← 返回搜索
6c95

The Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex bound to HYPK

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 102.9 Å Quality: EXCELLENT
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit

Homo sapiens

UniProt Q9BXJ9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–866 未记录 N-alpha-acetyltransferase 10 × 1 （P41227） Huntingtin-interacting protein K × 1 （Q9NX55） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；19.5% PEG3350, 11% Tascimate, pH 6.5 分辨率 3.15 Å R-free 0.255

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6C95 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6C9M The Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–866（866 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG3350, 10% Tascimate, pH 7.5, 2% acetone
分辨率 2.80 Å R-free 0.242
6C9M The Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex 提交 2018-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–866（866 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG3350, 10% Tascimate, pH 7.5, 2% acetone
分辨率 2.80 Å R-free 0.242
6PPL Cryo-EM structure of human NatE complex (NatA/Naa50) 提交 2019-07-08 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–866（866 aa）
未记录 ACO ACETYL COENZYME *A × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6PW9 Cryo-EM structure of human NatE/HYPK complex 提交 2019-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–866（866 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.03 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 DB 1–866（866 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 DB 1–866（866 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 DB 1–866（866 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9FPZ Human NatA-MAP2 80S ribosome complex 提交 2024-06-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 B 1–841（841 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9FQ0 Human NatA-NAC-MAP1 80S ribosome complex 提交 2024-06-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–841（841 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.67 Å
9GJ5 Human 80S ribosome in complex with NatA in distal position and Ebp1 提交 2024-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 B 1–841（841 aa）
未记录 KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.61 Å
9GJ6 Human 80S ribosome in complex with NatA in proximal and distal position 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 B 1–841（841 aa）
链 D 1–841（841 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 XA 1–866（866 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å

共 11 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NAA15_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–866； UniProt 1–866

N-alpha-acetyltransferase 10

Homo sapiens

UniProt P41227

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–235 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit × 1 （Q9BXJ9） Huntingtin-interacting protein K × 1 （Q9NX55） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；19.5% PEG3350, 11% Tascimate, pH 6.5 分辨率 3.15 Å R-free 0.255

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6C95 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6C9M The Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–235（235 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG3350, 10% Tascimate, pH 7.5, 2% acetone
分辨率 2.80 Å R-free 0.242
6C9M The Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex 提交 2018-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–235（235 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG3350, 10% Tascimate, pH 7.5, 2% acetone
分辨率 2.80 Å R-free 0.242
6PPL Cryo-EM structure of human NatE complex (NatA/Naa50) 提交 2019-07-08 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–235（235 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACO ACETYL COENZYME *A × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
6PW9 Cryo-EM structure of human NatE/HYPK complex 提交 2019-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–235（235 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.03 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 DC 1–235（235 aa）
突变：E24Q, Y26F MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 DC 1–235（235 aa）
突变：E24Q, Y26F UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 DC 1–235（235 aa）
突变：E24Q, Y26F UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9FPZ Human NatA-MAP2 80S ribosome complex 提交 2024-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 2 2–170（169 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9FQ0 Human NatA-NAC-MAP1 80S ribosome complex 提交 2024-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 2 2–170（169 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.67 Å
9GJ5 Human 80S ribosome in complex with NatA in distal position and Ebp1 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 2 2–170（169 aa）
未记录 KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.61 Å
9GJ6 Human 80S ribosome in complex with NatA in proximal and distal position 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 A 1–235（235 aa）
链 C 1–235（235 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 XB 1–235（235 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å

共 11 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NAA10_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 2–236； UniProt 1–235

Huntingtin-interacting protein K

Homo sapiens

UniProt Q9NX55

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–129 未记录 N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit × 1 （Q9BXJ9） N-alpha-acetyltransferase 10 × 1 （P41227） IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；19.5% PEG3350, 11% Tascimate, pH 6.5 分辨率 3.15 Å R-free 0.255

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6C95 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6PW9 Cryo-EM structure of human NatE/HYPK complex 提交 2019-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–129（129 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.03 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 DD 1–121（121 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HYPK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6c95

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6c95
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6c95
沉积日期 deposition_date2018-01-25
结构标题 titleThe Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex bound to HYPK
关键词 keywordsNatA, HYPK, N-terminal acetylation, Huntingtin interacting protein, protein complex, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier33.25 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron32.37 Å
零角强度 I(0) i0226347000.00
分子量 molecular_weight120010.0 kDa
排除体积 excluded_volume150240 ų
包络体积 envelope_volume198320 ų
水化壳体积 shell_volume49379 ų
包络直径 envelope_diameter111.8 Å
壳层 Rg shell_rg40.59 Å
包络 Rg envelope_rg32.05 Å
形状 Rg shape_rg32.36 Å
总 Rg total_rg33.06 Å
总原子数 total_atoms8420
残基数 n_residues1028
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax102.9 Å
Rg (实空间) rg_real33.02 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.59 Å
I(0) (实空间) i0_real2.2630e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1640e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal33.12 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal226400000.0000
解质量估计 total_estimate0.9028
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary42.9 Å
偏度 Skewness skewness0.128
峰度 Kurtosis kurtosis-0.482
角度范围 angular_range— – 0.2400 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha42160000.0000
实空间数据点数 n_real_points49
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.930; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.952
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6c95b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.108 — Acyl-CoA N-acyltransferases (Nat)
超家族 Superfamily superfamilyd.108.1 — Acyl-CoA N-acyltransferases (Nat)
家族 Family familyd.108.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6c95B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology630 — Aminopeptidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Gcn5-related N-acetyltransferase (GNAT)
▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)