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6dud

JAK3 with cyanamide CP12

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 66.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tyrosine-protein kinase JAK3

Homo sapiens

UniProt P52333

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 812–1124 片段：kinase domain 突变：C1048S HB4 N-[(1S)-6-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]imidoformamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea 分辨率 1.66 Å R-free 0.215

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6DUD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1YVJ Crystal structure of the Jak3 kinase domain in complex with a staurosporine analogue 提交 2005-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 814–1103（290 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DTV (2S,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 2 4ST 1,2,3,4-TETRAHYDROGEN-STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；malonate, glycerol, pipes, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.254
3LXK Structural and Thermodynamic Characterization of the TYK2 and JAK3 Kinase Domains in Complex with CP-690550 and CMP-6 提交 2010-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 806–1124（319 aa） 片段：Kinase Domain
突变：C1048S MI1 3-{(3R,4R)-4-methyl-3-[methyl(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]piperidin-1-yl}-3-oxopropanenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG-3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.02% Phenylurea, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
3LXL Structural and Thermodynamic Characterization of the TYK2 and JAK3 Kinase Domains in Complex with CP-690550 and CMP-6 提交 2010-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 806–1124（319 aa） 片段：Kinase Domain
突变：C1048S IZA 2-TERT-BUTYL-9-FLUORO-3,6-DIHYDRO-7H-BENZ[H]-IMIDAZ[4,5-F]ISOQUINOLINE-7-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG-3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.02% phenylurea, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.74 Å R-free 0.227
3PJC Crystal structure of JAK3 complexed with a potent ATP site inhibitor showing high selectivity within the Janus kinase family 提交 2010-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：UNP residues 812-1124
未记录 PJC 3-(1H-indol-3-yl)-4-[2-(4-oxopiperidin-1-yl)-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1H-pyrrole-2,5-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；CO-CRYSTALLIZATION WITH COMPOUND NVP-BLZ295 ADDED BEFORE CONCENTRATION OF THE PROTEIN AT 3 FOLD MOLAR EXCESS. 8% PEG 4000, 0.05 M MES PH 6.5, 0.01 M MGCL2. PROTEIN AT 10.0 MG/ML. CRYOPROTECTION: 30% GLYCEROL + WELL SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.215
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.265
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.265
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.265
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 813–1100（288 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.265
4HVD JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((S)-1,2,2-trimethyl-propyl)-amide 提交 2012-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：RESIDUES 811-1124
突变：C1040S, C1048S PHU 1-phenylurea × 1 933 2-cyclopropyl-N-[(2S)-3,3-dimethylbutan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.259
4HVG JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((S)-2-hydroxy-1,2-dimethyl-propyl)-amide 提交 2012-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：RESIDUES 811-1124
突变：C1040S, C1048S 19Q 2-cyclopropyl-N-[(2S)-3-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.75 Å R-free 0.274
4HVH JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((R)-2-hydroxy-1,2-dimethyl-propyl 提交 2012-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：RESIDUES 811-1124
突变：C1040S, C1048S 19R 2-cyclopropyl-N-[(2R)-3-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.283
4HVI JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((R)-1-methyl-2-oxo-2-piperidin-1-yl-ethyl)-amide 提交 2012-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：RESIDUES 811-1124
突变：C1040S, C1048S 19S 2-cyclopropyl-N-[(2R)-1-oxo-1-(piperidin-1-yl)propan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.303
4I6Q JAK3 kinase domain in complex with 2-Phenoxy-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((S)-1-cyclopropyl-ethyl)-amide 提交 2012-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：RESIDUES 811-1124, PROTEIN KINASE DOMAIN
突变：C1040S, C1048S PHU 1-phenylurea × 1 1DT N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-2-phenoxy-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.245
4QPS Crystal structure of Jak3 complexed to N-[3-(6-Phenylamino-pyrazin-2-yl)-3H-benzoimidazol-5-yl]-acrylamide 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1103（293 aa） 片段：Jak3, unp residues 811-1103
突变：C1040S, C1048S, D949A 37Q N-{1-[6-(phenylamino)pyrazin-2-yl]-1H-benzimidazol-6-yl}prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；25% PEG-3350, 0.2 M ammonium sulfate and 0.1 M BisTRIS pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.251
4QPS Crystal structure of Jak3 complexed to N-[3-(6-Phenylamino-pyrazin-2-yl)-3H-benzoimidazol-5-yl]-acrylamide 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 811–1103（293 aa） 片段：Jak3, unp residues 811-1103
突变：C1040S, C1048S, D949A 37Q N-{1-[6-(phenylamino)pyrazin-2-yl]-1H-benzimidazol-6-yl}prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；25% PEG-3350, 0.2 M ammonium sulfate and 0.1 M BisTRIS pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.251
4QT1 JAK3 kinase domain in complex with 1-[(3S)-1-isobutylsulfonyl-3-piperidyl]-3-(5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-2-yl)urea 提交 2014-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：RESIDUES 811-1124, PROTEIN KINASE DOMAIN
突变：C1040S, C1048S 3C9 1-{(3S)-1-[(2-methylpropyl)sulfonyl]piperidin-3-yl}-3-(5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-2-yl)urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG 3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.273
4RIO Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with a pyrrolopyridazine carboxamide inhibitor 提交 2014-10-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 810–1100（291 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP residues 810-1100)
突变：C811S, C1040S, C1048S 3QX 4-{[(1R,2S)-2-fluoro-2-methylcyclopentyl]amino}pyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；30% PEG-3350, 200MM MAGNESIUM CHLORIDE 100MM BIS-TRIS PH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.69 Å R-free 0.281
4V0G JAK3 in complex with a covalent EGFR inhibitor 提交 2014-09-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 816–1098（283 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 816-1098
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） G9B N-[3-(2-{3-amino-6-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazin-2-yl}-1H-benzimidazol-1-yl)phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4V0G JAK3 in complex with a covalent EGFR inhibitor 提交 2014-09-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 816–1098（283 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 816-1098
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） G9B N-[3-(2-{3-amino-6-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazin-2-yl}-1H-benzimidazol-1-yl)phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 811–1124（314 aa） 片段：UNP residues 811-1124
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.90 Å R-free 0.240
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 811–1124（314 aa） 片段：UNP residues 811-1124
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.90 Å R-free 0.240
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 811–1124（314 aa） 片段：UNP residues 811-1124
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.90 Å R-free 0.240
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 811–1124（314 aa） 片段：UNP residues 811-1124
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.90 Å R-free 0.240
5LWM Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 4 (FM381) 提交 2016-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 79T 2-cyano-3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]-~{N},~{N}-dimethyl-prop-2-enamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；18-25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5-6.1
分辨率 1.55 Å R-free 0.204
5LWN Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 5 (FM409) 提交 2016-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 79R (~{Z})-2-cyano-~{N},~{N}-dimethyl-3-[5-[3-[(1~{S},2~{R})-2-methylcyclohexyl]-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-4-yl]furan-2-yl]prop-2-enamide × 1 79S (2~{S})-2-cyano-~{N},~{N}-dimethyl-3-[5-[3-[(1~{S},2~{R})-2-methylcyclohexyl]-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-4-yl]furan-2-yl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；18-25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5-6.1
分辨率 1.60 Å R-free 0.209
5TOZ JAK3 with covalent inhibitor PF-06651600 提交 2016-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：UNP residues 812-1124
未记录 7H4 1-{(2S,5R)-2-methyl-5-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]piperidin-1-yl}propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG-3350, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.98 Å R-free 0.215
5TTS Jak3 with covalent inhibitor 4 提交 2016-11-04 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 812-1124)
突变：C1048S 7KU 1-{(3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]piperidin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea
分辨率 2.34 Å R-free 0.263
5TTU Jak3 with covalent inhibitor 7 提交 2016-11-04 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 812-1124)
突变：C1048S 7KV 1-[(3aR,7aR)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydro-6H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-6-yl]propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea
分辨率 1.72 Å R-free 0.212
5TTV Jak3 with covalent inhibitor 6 提交 2016-11-04 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 812-1124)
突变：C1048S 7KX N-[3-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea
分辨率 1.93 Å R-free 0.250
5VO6 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A PYRROLOPYRIDAZINE INHIBITOR 提交 2017-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1100（289 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)
突变：YES 9J4 4-{[(1R,3S)-3-amino-2,2,3-trimethylcyclopentyl]amino}-6-phenylpyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL
分辨率 2.65 Å R-free 0.284
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K
分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K
分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K
分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K
分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5WFJ THE JAK3 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A COVALENT INHIBITOR 提交 2017-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 810–1100（291 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)
突变：C4S, C233S, C241S 9Z4 4-({[3-(propanoylamino)phenyl]methyl}amino)pyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K
分辨率 2.48 Å R-free 0.255
6AAK Crystal structure of JAK3 in complex with peficitinib 提交 2018-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100
链 B 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100
突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9T6 4-[[(1S,3R)-5-oxidanyl-2-adamantyl]amino]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；buffer, salt, precipitant
分辨率 2.67 Å R-free 0.326
6AAK Crystal structure of JAK3 in complex with peficitinib 提交 2018-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100
链 D 814–1100（287 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100
突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9T6 4-[[(1S,3R)-5-oxidanyl-2-adamantyl]amino]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；buffer, salt, precipitant
分辨率 2.67 Å R-free 0.326
6DA4 JAK3 with Cyanamide CP10 提交 2018-05-01 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：kinase domain
突变：C1048S G4V (Z)-1-{2,2-difluoro-6-[5-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazin-4-yl}methanimine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea
分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6DB3 JAK3 with Cyanamide CP23 提交 2018-05-02 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：kinase domain
突变：C1048S G54 [(1S)-1-methyl-6-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]cyanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea
分辨率 1.97 Å R-free 0.224
6DB4 JAK3 with Cyanamide CP34 提交 2018-05-02 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa） 片段：kinase domain
突变：C1048S G4Y N-[(1S)-6-(5-phenyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]imidoformamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea
分辨率 1.66 Å R-free 0.216
6GL9 Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 10 (FM475) 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 F3W (~{E})-3-[3-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)phenyl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2
分辨率 1.70 Å R-free 0.244
6GL9 Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 10 (FM475) 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 812–1103（292 aa）
未记录 F3W (~{E})-3-[3-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)phenyl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2
分辨率 1.70 Å R-free 0.244
6GLA Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 11 (FM481) 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 F4B (~{E})-3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2
分辨率 1.92 Å R-free 0.273
6GLA Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 11 (FM481) 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 812–1103（292 aa）
未记录 F4B (~{E})-3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2
分辨率 1.92 Å R-free 0.273
6GLB Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 20 (FM484) 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 F48 3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]propanenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2
分辨率 2.00 Å R-free 0.290
6GLB Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 20 (FM484) 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 812–1103（292 aa）
未记录 F48 3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]propanenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2
分辨率 2.00 Å R-free 0.290
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 815–1099（285 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0
分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 815–1099（285 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0
分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 815–1099（285 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0
分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 815–1099（285 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0
分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6NY4 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with a pyrrolopyridazine carboxamide inhibitor 提交 2019-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 810–1100（291 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 810-1100)
突变：C811S,C1040S,C1048S Z3A 4-{[(2R,3R)-1,3-dihydroxybutan-2-yl]amino}-6-phenylpyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；30% PEG3350, 200 mM magnesium chloride, 100 mM Bis-Tris, pH 5.8
分辨率 2.33 Å R-free 0.241
7APF Crystal structure of JAK3 in complex with FM601 (compound 10a) 提交 2020-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 RQZ 3-[3-(propanoylamino)phenyl]-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2, 0.1 M MES, pH 5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.255
7APF Crystal structure of JAK3 in complex with FM601 (compound 10a) 提交 2020-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 812–1103（292 aa）
未记录 RQZ 3-[3-(propanoylamino)phenyl]-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2, 0.1 M MES, pH 5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.255
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 812–1103（292 aa）
未记录 RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 812–1103（292 aa）
未记录 RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 812–1103（292 aa）
未记录 RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7C3N Crystal structure of JAK3 in complex with Delgocitinib 提交 2020-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1124（313 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FHX 3-[(3S,4R)-3-methyl-7-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1,7-diazaspiro[3.4]octan-1-yl]-3-oxidanylidene-propanenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；50mM Pipes pH6.0, 1.1M sodium malonate, 1.6% glycerol, 10mM DTT
分辨率 1.98 Å R-free 0.194
7Q6H HUMAN JAK3 KINASE DOMAIN WITH 1-(4-((2-((1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino)quinazolin-8-yl)amino)piperidin-1-yl)ethan-1-one 提交 2021-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 806–1124（319 aa）
未记录 934 1-[4-[[2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]quinazolin-8-yl]amino]piperidin-1-yl]ethanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PHU 1-phenylurea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；8-20% PEG3350 and 0.2-0.3M ammonium sulphate (AS). 2% phenylurea
分辨率 1.75 Å R-free 0.220
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 810–1100（291 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols
分辨率 2.15 Å R-free 0.263
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 810–1100（291 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols
分辨率 2.15 Å R-free 0.263
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 810–1100（291 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols
分辨率 2.15 Å R-free 0.263
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 810–1100（291 aa） 片段：KINASE DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols
分辨率 2.15 Å R-free 0.263
8EXM Crystal structure of PTP1B D181A/Q262A phosphatase domain with a JAK3 activation loop phosphopeptide 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 973–988（16 aa） 片段：residues 973-988 of JAK3
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；12% Peg 4K, 0.15 M Calcium acetate, 0.05 M MES (pH 6.5)
分辨率 2.35 Å R-free 0.247
9R5Z Crystal structure of JAK3 with GCL258 提交 2025-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 812–1103（292 aa）
未记录 A1JJU 3-(3-cyclohexyl-3,8,10-triazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-5-yl)benzenesulfonyl fluoride × 1 PHU 1-phenylurea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；31% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M MES pH5.5.
分辨率 1.80 Å R-free 0.289
9R5Z Crystal structure of JAK3 with GCL258 提交 2025-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 812–1103（292 aa）
未记录 A1JJU 3-(3-cyclohexyl-3,8,10-triazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-5-yl)benzenesulfonyl fluoride × 1 PHU 1-phenylurea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；31% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M MES pH5.5.
分辨率 1.80 Å R-free 0.289

共 41 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 JAK3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 9–321； UniProt 812–1124

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6dud

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6dud
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6dud
沉积日期 deposition_date2018-06-20
结构标题 titleJAK3 with cyanamide CP12
关键词 keywordskinase, covalent, TRANSFERASE-TRANSFERASE inhibitor complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.00 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.94 Å
零角强度 I(0) i016469900.00
分子量 molecular_weight30952.0 kDa
排除体积 excluded_volume38900 ų
包络体积 envelope_volume45086 ų
水化壳体积 shell_volume19967 ų
包络直径 envelope_diameter66.3 Å
壳层 Rg shell_rg25.34 Å
包络 Rg envelope_rg19.18 Å
形状 Rg shape_rg18.95 Å
总 Rg total_rg19.87 Å
总原子数 total_atoms2180
残基数 n_residues272
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax66.4 Å
Rg (实空间) rg_real19.95 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.40 Å
I(0) (实空间) i0_real1.6470e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.9000e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal19.96 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal16470000.0000
解质量估计 total_estimate0.8768
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.7 Å
偏度 Skewness skewness0.302
峰度 Kurtosis kurtosis-0.219
角度范围 angular_range— – 0.3950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4221000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.815; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.949
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6duda_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id6dudA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id6dudA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)