6b1t

Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hexon protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Penton protein × 60 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （P24936） Hexon-interlacing protein × 240 （P03281） Pre-protein VI × 180 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 60 （P68951） Pre-protein VI × 60 （P24937）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Penton protein × 5 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 10 （P24936） Hexon-interlacing protein × 20 （P03281） Pre-protein VI × 15 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 5 （P68951） Pre-protein VI × 5 （P24937）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Penton protein × 6 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 12 （P24936） Hexon-interlacing protein × 24 （P03281） Pre-protein VI × 18 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 6 （P68951） Pre-protein VI × 6 （P24937）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAPSH_ADE05
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 B； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 C； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 D； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 E； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 F； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 G； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 H； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 I； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 J； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 K； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952 作者链 L； PDB构建体 1–952； UniProt 1–952

Penton protein

物种未注明

UniProt P12538

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Hexon protein × 720 （P04133） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （P24936） Hexon-interlacing protein × 240 （P03281） Pre-protein VI × 180 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 60 （P68951） Pre-protein VI × 60 （P24937）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Hexon protein × 60 （P04133） Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 10 （P24936） Hexon-interlacing protein × 20 （P03281） Pre-protein VI × 15 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 5 （P68951） Pre-protein VI × 5 （P24937）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Hexon protein × 72 （P04133） Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 12 （P24936） Hexon-interlacing protein × 24 （P03281） Pre-protein VI × 18 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 6 （P68951） Pre-protein VI × 6 （P24937）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAPSP_ADE05
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–571； UniProt 1–571

Pre-hexon-linking protein IIIa

物种未注明

UniProt P12537

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Hexon protein × 720 （P04133） Penton protein × 60 （P12538） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （P24936） Hexon-interlacing protein × 240 （P03281） Pre-protein VI × 180 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 60 （P68951） Pre-protein VI × 60 （P24937）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Hexon protein × 60 （P04133） Penton protein × 5 （P12538） Pre-hexon-linking protein VIII × 10 （P24936） Hexon-interlacing protein × 20 （P03281） Pre-protein VI × 15 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 5 （P68951） Pre-protein VI × 5 （P24937）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Hexon protein × 72 （P04133） Penton protein × 6 （P12538） Pre-hexon-linking protein VIII × 12 （P24936） Hexon-interlacing protein × 24 （P03281） Pre-protein VI × 18 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 6 （P68951） Pre-protein VI × 6 （P24937）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAP3_ADE05
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–585； UniProt 1–585

Pre-hexon-linking protein VIII

物种未注明

UniProt P24936

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Hexon protein × 720 （P04133） Penton protein × 60 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （P12537） Hexon-interlacing protein × 240 （P03281） Pre-protein VI × 180 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 60 （P68951） Pre-protein VI × 60 （P24937）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Hexon protein × 60 （P04133） Penton protein × 5 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 （P12537） Hexon-interlacing protein × 20 （P03281） Pre-protein VI × 15 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 5 （P68951） Pre-protein VI × 5 （P24937）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Hexon protein × 72 （P04133） Penton protein × 6 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 （P12537） Hexon-interlacing protein × 24 （P03281） Pre-protein VI × 18 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 6 （P68951） Pre-protein VI × 6 （P24937）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAP8_ADE05
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227 作者链 P； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227

Hexon-interlacing protein

物种未注明

UniProt P03281

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Hexon protein × 720 （P04133） Penton protein × 60 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （P24936） Pre-protein VI × 180 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 60 （P68951） Pre-protein VI × 60 （P24937）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Hexon protein × 60 （P04133） Penton protein × 5 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 10 （P24936） Pre-protein VI × 15 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 5 （P68951） Pre-protein VI × 5 （P24937）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Hexon protein × 72 （P04133） Penton protein × 6 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 12 （P24936） Pre-protein VI × 18 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 6 （P68951） Pre-protein VI × 6 （P24937）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAP9_ADE05
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 R； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 S； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 T； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

Pre-protein VI

物种未注明

UniProt P24937

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Hexon protein × 720 （P04133） Penton protein × 60 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （P24936） Hexon-interlacing protein × 240 （P03281） Pre-histone-like nucleoprotein × 60 （P68951）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Hexon protein × 60 （P04133） Penton protein × 5 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 10 （P24936） Hexon-interlacing protein × 20 （P03281） Pre-histone-like nucleoprotein × 5 （P68951）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Hexon protein × 72 （P04133） Penton protein × 6 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 12 （P24936） Hexon-interlacing protein × 24 （P03281） Pre-histone-like nucleoprotein × 6 （P68951）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-histone-like nucleoprotein × 1 （P68951）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAP6_ADE05
Isoform	—
PDB实体	6, 8
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33 作者链 V； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33 作者链 Y； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33 作者链 X； PDB构建体 1–217； UniProt 34–250

Pre-histone-like nucleoprotein

物种未注明

UniProt P68951

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1500	Hexon protein × 720 （P04133） Penton protein × 60 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （P24936） Hexon-interlacing protein × 240 （P03281） Pre-protein VI × 180 （P24937） Pre-protein VI × 60 （P24937）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 125	Hexon protein × 60 （P04133） Penton protein × 5 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 10 （P24936） Hexon-interlacing protein × 20 （P03281） Pre-protein VI × 15 （P24937） Pre-protein VI × 5 （P24937）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 150	Hexon protein × 72 （P04133） Penton protein × 6 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 12 （P24936） Hexon-interlacing protein × 24 （P03281） Pre-protein VI × 18 （P24937） Pre-protein VI × 6 （P24937）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Hexon protein × 12 （P04133） Penton protein × 1 （P12538） Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 （P12537） Pre-hexon-linking protein VIII × 2 （P24936） Hexon-interlacing protein × 4 （P03281） Pre-protein VI × 3 （P24937） Pre-protein VI × 1 （P24937）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NP_ADE05
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–11； UniProt 14–24

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6b1t
沉积日期 deposition_date	2017-09-18
结构标题 title	Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII
关键词 keywords	human adenovirus, cement protein, dsDNA genome packaging, genome-capsid co-assembly, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6b1t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6b1t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6b1t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	378.50 Å
总 Rg	378.60 Å
原子数	6008040
残基数	752640
排除体积	106190000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6b1t__assembly_1__model_1`	1500-meric （1500）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6b1t__assembly_2__model_1`	25-meric （25）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`6b1t__assembly_3__model_1`	125-meric （125）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`6b1t__assembly_4__model_1`	150-meric （150）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`6b1t__assembly_5__model_1`	25-meric （25）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hexon protein
分子量 formula_weight	108107.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	100134

MATPSMMPQWSYMHISGQDASEYLSPGLVQFARATETYFSLNNKFRNPTVAPTHDVTTDRSQRLTLRFIPVDREDTAYSYKARFTLAVGDNRVLDMASTYFDIRGVLDRGPTFKPYSGTAYNALAPKGAPNPCEWDEAATALEINLEEEDDDNEDEVDEQAEQQKTHVFGQAPYSGINITKEGIQIGVEGQTPKYADKTFQPEPQIGESQWYETEINHAAGRVLKKTTPMKPCYGSYAKPTNENGGQGILVKQQNGKLESQVEMQFFSTTEATAGNGDNLTPKVVLYSEDVDIETPDTHISYMPTIKEGNSRELMGQQSMPNRPNYIAFRDNFIGLMYYNSTGNMGVLAGQASQLNAVVDLQDRNTELSYQLLLDSIGDRTRYFSMWNQAVDSYDPDVRIIENHGTEDELPNYCFPLGGVINTETLTKVKPKTGQENGWEKDATEFSDKNEIRVGNNFAMEINLNANLWRNFLYSNIALYLPDKLKYSPSNVKISDNPNTYDYMNKRVVAPGLVDCYINLGARWSLDYMDNVNPFNHHRNAGLRYRSMLLGNGRYVPFHIQVPQKFFAIKNLLLLPGSYTYEWNFRKDVNMVLQSSLGNDLRVDGASIKFDSICLYATFFPMAHNTASTLEAMLRNDTNDQSFNDYLSAANMLYPIPANATNVPISIPSRNWAAFRGWAFTRLKTKETPSLGSGYDPYYTYSGSIPYLDGTFYLNHTFKKVAITFDSSVSWPGNDRLLTPNEFEIKRSVDGEGYNVAQCNMTKDWFLVQMLANYNIGYQGFYIPESYKDRMYSFFRNFQPMSRQVVDDTKYKDYQQVGILHQHNNSGFVGYLAPTMREGQAYPANFPYPLIGKTAVDSITQKKFLCDRTLWRIPFSSNFMSMGALTDLGQNLLYANSAHALDMTFEVDPMDEPTLLYVLFEVFDVVRVHRPHRGVIETVYLRTPFSAGNATT

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Penton protein
分子量 formula_weight	63356.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MRRAAMYEEGPPPSYESVVSAAPVAAALGSPFDAPLDPPFVPPRYLRPTGGRNSIRYSELAPLFDTTRVYLVDNKSTDVASLNYQNDHSNFLTTVIQNNDYSPGEASTQTINLDDRSHWGGDLKTILHTNMPNVNEFMFTNKFKARVMVSRLPTKDNQVELKYEWVEFTLPEGNYSETMTIDLMNNAIVEHYLKVGRQNGVLESDIGVKFDTRNFRLGFDPVTGLVMPGVYTNEAFHPDIILLPGCGVDFTHSRLSNLLGIRKRQPFQEGFRITYDDLEGGNIPALLDVDAYQASLKDDTEQGGGGAGGSNSSGSGAEENSNAAAAAMQPVEDMNDHAIRGDTFATRAEEKRAEAEAAAEAAAPAAQPEVEKPQKKPVIKPLTEDSKKRSYNLISNDSTFTQYRSWYLAYNYGDPQTGIRSWTLLCTPDVTCGSEQVYWSLPDMMQDPVTFRSTRQISNFPVVGAELLPVHSKSFYNDQAVYSQLIRQFTSLTHVFNRFPENQILARPPAPTITTVSENVPALTDHGTLPLRNSIGGVQRVTITDARRRTCPYVYKALGIVSPRVLSSRTF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Pre-hexon-linking protein IIIa
分子量 formula_weight	65322.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MMQDATDPAVRAALQSQPSGLNSTDDWRQVMDRIMSLTARNPDAFRQQPQANRLSAILEAVVPARANPTHEKVLAIVNALAENRAIRPDEAGLVYDALLQRVARYNSGNVQTNLDRLVGDVREAVAQRERAQQQGNLGSMVALNAFLSTQPANVPRGQEDYTNFVSALRLMVTETPQSEVYQSGPDYFFQTSRQGLQTVNLSQAFKNLQGLWGVRAPTGDRATVSSLLTPNSRLLLLLIAPFTDSGSVSRDTYLGHLLTLYREAIGQAHVDEHTFQEITSVSRALGQEDTGSLEATLNYLLTNRRQKIPSLHSLNSEEERILRYVQQSVSLNLMRDGVTPSVALDMTARNMEPGMYASNRPFINRLMDYLHRAAAVNPEYFTNAILNPHWLPPPGFYTGGFEVPEGNDGFLWDDIDDSVFSPQPQTLLELQQREQAEAALRKESFRRPSSLSDLGAAAPRSDASSPFPSLIGSLTSTRTTRPRLLGEEEYLNNSLLQPQREKNLPPAFPNNGIESLVDKMSRWKTYAQEHRDVPGPRPPTRRQRHDRQRGLVWEDDDSADDSSVLDLGGSGNPFAHLRPRLGRMF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Pre-hexon-linking protein VIII
分子量 formula_weight	24710.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P

MSKEIPTPYMWSYQPQMGLAAGAAQDYSTRINYMSAGPHMISRVNGIRAHRNRILLEQAAITTTPRNNLNPRSWPAALVYQESPAPTTVVLPRDAQAEVQMTNSGAQLAGGFRHRVRSPGQGITHLTIRGRGIQLNDESVSSSLGLRPDGTFQIGGAGRPSFTPRQAILTLQTSSSEPRSGGIGTLQFIEEFVPSVYFNPFSGPPGHYPDQFIPNFDAVKDSADGYD

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Hexon-interlacing protein
分子量 formula_weight	14468.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,R,S,T

MSTNSFDGSIVSSYLTTRMPPWAGVRQNVMGSSIDGRPVLPANSTTLTYETVSGTPLETAASAAASAAAATARGIVTDFAFLSPLASSAASRSSARDDKLTALLAQLDSLTRELNVVSQQLLDLRQQVSALKASSPPNAV

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Pre-protein VI
分子量 formula_weight	3585.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,V,Y

MEDINFASLAPRHGSRPFMGNWQDIGTSNMSGG

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Pre-histone-like nucleoprotein
分子量 formula_weight	1198.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

GLRFPSKMFGG

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Pre-protein VI
分子量 formula_weight	23460.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

AFSWGSLWSGIKNFGSTVKNYGSKAWNSSTGQMLRDKLKEQNFQQKVVDGLASGISGVVDLANQAVQNKINSKLDPRPPVEEPPPAVETVSPEGRGEKRPRPDREETLVTQIDEPPSYEEALKQGLPTTRPIAPMATGVLGQHTPVTLDLPPPADTQQKPVLPGPTAVVVTRPSRASLRRAASGPRSLRPVASGNWQSTLNSIVGLGVQSLKRRRCF

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	53000

Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hexon protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Penton protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-hexon-linking protein IIIa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-hexon-linking protein VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Hexon-interlacing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-protein VI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-histone-like nucleoprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6b1t__assembly_1__model_1

6b1t__assembly_1__model_1 | I(q)

6b1t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer