v) PEG 400, 100 mM Sodium acetate, 200 mM Calcium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.207 |
| 6E76 Structure of Human Transthyretin Asp38Ala/Thr119Met Mutant 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：D38A, T119M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D38A, T119M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；50% (w/v) PEG-400, 0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Sodium Acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.216 |
| 6E77 Structure of Human Transthyretin Asp38Ala Mutant in Complex with Tafamidis 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：D38A 突变：D38A | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；2.0M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium citrate, 0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.202 |
| 6E78 Structure of Human Transthyretin Asp38Ala Mutant in Complex with Diflunisal 提交 2018-07-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：D38A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D38A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 1FL 5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-2-HYDROXY-BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；30% (W/V) PEG-400, 0.1M Sodium Acetate, 0.2M Calcium Acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.213 |
| 6EOY Transthyretin in complex with 4-(1,3-Benzothiazol-2-yl)-2-methylaniline 提交 2017-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
未记录 | BM8 4-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-methyl-aniline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；acetate buffer 0.2 M pH 4.8-5.4, ammonium sulfate 1.8-2.2 M, 7% glycerol
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.195 |
| 6EP1 Transthyretin in complex with 5-(4-nitrophenylazo)-3-iodosalicylic acid 提交 2017-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
片段：UNP Residues 30-144
链 B
30–144（115 aa）
片段：UNP Residues 30-144
|
未记录 | BQB 5-(4-nitrophenylazo)-3-iodosalicylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；acetate buffer 0.2 M pH 4.8-5.4, ammonium sulfate 1.8-2.2 M, 7% glycerol
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.190 |
| 6FFT Neutron structure of human transthyretin (TTR) S52P mutant in complex with tafamidis at room temperature to 2A resolution (quasi-Laue) 提交 2018-01-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：P52S 突变：P52S | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 4 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.3M sodium malonate pD 5.9
|
分辨率未提供 |
| 6FWD Crystal structure of human transthyretin double mutant R34G/T119M at pH 5.5 提交 2018-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：R34G, T119M 突变：R34G, T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；7% glycerol, 1.3 M sodium citrate, pH 5.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.229 |
| 6FXU Crystal structure of human transthyretin mutant T119M at pH 5.5 提交 2018-03-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：T119M 突变：T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；7% glycerol, 1.3 M sodium citrate, pH 5.5.
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.216 |
| 6FZL Crystal structure of human transthyretin double mutant K35T/T119M 提交 2018-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：K35T, T119M 突变：K35T, T119M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；7% glycerol, 1.3 M sodium citrate, pH 5.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.192 |
| 6GR7 Crystal Structure Of Human Transthyretin in complex with 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid (2,4,5-T) 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | F52 2-[2,4,5-tris(chloranyl)phenoxy]ethanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；The purified human TTR was dialyzed against 10 mM Na-phosphate buffer with 100 mM KCl (pH 7.6) and concentrated to 5 mg/mL The reservoir contained 28% PEG 4K, 0.1M NaAc pH 4.5, 0.2M AmAc. Drop size 3 plus 3 microliter.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.188 |
| 6GRP Crystal Structure Of Human Transthyretin in complex with 3,5,6-trichloro-2-pyridinol (TC2P) 提交 2018-06-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | F4Z 3,5,6-trichloro-2-pyridinol × 8 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Purified TTRwt was dialyzed against 10 mM sodiumphosphate buffer with 100 mM KCl pH 7.6 and concentrated to 5 mg per ml. TC2P was added at 5 x molar excess to the protein. The 1.65 M NaCitrate pH 5.5, 5.8-8.6 % glycerol.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.187 |
| 6IMX Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with 18-Crown-6 提交 2018-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27% PEG400, 0.1 M MES pH 6.5, 0.4 M CaCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.224 |
| 6IMY Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with 4'-caroboxybenzo-18-Crown-6 提交 2018-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | AJU 2,3,5,6,8,9,11,12,14,15-decahydro-1,4,7,10,13,16-benzohexaoxacyclooctadecine-18-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；27% PEG400, 0.1 M MES pH 6.5, 0.4 M CaCl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.209 |
| 6KGB Crystal structure of E61K mutated transthyretin 提交 2019-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–146（146 aa）
链 B
1–146（146 aa）
|
突变：E61K 突变：E61K | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；27% PEG400, 0.2 M CaCl2, 0.1 M MES-NaOH pH 6.5
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.177 |
| 6R66 Crystal structure of transthyretin in complex with CHF5075, a flurbiprofen analogue 提交 2019-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | JTN 1-[4-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-3-fluoranyl-phenyl]cyclopropane-1-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1M KCl, 30 mM sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.192 |
| 6R67 Crystal structure of transthyretin in complex with CHF5075, a flurbiprofen analogue 提交 2019-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | JTE (2~{R})-2-[4-(3,5-dimethylphenyl)-3-fluoranyl-phenyl]propanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1M KCl, 30 mM sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.205 |
| 6R68 Crystal structure of transthyretin in complex with CHF4795, a flurbiprofen analogue 提交 2019-03-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | JTK (2~{R})-2-[4-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-3-fluoranyl-phenyl]propanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1M KCl, 30 mM sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.198 |
| 6R6I Crystal structure of transthyretin mutant A25T in complex with CHF5074, a flurbiprofen analogue 提交 2019-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | H50 1-(3',4'-dichloro-2-fluorobiphenyl-4-yl)cyclopropanecarboxylic acid × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1M KCl, 30 mM sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.218 |
| 6SDZ transthyritin derived amyloid fibril from patient with hereditary V30M ATTR amyloidosis 提交 2019-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
链 I
21–147（127 aa）
链 J
21–147（127 aa）
链 K
21–147（127 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Water extract
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 6SUG Crystal structure of transthyretin in complex with 3-deoxytolcapone, a tolcapone analogue 提交 2019-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | LVB 3-deoxytolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1M KCl, 30 mM sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.170 |
| 6SUH Crystal structure of human transthyretin in complex with 3-O-methyltolcapone, a tolcapone analogue 提交 2019-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | LVE 3-O-methyltolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.1M KCl, 30 mM sodium phosphate, pH 7.0
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.179 |
| 6TI9 Human transthyretin (TTR) complexed with (E)-3-(((3,5-dibromo-2-hydroxybenzylidene)amino)oxy)propanoic acid. 提交 2019-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | ND5 3-[(~{E})-[3,5-bis(bromanyl)-2-oxidanyl-phenyl]methylideneamino]oxypropanoic acid × 4 GOL GLYCEROL × 2 PGO S-1,2-PROPANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Protein: 4.93 mg/mL, Tris pH 8.0, 150mM NaCl. Precipitant: 24% PEG 600, 0.2M imidazole malate pH 5.5.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.182 |
| 6TJN Human transthyretin (TTR) complexed with (E)-3-(((4-hydroxybenzylidene)amino)oxy)propanoic acid 提交 2019-11-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | NEK 3-[(~{E})-(4-hydroxyphenyl)methylideneamino]oxypropanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein: 4.93 mg/mL, Tris pH 8.0, 150mM NaCl. Reservoir: 24% PEG 600, 0.2 Imidazole Malate pH 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.193 |
| 6TXV A25T Transthyretin structure in complex with Tolcalpone 提交 2020-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
突变：A25T 突变：A25T | TCW Tolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.2M CaCl2, 25% PEG400, 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 6TXW V30G Transthyretin structure in complex with Tolcalpone 提交 2020-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | TCW Tolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M CaCl2, 30% PEG400, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.185 |
| 6U0Q Transthyretin in complex with (E)-5,5'-(ethene-1,2-diyl)bis(1,1-dihydroxy-3-oxo-1,3-dihydrobenzo[c][1,2]oxaborol-1-uide) 提交 2019-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | S2B 3-[(~{E})-2-[7,7-bis(oxidanyl)-9-oxidanylidene-8-oxa-7-boranuidabicyclo[4.3.0]nona-1,3,5-trien-3-yl]ethenyl]-7,7-bis(oxidanyl)-8-oxa-7-boranuidabicyclo[4.3.0]nona-1(6),2,4-trien-9-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.3 M sodium citrate, 2% v/v glycerol
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 6XTK Y114C Transthyretin structure in complex with Tolcalpone 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
突变：Y114C 突变：Y114C | TCW Tolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M CaCl2, 30% PEG400, 0.1M HEPES, pH 7.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.220 |
| 7ACU Crystal structure of human transthyretin in complex with Benzbromarone 提交 2020-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
未记录 | R75 [3,5-bis(bromanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-(2-ethyl-1-benzofuran-3-yl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；0.2 M acetate buffer pH 4.8, 2.2 M ammonium sulfate, 7% glycerol
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.214 |
| 7DT3 Crystal structure of human transthyretin in complex with 4-chloro-9,10-dioxo-9,10-dihydroanthracene-2-carboxylic acid 提交 2021-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 HG6 4-chloranyl-9,10-bis(oxidanylidene)anthracene-2-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG400, CaCl2, sodium acetate
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.186 |
| 7DT5 Crystal structure of human transthyretin in complex with 4-chloro-9-oxo-9H-xanthene-2-carboxylic acid 提交 2021-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 HH9 4-chloranyl-9-oxidanylidene-xanthene-2-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.185 |
| 7DT6 Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with purpurin 提交 2021-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | 9TF Purpurin × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaC2l, NaOAc
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.211 |
| 7DT8 Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with 4-chloro-9-oxo-9H-xanthene-2-carboxylic acid 提交 2021-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 HH9 4-chloranyl-9-oxidanylidene-xanthene-2-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.177 |
| 7EJQ Crystal structure of human transthyretin in complex with 8-chloro-9-oxo-9H-xanthene-3-carboxylic acid 提交 2021-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–146（146 aa）
链 B
1–146（146 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 J5R 8-chloranyl-9-oxidanylidene-xanthene-3-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.167 |
| 7EJR Crystal structure of V30M mutated transthyretin in complex with 8-chloro-9-oxo-9H-xanthene-3-carboxylic acid 提交 2021-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–146（146 aa）
链 B
1–146（146 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 J5R 8-chloranyl-9-oxidanylidene-xanthene-3-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.207 |
| 7ERH Crystal structure of WT-TTR in complex with bithionol 提交 2021-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | B1T 2,2'-sulfanediylbis(4,6-dichlorophenol) × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, Tris-HCl pH 8, bithionol
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.218 |
| 7ERI Crystal structure of V30M-TTR in complex with triclabendazole 提交 2021-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V50M 突变：V50M | JA9 6-[2,3-bis(chloranyl)phenoxy]-5-chloranyl-2-methylsulfanyl-1H-benzimidazole × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.222 |
| 7ERJ Crystal structure of V30M-TTR in complex with dichlorophen 提交 2021-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V50M 突变：V50M | JAL 4-chloranyl-2-[(5-chloranyl-2-oxidanyl-phenyl)methyl]phenol × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc, dichlorophen
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.211 |
| 7ERK Crystal structure of V30M-TTR in complex with dasatinib 提交 2021-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V50M 突变：V50M | 1N1 N-(2-CHLORO-6-METHYLPHENYL)-2-({6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-2-METHYLPYRIMIDIN-4-YL}AMINO)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, CaCl2, NaOAc
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 7OB4 Cryo-EM structure of a twisted-dimer transthyretin amyloid fibril from vitreous body of the eye 提交 2021-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
链 I
21–147（127 aa）
链 J
21–147（127 aa）
链 K
21–147（127 aa）
链 L
21–147（127 aa）
链 M
21–147（127 aa）
链 N
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 7Q3I Human Transthyretin expressed in Vibrio natriegens 提交 2021-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 AAA
21–147（127 aa）
链 BBB
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291.15 K；11.6 mg/mL protein in PBS pH 7.4 mixed 1:1 with MgFormate 0.1 M, 24 % PEG1000.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.227 |
| 7Q9L Transthyretin complexed with (E)-4-(2-(naphthalen-1-yl)vinyl)benzene-1,2-diol 提交 2021-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
链 B
29–147（119 aa）
|
未记录 | 9RJ 4-[(~{E})-2-naphthalen-1-ylethenyl]benzene-1,2-diol × 4 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；TTR:SB11 complex at 5.2mg/ml in 10mM sodium phosphate pH7.6 and 100mM potassium chloride was mixed 1:1 with
1.3-1.6M sodium citrate and 3.5% glycerol.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.163 |
| 7Q9N Transthyretin complexed with (E)-4-(2-(naphthalen-2-yl)vinyl)benzene-1,2-diol 提交 2021-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
链 B
29–147（119 aa）
|
未记录 | 9PS 4-[(~{E})-2-naphthalen-2-ylethenyl]benzene-1,2-diol × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；TTR:SB14 complex at 5.2mg/ml in 10mM sodium phosphate pH7.6 and 100mM potassium chloride was mixed 1:1 with
1.3-1.6M sodium citrate and 3.5% glycerol.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.171 |
| 7Q9O Complex of Transthyretin with resveratrol exhibits multiple binding modes 提交 2021-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
链 B
29–147（119 aa）
|
未记录 | STL RESVERATROL × 4 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；protein at 5.2mg/ml in 10mM sodium phosphate pH7.6 and 100mM potassium chloride was mixed 1:1 with
1.3-1.6M sodium citrate and 3.5% glycerol.
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.175 |
| 7QC5 Crystal structure of human wild type transthyretin in complex with (3,4-dihydroxy-5-nitrophenyl)-(3-fluoro-5-hydroxyphenyl)methanone compound 提交 2021-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | AQI (3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)-[3-nitro-4,5-bis(oxidanyl)phenyl]methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG 400, hepes, calcium chloride
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.175 |
| 7THA Crystal structure of human transthyretin variant C10A/M13V 提交 2022-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：C10A, M13V 突变：C10A, M13V | CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Crystals of TTR C10A/M13V were grown at 23 degrees C using sitting-drop vapor diffusion by mixing 0.2 microliters of 5 mg/mL protein in 50 mM Tris pH 7.8 and 0.2 microliters of a crystallization buffer consisting of 0.19M CaCl2, 5% (v/v) glycerol, 0.095M HEPES pH 7.5, and 26.6% (v/v) PEG 400. Crystals were frozen directly without additional cryo-protection by plunging in liquid nitrogen
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.211 |
| 7W9Q Crystal structure of V30M-TTR in complex with naringenin derivative-14 提交 2021-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | 90Q (2~{R})-2-(3-chloranyl-4-oxidanyl-phenyl)-5,7-bis(oxidanyl)-2,3-dihydrochromen-4-one × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, NaOAc, CaCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 7W9R Crystal structure of V30M-TTR in complex with naringenin derivative-18 提交 2021-12-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | 91C (2~{R})-2-[3,5-bis(chloranyl)-4-oxidanyl-phenyl]-5,7-bis(oxidanyl)-2,3-dihydrochromen-4-one × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, NaOAc, CaCl2
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.225 |
| 7WL6 Crystal structure of I73L mutated human transthyretin 提交 2022-01-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：I73L 突变：I73L | MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；24% PEG400, 0.2 M magnesium acetate, 5% glycerol, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.210 |
| 7Y1I Crystal Structure of TTR-G67R 提交 2022-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
链 F
1–147（147 aa）
链 I
1–147（147 aa）
链 J
1–147（147 aa）
链 K
1–147（147 aa）
链 L
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；AMMONIUM SULFATE, PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.314 |
| 7Y1I Crystal Structure of TTR-G67R 提交 2022-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 G
1–147（147 aa）
链 H
1–147（147 aa）
链 M
1–147（147 aa）
链 N
1–147（147 aa）
链 O
1–147（147 aa）
链 P
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；AMMONIUM SULFATE, PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.314 |
| 7Y1I Crystal Structure of TTR-G67R 提交 2022-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 Q
1–147（147 aa）
链 R
1–147（147 aa）
链 S
1–147（147 aa）
链 T
1–147（147 aa）
链 U
1–147（147 aa）
链 V
1–147（147 aa）
链 W
1–147（147 aa）
链 X
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；AMMONIUM SULFATE, PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.314 |
| 7Y6J Crystal structure of human transthyretin variant A97S at pH 5.4 提交 2022-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A97S 突变：A97S | GOL GLYCEROL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；1.75 M Ammonium sulfate, 0.01 M Citrate buffer, pH 5.4
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.191 |
| 7YBR Crystal structure of human transthyretin variant A97S complexed with Tolcapone 提交 2022-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A97S 突变：A97S | TCW Tolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；20% PEG 400, 200 mM Calcium Chloride, 100 mM HEPES
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.219 |
| 7YCQ Crystal structure of human transthyretin variant A97S complexed with Diflunisal 提交 2022-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A97S 突变：A97S | 1FL 5-(2,4-DIFLUOROPHENYL)-2-HYDROXY-BENZOIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.5 M Ammonium Sulfate, 0.01M citrate buffer; soaked with 800 micromolar Dilfunisal
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.222 |
| 7Z60 Human transthyretin (TTR) complexed with Quercetin 3-O-beta-D-galactoside 提交 2022-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 J6O 2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]-3-[(2S,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-5,7-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein: 5 mg/ml TTR dialysed against 0.1 M NaCl, 0.05M Na acetate, pH 5.5. Precipitant:80% (30% PEG 4000, 0.2 M Imidazole Malate pH 6.0), 15% ((12% MPEG 5000, 0.1 Sodium Acetate pH 5.5)
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.220 |
| 8ADE Wild type ATTR amyloid fibril from senile systemic amyloidosis 提交 2022-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 8AWI Crystal structure of Human Transthyretin at 1.15 Angstrom resolution 提交 2022-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
29–147（119 aa）
链 B
29–147（119 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；protein at 5.2mg/ml in 10mM sodium phosphate pH7.6 and 100mM potassium chloride was mixed 1:1 with 1.3-1.6M sodium citrate and 3.5% glycerol
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.166 |
| 8AWW Transthyretin conjugated with a tafamidis derivative 提交 2022-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–145（116 aa）
链 B
30–145（116 aa）
|
未记录 | OIT ~{N}-(6-azanylhexyl)-2-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-1,3-benzoxazole-6-carboxamide × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；1.4 M sodium citrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 8C85 Crystal structure of human transthyretin in complex with 3-O-methyltolcapone analogue 1 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | U1F (3,5-dimethylphenyl)(4-hydroxy-3-methoxy-5-nitrophenyl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M Tris 7.5, and 25% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.168 |
| 8C86 Crystal structure of human transthyretin in complex with 3-O-methyltolcapone analogue 2 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | TQ0 (2,4-dimethylphenyl)(4-hydroxy-3-methoxy-5-nitrophenyl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M Tris 7.5, and 25% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.158 |
| 8DW5 Complex of Human Transthyretin with 3',5'-Dichlorophenylanthranilic Acid 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
|
未记录 | FQ7 2-[(3,5-dichlorophenyl)amino]benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.71；298 K；1.3 M sodium citrate pH 5.71, 3% glycerol
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.235 |
| 8E7D Cryo-EM structure of wild-type transthyretin amyloid from heart tissue 提交 2022-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 8E7E Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTR I84S amyloidosis patient 提交 2022-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.61 Å |
| 8E7H Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a wild-type amyloidosis patient 提交 2022-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8E7I Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTR P24S amyloidosis patient 提交 2022-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
突变：P24S 突变：P24S 突变：P24S 突变：P24S 突变：P24S | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |
| 8E7J Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTR I84S amyloidosis patient 提交 2022-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8G9R Cardiac amyloid fibrils extracted from a wild-type ATTR amyloidosis patient 提交 2023-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；H2O, 5 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 8GBR Cardiac amyloid fibrils extracted from a wild-type ATTR amyloidosis patient 提交 2023-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；fibrils are in water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8HEJ Crystal structure of Transthyretin in complex with a covalent inhibitor trans-styrylpyrazole 提交 2022-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
31–144（114 aa）
链 B
31–144（114 aa）
|
未记录 | XHF 2,6-dibromo-4-[(E)-2-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)ethenyl]phenol × 4 XHB 2,4,6-trifluorobenzaldehyde × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；Sodium Citrate pH5.5,
Glycerol
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.223 |
| 8HY4 Crystal structure of human transthyretin variant A97S at pH 7.6 提交 2023-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A97S 突变：A97S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；278 K；0.1 M HEPES, pH 7.6, 38% PEG 400, and 0.4 M CaCl2
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.257 |
| 8I00 Crystal structure of A97S transthyretin 提交 2023-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A97S 突变：A97S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M Sodium citrate tribasic dihydrate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.209 |
| 8I0O Crystal structure of Transthyretin variant A97S in monomeric form 提交 2023-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：F87M, L110M, A97S 突变：F87M, L110M, A97S 突变：F87M, L110M, A97S 突变：F87M, L110M, A97S | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1 M Sodium HEPES; MOPS (acid),
0.3M Sodium fluoride; 0.3M Sodium bromide; 0.3M Sodium iodide,
25% v/v MPD; 25% PEG 1000; 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.234 |
| 8IG1 Crystal structure of wild-type transthyretin in complex with rafoxanide 提交 2023-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | OX9 ~{N}-[3-chloranyl-4-(4-chloranylphenoxy)phenyl]-3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-benzamide × 4 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, sodium acetate pH 4.6
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.193 |
| 8II1 Crystal structure of V30M-TTR in complex with BID 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PJO Benziodarone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, CaCl2, Sodium acetate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.231 |
| 8II2 Crystal structure of V30M-TTR in complex with BBM 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | R75 [3,5-bis(bromanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-(2-ethyl-1-benzofuran-3-yl)methanone × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, CaCl2, Sodium acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 8II3 Crystal structure of V30M-TTR in complex with 6-hydroxy BID 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PKK [3,5-bis(iodanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-(2-ethyl-6-oxidanyl-1-benzofuran-3-yl)methanone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, CaCl2, Sodium acetate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.212 |
| 8II4 Crystal structure of V30M-TTR in complex with 6-hydroxy BBM 提交 2023-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PKQ [3,5-bis(bromanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-(2-ethyl-6-oxidanyl-1-benzofuran-3-yl)methanone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, CaCl2, Sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.199 |
| 8JNU Crystal structure of V30G mutated human transthyretin 提交 2023-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30G 突变：V30G | MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；PEG400, MgCl2, glycerol
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.207 |
| 8JOK Crystal structure of V30L mutated human transthyretin 提交 2023-06-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30L 突变：V30L | MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；293 K；PEG400, MgCl2, glycerol
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.215 |
| 8JQW Crystal structure of V30I mutated human transthyretin 提交 2023-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30I 突变：V30I | MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；PEG400, MgCl2, glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 8PKE ATTRV20I amyloid fibril from hereditary ATTR amloidosis 提交 2023-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
|
突变：V20I 突变：V20I 突变：V20I 突变：V20I 突变：V20I 突变：V20I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 8PKF ATTRG47E amyloid fibril from hereditary ATTR amloidosis 提交 2023-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
|
突变：G47E 突变：G47E 突变：G47E 突变：G47E 突变：G47E 突变：G47E | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.37 Å |
| 8PKG ATTRV122I amyloid fibril from hereditary ATTR amloidosis 提交 2023-06-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
|
突变：V122I 突变：V122I 突变：V122I 突变：V122I 突变：V122I 突变：V122I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 8PM8 V30M Transthyretin structure in complex with Tolcalpone 提交 2023-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | TCW Tolcapone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.2M CaCl2, 25% PEG 400
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.231 |
| 8PM9 Crystal structure of human wild type transthyretin in complex with PITB (Pharmacokinetically Improved TTR Binder) 提交 2023-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | ZP2 (3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)-(3-methoxy-5-nitro-4-oxidanyl-phenyl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M HEPES pH8, 0.2M CaCl2, 25% PEG 400
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 8PMA Crystal structure of human V30M transthyretin in complex with PITB (Pharmacokinetically Improved TTR Binder) 提交 2023-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | ZP2 (3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)-(3-methoxy-5-nitro-4-oxidanyl-phenyl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M HEPES pH7.0, 0.2M CaCl2, 20% PEG 400
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.201 |
| 8PMO Crystal structure of human V122I transthyretin in complex with PITB (Pharmacokinetically Improved TTR Binder) 提交 2023-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：V122I 突变：V122I | ZP2 (3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)-(3-methoxy-5-nitro-4-oxidanyl-phenyl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M HEPES pH 8.0, 0.2M CaCl2, 30% PEG 400
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.212 |
| 8TDN Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTR I84S amyloidosis patient-3, wild-type morphology 提交 2023-07-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；water containing 5-10 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8TDO Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTR I84S amyloidosis patient-3, variant-type morphology 提交 2023-07-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；water containing 5-10 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8U52 Co-crystal structure of human transthyretin conjugated to the stilbene substructure derived from reaction with the fluorogenic covalent kinetic stabilizer A2 提交 2023-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1W4 S-(4-fluorophenyl) 3-(dimethylamino)-5-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]benzenecarbothioate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；The WT-TTR was concentrated to 4 mg/mL in 10 mM sodium phosphate, 100 mM KCl, at pH 7.6 and co-crystallized at room temperature using the vapor diffusion sitting drop method.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.194 |
| 8VE0 Human transthyretin covalently modified with A2-derived stilbene in the compressed conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1WZ 3-(dimethylamino)-5-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]benzoic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 6 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VE1 Human transthyretin covalently modified with A2-derived stilbene in the canonical conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | 1WZ 3-(dimethylamino)-5-[(E)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)ethenyl]benzoic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 6 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 2.70 Å |
| 8VE2 Unliganded human transthyretin in the canonical conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 4 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 3.30 Å |
| 8VE3 Unliganded human transthyretin in the compressed conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 4 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 3.30 Å |
| 8VE4 Unliganded human transthyretin in the frayed conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 4 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 3.30 Å |
| 8VE5 (Biarylamine-FT2-WT)1(C10A)3-human transthyretin in the compressed conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | P2C 2-[(3,5-DICHLORO-4-TRIOXIDANYLPHENYL)AMINO]BENZOIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 3 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 3.40 Å |
| 8VE6 (Biarylamine-FT2-WT)1(C10A)3-human transthyretin in the frayed conformation 提交 2023-12-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | P2C 2-[(3,5-DICHLORO-4-TRIOXIDANYLPHENYL)AMINO]BENZOIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample were applied onto the graphene side of the grid after it was mounted on the plunger (always at the same height), and immediately blotted for 3 seconds by holding a 1 x 6 cm piece of Whatman 1 filter paper parallel to the grid, in full contact. Timing was kept with the help of a metronome. The blotting countdown was started after the blotted liquid spot on the filter paper stopped spreading and the grid was plunged in liquid ethane at the same time the blotting paper was pulled back, in a single motion.
|
分辨率 4.10 Å |
| 8W1N Structure of transthyretin pathogenic mutation A120S 提交 2024-02-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：A120S 突变：A120S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES at pH 6.0, 10% (v/v) glycerol, 5% (w/v) PEG 1000, and 30% (v/v) PEG 600
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.284 |
| 8W2W Structure of transthyretin synthetic mutation A120L 提交 2024-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
|
突变：A120L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M sodium cacodylate (pH 6.5), 1M sodium chloride, 10% (v/v) glycerol, and 30% (v/v) PEG 600
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.235 |
| 8W42 X-ray crystal structure of V30M-TTR in complex with resveratrol 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | STL RESVERATROL × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.180 |
| 8W43 X-ray crystal structure of V30M-TTR in complex with piceatannol 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | PIT PICEATANNOL × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.181 |
| 8W44 X-ray crystal structure of V30M-TTR in complex with oxyresveratrol 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | EZE trans-oxyresveratrol × 6 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.181 |
| 8W45 X-ray crystal structure of V30M-TTR in complex with pinostilbene 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 8KZ 3-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-5-methoxy-phenol × 4 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.165 |
| 8W46 X-ray crystal structure of V30M-TTR in complex with pterostilbene 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 3RL Pterostilbene × 6 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.188 |
| 8W47 X-ray crystal structure of V30M-TTR in complex with isorhapontigenin 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | P5O 5-[(~{E})-2-(3-methoxy-4-oxidanyl-phenyl)ethenyl]benzene-1,3-diol × 4 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.171 |
| 8W48 Neutron and X-ray joint structure of WT-TTR in complex with piceatannol 提交 2023-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
未记录 | PIT PICEATANNOL × 4 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1M NaOAc pH 4.6
|
分辨率未提供 |
| 8WGS Crystal structure of V30M-TTR in complex with compound 4 提交 2023-09-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | WGH [3,5-bis(iodanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-(2-ethyl-4-iodanyl-1-benzofuran-3-yl)methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, sodium acetate, calcium chloride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.214 |
| 8WGT Crystal structure of V30M-TTR in complex with compound 7 提交 2023-09-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | WGJ [4,7-bis(chloranyl)-2-ethyl-1-benzofuran-3-yl]-[3,5-bis(iodanyl)-4-oxidanyl-phenyl]methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, sodium acetate, calcium chloride
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.231 |
| 8WGU Crystal structure of V30M-TTR in complex with compound 20 提交 2023-09-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | WH0 [3,5-bis(iodanyl)-4-oxidanyl-phenyl]-[2-ethyl-4,7-bis(fluoranyl)-1-benzofuran-3-yl]methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, sodium acetate, calcium chloride
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.213 |
| 8YQD Crystal structure of human transthyretin variant A97S in complex with Tafamidis 提交 2024-03-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–144（124 aa）
链 B
21–144（124 aa）
|
突变：A97S 突变：A97S | 3MI 2-(3,5-dichlorophenyl)-1,3-benzoxazole-6-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；310 K；0.05 M Calcium chloride dihydrate +0.1 M Bis-Tris +25% PEG 550
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.225 |
| 8Z9V Amyloid beta and TTR 提交 2024-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 b
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.82
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 7.84 Å |
| 9BDM Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTRV122delta, single filament morphology 提交 2024-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；ice-chilled water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 9BDR Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTRV122delta, double filament morphology 1 提交 2024-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
链 I
21–147（127 aa）
链 J
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Fibrils were purified in ice-chilled water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 9BYN Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from nerve of a variant ATTR V30M amyloidosis patient 提交 2024-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Milli-Q water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot-force 0, blotting time 3 sec
|
分辨率 3.36 Å |
| 9BZS Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibril from a variant ATTR V30M amyloidosis patient 提交 2024-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；Milli-Q water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot-force 0, blotting time 3 sec
|
分辨率 3.14 Å |
| 9D21 Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from heart of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 1 提交 2024-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9D23 Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from heart of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 2 提交 2024-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；We used water as the buffer for the final elution of fibrils
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9D24 Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from thyroid of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 3 提交 2024-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；We used water as the buffer for the final elution of fibrils
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9D27 Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from kidney of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 3 提交 2024-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；We used water as the buffer for the final elution of fibrils
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 9D2G Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from liver of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 3 提交 2024-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；We used water as the buffer for the final elution of fibrils
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9FF6 Human transthyretin (TTR) in complex with (E)-4-((((2-methoxybenzyl)oxy)imino)methyl)benzoic acid (Lic157) 提交 2024-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–145（125 aa）
链 B
21–145（125 aa）
|
未记录 | A1ICE 4-[(~{Z})-(2-methoxyphenyl)methoxyiminomethyl]benzoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；4.93 mg/mL, Tris pH 8.0, 150mM NaCl. Precipitant: 24% PEG 600, 0.2M imidazole malate pH 5.5
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.203 |
| 9FF8 Human transthyretin (TTR) in complex with (E)-2-((((2-chlorobenzyl)oxy)imino)methyl)benzoic acid (Lic166) 提交 2024-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1ICF 2-[(2-chlorophenyl)methoxyiminomethyl]benzoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein: 4.93 mg/mL, Tris pH 8.0, 150mM NaCl. Precipitant: 24% PEG 600, 0.2M imidazole malate pH 5.5.
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.214 |
| 9FHA Human transthyretin (TTR) in complex with (E)-2-((((2-(trifluoromethyl)benzyl)oxy)imino)methyl)benzoic acid 提交 2024-05-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | A1IC9 2-[(~{E})-[2-(trifluoromethyl)phenyl]methoxyiminomethyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Protein: 4.93 mg/mL, Tris pH 8.0, 150mM NaCl. Precipitant: 24% PEG 600, 0.2M imidazole malate pH 5.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.234 |
| 9H5X Crystal structure of human V122I transthyretin in complex with (3,4-dihydroxy-5-nitrophenyl)-(3-fluoro-5-hydroxyphenyl)methanone compound 提交 2024-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–145（125 aa）
链 B
21–145（125 aa）
|
未记录 | AQI (3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)-[3-nitro-4,5-bis(oxidanyl)phenyl]methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M CaCl2, 25% PEG 400
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 9H5Y Crystal structure of human V30M transthyretin in complex with (3,4-dihydroxy-5-nitrophenyl)-(3-fluoro-5-hydroxyphenyl)methanone compound 提交 2024-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–145（125 aa）
链 B
21–145（125 aa）
|
未记录 | AQI (3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)-[3-nitro-4,5-bis(oxidanyl)phenyl]methanone × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M CaCl2, 25% PEG 400
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.220 |
| 9H7A Human Transthyretin in Complex with 3,5-Dichlorobenzenesulfonamide 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | 6OT 3,5-dichlorobenzene-1-sulfonamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.226 |
| 9H7B Human Transthyretin in Complex with Biphenyl-4-carboxylic Acid 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 Z7Z biphenyl-4-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.228 |
| 9H7C Human Transthyretin in Complex with 4-(1H-imidazol-1-yl)phenol 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MSR 4-(1H-IMIDAZOL-1-YL)PHENOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.209 |
| 9H7D Human Transthyretin in Complex with 2-(phenylamino)benzoic acid 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 EHO 2-phenylazanylbenzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.188 |
| 9H7E Human Transthyretin in Complex with 4-pyridin-3-ylbenzoic acid 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 PQM 4-(pyridin-3-yl)benzoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.291 |
| 9H7F Human Transthyretin in Complex with 3,5-dichloroaniline 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | A1ISU 3,5-bis(chloranyl)aniline × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.178 |
| 9H7G Human Transthyretin in Complex with 1H-indole-3-carbonitrile 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 98Z 1~{H}-indole-3-carbonitrile × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.210 |
| 9H7H Human Transthyretin in Complex with Isoquinolin-3-amine 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 WLX isoquinolin-3-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.215 |
| 9H7I Human Transthyretin in Complex with 4-(1H-pyrazol-4-yl)quinoline 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 A1ISS 4-(1H-pyrazol-4-yl)quinoline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.183 |
| 9H7J Human Transthyretin in Complex with 5-methyl-4-phenyl-1H-pyrazol-3-amine 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 A1ISY 5-methyl-4-phenyl-1H-pyrazol-3-amine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.260 |
| 9H7K Human Transthyretin in Complex with 8-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)quinoline 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 A1IS2 8-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)quinoline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.236 |
| 9H7L Human Transthyretin in Complex with 4-phenyl-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-3-amine 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 A1IS0 4-phenyl-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-3-amine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.192 |
| 9H7M Human Transthyretin in Complex with 4-(quinolin-8-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-amine 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 A1ISV 4-quinolin-8-yl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-amine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.191 |
| 9H7N Human Transthyretin in Complex with 4-(5-methyl-1H-1,2,4-triazol-3-yl)quinoline 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 A1IST 4-(5-methyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)quinoline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.205 |
| 9H7O Human Transthyretin in Complex with 5-(quinolin-8-yl)pyrimidin-2-amine 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 A1ISZ 5-quinolin-8-ylpyrimidin-2-amine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.193 |
| 9H7P Human Transthyretin S52P Mutant in Complex with 4-(1H-pyrazol-4-yl)quinoline 提交 2024-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 A1ISS 4-(1H-pyrazol-4-yl)quinoline × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294.15 K；100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, 28% v/v PEG400, pH 7.5
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.205 |
| 9HX3 Amyloid fibril of TTR 提交 2025-01-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9HYW Cryo-EM structure of ATTRv-F64S amyloid fibril from patient skin tissue. 提交 2025-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
链 F
1–147（147 aa）
链 G
1–147（147 aa）
链 H
1–147（147 aa）
链 I
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9JIQ Crystal structure of V30M-TTR in complex with bromoxynil 提交 2024-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | A1L36 bromoxynil × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1 M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.249 |
| 9JIR Crystal structure of V30M-TTR in complex with ioxynil 提交 2024-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | A1L37 ioxynil × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1 M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.197 |
| 9JIS Crystal structure of V30M-TTR in complex with aclonifen 提交 2024-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | A1L38 Aclonifen × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Disodium malonate, 0.1 M NaOAc pH 4.6
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.189 |
| 9NNN Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from the heart of a variant ATTR D38A amyloidosis patient 提交 2025-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；fibrils were eluted in ice-cold water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9PX6 ATTR cardiac amyloid fibrils apex1 提交 2025-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
链 F
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9PX7 ATTR cardiac amyloid fibrils apex2 提交 2025-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
链 F
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9PX9 ATTR V122I cardiac amyloid fibrils 提交 2025-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–147（147 aa）
链 B
1–147（147 aa）
链 C
1–147（147 aa）
链 D
1–147（147 aa）
链 E
1–147（147 aa）
链 F
1–147（147 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9RGK Human Transthyretin I107V Mutant 提交 2025-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
|
突变：I107V 突变：I107V | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2M (NH4)2SO4; 100 mM citrate buffer pH 5.5; 7 v/v % glycerol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 9RSP Cryogenic crystal structure of the perdeuterated TTR mutant V30M at pH5. 提交 2025-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；1.7 M Sodium Malonate pH 5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.201 |
| 9RSR Cryogenic crystal structure of the TTR mutant V30M at pH5. 提交 2025-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；2.15 M sodium malonate pH 5
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.209 |
| 9RTO Room temperature crystal structure of the perdeuterated TTR mutant V30M at pH5. 提交 2025-07-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
30–144（115 aa）
链 B
30–144（115 aa）
|
突变：V30M 突变：V30M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；1.7 M sodium malonate pH5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.198 |
| 9WPB Crystal structure of human transthyretin (TTR) with pryazole-based stabilizer 提交 2025-09-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
未记录 | A1MB7 4-[2-[3,5-bis(chloranyl)-1~{H}-pyrazol-4-yl]ethyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M CaCl2, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.180 |
| 9WPB Crystal structure of human transthyretin (TTR) with pryazole-based stabilizer 提交 2025-09-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
21–147（127 aa）
链 F
21–147（127 aa）
链 G
21–147（127 aa）
链 H
21–147（127 aa）
|
未记录 | A1MB7 4-[2-[3,5-bis(chloranyl)-1~{H}-pyrazol-4-yl]ethyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M CaCl2, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.180 |
| 9ZBV Human TTR-C10A at pH 7.4 提交 2025-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
|
突变：C10A 突变：C10A 突变：C10A 突变：C10A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9ZLD Cryo-EM structure of hepatic amyloid fibril from a variant ATTRV122delta, single filament morphology 提交 2025-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
21–147（127 aa）
链 B
21–147（127 aa）
链 C
21–147（127 aa）
链 D
21–147（127 aa）
链 E
21–147（127 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7；ice-chilled water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | TTHY_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 B； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 C； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 D； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 E； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 F； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 G； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 作者链 H； PDB构建体 1–122； UniProt 26–147 |
