5ijo

Alternative composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (16 copies of Nup188, 16 copies of Nup205)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nuclear pore complex protein Nup155

Homo sapiens

UniProt O75694

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup93 × 32 (Q8N1F7) Nuclear pore complex protein Nup205 × 16 (Q92621) Nucleoporin p54 × 32 (Q7Z3B4) Nucleoporin p58/p45 × 32 (Q9BVL2) Nuclear pore glycoprotein p62 × 32 (P37198) Nucleoporin NUP188 homolog × 16 (Q5SRE5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU155_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1391; UniProt 1–1391 作者链 B; PDB构建体 1–1391; UniProt 1–1391 作者链 E; PDB构建体 1–1391; UniProt 1–1391 作者链 K; PDB构建体 1–1391; UniProt 1–1391 作者链 Q; PDB构建体 1–1391; UniProt 1–1391 作者链 W; PDB构建体 1–1391; UniProt 1–1391

Nuclear pore complex protein Nup93

Homo sapiens

UniProt Q8N1F7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup155 × 48 (O75694) Nuclear pore complex protein Nup205 × 16 (Q92621) Nucleoporin p54 × 32 (Q7Z3B4) Nucleoporin p58/p45 × 32 (Q9BVL2) Nuclear pore glycoprotein p62 × 32 (P37198) Nucleoporin NUP188 homolog × 16 (Q5SRE5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP93_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–819; UniProt 1–819 作者链 I; PDB构建体 1–819; UniProt 1–819 作者链 O; PDB构建体 1–819; UniProt 1–819 作者链 U; PDB构建体 1–819; UniProt 1–819

Nuclear pore complex protein Nup205

Homo sapiens

UniProt Q92621

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup155 × 48 (O75694) Nuclear pore complex protein Nup93 × 32 (Q8N1F7) Nucleoporin p54 × 32 (Q7Z3B4) Nucleoporin p58/p45 × 32 (Q9BVL2) Nuclear pore glycoprotein p62 × 32 (P37198) Nucleoporin NUP188 homolog × 16 (Q5SRE5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU205_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–2012; UniProt 1–2012 作者链 P; PDB构建体 1–2012; UniProt 1–2012

Nucleoporin p54

Homo sapiens

UniProt Q7Z3B4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup155 × 48 (O75694) Nuclear pore complex protein Nup93 × 32 (Q8N1F7) Nuclear pore complex protein Nup205 × 16 (Q92621) Nucleoporin p58/p45 × 32 (Q9BVL2) Nuclear pore glycoprotein p62 × 32 (P37198) Nucleoporin NUP188 homolog × 16 (Q5SRE5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP54_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507 作者链 L; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507 作者链 R; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507 作者链 X; PDB构建体 1–507; UniProt 1–507

Nucleoporin p58/p45

Homo sapiens

UniProt Q9BVL2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup155 × 48 (O75694) Nuclear pore complex protein Nup93 × 32 (Q8N1F7) Nuclear pore complex protein Nup205 × 16 (Q92621) Nucleoporin p54 × 32 (Q7Z3B4) Nuclear pore glycoprotein p62 × 32 (P37198) Nucleoporin NUP188 homolog × 16 (Q5SRE5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP58_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–599; UniProt 1–599 作者链 M; PDB构建体 1–599; UniProt 1–599 作者链 S; PDB构建体 1–599; UniProt 1–599 作者链 Y; PDB构建体 1–599; UniProt 1–599

Nuclear pore glycoprotein p62

Homo sapiens

UniProt P37198

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup155 × 48 (O75694) Nuclear pore complex protein Nup93 × 32 (Q8N1F7) Nuclear pore complex protein Nup205 × 16 (Q92621) Nucleoporin p54 × 32 (Q7Z3B4) Nucleoporin p58/p45 × 32 (Q9BVL2) Nucleoporin NUP188 homolog × 16 (Q5SRE5) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP62_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–522; UniProt 1–522 作者链 N; PDB构建体 1–522; UniProt 1–522 作者链 T; PDB构建体 1–522; UniProt 1–522 作者链 Z; PDB构建体 1–522; UniProt 1–522

Nucleoporin NUP188 homolog

Homo sapiens

UniProt Q5SRE5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 208 Nuclear pore complex protein Nup155 × 48 (O75694) Nuclear pore complex protein Nup93 × 32 (Q8N1F7) Nuclear pore complex protein Nup205 × 16 (Q92621) Nucleoporin p54 × 32 (Q7Z3B4) Nucleoporin p58/p45 × 32 (Q9BVL2) Nuclear pore glycoprotein p62 × 32 (P37198) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU188_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–1749; UniProt 1–1749 作者链 V; PDB构建体 1–1749; UniProt 1–1749

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5ijo
沉积日期 deposition_date2016-03-02
结构标题 titleAlternative composite structure of the inner ring of the human nuclear pore complex (16 copies of Nup188, 16 copies of Nup205)
关键词 keywordsNuclear pore complex, Nucleocytoplasmic transport, Transport protein; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5ijo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5ijo__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5ijo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)327.90 Å
总 Rg327.90 Å
原子数612208
残基数123552
排除体积9876500 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5ijo__assembly_1__model_1 208-meric (208) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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7. 引用文献 (1)