5fbv

PI4KB in complex with Rab11 and the MI364 Inhibitor

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 109.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 4-kinase beta,Phosphatidylinositol 4-kinase beta

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 128–422 链 A； UniProt 523–799	片段：UNP Residues 128-422, 523-799	Ras-related protein Rab-11A × 1 （P62491） 5W3 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[3-(2-hydroxyethylsulfamoyl)-4-methoxy-phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethy l]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15M amonium sulfate, 0.1M MEW pH=6, 15% PEG 4000	分辨率 3.29 Å R-free 0.281

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5FBV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4D0L Phosphatidylinositol 4-kinase III beta-PIK93 in a complex with Rab11a- GTP gammaS 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 121–407（287 aa）片段：RESIDUES 121-407,508-784 链 A 508–784（277 aa）片段：RESIDUES 121-407,508-784	突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；15% (W/V) PEG 4000, 0.1 M NA CITRATE PH 5.6, AND 0.2 M AMMONIUM ACETATE	分辨率 2.94 Å R-free 0.259
4D0L Phosphatidylinositol 4-kinase III beta-PIK93 in a complex with Rab11a- GTP gammaS 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 121–407（287 aa）片段：RESIDUES 121-407,508-784 链 C 508–784（277 aa）片段：RESIDUES 121-407,508-784	突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；15% (W/V) PEG 4000, 0.1 M NA CITRATE PH 5.6, AND 0.2 M AMMONIUM ACETATE	分辨率 2.94 Å R-free 0.259
4D0L Phosphatidylinositol 4-kinase III beta-PIK93 in a complex with Rab11a- GTP gammaS 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 121–407（287 aa）片段：RESIDUES 121-407,508-784 链 E 508–784（277 aa）片段：RESIDUES 121-407,508-784	突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；15% (W/V) PEG 4000, 0.1 M NA CITRATE PH 5.6, AND 0.2 M AMMONIUM ACETATE	分辨率 2.94 Å R-free 0.259
4D0M Phosphatidylinositol 4-kinase III beta in a complex with Rab11a-GTP- gamma-S and the Rab-binding domain of FIP3 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 121–303（183 aa）链 A 319–421（103 aa）链 A 522–799（278 aa）链 C 121–303（183 aa）链 C 319–421（103 aa）链 C 522–799（278 aa）链 O 121–303（183 aa）链 O 319–421（103 aa）链 O 522–799（278 aa）链 S 121–303（183 aa）链 S 319–421（103 aa）链 S 522–799（278 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 16% PEG 6K, 0.01 M NA CITRATE	分辨率 6.00 Å R-free 0.359
4D0M Phosphatidylinositol 4-kinase III beta in a complex with Rab11a-GTP- gamma-S and the Rab-binding domain of FIP3 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 121–303（183 aa）链 G 319–421（103 aa）链 G 522–799（278 aa）链 I 121–303（183 aa）链 I 319–421（103 aa）链 I 522–799（278 aa）链 M 121–303（183 aa）链 M 319–421（103 aa）链 M 522–799（278 aa）链 Q 121–303（183 aa）链 Q 319–421（103 aa）链 Q 522–799（278 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 16% PEG 6K, 0.01 M NA CITRATE	分辨率 6.00 Å R-free 0.359
4D0M Phosphatidylinositol 4-kinase III beta in a complex with Rab11a-GTP- gamma-S and the Rab-binding domain of FIP3 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 W 121–303（183 aa）链 W 319–421（103 aa）链 W 522–799（278 aa）链 Y 121–303（183 aa）链 Y 319–421（103 aa）链 Y 522–799（278 aa）链 c 121–303（183 aa）链 c 319–421（103 aa）链 c 522–799（278 aa）链 g 121–303（183 aa）链 g 319–421（103 aa）链 g 522–799（278 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 16% PEG 6K, 0.01 M NA CITRATE	分辨率 6.00 Å R-free 0.359
4WAE Phosphatidylinositol 4-kinase III beta crystallized with ATP 提交 2014-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–422（295 aa）片段：UNP residues 130-422, UNP residues 523-799 链 A 523–799（277 aa）片段：UNP residues 130-422, UNP residues 523-799	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% w/v PEG 4000, 20% v/v glycerol 0.1 M MOPS/HEPES-Na pH 7.5	分辨率 3.32 Å R-free 0.244
4WAG Phosphatidylinositol 4-kinase III beta crystallized with MI103 inhibitor 提交 2014-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 128–422（295 aa）片段：UNP residues 128-422, UNP residues 523-799 链 A 523–799（277 aa）片段：UNP residues 128-422, UNP residues 523-799	未记录	3K7 6-chloro-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-2-methylimidazo[1,2-b]pyridazin-8-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% w/v PEG 4000, 20% v/v glycerol 0.1 M MOPS/HEPES-Na pH 7.5	分辨率 3.41 Å R-free 0.251
5C46 Crystal structure of an engineered construct of phosphatidylinositol 4 kinase III beta in complex with GTP gamma S loaded Rab11 提交 2015-06-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 121–248（128 aa）链 E 288–407（120 aa）链 E 508–784（277 aa）	突变：S294A 突变：S294A 突变：S294A	SO4 SULFATE ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；PEG-4000, sodium citrate, ammonium sulfate, glycerol	分辨率 2.65 Å R-free 0.246
5C4G Crystal structure of an engineered construct of phosphatidylinositol 4 kinase III beta with the inhibitor BQR695 in complex with GDP loaded Rab11 提交 2015-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 121–248（128 aa）链 E 288–407（120 aa）链 E 508–784（277 aa）	突变：S294A 突变：S294A 突变：S294A	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 BQR N~2~-[7-(3,4-dimethoxyphenyl)quinoxalin-2-yl]-N-methylglycinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；PEG-4000, sodium citrate, ammonium sulfate, glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.287
5EUQ Crystal structure of an engineered construct of phosphatidylinositol 4 kinase III beta with a potent and selective inhibitor in complex with GDP loaded Rab11 提交 2015-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 121–248（128 aa）链 E 523–799（277 aa）	突变：S294A 突变：S294A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 5S8 ~{N}-[5-[3-[[(4-hydroxyphenyl)amino]-bis(oxidanyl)-$l^{4}-sulfanyl]-4-methoxy-phenyl]-4-methyl-1,3-thiazol-2-yl]cyclopentanecarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；290 K；PEG-4000, sodium citrate, ammonium sulfate, glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
5FBL PI4KB in complex with Rab11 and the MI356 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 128–422（295 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-799 链 A 523–799（277 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-799	未记录	5W9 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-(4-methoxy-3-morpholin-4-ylsulfonyl-phenyl)-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M Lithium chloride, 0.1M Citric acid pH=5, 10% (w/v) PEG 6000	分辨率 3.37 Å R-free 0.269
5FBQ PI4KB in complex with Rab11 and the MI358 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 128–422（295 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-799 链 A 523–799（277 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-799	未记录	5W6 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[3-[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]sulfonyl-4-methoxy-phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M magnesium chloride, 0.1M Tris PH=7, 10% (w/v) PEG 8000	分辨率 3.79 Å R-free 0.302
5FBR PI4KB in complex with Rab11 and the MI359 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 128–422（295 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-799 链 A 523–799（277 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-799	未记录	5W7 ~{N}-[2-[[3-[3-[(4-azanylcyclohexyl)sulfamoyl]-4-methoxy-phenyl]-6-chloranyl-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15M amonium sulfate, 0.1M MES pH=6, 15% PEG 4000	分辨率 3.28 Å R-free 0.264
5FBW PI4KB in complex with Rab11 and the MI369 Inhibitor 提交 2015-12-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 128–422（295 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-729,UNP Residues 128-422, 523-729 链 A 191–467（277 aa）片段：UNP Residues 128-422, 523-729,UNP Residues 128-422, 523-729	未记录	5W8 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[4-methoxy-3-[[(2~{R})-1-oxidanylbutan-2-yl]sulfamoyl]phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M MES pH=6.5, 20% (w/v) PEG 8000	分辨率 3.49 Å R-free 0.283
5NAS Crystal structure of human 14-3-3 zeta in complex with PI4KIIIB peptide 提交 2017-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 289–297（9 aa）片段：UNP residues 289-297 链 D 289–297（9 aa）片段：UNP residues 289-297	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MES, PEG, ethylene glycol	分辨率 2.08 Å R-free 0.231
6GL3 Crystal structure of human Phosphatidylinositol 4-kinase III beta (PI4KIIIbeta) in complex with ligand 44 提交 2018-05-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 317–428（112 aa）链 A 532–798（267 aa）	未记录	EMW (3~{S})-4-(6-azanyl-1-methyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl)-~{N}-(4-methoxy-2-methyl-phenyl)-3-methyl-piperazine-1-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 22% (w/v) PEG3350, 10 mM Manganese(II)chloride	分辨率 2.77 Å R-free 0.333
6GL3 Crystal structure of human Phosphatidylinositol 4-kinase III beta (PI4KIIIbeta) in complex with ligand 44 提交 2018-05-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 317–428（112 aa）链 B 532–798（267 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 22% (w/v) PEG3350, 10 mM Manganese(II)chloride	分辨率 2.77 Å R-free 0.333
8Q6F HUMAN PI4KIIIB IN COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (COMPOUND 4) 提交 2023-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–415（125 aa）	突变：R409Q,R412Q	KHR 3-(3-fluorosulfonyloxy-4-methoxy-phenyl)-2,5-dimethyl-7-(pyridin-4-ylmethylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Sodium Formate	分辨率 1.51 Å R-free 0.224
8Q6G HUMAN PI4KIIIB IN COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (COMPOUND 8) 提交 2023-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–415（125 aa）	突变：R409Q,R412Q	KIH 3-(3,4-dimethoxyphenyl)-7-[(4-fluorosulfonyloxyphenyl)methylamino]-2,5-dimethyl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Sodium Formate	分辨率 1.54 Å R-free 0.221
8Q6H HUMAN PI4KIIIB IN COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (COMPOUND 11) 提交 2023-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–415（125 aa）	突变：R409Q,R412Q	MG MAGNESIUM ION × 1 KI7 3-(3-fluorosulfonyloxy-4-methoxy-phenyl)-7-[(4-fluorosulfonyloxyphenyl)methylamino]-2,5-dimethyl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Sodium Formate	分辨率 1.94 Å R-free 0.237
8VOF GI targeted CpPI4K inhibitor 提交 2024-01-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 121–407（287 aa）	突变：L294A,L374Y,P597Y	A1ADE methyl 2-chloro-5-(methyl{(8R)-3-[4-(methylcarbamoyl)phenyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-5-carbonyl}amino)benzoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.5M ammonium sulfate, 0.088M sodium citrate, 0.875M lithium sulfate, 2.4% glycerol, 2.5% ethylene glycol, 50mM HEPES pH 6.8	分辨率 3.00 Å R-free 0.270

共 17 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PI4KB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–295； UniProt 128–422 作者链 A； PDB构建体 296–572； UniProt 523–799

Ras-related protein Rab-11A

Homo sapiens

UniProt P62491

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–216	未记录	Phosphatidylinositol 4-kinase beta,Phosphatidylinositol 4-kinase beta × 1 （Q9UBF8） 5W3 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[3-(2-hydroxyethylsulfamoyl)-4-methoxy-phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethy l]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15M amonium sulfate, 0.1M MEW pH=6, 15% PEG 4000	分辨率 3.29 Å R-free 0.281

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5FBV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YZK GppNHp bound Rab11 GTPase 提交 2005-02-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 8–175（168 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；NaCl, Glycerol, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
2D7C Crystal structure of human Rab11 in complex with FIP3 Rab-binding domain 提交 2005-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–172（167 aa）片段：residues 7-173	突变：Q70L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；20% iso-propanol, 3% (w/v) PEG 4000, 0.05M MES-NaOH, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 1.75 Å R-free 0.224
2D7C Crystal structure of human Rab11 in complex with FIP3 Rab-binding domain 提交 2005-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 6–172（167 aa）片段：residues 7-173	突变：Q70L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；20% iso-propanol, 3% (w/v) PEG 4000, 0.05M MES-NaOH, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 1.75 Å R-free 0.224
2GZD Crystal Structure of Rab11 in Complex with Rab11-FIP2 提交 2006-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–172（172 aa）片段：G protein domain 链 B 1–172（172 aa）片段：G protein domain	突变：Q70L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Q70L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；Ammonium phosphate buffer, between 0.1 and 0.5 M concentration, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.44 Å R-free 0.279
2GZH Crystal Structure of Rab11 in Complex with Rab11-Family Interacting Protein 2 提交 2006-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–172（172 aa）片段：G protein domain	突变：Q70L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；Ammonium phosphate buffer, approximately 0.3M concentration, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.47 Å R-free 0.254
2HV8 Crystal structure of GTP-bound Rab11 in complex with FIP3 提交 2006-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–174（170 aa）片段：GTPase domain	突变：Q70L	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG4000, 0.4M Ammonium Sulfate, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.86 Å R-free 0.237
2HV8 Crystal structure of GTP-bound Rab11 in complex with FIP3 提交 2006-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 5–174（170 aa）片段：GTPase domain 链 C 5–174（170 aa）片段：GTPase domain	突变：Q70L 突变：Q70L	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 2ME METHOXYETHANE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG4000, 0.4M Ammonium Sulfate, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.86 Å R-free 0.237
4C4P Crystal Structure of Wild-Type Rab11 Complexed to FIP2 提交 2013-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–173（173 aa）片段：RESIDUES 1-173	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
4D0L Phosphatidylinositol 4-kinase III beta-PIK93 in a complex with Rab11a- GTP gammaS 提交 2014-04-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；15% (W/V) PEG 4000, 0.1 M NA CITRATE PH 5.6, AND 0.2 M AMMONIUM ACETATE	分辨率 2.94 Å R-free 0.259
4D0L Phosphatidylinositol 4-kinase III beta-PIK93 in a complex with Rab11a- GTP gammaS 提交 2014-04-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–216（216 aa）	突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；15% (W/V) PEG 4000, 0.1 M NA CITRATE PH 5.6, AND 0.2 M AMMONIUM ACETATE	分辨率 2.94 Å R-free 0.259
4D0L Phosphatidylinositol 4-kinase III beta-PIK93 in a complex with Rab11a- GTP gammaS 提交 2014-04-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–216（216 aa）	突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；15% (W/V) PEG 4000, 0.1 M NA CITRATE PH 5.6, AND 0.2 M AMMONIUM ACETATE	分辨率 2.94 Å R-free 0.259
4D0M Phosphatidylinositol 4-kinase III beta in a complex with Rab11a-GTP- gamma-S and the Rab-binding domain of FIP3 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–216（216 aa）链 D 1–216（216 aa）链 P 1–216（216 aa）链 T 1–216（216 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 16% PEG 6K, 0.01 M NA CITRATE	分辨率 6.00 Å R-free 0.359
4D0M Phosphatidylinositol 4-kinase III beta in a complex with Rab11a-GTP- gamma-S and the Rab-binding domain of FIP3 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–216（216 aa）链 J 1–216（216 aa）链 N 1–216（216 aa）链 R 1–216（216 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 16% PEG 6K, 0.01 M NA CITRATE	分辨率 6.00 Å R-free 0.359
4D0M Phosphatidylinositol 4-kinase III beta in a complex with Rab11a-GTP- gamma-S and the Rab-binding domain of FIP3 提交 2014-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 X 1–216（216 aa）链 Z 1–216（216 aa）链 d 1–216（216 aa）链 h 1–216（216 aa）	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	093 N-(5-(4-CHLORO-3-(2-HYDROXY-ETHYLSULFAMOYL)- PHENYLTHIAZOLE-2-YL)-ACETAMIDE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 16% PEG 6K, 0.01 M NA CITRATE	分辨率 6.00 Å R-free 0.359
4LWZ Crystal structure of Myo5b globular tail domain in complex with inactive Rab11a 提交 2013-07-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–177（177 aa）片段：Dilute domain residues 1456-1848	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；17% peg, 100 mM NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.55 Å R-free 0.295
4LWZ Crystal structure of Myo5b globular tail domain in complex with inactive Rab11a 提交 2013-07-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–177（177 aa）片段：Dilute domain residues 1456-1848	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；17% peg, 100 mM NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.55 Å R-free 0.295
4LX0 Crystal structure of Myo5b globular tail domain in complex with active Rab11a 提交 2013-07-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–177（177 aa）片段：Dilute domain residues 1456-1848	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；10 % peg, 90 mM NaF, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.19 Å R-free 0.218
4LX0 Crystal structure of Myo5b globular tail domain in complex with active Rab11a 提交 2013-07-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–177（177 aa）片段：Dilute domain residues 1456-1848	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；10 % peg, 90 mM NaF, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.19 Å R-free 0.218
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 M 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 S 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ3 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 V 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50MM MES PH 5.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 12% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.250
4UJ4 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 4-186 链 G 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 4-186	突变：YES 突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；50MM MES PH 5.8, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 14% PEG 8000	分辨率 4.20 Å R-free 0.266
4UJ4 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 4-186 链 J 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 4-186	突变：YES 突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；50MM MES PH 5.8, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 14% PEG 8000	分辨率 4.20 Å R-free 0.266
4UJ4 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 4-186 链 J 4–186（183 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 4-186	突变：YES 突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；50MM MES PH 5.8, 0.2M AMMONIUM SULFATE AND 14% PEG 8000	分辨率 4.20 Å R-free 0.266
4UJ5 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–186（181 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 6-186	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；0.1M HEPES PH 7.0, 0.2M LITHIUM SULFATE AND 24% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.272
4UJ5 Crystal structure of human Rab11-Rabin8-FIP3 提交 2015-04-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 6–186（181 aa）片段：GTPASE DOMAIN, RESIDUES 6-186	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；0.1M HEPES PH 7.0, 0.2M LITHIUM SULFATE AND 24% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.272
5C46 Crystal structure of an engineered construct of phosphatidylinositol 4 kinase III beta in complex with GTP gamma S loaded Rab11 提交 2015-06-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–216（216 aa）	突变：Q70L	SO4 SULFATE ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；PEG-4000, sodium citrate, ammonium sulfate, glycerol	分辨率 2.65 Å R-free 0.246
5C4G Crystal structure of an engineered construct of phosphatidylinositol 4 kinase III beta with the inhibitor BQR695 in complex with GDP loaded Rab11 提交 2015-06-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	突变：Q70L	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 BQR N~2~-[7-(3,4-dimethoxyphenyl)quinoxalin-2-yl]-N-methylglycinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；PEG-4000, sodium citrate, ammonium sulfate, glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.287
5EUQ Crystal structure of an engineered construct of phosphatidylinositol 4 kinase III beta with a potent and selective inhibitor in complex with GDP loaded Rab11 提交 2015-11-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 5S8 ~{N}-[5-[3-[[(4-hydroxyphenyl)amino]-bis(oxidanyl)-$l^{4}-sulfanyl]-4-methoxy-phenyl]-4-methyl-1,3-thiazol-2-yl]cyclopentanecarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；290 K；PEG-4000, sodium citrate, ammonium sulfate, glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.266
5EZ5 Crystal structure of active Rab11A (S20V) in complex with GTP 提交 2015-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 8–175（168 aa）片段：UNP residues 8-175 链 B 8–175（168 aa）片段：UNP residues 8-175	突变：S20V 突变：S20V	MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium chloride, Tris, Magnessium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.304
5EZ5 Crystal structure of active Rab11A (S20V) in complex with GTP 提交 2015-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 8–175（168 aa）片段：UNP residues 8-175 链 B 8–175（168 aa）片段：UNP residues 8-175	突变：S20V 突变：S20V	MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium chloride, Tris, Magnessium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.304
5FBL PI4KB in complex with Rab11 and the MI356 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	未记录	5W9 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-(4-methoxy-3-morpholin-4-ylsulfonyl-phenyl)-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M Lithium chloride, 0.1M Citric acid pH=5, 10% (w/v) PEG 6000	分辨率 3.37 Å R-free 0.269
5FBQ PI4KB in complex with Rab11 and the MI358 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	未记录	5W6 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[3-[4-(hydroxymethyl)piperidin-1-yl]sulfonyl-4-methoxy-phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M magnesium chloride, 0.1M Tris PH=7, 10% (w/v) PEG 8000	分辨率 3.79 Å R-free 0.302
5FBR PI4KB in complex with Rab11 and the MI359 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	未记录	5W7 ~{N}-[2-[[3-[3-[(4-azanylcyclohexyl)sulfamoyl]-4-methoxy-phenyl]-6-chloranyl-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15M amonium sulfate, 0.1M MES pH=6, 15% PEG 4000	分辨率 3.28 Å R-free 0.264
5FBW PI4KB in complex with Rab11 and the MI369 Inhibitor 提交 2015-12-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	未记录	5W8 ~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[4-methoxy-3-[[(2~{R})-1-oxidanylbutan-2-yl]sulfamoyl]phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethyl]ethanamide × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M MES pH=6.5, 20% (w/v) PEG 8000	分辨率 3.49 Å R-free 0.283
5JCZ Rab11 bound to MyoVa-GTD 提交 2016-04-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–177（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；7% (w/v) PEG-8000, 50 mM Bicine, 50 mM Tris, 30mM sodium fluoride, 20% (v/v) ethylene glycol	分辨率 2.06 Å R-free 0.208
5JCZ Rab11 bound to MyoVa-GTD 提交 2016-04-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–177（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；7% (w/v) PEG-8000, 50 mM Bicine, 50 mM Tris, 30mM sodium fluoride, 20% (v/v) ethylene glycol	分辨率 2.06 Å R-free 0.208
5JCZ Rab11 bound to MyoVa-GTD 提交 2016-04-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1–177（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；7% (w/v) PEG-8000, 50 mM Bicine, 50 mM Tris, 30mM sodium fluoride, 20% (v/v) ethylene glycol	分辨率 2.06 Å R-free 0.208
6DJL Crystal structure of the Rab11 GEF SH3BP5 bound to nucleotide free Rab11A 提交 2018-05-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–216（216 aa）	突变：Q70L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；23% PEG-3350, 200 mM NaCl, 100 mM Bis Tris pH-6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.278
6DJL Crystal structure of the Rab11 GEF SH3BP5 bound to nucleotide free Rab11A 提交 2018-05-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–216（216 aa）	突变：Q70L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；23% PEG-3350, 200 mM NaCl, 100 mM Bis Tris pH-6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.278
6DJL Crystal structure of the Rab11 GEF SH3BP5 bound to nucleotide free Rab11A 提交 2018-05-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–216（216 aa）	突变：Q70L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；23% PEG-3350, 200 mM NaCl, 100 mM Bis Tris pH-6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.278
6DJL Crystal structure of the Rab11 GEF SH3BP5 bound to nucleotide free Rab11A 提交 2018-05-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–216（216 aa）	突变：Q70L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；23% PEG-3350, 200 mM NaCl, 100 mM Bis Tris pH-6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.278
6IXV Crystal structure of SH3BP5-Rab11a 提交 2018-12-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–173（173 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6M NaCl, 0.1M NaH2PO4 pH 6.8, 16% PEG 2000	分辨率 3.80 Å R-free 0.259
6IXV Crystal structure of SH3BP5-Rab11a 提交 2018-12-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–173（173 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6M NaCl, 0.1M NaH2PO4 pH 6.8, 16% PEG 2000	分辨率 3.80 Å R-free 0.259
6IXV Crystal structure of SH3BP5-Rab11a 提交 2018-12-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–173（173 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6M NaCl, 0.1M NaH2PO4 pH 6.8, 16% PEG 2000	分辨率 3.80 Å R-free 0.259
6IXV Crystal structure of SH3BP5-Rab11a 提交 2018-12-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–173（173 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6M NaCl, 0.1M NaH2PO4 pH 6.8, 16% PEG 2000	分辨率 3.80 Å R-free 0.259
6IY1 Structure of human Ras-related protein Rab11 提交 2018-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 9–173（165 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Li2SO4, 0.1M Glycine, 0.8M NaH2PO4 1.2M Na2HPO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.261
6IY1 Structure of human Ras-related protein Rab11 提交 2018-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 9–173（165 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Li2SO4, 0.1M Glycine, 0.8M NaH2PO4 1.2M Na2HPO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.261
6IY1 Structure of human Ras-related protein Rab11 提交 2018-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 9–173（165 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Li2SO4, 0.1M Glycine, 0.8M NaH2PO4 1.2M Na2HPO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.261
6IY1 Structure of human Ras-related protein Rab11 提交 2018-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 7–173（167 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Li2SO4, 0.1M Glycine, 0.8M NaH2PO4 1.2M Na2HPO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.261
6IY1 Structure of human Ras-related protein Rab11 提交 2018-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 9–173（165 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Li2SO4, 0.1M Glycine, 0.8M NaH2PO4 1.2M Na2HPO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.261
6IY1 Structure of human Ras-related protein Rab11 提交 2018-12-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 6–173（168 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Li2SO4, 0.1M Glycine, 0.8M NaH2PO4 1.2M Na2HPO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.261
8VOF GI targeted CpPI4K inhibitor 提交 2024-01-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–216（216 aa）	突变：Q70L	A1ADE methyl 2-chloro-5-(methyl{(8R)-3-[4-(methylcarbamoyl)phenyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-5-carbonyl}amino)benzoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.5M ammonium sulfate, 0.088M sodium citrate, 0.875M lithium sulfate, 2.4% glycerol, 2.5% ethylene glycol, 50mM HEPES pH 6.8	分辨率 3.00 Å R-free 0.270

共 26 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RB11A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 6–221； UniProt 1–216

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5fbv
沉积日期 deposition_date	2015-12-14
结构标题 title	PI4KB in complex with Rab11 and the MI364 Inhibitor
关键词 keywords	Inhibitor, Complex, Kinase, Lipid, Transferase; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.60 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.33 Å
零角强度 I(0) i0	81457700.00
分子量 molecular_weight	72213.0 kDa
排除体积 excluded_volume	90828 Å³
包络体积 envelope_volume	114670 Å³
水化壳体积 shell_volume	32372 Å³
包络直径 envelope_diameter	115.7 Å
壳层 Rg shell_rg	35.98 Å
包络 Rg envelope_rg	31.78 Å
形状 Rg shape_rg	31.35 Å
总 Rg total_rg	31.67 Å
总原子数 total_atoms	5091
残基数 n_residues	632
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	109.8 Å
Rg (实空间) rg_real	31.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.04 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.1460e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3910e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.75 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	81450000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8538
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.511
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.302
角度范围 angular_range	— – 0.2500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	23440000.0000
实空间数据点数 n_real_points	51
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.764; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.859; Smooth: 0.944

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phosphatidylinositol 4-kinase beta,Phosphatidylinositol 4-kinase beta
分子量 formula_weight	65264.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.67,2.7.1.67
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5091

SWLLRLFESKLFDISMAISYLYNSKEPGVQAYIGNRLFCFRNEDVDFYLPQLLNMYIHMDEDVGDAIKPYIVHRCRQSINFSLQCALLLGAYSSDMHISTQRHSRGTKLRKLILSDELKPAHRKRELPSLSPAPDTGLSPSKRTHQRSKSDATASISLSSNLKRTASNPKVENEDEELSSSTESIDNSFSSPVRLAPEREFIKSLMAIGKRLATLPTKEQKTQRLISELSLLNHKLPARVWLPTAGFDHHVVRVPHTQAVVLNSKDKAPYLIYVEVLECENFDTTSVPARIPENRRDPEDPSAVALKEPWQEKVRRIREGSPYGHLPNWRLLSVIVKCGDDLRQELLAFQVLKQLQSIWEQERVPLWIKPYKILVISADSGMIEPVVNAVSIHQVKKQSQLSLLDYFLQEHGSYTTEAFLSAQRNFVQSCAGYCLVCYLLQVKDRHNGNILLDAEGHIIHIDFGFILSSSPRNLGFETSAFKLTTEFVDVMGGLDGDMFNYYKMLMLQGLIAARKHMDKVVQIVEIMQQGSQLPCFHGSSTIRNLKERFHMSMTEEQLQLLVEQMVDGSMRS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ras-related protein Rab-11A
分子量 formula_weight	24813.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GAMGSMGTRDDEYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFNLESKSTIGVEFATRSIQVDGKTIKAQIWDTAGLERYRAITSAYYRGAVGALLVYDIAKHLTYENVERWLKELRDHADSNIVIMLVGNKSDLRHLRAVPTDEARAFAEKNGLSFIETSALDSTNVEAAFQTILTEIYRIVSQKQMSDRRENDMSPSNNVVPIHVPPTTENKPKVQCCQNI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	;~{N}-[2-[[6-chloranyl-3-[3-(2-hydroxyethylsulfamoyl)-4-methoxy-phenyl]-2-methyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl]amino]ethy l]ethanamide ;
分子量 formula_weight	497.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	539.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	5fbvB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	48.536 Å
晶胞边长 b length_b	102.782 Å
晶胞边长 c length_c	186.141 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.285 Å
最低分辨率 resolution_low	46.966 Å
R 因子 r_factor	0.2394
R_work r_work	0.2371
R_free r_free	0.2814

fit	/app/data/saxs_computation/fb/5fbv/5fbv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fb/5fbv/5fbv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fb/5fbv/5fbv.dat

PI4KB in complex with Rab11 and the MI364 Inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 4-kinase beta,Phosphatidylinositol 4-kinase beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ras-related protein Rab-11A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)