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6C95
The Human NatA (Naa10/Naa15) amino-terminal acetyltransferase complex bound to HYPK
提交 2018-01-25
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聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
1–235(235 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;19.5% PEG3350, 11% Tascimate, pH 6.5
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分辨率 3.15 Å
R-free 0.255
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6PPL
Cryo-EM structure of human NatE complex (NatA/Naa50)
提交 2019-07-08
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
1–235(235 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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ACO ACETYL COENZYME *A × 2
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.02 Å
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6PW9
Cryo-EM structure of human NatE/HYPK complex
提交 2019-07-22
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 C
1–235(235 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ACO ACETYL COENZYME *A × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.03 Å
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9F1B
Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E
提交 2024-04-18
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突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 83
PDB 声明:89-meric
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链 DC
1–235(235 aa)
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突变:E24Q, Y26F
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MG MAGNESIUM ION × 420
ZN ZINC ION × 8
UNX UNKNOWN LIGAND × 306
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
SPD SPERMIDINE × 30
SPM SPERMINE × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.01 Å
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9F1C
Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E
提交 2024-04-18
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突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 84
PDB 声明:90-meric
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链 DC
1–235(235 aa)
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突变:E24Q, Y26F
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UNX UNKNOWN LIGAND × 277
MG MAGNESIUM ION × 420
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SPD SPERMIDINE × 30
SPM SPERMINE × 3
ZN ZINC ION × 8
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.78 Å
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9F1D
Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK
提交 2024-04-18
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突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 85
PDB 声明:91-meric
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链 DC
1–235(235 aa)
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突变:E24Q, Y26F
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UNX UNKNOWN LIGAND × 295
SPD SPERMIDINE × 30
MG MAGNESIUM ION × 420
SPM SPERMINE × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.26 Å
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9FPZ
Human NatA-MAP2 80S ribosome complex
提交 2024-06-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:13-meric
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链 2
2–170(169 aa)
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未记录
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CO COBALT (II) ION × 2
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.69 Å
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9FQ0
Human NatA-NAC-MAP1 80S ribosome complex
提交 2024-06-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:hexadecameric
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链 2
2–170(169 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.67 Å
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9GJ5
Human 80S ribosome in complex with NatA in distal position and Ebp1
提交 2024-08-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:13-meric
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链 2
2–170(169 aa)
|
未记录
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KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.61 Å
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9GJ6
Human 80S ribosome in complex with NatA in proximal and distal position
提交 2024-08-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 15
PDB 声明:17-meric
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链 A
1–235(235 aa)
链 C
1–235(235 aa)
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未记录
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IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.91 Å
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9QQB
Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA
提交 2025-03-31
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突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 84
PDB 声明:89-meric
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链 XB
1–235(235 aa)
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未记录
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SPD SPERMIDINE × 30
SPM SPERMINE × 3
MG MAGNESIUM ION × 412
UNX UNKNOWN LIGAND × 168
ZN ZINC ION × 8
IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.43 Å
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