6f3z

Complex of E. coli LolA and periplasmic domain of LolC

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Lipoprotein-releasing system transmembrane protein LolC

Escherichia coli K-12

UniProt P0ADC3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Outer-membrane lipoprotein carrier protein × 1 (P61316) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Outer-membrane lipoprotein carrier protein × 1 (P61316) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LOLC_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–219; UniProt 48–266 作者链 C; PDB构建体 1–219; UniProt 48–266

Outer-membrane lipoprotein carrier protein

Escherichia coli K-12

UniProt P61316

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Lipoprotein-releasing system transmembrane protein LolC × 1 (P0ADC3) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Lipoprotein-releasing system transmembrane protein LolC × 1 (P0ADC3) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LOLA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 25–206; UniProt 22–203 作者链 D; PDB构建体 25–206; UniProt 22–203

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6f3z
沉积日期 deposition_date2017-11-29
结构标题 titleComplex of E. coli LolA and periplasmic domain of LolC
关键词 keywordsLipoprotein trafficking, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6f3z__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6f3z__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6f3z__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.27 Å
Rg(电子密度)25.40 Å
总 Rg26.20 Å
原子数3228
残基数413
排除体积56900 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6f3z__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6f3z__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd6f3zb1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.125 — LolA-like prokaryotic lipoproteins and lipoprotein localization factors
超家族 Superfamily superfamilyb.125.1 — Prokaryotic lipoproteins and lipoprotein localization factors
家族 Family familyb.125.1.1 — Outer-membrane lipoproteins carrier protein LolA
结构域编号 domain_idd6f3zb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6f3zd1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.125 — LolA-like prokaryotic lipoproteins and lipoprotein localization factors
超家族 Superfamily superfamilyb.125.1 — Prokaryotic lipoproteins and lipoprotein localization factors
家族 Family familyb.125.1.1 — Outer-membrane lipoproteins carrier protein LolA
结构域编号 domain_idd6f3zd2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id6f3zB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture50 — Clam
拓扑 Topology topology20 — outer membrane lipoprotein receptor (LolB), chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Lipoprotein localisation LolA/LolB/LppX
结构域编号 domain_id6f3zD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture50 — Clam
拓扑 Topology topology20 — outer membrane lipoprotein receptor (LolB), chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Lipoprotein localisation LolA/LolB/LppX
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7. 引用文献 (1)