Immunoglobulin G-binding protein G,Serine/arginine-rich splicing factor 1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 RNA 1 PDB 声明:dimeric(2) 与全部聚合物数一致 | 链 B; UniProt 304–357 | 未记录 | ;RNA (5'-R(*AP*AP*CP*AP*AP*A)-3') ; × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 7;313 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 atmospheric NMR样品组成:0.5 mM [U-99% 15N] SRSF1 RRM1, 0.5 mM RNA (5'-R(*AP*AP*CP*AP*AP*A)-3'), 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成:0.5 mM [U-99% 15N] SRSF1 RRM1, 0.5 mM NA RNA (5'-R(*AP*AP*CP*AP*AP*A)-3'), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] SRSF1 RRM1, 0.5 mM NA RNA (5'-R(*AP*AP*CP*AP*AP*A)-3'), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6HPJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10DV Room Temperature X-Ray Structure of SARS CoV-2 Main Protease Intermediate Precursor with Ensitrelvir (ESV) 提交 2026-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
304–357(54 aa)
链 B
304–357(54 aa)
|
突变:C145A 突变:C145A | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5 or 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 1FCC CRYSTAL STRUCTURE OF THE C2 FRAGMENT OF STREPTOCOCCAL PROTEIN G IN COMPLEX WITH THE FC DOMAIN OF HUMAN IGG 提交 1995-01-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
372–427(56 aa)
链 D
372–427(56 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.357 |
| 1FCL DELTA1.5: A COMPUTATIONALLY DESIGNED CORE VARIANT OF THE B1 DOMAIN OF STREPTOCOCCAL PROTEIN G 提交 2000-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
302–357(56 aa)
片段:GB1_DELTA1.5
|
突变:Y3F, L7I, F30L, A34I, V39I, F52W | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM sodium phosphate;压力 Atmospheric
NMR样品组成
1 mM unlabeled protein in 50 mM sodium phosphate, pH 6.0 | either D2O or 90:10 H2O:D2O
|
分辨率未提供 |
| 1FD6 DELTA0: A COMPUTATIONALLY DESIGNED CORE VARIANT OF THE B1 DOMAIN OF STREPTOCOCCAL PROTEIN G 提交 2000-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
302–357(56 aa)
片段:GB1_DELT0
|
突变:Y3F, L7I, V39I | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM sodium phosphate;压力 ambient
NMR样品组成
3 mM protein in 50 mM sodium phosphate, pH 6.0 | either D2O or 90:10 H2O:D2O
|
分辨率未提供 |
| 1GB4 HYPERTHERMOPHILIC VARIANT OF THE B1 DOMAIN FROM STREPTOCOCCAL PROTEIN G, NMR, 47 STRUCTURES 提交 1998-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
372–427(56 aa)
片段:B1 DOMAIN
|
突变:V1M, Y4F, V7I, T17I, T19I, T26E, V30I, V40I | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM;压力 ATMOSPHERIC
NMR样品组成
H2O/D2O
|
分辨率未提供 |
| 1GJS Solution structure of the Albumin binding domain of Streptococcal Protein G 提交 2001-08-02 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
254–299(46 aa)
片段:ALBUMIN-BINDING DOMAIN RESIDUES 254-299
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2;300 K;压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1GJT Solution structure of the Albumin binding domain of Streptococcal Protein G 提交 2001-08-02 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
254–299(46 aa)
片段:ALBUMIN-BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2;300 K;压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1IBX NMR STRUCTURE OF DFF40 AND DFF45 N-TERMINAL DOMAIN COMPLEX 提交 2001-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
302–357(56 aa)
片段:B1 DOMAIN OF PROTEIN G FUSED WITH N-TERMINAL DOMAIN (CIDE DOMAIN) OF DFF45
|
突变:T(-43)Q | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;296 K;离子强度(mmCIF原始值)50 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex 90% deuterated, U-15N/13C labeled DFF40 non-labeled DFF45 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex U-13C labeled DFF45 non-labeled DFF40 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl D2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex 90% deuterated, U-15N/13C labeled DFF45 non-labeled DFF40 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex U-15N labeled DFF40 non-labeled DFF45 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex U-15N labeled DFF45 non-labeled DFF40 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex perdeuterated, U-15N labeled DFF40 non-labeled DFF45 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex perdeuterated, U-15N labeled DFF45 non-labeled DFF40 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex 10% 13C labeled DFF40 non-labeled DFF45 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex 10% 13C labeled DFF45 non-labeled DFF40 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl 10%D2O/90%H2O
NMR样品组成
0.6 mM DFF40/DFF45 NTD complex U-13C labeled DFF40 non-labeled DFF45 | 20 mM Phosphate buffer 5 mM DTT, 50 mM NaCl D2O
|
分辨率未提供 |
| 1P7E GB3 solution structure obtained by refinement of X-ray structure with dipolar couplings 提交 2003-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
444–497(54 aa)
片段:THIRD IGG-BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
25 mM NaH2PO4/Na2HPO4, 0.2 mg/mL NaN3, 1.5 mM GB3 protein and aligning media
|
分辨率未提供 |
| 1P7F GB3 solution structure obtained by refinement of X-ray structure with dipolar couplings 提交 2003-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
444–497(54 aa)
片段:THIRD IGG-BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
25 mM NaH2PO4/Na2HPO4, 0.2 mg/mL NaN3, 1.5 mM GB3 protein and aligning media
|
分辨率未提供 |
| 1ZXH G311 mutant protein 提交 2005-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
443–497(55 aa)
|
突变:yes | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;275 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1M;压力 ambient
NMR样品组成
G311 mutant protein, 0.1 M KPi, pH7.0, ~0.6 M GuHCl. | 0.1 M KPi, pH7.0, ~0.6 M GuHCl.
|
分辨率未提供 |
| 2GI9 Backbone Conformational Constraints in a Microcrystalline U-15N-Labeled Protein by 3D Dipolar-Shift Solid-State NMR Spectroscopy 提交 2006-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:T2Q | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5;5mM Acetate 3.8, 150mM NaCl, 50% MPD and 20% IPA, pH 4.5
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.181 |
| 2I2Y Solution structure of the RRM of SRp20 bound to the RNA CAUC 提交 2006-08-17 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:dimeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:RRM domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.4;315 K;压力 ambient
NMR样品组成
1mM SRp20 13C-15N labelled + 1 mM CAUC natural abundance in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 6.4, 1mM DTT; | 10% D2O,90% H2O
or 100% D2O
NMR样品组成
1mM SRp20 15N labelled + 1 mM CAUC natural abundance in 1mM SRp20 15N labelled in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 6.4, 1mM DTT | 10% D2O, 90% H2O
or 100% D2O
NMR样品组成
1mM SRp20 15N labelled + 1 mM CAUC with 13C labelled riboses and natural abundance bases in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 6.4, 1mM DTT; | 10% D2O, 90% H2O
or 100% D2O
NMR样品组成
1mM SRp20 15N labelled + 1 mM CAUC with A2 and U3 riboses 13C labelled and natural abundance of other riboses and all bases in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 6.4, 1mM DTT; | 10% D2O, 90% H2O
or 100% D2O
NMR样品组成
1mM SRp20 15N labelled + 1 mM CAUC with C1 and C4 riboses 13C labelled and natural abundance of other riboses and all bases, in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 6.4, 1mM DTT; | 10% D2O, 90% H2O
or 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2I38 Solution structure of the RRM of SRp20 提交 2006-08-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:RRM domain
|
突变:E129D | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.8;315 K;压力 ambient
NMR样品组成
1mM SRp20 13C-15N labelled in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 5.8, 1mM DTT; | 10% D2O, 90% H2O
or 100% D2O
NMR样品组成
1mM SRp20 15N labelled in 50 mM sodium dihydrogenophosphate, pH 5.8, 1mM DTT; | 10% D2O, 90% H2O
or 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2IGG DETERMINATION OF THE SOLUTION STRUCTURES OF DOMAINS II AND III OF PROTEIN G FROM STREPTOCOCCUS BY 1H NMR 提交 1992-08-26 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
367–430(64 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2JSV Dipole tensor-based refinement for atomic-resolution structure determination of a nanocrystalline protein by solid-state NMR spectroscopy 提交 2007-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 X
303–357(55 aa)
片段:2-1 repeat
|
突变:T2Q | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 5.5;281 K;压力 ambient
NMR样品组成
14 mg/mL [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, (4R)-2-Metylpentane-2,4-Diol (50% v/v), Isopropyl alcohol (25% v/v), 25 mg/mL GB1 in 50 mM sodium phosphate buffered H2O | H2O
NMR样品组成
14 mg/mL [U-99% 15N] protein, (4R)-2-Metylpentane-2,4-Diol (50% v/v), Isopropyl alcohol (25% v/v), 25 mg/mL GB1 in 50 mM sodium phosphate buffered H2O | H2O
NMR样品组成
14 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, (4R)-2-Metylpentane-2,4-Diol (50% v/v), Isopropyl alcohol (25% v/v), 25 mg/mL GB1 in 50 mM sodium phosphate buffered H2O | H2O
NMR样品组成
14 mg/mL (1,3) 13C glycerol, U15N protein, (4R)-2-Metylpentane-2,4-Diol (50% v/v), Isopropyl alcohol (25% v/v), 25 mg/mL GB1 in 50 mM sodium phosphate buffered H2O | H2O
NMR样品组成
14 mg/mL 2 13C glycerol, Uniform 15N protein, (4R)-2-Metylpentane-2,4-Diol (50% v/v), Isopropyl alcohol (25% v/v), 25 mg/mL GB1 in 50 mM sodium phosphate buffered H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 2KHU Solution Structure of the Ubiquitin-Binding Motif of Human Polymerase Iota 提交 2009-04-11 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357, 676-715
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;25 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成
1-4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] D2O-1, 1-4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] H2O-2, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KHW Solution Structure of the human Polymerase iota UBM2-Ubiquitin Complex 提交 2009-04-13 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357, 676-715
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 15N] entity_1-1, 4 mM entity_2-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3 mM [U-100% 15N] entity_1-3, 3 mM [U-100% 15N] entity_2-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-5, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-6, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-7, 4 mM entity_2-8, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KN4 The structure of the RRM domain of SC35 提交 2009-08-14 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357 from P19909, UNP residues 9-101 from Q01130
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;305 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SC35-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SC35-2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 15N] SC35-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM SC35-4, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KQ4 Atomic resolution protein structure determination by three-dimensional transferred echo double resonance solid-state nuclear magnetic resonance spectroscopy 提交 2009-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 X
303–357(55 aa)
片段:UNP residues 303 to 357
|
突变:T2Q | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
压力 ambient
NMR样品组成
30 mg 1,3-13C glycerol, U 15N entity-1, 50 v/v MPTG-2, solid | solid
NMR样品组成
30 mg 2-13C glycerol, U 15N entity-3, 50 v/v MPTG-4, solid | solid
|
分辨率未提供 |
| 2KWD Supramolecular Protein Structure Determination by Site-Specific Long-Range Intermolecular Solid State NMR Spectroscopy 提交 2010-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
304–357(54 aa)
链 B
304–357(54 aa)
链 C
304–357(54 aa)
链 D
304–357(54 aa)
链 E
304–357(54 aa)
|
突变:T2Q 突变:T2Q 突变:T2Q 突变:T2Q 突变:T2Q | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
273 K;压力 1
NMR样品组成
20 mg [U-1,3-13C-glycerol; U-100% 15N] GB1-1, solid | solid
NMR样品组成
50 % [U-1,3-13C-glycerol] GB1-2, 50 % [U-99% 15N] GB1-3, solid | solid
NMR样品组成
20 mg [U-2-13C-glycerol; U-100% 15N] GB1-4, solid | solid
|
分辨率未提供 |
| 2LUM Three-State Ensemble obtained from eNOEs of the Third Immunoglobulin Binding Domain of Protein G (GB3) 提交 2012-06-18 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
444–497(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
4 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Third Immunoglobulin G-binding protein G, 50 mM potassium phosphate, 0.5 mg/mL sodium azide, 50 mM sodium chloride, 97% H2O/3% D2O | 97% H2O/3% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N9K 1H, 13C, and 15N Chemical Shift Assignments for in vitro GB1 提交 2015-11-26 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
片段:UNP residues 303-357
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;295 K;离子强度(mmCIF原始值)0.31;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Protein G B1-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N9L 1H, 13C, and 15N Chemical Shift Assignments for in-cell GB1 提交 2015-11-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
片段:UNP residues 303-357
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;295 K;离子强度(mmCIF原始值)0.31;压力 ambient
NMR样品组成
250 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Protein G B1-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OED GB3 solution structure obtained by refinement of X-ray structure with dipolar couplings 提交 2006-12-29 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
444–497(54 aa)
片段:THIRD IGG-BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 ambient
NMR样品组成
25 MM NAH2PO4/NA2HPO4, 0.2 MG/ML NAN3, 1.5 MM GB3 PROTEIN AND ALIGNING MEDIA, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2ON8 Gbeta1 stabilization by in vitro evolution and computational design 提交 2007-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
|
突变:T1M, T2Q, Y3F, V6I, T16I, T18L, T25E, V29K, V39I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;50mM Na acetate, pH 5.0, 17 mg/ml protein mixed with equal volume of 2.3M ammonium suphate, 0.1M sodium acetate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.195 |
| 2ONQ Gbeta1 stabilization by in vitro evolution and computational design 提交 2007-01-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
片段:residues 373-427
|
突变:T2Q, Y3F, L7I, T16I, T18I, T25E, V29F, V39I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293.15 K;50mM sodium acetate, 20mg/ml protein solution mixed in equal volume of crystallization buffer containing
33% PEG monomethylether, 0.1M calcium chloride, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.229 |
| 2PLP Ultra high resolution backbone conformation of protein GB1 from residual dipolar couplings alone 提交 2007-04-20 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–356(54 aa)
片段:First Immunoglobin binding domain (GB1)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.6;300 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM salt;压力 ambient
NMR样品组成
perdeuterated (triple labelled 15N, 13C, 2D) | Partially aligned in bacteriophage and lyotrophic alcohol medium.
|
分辨率未提供 |
| 2QMT Crystal Polymorphism of Protein GB1 Examined by Solid-state NMR and X-ray Diffraction 提交 2007-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
片段:immunoglobulin beta 1 binding domain (residues 303-357)
|
突变:T2Q | PO4 PHOSPHATE ION × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;50 mM NaCl, 50% MPD, 6% IPA, 25 mM Acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.207 |
| 3FIL Structural and energetic determinants for hyperstable variants of GB1 obtained from in-vitro evolution 提交 2008-12-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
303–357(55 aa)
片段:immunoglobulin binding domain, UNP residues 303-357
链 B
303–357(55 aa)
片段:immunoglobulin binding domain, UNP residues 303-357
|
突变:T2Q, E15V, T16L, T18I, N37L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:T2Q, E15V, T16L, T18I, N37L | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293.15 K;protein solution: 50mM sodium acetate pH 5.6, 50mg/ml protein. reservoir solution: 25% PEG 3350, 0.1M citric acids pH 3.5. Drop 400nl protein solution & 400nl reservoir solution, 80 micro-l reservoir, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 0.88 Å R-free 0.149 |
| 3UI3 Structural and Biochemical Characterization of HP0315 from Helicobacter pylori as a VapD Protein with an Endoribonuclease Activity 提交 2011-11-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
304–357(54 aa)
链 B
304–357(54 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.2M (NH4)2SO4, 9% PEG3350, 5-8% glycerol, 100mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid', pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.284 |
| 3V3X Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: N8/K28 Double Mutant 提交 2011-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
304–357(54 aa)
链 C
304–357(54 aa)
|
突变:C8N 突变:C8N | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 3 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;150 mM sodium acetate pH 4.5, 18% w/v PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 3V3X Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: N8/K28 Double Mutant 提交 2011-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
304–357(54 aa)
链 D
304–357(54 aa)
|
突变:C8N 突变:C8N | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 4 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;150 mM sodium acetate pH 4.5, 18% w/v PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.288 |
| 4WH4 Protein GB1 Quadruple Mutant I6H/N8H/K28H/Q32H 提交 2014-09-19 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
突变:I6H/N8H/K28H/Q32H | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;1.75 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.256 |
| 4WH4 Protein GB1 Quadruple Mutant I6H/N8H/K28H/Q32H 提交 2014-09-19 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
304–357(54 aa)
|
突变:I6H/N8H/K28H/Q32H | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;1.75 M ammonium sulfate, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.256 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMG Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: E15 Mutant 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:E15C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;0.1 M magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 4.5, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 5BMH Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: T44 Mutant, Crystal Form B 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:T44C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;0.2 M potassium sodium tartrate, 0.2 M sodium citrate pH 6.0, 2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.175 |
| 5BMI Nitroxide Spin Labels in Protein GB1: T44 Mutant, Crystal Form A 提交 2015-05-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
片段:UNP residues 304-357
|
突变:T44C | MTN S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 1.2 M sodium citrate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 5HFY Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: beta-2-Ala24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-3-Asn35 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;0.2 M sodium acetate pH 4.6, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.230 |
| 5HFY Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: beta-2-Ala24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-3-Asn35 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;0.2 M sodium acetate pH 4.6, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.230 |
| 5HG2 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: beta-3-Ala24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-2-Asn35 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M magnesium acetate, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 5HG2 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: beta-3-Ala24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-2-Asn35 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M magnesium acetate, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 5HG2 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: beta-3-Ala24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-2-Asn35 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M magnesium acetate, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 5HG2 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: beta-3-Ala24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-2-Asn35 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M magnesium acetate, 20% w/v PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 G
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5HI1 Backbone Modifications in the Protein GB1 Helix: Aib24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, Aib35 提交 2016-01-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 H
302–357(56 aa)
片段:UNP residues 302-357
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.5, 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5LDE Crystal structure of a vFLIP-IKKgamma stapled peptide dimer 提交 2016-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
304–356(53 aa)
片段:UNP residues 304-356
链 B
304–356(53 aa)
片段:UNP residues 304-356
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;299 K;1.2M Ammonium Sulphate,
0.05M tri-sodium citrate,
3% isopropanol,
0.1-0.2% vitamin B12
|
分辨率 3.38 Å R-free 0.290 |
| 5UB0 Solution NMR Structure of NERD-C, a natively folded tetramutant of the B1 domain of streptococcal protein G (GB1) 提交 2016-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
片段:UNP residues 373-427
|
突变:Y3F/L7I/F30L/V39I | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成
1.0 mM [U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5UBS Solution NMR Structure of NERD-S, a natively folded pentamutant of the B1 domain of streptococcal protein G (GB1) with a solvent-exposed Trp43 提交 2016-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
片段:UNP residues 373-427
|
突变:Y3F/L7I/A34F/V39L/V54I | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5UCE Solution NMR structure of the major species of DANCER-2, a dynamic and natively folded pentamutant of the B1 domain of streptococcal protein G (GB1) 提交 2016-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
片段:UNP residues 373-427
|
突变:Y3F/L5A/L7I/A34F/V39L | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成
200 uM [U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
200 uM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
200 uM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5UCF Solution NMR-derived model of the minor species of DANCER-2, a dynamic and natively folded pentamutant of the B1 domain of streptococcal protein G (GB1) 提交 2016-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
片段:UNP residues 373-427
|
突变:Y3F/L5A/L7I/A34F/V39L | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成
200 uM [U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
200 uM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
200 uM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100 uM EDTA, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6C9O Selenomethionine mutant (V29Sem) of protein GB1 examined by X-ray diffraction 提交 2018-01-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
突变:V29M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;283.15 K;46% MPD, 20% IPA, 25 mM sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.179 |
| 6C9O Selenomethionine mutant (V29Sem) of protein GB1 examined by X-ray diffraction 提交 2018-01-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
304–357(54 aa)
|
突变:V29M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;283.15 K;46% MPD, 20% IPA, 25 mM sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.179 |
| 6CHE Selenomethionine mutant (A34Sem) of protein GB1 examined by X-ray diffraction 提交 2018-02-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
突变:A34Sem 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.9;283.15 K;49% MPD
20% IPA
25 mM sodium acetate pH 4.9
20 mg/ml protein in 25 mM sodium acetate buffer pH 5.5 and 2 mM TCEP
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.147 |
| 6CPZ Selenomethionine mutant (I6Sem) of protein GB1 examined by X-ray diffraction 提交 2018-03-14 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
突变:I6Sem 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.7;283.15 K;48% MPD
20% IPA
25 mM sodium acetate buffer pH 4.7
20 mg/ml protein in 25 mM sodium acetate buffer pH 5.5 and 2 mM TCEP
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.156 |
| 6CPZ Selenomethionine mutant (I6Sem) of protein GB1 examined by X-ray diffraction 提交 2018-03-14 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
304–357(54 aa)
|
突变:I6Sem 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.7;283.15 K;48% MPD
20% IPA
25 mM sodium acetate buffer pH 4.7
20 mg/ml protein in 25 mM sodium acetate buffer pH 5.5 and 2 mM TCEP
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.156 |
| 6CTE 77Se-NMR probes the protein environment of selenomethionine 提交 2018-03-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
突变:V39Sem 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.7;283.15 K;49% MPD
20% IPA
25 mM sodium acetate pH 4.7
20 mg/ml protein concentration
25 mM sodium acetate pH 5.5
non-reducing
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.175 |
| 6CTE 77Se-NMR probes the protein environment of selenomethionine 提交 2018-03-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
304–357(54 aa)
|
突变:V39Sem 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.7;283.15 K;49% MPD
20% IPA
25 mM sodium acetate pH 4.7
20 mg/ml protein concentration
25 mM sodium acetate pH 5.5
non-reducing
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.175 |
| 6HKA The solution structure of the micelle-associated FATC domain of the human protein kinase ataxia telangiectasia mutated (ATM) 提交 2018-09-06 | 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
100 mM sodium chloride, 50 mM TRIS, 150 mM [U-100% 2H] DPC, 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] 13C-15N-hATMfatc, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
100 mM sodium chloride, 50 mM TRIS, 150 mM [U-100% 2H] DPC, 0.4 mM [U-10% 13C] 13C-hATMfatc, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
100 mM sodium chloride, 50 mM TRIS, 150 mM [U-100% 2H] DPC, 0.5 mM [U-100% 15N] 15N-hATMfatc, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6NJF Solution NMR Structure of DANCER3-F34A, a rigid and natively folded single mutant of the dynamic protein DANCER-3 提交 2019-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
373–427(55 aa)
片段:residues 373-427
|
突变:Y3F, V7I, V39L, V54I | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成
1.0 mM [U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-99% 13C; U-98% 15N] protein (GB1), 10 mM sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6NL6 Crystal structure of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, N35K, D36H, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, D36H, N35K, D36A, N37Q | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;70 mM acetic Acid pH 3.6, 30 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 100 mM NaCl, and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.214 |
| 6NL6 Crystal structure of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, N35K, D36H, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, D36H, N35K, D36A, N37Q | ZN ZINC ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;70 mM acetic Acid pH 3.6, 30 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 100 mM NaCl, and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.214 |
| 6NL6 Crystal structure of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, N35K, D36H, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, D36H, N35K, D36A, N37Q | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;70 mM acetic Acid pH 3.6, 30 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 100 mM NaCl, and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.214 |
| 6NL6 Crystal structure of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, N35K, D36H, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21E, T25L, K28Y, V29I, K31R, Q32H, Y33L, D36H, N35K, D36A, N37Q | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;70 mM acetic Acid pH 3.6, 30 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 100 mM NaCl, and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.214 |
| 6NL7 Crystal structure of B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q | ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;80 mM acetic acid pH 3.6, 20 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 200 mM NaCl and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.158 |
| 6NL7 Crystal structure of B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q | ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;80 mM acetic acid pH 3.6, 20 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 200 mM NaCl and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.158 |
| 6NL7 Crystal structure of B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q | ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;80 mM acetic acid pH 3.6, 20 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 200 mM NaCl and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.158 |
| 6NL7 Crystal structure of B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q) 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
303–357(55 aa)
|
突变:T16F, T18A, V21H, T25H, K28Y, V29I, K31R, Q32A, Y33L, N35K, D36A, N37Q | ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;80 mM acetic acid pH 3.6, 20 mM acetic acid pH 5.8, 30% 2,4-methylpentanediol, 200 mM NaCl and 20 mM zinc sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.158 |
| 6NL8 Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L)-zinc 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;18.5% PEG 400 0.1M HEPES pH 7.5
50 mM MgCl2, 5mM zinc sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.163 |
| 6NL9 Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L | MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;30% PEG 4000 0.1M HEPES pH 7.5
200 mM MgCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 6NL9 Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;30% PEG 4000 0.1M HEPES pH 7.5
200 mM MgCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 6NL9 Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;30% PEG 4000 0.1M HEPES pH 7.5
200 mM MgCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 6NL9 Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, T16L, V29H, Y33H, N37L | NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;30% PEG 4000 0.1M HEPES pH 7.5
200 mM MgCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 6NLA Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L)-zinc 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;4M NaCl 0.1M HEPES pH 7.5
50mM MgCl2, 5mM zinc sulfate
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.128 |
| 6NLB Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;31% PEG 4,000 0.1M Tris pH 8.5
200mM MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 6NLB Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;31% PEG 4,000 0.1M Tris pH 8.5
200mM MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 6NLB Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;31% PEG 4,000 0.1M Tris pH 8.5
200mM MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 6NLB Crystal structure of de novo designed metal-controlled dimer of mutant B1 immunoglobulin-binding domain of Streptococcal Protein G (L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L)-apo 提交 2019-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
303–357(55 aa)
|
突变:L12H, E15V, T16L, T18I, V29H, Y33H, N37L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;31% PEG 4,000 0.1M Tris pH 8.5
200mM MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 6O41 Crystal structure of the unbound PGZL1 germline Fab fragment (PGZL1_gVmDmJ) 提交 2019-02-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 M
438–497(60 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;20% PEG3350, 0.2 M lithium citrate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.219 |
| 6O41 Crystal structure of the unbound PGZL1 germline Fab fragment (PGZL1_gVmDmJ) 提交 2019-02-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 O
438–497(60 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;20% PEG3350, 0.2 M lithium citrate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.219 |
| 6O41 Crystal structure of the unbound PGZL1 germline Fab fragment (PGZL1_gVmDmJ) 提交 2019-02-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 N
438–497(60 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;20% PEG3350, 0.2 M lithium citrate
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.219 |
| 6OC7 HMP42 Fab in complex with Protein G 提交 2019-03-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
438–497(60 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;17% PEG 4000, 15% glycerol, 8.5% 2-propanol and 85 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.184 |
| 6UUH Crystal structure of broad and potent HIV-1 neutralizing antibody 438-B11 提交 2019-10-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
438–497(60 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.085M sodium acetate (pH=4.0), 0.17M ammonium acetate, 5% %(v/v) glycerol, 27.882 %(w/v) PEG4000, 15% glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.260 |
| 6UUH Crystal structure of broad and potent HIV-1 neutralizing antibody 438-B11 提交 2019-10-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 F
438–497(60 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.085M sodium acetate (pH=4.0), 0.17M ammonium acetate, 5% %(v/v) glycerol, 27.882 %(w/v) PEG4000, 15% glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.260 |
| 6UYG Structure of Hepatitis C Virus Envelope Glycoprotein E2c3 core from genotype 6a bound to broadly neutralizing antibody AR3A and non neutralizing antibody E1 提交 2019-11-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 G
438–497(60 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M magnesium chloride, 10% (w/v) PEG 3000, 15% ethylene glycol, 0.1M Na-cacodylate, pH=6.5
|
分辨率 3.38 Å R-free 0.305 |
| 6W00 Crystal structure of Fab239 in complex with NPNA2 peptide from circumsporozoite protein 提交 2020-02-28 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
440–497(58 aa)
片段:domain III (UNP residues 438-497)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.2 M sodium chloride, 20% w/v PEG3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.206 |
| 6WFW Crystal structure of Fab364 in complex with NPNA2 peptide from circumsporozoite protein 提交 2020-04-04 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
439–497(59 aa)
片段:domain III (UNP residues 438-497)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;20% PEG8000, 0.05 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.257 |
| 7DA8 X-ray structure of a GB1:T2Q/D46K mutant 提交 2020-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
突变:T303Q, D347K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;MES monohydrate pH 6.5 (buffer system 1), 40% v/v PEG 500* MME, 20 % w/v PEG 20000 (Precipitant mix1) (Morpheus Screen ID 25).
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.305 |
| 8DIJ NMR Structure of Streptococcal Protein GB1 Backbone Modified Variant: beta-ACPC24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-ACPC35 提交 2022-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
302–357(56 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40;压力 1
NMR样品组成
0.65 mM Streptococcal Protein GB1 Backbone Modified Variant: beta-ACPC24, beta-3-Lys28, beta-3-Lys31, beta-ACPC35, 20 mM sodium phosphate, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8TFR Apo Fab from C10-S66K antibody 提交 2023-07-11 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
438–497(60 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;20% PEG 3350, 0.2 M Na3-citrate, pH 8.2
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.262 |
| 8UM7 Site-specific Aspartic Acid Dehydration and Isomerization in Streptococcal Protein GB1: Wild-type Protein 提交 2023-10-17 | 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)41;压力 1
NMR样品组成
0.12 mM B1 Domain of Streptococcal Protein G, 20 mM sodium phosphate, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8UM9 Site-specific Aspartic Acid Dehydration and Isomerization in Streptococcal Protein GB1: D-Asp40 Variant 提交 2023-10-17 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)41;压力 1
NMR样品组成
0.12 mM B1 Domain of Streptococcal Protein G, D-Asp40 Variant, 20 mM sodium phosphate, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8UMA Site-specific Aspartic Acid Dehydration and Isomerization in Streptococcal Protein GB1: D-isoAsp40 Variant 提交 2023-10-17 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)41;压力 1
NMR样品组成
0.17 mM B1 Domain of Streptococcal Protein G, D-isoAsp40 Variant, 20 mM sodium phosphate, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8UMB Site-specific Aspartic Acid Dehydration and Isomerization in Streptococcal Protein GB1: L-Aspartyl Succinimide 40-41 Variant 提交 2023-10-17 | 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)41;压力 1
NMR样品组成
0.07 mM B1 Domain of Streptococcal Protein G, L-Aspartyl Succinimide 40-41 Variant, 20 mM sodium phosphate, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8UMS Site-specific Aspartic Acid Dehydration and Isomerization in Streptococcal Protein GB1: L-isoAsp40 Variant 提交 2023-10-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
304–357(54 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)41;压力 1
NMR样品组成
0.18 mM B1 Domain of Streptococcal Protein G, L-isoAsp40 Variant, 20 mM sodium phosphate, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8WCJ Crystal structure of GB3 penta mutation L5V/K10H/T16S/K19E/Y33I 提交 2023-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
444–497(54 aa)
|
突变:L446V, K451H, T457S, K460E, Y474I | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;60% v/v Tacsimate pH 7.0
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.233 |
| 9AWE The crystal structure of an engineered Protein GF with Human Kappa Fab 提交 2024-03-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
368–430(63 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M Sodium Cacodylate pH 6.0, 0.1M Calcium acetate hydrate, 10% PEG 8000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 9BDE Middle Region of Apolipoprotein B 100 bound to Low Density Lipoprotein Receptor 提交 2024-04-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 B
440–497(58 aa)
片段:;residues 27-384 (Uniprot numbering),residues 278-327 (Uniprot numbering),103-151 (Uniprot numbering),residues 440-497 (Uniprot numbering)
;
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 9I2I X-ray structure of the B1 domain of streptococcal protein G triple mutant T2Q, N8D, and N37D (GB1-QDD). 提交 2025-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS;278 K;50% MPD, 25% isopropyl alcohol,
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.210 |
| 9I2I X-ray structure of the B1 domain of streptococcal protein G triple mutant T2Q, N8D, and N37D (GB1-QDD). 提交 2025-01-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
303–357(55 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS;278 K;50% MPD, 25% isopropyl alcohol,
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.210 |
| 9QBJ Legobody dimer 提交 2025-03-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 I
440–496(57 aa)
链 J
440–497(58 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9T8Z Room temperature X-ray structure of the B1 domain of streptococcal protein G triple mutant T2Q, N8D, and N37D (GB1-QDD). 提交 2025-11-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
303–357(55 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS;278 K;50 % 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 25 % isopropanol
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.197 |
| 9T8Z Room temperature X-ray structure of the B1 domain of streptococcal protein G triple mutant T2Q, N8D, and N37D (GB1-QDD). 提交 2025-11-13 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
303–357(55 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS;278 K;50 % 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 25 % isopropanol
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.197 |
共 76 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | SPG2_STRSG |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 B; PDB构建体 3–56; UniProt 304–357 |