6hwh

Structure of a functional obligate respiratory supercomplex from Mycobacterium smegmatis

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R051_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–408； UniProt 1–408 作者链 B； PDB构建体 1–408； UniProt 1–408

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

物种未注明

UniProt A0R050

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R050_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268 作者链 M； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268 作者链 i； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268 作者链 j； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268

Cytochrome c oxidase subunit 2

物种未注明

UniProt A0R057

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R057_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341 作者链 P； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

MSMEG_4693

物种未注明

UniProt A0R1B6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R1B6_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 R； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

物种未注明

UniProt A0R1B5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Y4692_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157 作者链 T； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

Cytochrome c oxidase subunit 1

物种未注明

UniProt A0R0M4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R0M4_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–583； UniProt 1–583 作者链 V； PDB构建体 1–583； UniProt 1–583

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

物种未注明

UniProt A0R056

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R056_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 X； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Cytochrome c oxidase subunit 3

物种未注明

UniProt A0R049

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB × 2 （I7FGS8） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R049_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 Z； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB

Mycobacterium smegmatis MC2 155

UniProt I7FGS8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 4 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 26	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit × 2 （A0R051） Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Co-purified unknown peptide built as polyALA × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） MSMEG_4693 × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 （A0R0M4） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CARDIOLIPIN × 8 MENAQUINONE-9 × 4 COPPER (II) ION × 6 HEME-AS × 4 HEME C × 1 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I7FGS8_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546 作者链 b； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6hwh
沉积日期 deposition_date	2018-10-12
结构标题 title	Structure of a functional obligate respiratory supercomplex from Mycobacterium smegmatis
关键词 keywords	Membrane Protein, Cryo-EM, Respiratory supercomplex, Mycobacterium, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6hwh__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6hwh__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6hwh__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.64 Å
Rg（电子密度）	65.64 Å
总 Rg	65.37 Å
原子数	39207
残基数	4980
排除体积	710370 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6hwh__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6hwh__assembly_2__model_1`	26-meric （26）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit
分子量 formula_weight	44869.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	40632

MDRIASMSQDSPDIKGTDAPGQTGVPGQPTDAELAEMSREELVKLGGKIDGVETIFKEPRWPVPGTKAEKRTERLVAYWLMLGGLSGLALLLVFLFWPWEYQPFGSEGEFLYSLATPLYGLTFGLSILSIGIGAVLFQKKFIPEEISVQDRHDGRSPEVHRKTVAANLTDALEGSTLKRRKVIGLSLGIGLGAFGAGTLVAFIGGLIKNPWKPVVPTAEGKKAVLWTSGWTPRFKGETIYLARATGRPGESPFVKMRPEDIDAGGMETVFPWRESDGDGTTVESEHKLTEIAMGVRNPVMLIRIKPADMHRVIKRKGQESFNFGELFAYTKVCSHLGCPSSLYEQQTYRILCPCHQSQFDALEFAKPIFGPAARALAQLPITIDEDGYLVANGDFVEPVGPAFWERKS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA
分子量 formula_weight	6315.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,C

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Co-purified unknown transmembrane helices built as polyALA
分子量 formula_weight	5549.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,D

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Co-purified unknown peptide built as polyALA
分子量 formula_weight	1720.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,E

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Co-purified unknown peptide built as polyALA
分子量 formula_weight	2996.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,F

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit
分子量 formula_weight	27874.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.2.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,K,i,j

MTSKSRRRLRRRLSAGLLLLIGLAVAGGVAATLTPQPQVAVADESQSALLRTGKQLFETSCVSCHGANLQGVPDRGPSLIGTGEAAVYFQVSTGRMPAMRGEAQAPSKPPHFDESQIDALGAYVQANGGGPTVPRDDHGAVAQESLIGGDVARGGDLFRLNCASCHNFTGKGGALSSGKYAPDLGDANPAQIYTAMLTGPQNMPKFSDRQLTPDEKRDIVAYVRESAETPSYGGYGLGGFGPAPEGMAMWIIGMVAAIGVAMWIGSRA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 2
分子量 formula_weight	38077.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,L

MTPRGFRVVALSIVLGGSALLLSGCSWSDALALGWPTGITPEAKLNRELWIGSVIASFAVGAIVWGLIFWTSAFHRKKATDTELPRQFGYNMPLELTLTVIPFLIISVLFYFTVVVQERMMHKDPNPEVVIDVTAFQWNWKFGYQKIAFADGSFDYDGADPERKEAMTSRPEGKDEHGIEKVGPIRGMTPEDRTYLNFDKIETLGTSSEIPVLVLPAGKRIEFVLNSADVIHGFWVPEFLFKRDVLPEPKANNSDNVFQVSEIQQTGAFVGRCTEMCGTFHAMMNFEVRVVEPNDFKAYIDQRNAGKTNAEALAAINQPPLAITTEPFESRRGELVPQASK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	MSMEG_4693
分子量 formula_weight	8365.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,N

MSTALTHGLIGGVPLVLFAVLALIFLTRKGPHPDTYKMSDPWTHAPILWAAEEPREHGHGGHGHDSHGVVIGGGASGKW

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575
分子量 formula_weight	15911.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,O

MASGDIATVANAELDLPYGSALTSSGRISAVTEPGELSVHYPFPTMDLVVLDDALKYGSRAAKARFAVYIGPLGADTAATAREILANVPTPENAVLLAVSPDQRAIEVVYGADVKGRGIESAAPLGVSAAAASFKEGNLIDGLISAVRVMSAGVSPA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	64841.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,Q

MTTHAPSAGELLARRPFPQRLGPRWTLLYKLVTTTDHKLIGMMYVVACFIFFFIGGLMALLLRTELAVPGLQFLSNEQYNQLFTMHGTVMLLFYATPIVFGFANLVVPLQIGAPDVAFPRLNALSFWLFLFGASIALGGFLAPGGPADFGWTAYTPLSNAMHSPGAGGDLWIFGLIVGGLGTILGAVNMITTVVCMRAPGMIMFRMPIFTWNILVTSVIVLVAFPLLTSALFGLAADRNLGAHVFDPANGGTMLWEHLFWFFGHPEVYIIALPFFGIVTEIFPVFSRKPVFGYTTLVYATISIGALSIAVWAHHLYATGAVLLPFFSFMTFMIAVPTGIKFVNWIGTMWKGQLTFETPMLFSVGFLVTFLLGGLTGVILASPPLDFHVTDSYFVVAHFHYVLFGTIVFATYAGVYFWFPKMTGRLLDDRLGKLHFWLTLIGFHTTFLVHHWLGAEGMPRRYADYLPTDGFTTLNIVSTIGSFILGVSMLPFVWNVFKSWRYGEPVTVDDPWGYGNSLEWATSCPPPRHNFTELPRIRSERPAFELHYPHMIERLRAESHPGRTQGGPGAVTLPQPQARSHPVE

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide 4
分子量 formula_weight	15177.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,S

MHIEARLFEILTAFFALAAVVYAVLTAMFATGGVEWAGTTALVLTTGLTLITGTFFRFVARRLDTRPEDYEDAEISDGAGELGFFAPHSWWPILISLSFSTAAVGAALWLPWLIAAGVAFVITSVCGLVFEYYWGPEKH

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 3
分子量 formula_weight	22196.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,W

MTSAVGTSGTAITSRVHSLNRPNMVSVGTIVWLSSELMFFAGLFAMYFTARAQAGGAWPPEPTELNLALAVPVTLVLIASSFTCQMGVFAAERGDVFGLRRWYVITFLMGLFFVLGQGYEYIHLVEHGTTIPGSAYGSVFYLATGFHGLHVIGGLVAFVLLLARTKMSKFTPAQATAAIVVSYYWHFVDIVWIALFATIYFVR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB
分子量 formula_weight	61271.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.2.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,Y

MSPDFAKLAAAQGDAIDSRYHPSAAVRRQLNKVFPTHWSFLLGEIALYSFIILLLTGVWLTLFFDPSMAHVTYDGVYQPLRGVQMSRAYETALDISFEVRGGLFVRQVHHWAALMFAASIMVHLARIFFTGAFRRPREANWVIGSLLLILAMFEGFFGYSLPDDLLSGTGIRAALSGITMGIPVIGTWMHWALFGGDFPGEILIPRLYALHILLIPGIILALIGAHLALVWFQKHTQFPGPGRTETNVVGVRVMPVFAVKSGAFFAMITGVLGLMGGLLTINPIWNLGPYKPSQVSAGSQPDFYMMWTDGLIRLWPAWEFYPFGHTIPQGVWVAVGMGLVFALLIAYPFIEKKVTGDDAHHNLLQRPRDVPVRTAIGSMAIALYLLLTFACMNDIIALKFHISLNATTWIGRIGMVVLPAIVYFVAYRWAISLQRSDREVLEHGVETGIIKRLPHGAYVELHQPLGPVDEHGHPIPLEYAGAPLPKRMNKLGSGGAPGTGSFLFPDPAVEHEALTEAAHASEHKSLTALKEHQDRIHGNGETNGHHDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium smegmatis MC2 155
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	246196
宿主生物 host_organism	Mycobacterium smegmatis MC2 155

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	MENAQUINONE-9
分子量 formula_weight	785.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	HEME-AS
分子量 formula_weight	921.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	6hwhQ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	6hwhV01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	6hwhW01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Cytochrome c oxidase, subunit III, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	6hwhY01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C

结构域编号 domain_id	6hwhZ01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Cytochrome c oxidase, subunit III, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	6hwhb01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	104198

Structure of a functional obligate respiratory supercomplex from Mycobacterium smegmatis

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MSMEG_4693

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ubiquinol-cytochrome C reductase QcrB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6hwh__assembly_2__model_1

6hwh__assembly_2__model_1 | I(q)

6hwh__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment