SAXSdb — 6f3t

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–608； UniProt 194–800 作者链 B； PDB构建体 2–608； UniProt 194–800 作者链 C； PDB构建体 2–608； UniProt 194–800 作者链 D； PDB构建体 2–608； UniProt 194–800

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

Homo sapiens

UniProt P49848

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 1 （Q16594） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF6_HUMAN
Isoform	P49848-3
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–88； UniProt 42–129 作者链 G； PDB构建体 1–88； UniProt 42–129 作者链 I； PDB构建体 1–88； UniProt 42–129 作者链 K； PDB构建体 1–88； UniProt 42–129

Transcription initiation factor TFIID subunit 9

Homo sapiens

UniProt Q16594

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） CHLORIDE ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （P49848） CHLORIDE ION × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–116； UniProt 5–120 作者链 H； PDB构建体 1–116； UniProt 5–120 作者链 J； PDB构建体 1–116； UniProt 5–120 作者链 L； PDB构建体 1–116； UniProt 5–120

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6f3t
沉积日期 deposition_date	2017-11-28
结构标题 title	Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex
关键词 keywords	Transcription, Complex, TFIID, TAF, TBD-associated Factor; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6f3t__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6f3t__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6f3t__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	29.35 Å
Rg（电子密度）	28.57 Å
总 Rg	29.46 Å
原子数	12094
残基数	758
排除体积	108170 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6f3t__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6f3t__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6f3t__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`6f3t__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 5
分子量 formula_weight	68950.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	48812

GDQPDVSAVLSAYNQQGDPTMYEEYYSGLKHFIECSLDCHRAELSQLFYPLFVHMYLELVYNQHENEAKSFFEKFHGDQECYYQDDLRVLSSLTKKEHMKGNETMLDFRTSKFVLRISRDSYQLLKRHLQEKQNNQIWNIVQEHLYIDIFDGMPRSKQQIDAMVGSLAGEAKREANKSKVFFGLLKEPEIEVPLDDEDEEGENEEGKSKKKKPKKDSIGSKSKKQDPNAPPQNRIPLPELKDSDKLDKIMNMKETTKRVRLGPDCLPSICFYTFLNAYQGLTAVDVTDDSSLIAGGFADSTVRVWSVTPKKLRSVKQASDLSLIDKESDDVLERIMDEKTASELKILYGHSGPVYGASFSPDRNYLLSSSEDGTVRLWSLQTFTCLVGYKGHNYPVWDTQFSPYGYYFVSGGHDRVARLWATDHYQPLRIFAGHLADVNCTRFHPNSNYVATGSADRTVRLWDVLNGNCVRIFTGHKGPIHSLTFSPNGRFLATGATDGRVLLWDIGHGLMVGELKGHTDTVCSLRFSRDGEILASGSMDNTVRLWDAIKAFEDLETDDFTTATGHINLPENSQELLLGTYMTKSTPVVHLHFTRRNLVLAAGAYSPQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	unidentified baculovirus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 6
分子量 formula_weight	10888.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,G,I,K

KKLKLSNTVLPSESMKVVAESMGIAQIQEETCQLLTDEVSYRIKEIAQDALKFMHMGKRQKLTTSDIDYALKLKNVEPLYGFHAQEFIRLRRRA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	unidentified baculovirus

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 9
分子量 formula_weight	13325.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,H,J,L

KTASPKSMPKDAQMMAQILKDMGITEYEPRVINQMLEFAFRYVTTILDDAKIYSSHAKKATVDADDVRLAIQCRADQSFTSPPPRDFLLDIARQRNQTPLPLIKPYSGPRLPPDRY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	unidentified baculovirus

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	391

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6f3tE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6f3tG01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6f3tI01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

结构域编号 domain_id	6f3tK01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Histone, subunit A

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晶胞边长 a length_a	339.050 Å
晶胞边长 b length_b	339.050 Å
晶胞边长 c length_c	339.050 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	96

空间群 space_group	I 2 3
空间群编号 int_tables_number	197
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	79.915 Å
R 因子 r_factor	0.1984
R_work r_work	0.1973
R_free r_free	0.2200

Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6f3t__assembly_4__model_1

6f3t__assembly_4__model_1 | I(q)

6f3t__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transcription initiation factor TFIID subunit 9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6f3t__assembly_4__model_1

6f3t__assembly_4__model_1 | I(q)

6f3t__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)