Tubulin beta chain
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 | 链 b； UniProt 2–427 | 未记录 | Alpha tubulin × 1 Dynein heavy chain, cytoplasmic × 1 （P36022） | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.8；DTT was added to the final concentration of 1 mM. cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.62 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6KIQ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FFX TUBULIN:STATHMIN-LIKE DOMAIN COMPLEX 提交 2000-07-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.367 |
| 1IA0 KIF1A HEAD-MICROTUBULE COMPLEX STRUCTURE IN ATP-FORM 提交 2001-03-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TXL TAXOTERE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
buf1；pH 7.4；IMIDAZOLE 50 MM, MG-ACETATE 5 MM, EGTA 1 MM, K-ACETATE 50 MM, DTT 10 MM, PACLITAXEL 10 MICRO M
cryo-EM玻璃化条件
PLUNGED INTO ETHANE
X-ray结晶条件
polymerization of the microtubule；pH 6.8；296 K；pH 6.8, polymerization of the microtubule, temperature 296K
|
分辨率 15.00 Å |
| 1SA0 TUBULIN-COLCHICINE: STATHMIN-LIKE DOMAIN COMPLEX 提交 2004-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PEG, PIPES BUFFER, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.249 |
| 1SA1 Tubulin-podophyllotoxin: stathmin-like domain complex 提交 2004-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 E
49–189（141 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 POD 9-HYDROXY-5-(3,4,5-TRIMETHOXYPHENYL)-5,8,8A,9-TETRAHYDROFURO[3',4':6,7]NAPHTHO[2,3-D][1,3]DIOXOL-6(5AH)-ONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；PEG, PIPES BUFFER, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.259 |
| 1TUB TUBULIN ALPHA-BETA DIMER, ELECTRON DIFFRACTION 提交 1997-09-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–427（427 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TXL TAXOTERE × 1 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
X-ray结晶条件
TWO-DIMENSIONAL SHEETS ARE FORMED UNDER NORMAL POLYMERIZING CONDITIONS WITH THE ADDITION OF 1 MM ZNCL2
|
分辨率 3.70 Å |
| 1TVK The binding mode of epothilone A on a,b-tubulin by electron crystallography 提交 2004-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–427（427 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EP EPOTHILONE A × 1 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.89 Å R-free 0.321 |
| 2HXF KIF1A head-microtubule complex structure in amppnp-form 提交 2006-08-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
IMIDAZOLE；pH 7.4；IMIDAZOLE
cryo-EM玻璃化条件
Ethan slash
|
分辨率 10.00 Å |
| 2HXH KIF1A head-microtubule complex structure in adp-form 提交 2006-08-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
imidazole；pH 7.4；imidazole
cryo-EM玻璃化条件
Ethan slash
|
分辨率 11.00 Å |
| 2WBE Kinesin-5-Tubulin Complex with AMPPNP 提交 2009-02-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80MM PIPES, 150MM NACL, 7MM MGCL2, 1MM EGTA, 1MM BETA-MERCAPTOETHANOL；pH 6.8；80MM PIPES, 150MM NACL, 7MM MGCL2, 1MM EGTA, 1MM BETA-MERCAPTOETHANOL
cryo-EM玻璃化条件
ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 3EDL Kinesin13-Microtubule Ring complex 提交 2008-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 165 PDB 声明：165-meric |
链 B
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 33 MG MAGNESIUM ION × 99 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 66 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 66 TA1 TAXOL × 33 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 33 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 33 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å |
| 3EDL Kinesin13-Microtubule Ring complex 提交 2008-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å |
| 3EDL Kinesin13-Microtubule Ring complex 提交 2008-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å |
| 3J6E Energy minimized average structure of Microtubules stabilized by GmpCpp 提交 2014-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
1–427（427 aa）
链 D
1–427（427 aa）
链 F
1–427（427 aa）
链 H
1–427（427 aa）
链 J
1–427（427 aa）
链 L
1–427（427 aa）
链 N
1–427（427 aa）
链 P
1–427（427 aa）
链 R
1–427（427 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 4.70 Å |
| 3J6F Minimized average structure of GDP-bound dynamic microtubules 提交 2014-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
1–427（427 aa）
链 D
1–427（427 aa）
链 F
1–427（427 aa）
链 H
1–427（427 aa）
链 J
1–427（427 aa）
链 L
1–427（427 aa）
链 N
1–427（427 aa）
链 P
1–427（427 aa）
链 R
1–427（427 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 4.90 Å |
| 3J6G Minimized average structure of microtubules stabilized by taxol 提交 2014-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
1–427（427 aa）
链 D
1–427（427 aa）
链 F
1–427（427 aa）
链 H
1–427（427 aa）
链 J
1–427（427 aa）
链 L
1–427（427 aa）
链 N
1–427（427 aa）
链 P
1–427（427 aa）
链 R
1–427（427 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 TA1 TAXOL × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 5.50 Å |
| 3J6H Nucleotide-free Kinesin motor domain complexed with GMPCPP-microtubule 提交 2014-02-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å |
| 3J6P Pseudo-atomic model of dynein microtubule binding domain-tubulin complex based on a cryoEM map 提交 2014-03-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 3J7I Structure of alpha- and beta- tubulin in GMPCPP-microtubules 提交 2014-07-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 3JAK Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerized with EB3 (merged dataset with and without kinesin bound) 提交 2015-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.30 Å |
| 3JAL Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerized with EB3 提交 2015-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å |
| 3JAR Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerized with EB3 提交 2015-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging/；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.40 Å |
| 3JAS Cryo-EM structure of dynamic GDP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin 提交 2015-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å |
| 3JAT Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin 提交 2015-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å |
| 3JAW Atomic model of a microtubule seam based on a cryo-EM reconstruction of the EB3-bound microtubule (merged dataset containing tubulin bound to GTPgammaS, GMPCPP, and GDP) 提交 2015-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80；pH 6.8；80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.；90.4 K；冷冻剂 ETHANE；Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.90 Å |
| 4ZHQ Crystal structure of Tubulin-Stathmin-TTL-MMAE Complex 提交 2015-04-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 4Q5 N-methyl-L-valyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.245 |
| 4ZI7 CRYSTAL STRUCTURE OF TUBULIN-STATHMIN-TTL-HTI286 COMPLEX 提交 2015-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 4SL N,beta,beta-trimethyl-L-phenylalanyl-N-[(3S,4Z)-5-carboxy-2-methylhex-4-en-3-yl]-N,3-dimethyl-L-valinamide × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG, glycerol, MES, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.239 |
| 4ZOL Crystal Structure of Tubulin-Stathmin-TTL-Tubulysin M Complex 提交 2015-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 55Q (2R,4R)-4-{[(2-{(1R,3R)-1-(acetyloxy)-4-methyl-3-[methyl(N-{[(2S)-1-methylpiperidin-2-yl]carbonyl}-D-isoleucyl)amino]pentyl}-1,3-thiazol-4-yl)carbonyl]amino}-2-methyl-5-phenylpentanoic acid × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.232 |
| 5BMV CRYSTAL STRUCTURE OF TUBULIN-STATHMIN-TTL-Vinblastine COMPLEX 提交 2015-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 VLB (2ALPHA,2'BETA,3BETA,4ALPHA,5BETA)-VINCALEUKOBLASTINE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.235 |
| 5FNV a new complex structure of tubulin with an alpha-beta unsaturated lactone 提交 2015-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X3H PIRONETIN × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.7；0.1M MES PH6.7;6% PEG4000 ;5% GLYCEROL;30MM CACL2;30MM MGCL2
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.226 |
| 5JQG An apo tubulin-RB-TTL complex structure used for side-by-side comparison 提交 2016-05-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；293 K；0.1M MES, 6% PEG4000, 5% Glycerol, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.212 |
| 5KMG Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule 提交 2016-06-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric |
链 B
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 POU Peloruside A × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å |
| 5KMG Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule 提交 2016-06-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å |
| 5KMG Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule 提交 2016-06-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å |
| 5MM4 Ustilago maydis kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules 提交 2016-12-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–427（427 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 5MM7 Ustilago maydis kinesin-5 motor domain with N-terminal extension in the AMPPNP state bound to microtubules 提交 2016-12-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–427（427 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.10 Å |
| 5OAM Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition 提交 2017-06-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 5OCU Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition 提交 2017-07-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.20 Å |
| 5OGC Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition 提交 2017-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | 9V5 4-chloranyl-2-nitro-1-(phenylsulfonyl)benzene × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 5SYC Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of peloruside-stabilized microtubule 提交 2016-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：52-meric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 POU Peloruside A × 26 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYC Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of peloruside-stabilized microtubule 提交 2016-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYC Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of peloruside-stabilized microtubule 提交 2016-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYE Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of doubly bound Taxol- and peloruside-stabilized microtubule 提交 2016-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：156-meric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 TA1 TAXOL × 26 POU Peloruside A × 26 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYE Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of doubly bound Taxol- and peloruside-stabilized microtubule 提交 2016-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYE Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of doubly bound Taxol- and peloruside-stabilized microtubule 提交 2016-08-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 POU Peloruside A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYF High-resolution cryo-EM reconstruction of Taxol-stabilized microtubule 提交 2016-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：130-meric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 TA1 TAXOL × 26 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYF High-resolution cryo-EM reconstruction of Taxol-stabilized microtubule 提交 2016-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYF High-resolution cryo-EM reconstruction of Taxol-stabilized microtubule 提交 2016-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYG Cryo-EM reconstruction of zampanolide-bound microtubule 提交 2016-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：130-meric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26 MG MAGNESIUM ION × 26 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26 ZPN (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide × 26 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYG Cryo-EM reconstruction of zampanolide-bound microtubule 提交 2016-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZPN (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5SYG Cryo-EM reconstruction of zampanolide-bound microtubule 提交 2016-08-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZPN (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å |
| 5XXT GDP-microtubule complexed with nucleotide-free KIF5C 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 D
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 F
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 H
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 J
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 L
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 N
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 P
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 R
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.35 Å |
| 5XXV GDP-microtubule complexed with KIF5C in AMPPNP state 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 D
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 F
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 H
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 J
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 L
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 N
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 P
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 R
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 9 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.46 Å |
| 5XXW GDP-microtubule complexed with KIF5C in ATP state 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 D
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 F
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 H
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 J
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 L
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 N
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 P
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 R
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 5XXX GMPCPP-microtubule complexed with nucleotide-free KIF5C 提交 2017-07-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 B
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 D
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 F
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 H
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 J
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 L
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 N
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 P
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
链 R
2–427（426 aa）
片段：UNP residues 2-427
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.43 Å |
| 6BJC TPX2_mini decorated GMPCPP-microtubule 提交 2017-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging
|
分辨率 3.30 Å |
| 6CVJ Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric |
链 B
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30 MG MAGNESIUM ION × 30 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CVJ Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CVJ Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CVN Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric |
链 A
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30 MG MAGNESIUM ION × 30 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6CVN Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6CVN Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule 提交 2018-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6DPU Undecorated GMPCPP microtubule 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GMPCPP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.10 Å |
| 6DPV Undecorated GDP microtubule 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer (80 mM PIPES pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.30 Å |
| 6DPW Undecorated GTPgammaS microtubule 提交 2018-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Modified BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 0.2 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTPgammaS, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.50 Å |
| 6EVW Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–429（429 aa）
链 D
1–429（429 aa）
链 F
1–429（429 aa）
链 G
1–429（429 aa）
链 H
1–429（429 aa）
链 I
1–429（429 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 12 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6EVX Cryo-EM structure of GDP.Pi-microtubule rapidly co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6EVY Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6EVZ Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6EW0 Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin and supplemented with Taxol 提交 2017-11-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 TA1 TAXOL × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6KIO Complex of yeast cytoplasmic dynein MTBD-High and MT without DTT 提交 2019-07-19 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 b
2–427（426 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.94 Å |
| 6LS4 A novel anti-tumor agent S-40 in complex with tubulin 提交 2020-01-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 S40 3-[(4-cyclopropylphenyl)sulfonylamino]-4-methyl-N-(pyridin-3-ylmethyl)benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；6% PEG 4000, 6% GLYCEROL, 30mM MAGNESIUM CHLORIDE, 30mM CALCIUM CHLORIDE, 3.3% Jeffamin M-600, 100mM MES
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 6MLQ Cryo-EM structure of microtubule-bound Kif7 in the ADP state 提交 2018-09-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 6MLR Cryo-EM structure of microtubule-bound Kif7 in the AMPPNP state 提交 2018-09-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 6MZE Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
链 K
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.245 |
| 6MZE Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 P
1–445（445 aa）
链 R
1–445（445 aa）
链 W
1–445（445 aa）
链 Y
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.245 |
| 6MZF Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
链 K
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 4.40 Å R-free 0.252 |
| 6MZF Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 P
1–445（445 aa）
链 R
1–445（445 aa）
链 W
1–445（445 aa）
链 Y
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 4.40 Å R-free 0.252 |
| 6MZG Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.234 |
| 6MZG Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays 提交 2018-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 H
1–445（445 aa）
链 J
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.234 |
| 6O2Q Acetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.70 Å |
| 6O2R Deacetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.30 Å |
| 6O2S Deacetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 104 PDB 声明：104-meric |
链 1H
1–445（445 aa）
链 1O
1–445（445 aa）
链 1P
1–445（445 aa）
链 1Q
1–445（445 aa）
链 1R
1–445（445 aa）
链 1S
1–445（445 aa）
链 1T
1–445（445 aa）
链 1U
1–445（445 aa）
链 1V
1–445（445 aa）
链 1W
1–445（445 aa）
链 1X
1–445（445 aa）
链 1Y
1–445（445 aa）
链 1Z
1–445（445 aa）
链 2H
1–445（445 aa）
链 2O
1–445（445 aa）
链 2P
1–445（445 aa）
链 2Q
1–445（445 aa）
链 2R
1–445（445 aa）
链 2S
1–445（445 aa）
链 2T
1–445（445 aa）
链 2U
1–445（445 aa）
链 2V
1–445（445 aa）
链 2W
1–445（445 aa）
链 2X
1–445（445 aa）
链 2Y
1–445（445 aa）
链 2Z
1–445（445 aa）
链 3H
1–445（445 aa）
链 3O
1–445（445 aa）
链 3P
1–445（445 aa）
链 3Q
1–445（445 aa）
链 3R
1–445（445 aa）
链 3S
1–445（445 aa）
链 3T
1–445（445 aa）
链 3U
1–445（445 aa）
链 3V
1–445（445 aa）
链 3W
1–445（445 aa）
链 3X
1–445（445 aa）
链 3Y
1–445（445 aa）
链 3Z
1–445（445 aa）
链 4H
1–445（445 aa）
链 4O
1–445（445 aa）
链 4P
1–445（445 aa）
链 4Q
1–445（445 aa）
链 4R
1–445（445 aa）
链 4S
1–445（445 aa）
链 4T
1–445（445 aa）
链 4U
1–445（445 aa）
链 4V
1–445（445 aa）
链 4W
1–445（445 aa）
链 4X
1–445（445 aa）
链 4Y
1–445（445 aa）
链 4Z
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52 MG MAGNESIUM ION × 52 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.00 Å |
| 6O2T Acetylated Microtubules 提交 2019-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 104 PDB 声明：104-meric |
链 1H
1–445（445 aa）
链 1O
1–445（445 aa）
链 1P
1–445（445 aa）
链 1Q
1–445（445 aa）
链 1R
1–445（445 aa）
链 1S
1–445（445 aa）
链 1T
1–445（445 aa）
链 1U
1–445（445 aa）
链 1V
1–445（445 aa）
链 1W
1–445（445 aa）
链 1X
1–445（445 aa）
链 1Y
1–445（445 aa）
链 1Z
1–445（445 aa）
链 2H
1–445（445 aa）
链 2O
1–445（445 aa）
链 2P
1–445（445 aa）
链 2Q
1–445（445 aa）
链 2R
1–445（445 aa）
链 2S
1–445（445 aa）
链 2T
1–445（445 aa）
链 2U
1–445（445 aa）
链 2V
1–445（445 aa）
链 2W
1–445（445 aa）
链 2X
1–445（445 aa）
链 2Y
1–445（445 aa）
链 2Z
1–445（445 aa）
链 3H
1–445（445 aa）
链 3O
1–445（445 aa）
链 3P
1–445（445 aa）
链 3Q
1–445（445 aa）
链 3R
1–445（445 aa）
链 3S
1–445（445 aa）
链 3T
1–445（445 aa）
链 3U
1–445（445 aa）
链 3V
1–445（445 aa）
链 3W
1–445（445 aa）
链 3X
1–445（445 aa）
链 3Y
1–445（445 aa）
链 3Z
1–445（445 aa）
链 4H
1–445（445 aa）
链 4O
1–445（445 aa）
链 4P
1–445（445 aa）
链 4Q
1–445（445 aa）
链 4R
1–445（445 aa）
链 4S
1–445（445 aa）
链 4T
1–445（445 aa）
链 4U
1–445（445 aa）
链 4V
1–445（445 aa）
链 4W
1–445（445 aa）
链 4X
1–445（445 aa）
链 4Y
1–445（445 aa）
链 4Z
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52 MG MAGNESIUM ION × 52 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.10 Å |
| 6RZA Cryo-EM structure of the human inner arm dynein DNAH7 microtubule binding domain bound to microtubules 提交 2019-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–426（426 aa）
链 D
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6RZB Cryo-EM structure of mouse cytoplasmic dynein-1 microtubule binding domain bound to microtubules 提交 2019-06-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6TA3 Human kinesin-5 motor domain in the GSK-1 state bound to microtubules (Conformation 1) 提交 2019-10-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–429（429 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6TA4 Human kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules 提交 2019-10-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–429（429 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 6TIW Human kinesin-5 motor domain in the GSK state bound to microtubules (Conformation 2) 提交 2019-11-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–429（429 aa）
|
未记录 | MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6VPO Cryo-EM structure of microtubule-bound KLP61F motor domain in the AMPPNP state 提交 2020-02-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6VPP Cryo-EM structure of microtubule-bound KLP61F motor with tail domain in the nucleotide-free state 提交 2020-02-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6Y4M Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb111 提交 2020-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1 O9H [(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-1-[4-methanoyl-5-(2-phenylmethoxyethyl)-2,3-dihydro-1,3-thiazol-2-yl]-4-methyl-pentan-3-yl]-methyl-azanium × 1 OH5 (2~{S},4~{R})-4-azanyl-2-methyl-5-phenyl-pentanoic acid × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 VAL VALINE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.03 M calcium chloride, 0.03 M magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.50, 3.20% w/v
PEG 4000, 5.00% w/v glycerol
|
分辨率 3.34 Å R-free 0.234 |
| 6Y4N Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb116 提交 2020-02-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1 O9K [(1~{R},3~{R})-1-(4-methanoyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-methyl-3-(methylamino)pentyl] ethanoate × 1 O9N methyl (2~{S},4~{S})-2,4-bis(azanyl)-5-phenyl-pentanoate × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 VAL VALINE × 1 P6S benzyl hydrogen carbonate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；30 mM calcium chloride, 30 mM magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.0, 2.0% w/v PEG 4000, 5.0% w/v glycerol
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.220 |
| 6ZPI Microtubule complexed with Kif15 motor domain. Symmetrised asymmetric unit 提交 2020-07-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–431（431 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7CBZ Crystal structure of T2R-TTL-A31 complex 提交 2020-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 FUO 2-[5-[4-[2-[4-(2-cyclopropylethanoyl)piperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]pyridin-2-yl]-N-(phenylmethyl)ethanamide × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG4000, 8% glycerol, 0.1 M
MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.255 |
| 7DMZ GMPCPP microtubule complex 提交 2020-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 C
1–445（445 aa）
链 E
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 TAJ taccalonolide AJ × 3 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7DN0 AJ-GMPCPP-MT-non-seam 提交 2020-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 E
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 TAJ taccalonolide AJ × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7EMJ Crystal structure of T2R-TTL-Barbigerone complex 提交 2021-04-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 J6L 8,8-dimethyl-3-(2,4,5-trimethoxyphenyl)pyrano[2,3-f]chromen-4-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.241 |
| 7EXC Crystal structure of T2R-TTL-1129A2 complex 提交 2021-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 JEL N-[[3-(1,3-benzodioxol-5-yloxy)phenyl]methyl]-9H-pyrido[3,4-b]indol-3-amine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.264 |
| 7L05 Complex of novel maytansinoid M24 bound to T2R-TTL (two tubulin alpha/beta heterodimers, RB3 stathmin-like domain, and tubulin tyrosine ligase) 提交 2020-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 XQ4 (1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl (2S)-2-{methyl[3-(methylamino)propanoyl]amino}propanoate (non-preferred name) × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 3350, MES, CaCl2, MgCl2, glycerol
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.217 |
| 7NB8 Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain without nucleotide, complexed with 14 protofilament microtubule. 提交 2021-01-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3.5 uM microtubules were incubated to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added and incubated for 30 seconds. The grid was again blotted and 40 uM kinesin motor domain added for 30 seconds. Then the grid was blotted and plunge frozen.
|
分辨率 4.40 Å |
| 7NBA Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain bound to AMPPNP, complexed with 14 protofilament microtubule. 提交 2021-01-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；5 uM microtubules were applied to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added, incubated for 30 seconds, then blotted. 40 uM Kinesin motor domain was again added, incubated for 40 seconds, blotted, then plunge frozen.
|
分辨率 4.00 Å |
| 7PQC tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data 提交 2021-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
链 E
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
链 K
1–445（445 aa）
链 M
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7PQP tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data 提交 2021-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
链 E
1–445（445 aa）
链 G
1–445（445 aa）
链 I
1–445（445 aa）
链 K
1–445（445 aa）
链 M
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7RS5 Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to Taxol-Stabilized Microtubules 提交 2021-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 J
1–445（445 aa）
链 M
1–445（445 aa）
链 O
1–445（445 aa）
链 Q
1–445（445 aa）
链 S
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 TA1 TAXOL × 9 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；cryoEM buffer (50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT supplemented with 2mM AMPPNP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7RS6 Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to GMPCPP-Stabilized Microtubules 提交 2021-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
链 J
1–445（445 aa）
链 M
1–445（445 aa）
链 O
1–445（445 aa）
链 Q
1–445（445 aa）
链 S
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 27 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 buffer (80 mM PIPES-KOH, pH 6.8; 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7RX0 Complex of AMPPNP-Kif7 and Gli2 Zinc-Finger domain bound to microtubules 提交 2021-08-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 3.89 Å |
| 7SGS Cryo-EM structure of full-length MAP7 bound to the microtubule 提交 2021-10-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7U0F HIV-1 Rev in complex with tubulin 提交 2022-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 150 PDB 声明：150-meric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7U0F HIV-1 Rev in complex with tubulin 提交 2022-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7U0F HIV-1 Rev in complex with tubulin 提交 2022-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 7X4N Crystal Structure of C. elegans kinesin-4 KLP-12 complexed with tubulin and DARPin 提交 2022-03-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；ammonium acetate, HEPES, polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.296 |
| 7YHN ANTI-TUMOR AGENT Y48 IN COMPLEX WITH TUBULIN 提交 2022-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 IUK 4-methyl-3-[(4-methylphenyl)sulfonylamino]-~{N}-[(6-methylpyridin-3-yl)methyl]benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；6% PEG 4000, 8% GLYCEROL, 30MM MAGNESIUM CHLORIDE, 30MM CALCIUM CHLORIDE, 100MM MES
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 7YSN Tubulin heterodimer structure of GMPCPP state in solution 提交 2022-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7YSO Tubulin heterodimer structure of GDP-1 state in solution 提交 2022-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7YSP Tubulin heterodimer structure of GDP-2 state in solution 提交 2022-08-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7Z2A P. berghei kinesin-8B motor domain in no nucleotide state bound to tubulin dimer 提交 2022-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 H
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7Z2B P. berghei kinesin-8B motor domain in AMPPNP state bound to tubulin dimer 提交 2022-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 H
1–426（426 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7Z2C P. falciparum kinesin-8B motor domain in no nucleotide bound to tubulin dimer 提交 2022-02-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 H
1–426（426 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8JJB Crystal structure of T2R-TTL-Y61 complex 提交 2023-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–431（431 aa）
链 D
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 USI ~{N}4-(1~{H}-indol-5-ylmethyl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.260 |
| 8JJC Tubulin-Y62 提交 2023-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–431（431 aa）
链 D
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 UPO 4-(6,7-dimethoxy-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidin-2-amine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.264 |
| 8QAU Outer kinetochore Ndc80-Dam1 alpha/beta-tubulin complex 提交 2023-08-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 8RC1 MAP7 MTBD (microtubule binding domain) decorated microtubule protofilament 提交 2023-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–430（430 aa）
链 D
1–430（430 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5；80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Microtubules stabilised by MAP7 MTBD were applied to a glow discharged grid, incubated for 30 seconds at room temperature following which excess sample was wicked off and MAP7 MTBD was immediately added to the grid. After incubation for 60 seconds in a Vitrobot, excess liquid was blotted off and the grid was plunge frozen in liquid ethane.
|
分辨率 3.70 Å |
| 8RHB Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, single-headed state 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RHH Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, two-headed state 提交 2023-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8RIK Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, single-headed state 提交 2023-12-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8RIZ Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, two-headed state 提交 2023-12-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8V4K CCP5 in complex with microtubules class1 提交 2023-11-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8V4L CCP5 in complex with microtubules class2 提交 2023-11-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8V4M CCP5 in complex with microtubules class3 提交 2023-11-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8X9P HURP (428-534)-alpha-tubulin-beta-tubulin complex 提交 2023-11-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–427（427 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9DA8 Tau-Microtubule structure in the presence of ATP 提交 2024-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
链 K
1–445（445 aa）
链 M
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 TA1 TAXOL × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9DHZ Cryo-EM structure of HURP bound to a microtubule 提交 2024-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–445（445 aa）
链 K
1–445（445 aa）
|
未记录 | TA1 TAXOL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DI0 Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule 提交 2024-09-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 K
1–445（445 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DUQ HURP(65-174) bound to GMPCPP-stabilized microtubule 提交 2024-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 B
1–427（427 aa）
链 D
1–427（427 aa）
链 F
1–427（427 aa）
链 H
1–427（427 aa）
链 J
1–427（427 aa）
链 L
1–427（427 aa）
链 N
1–427（427 aa）
链 P
1–427（427 aa）
链 R
1–427（427 aa）
|
未记录 | G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 MG MAGNESIUM ION × 18 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 (1X): 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9DXC Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule-HURP complex 提交 2024-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9DXE Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule 提交 2024-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9EDR Tubulin Cofactors D,E,G,C and Tubulin complex -- TBCC N Terminus Bound to Tubulin 提交 2024-11-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9EDS Tubulin cofactors D,E,G,C bound to tubulin dimer -- TBCC N terminus unbound 提交 2024-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9EDT Tubulin cofactors D,E,G bound to tubulin dimer 提交 2024-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9EEB Tubulin cofactors D,E,G bound to tubulin dimer 提交 2024-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9GNQ Microtubule-associated Kif5B IAK tail mutant bound to ADP 提交 2024-09-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9IM5 Tubulin-RB3(MUT)-TTL-Y12 提交 2024-07-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.246 |
| 9IMO Crystal structure of Tubulin-RB3-TTL-Y12 提交 2024-07-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–431（431 aa）
链 D
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 3 A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 9KBW CryoEM structure of microtubule bound with GAS2-GAR domain. 提交 2024-10-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–426（426 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；80 mM PIPES, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9L7M Nucleotide-free kinesin-1 motor domain bound to the microtubule 提交 2024-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 9N9E Cryo-EM structure of the SAH domain of Caenorhabditis elegans ICP-1 bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9N9F Cryo-EM structure of the SAH domain of human INCENP bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9N9G Cryo-EM structure of the human Hec1-Nuf2 dimer bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 b
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9N9H Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 b
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TA1 TAXOL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9N9I Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 3
1–445（445 aa）
链 B
1–445（445 aa）
链 C
1–445（445 aa）
链 b
1–445（445 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 TA1 TAXOL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9NNL Bordetella filamentous hemagglutinin (FhaB) C-terminal domain bound to microtubules 提交 2025-03-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
链 F
1–445（445 aa）
链 H
1–445（445 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 TA1 TAXOL × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 9RPD D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles 提交 2025-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 B
1–445（445 aa）
链 D
1–445（445 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 9T1D Cryo-EM reconstruction of undecorated GDP microtubule 提交 2025-10-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–429（429 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9U6A Tubulin-DARPin D1 in complex with a flavone 提交 2025-03-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 A1L8X 3-methoxy-2-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)-5,7-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3000, ammonium sulfate, bis-tris methane
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.224 |
| 9U6D Crystal structure of tubulin-RB3-TTL in complex with X8 提交 2025-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–431（431 aa）
链 D
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 A1L8Z 2-[2-fluoranyl-4-[4-[2-[4-[(1~{R},2~{S})-2-fluoranylcyclopropyl]carbonylpiperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]phenyl]-~{N}-(phenylmethyl)ethanamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.238 |
| 9U9Q Tubulin-RB3-TTL in complex with C38 提交 2025-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–431（431 aa）
链 D
1–431（431 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1L80 2-(1-benzofuran-5-yl)-6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-~{N}-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.269 |
| 9YMG Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin 提交 2025-10-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
1–444（444 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.238 |
| 9YMG Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin 提交 2025-10-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
1–444（444 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.238 |
| 9YXQ Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule 提交 2025-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric |
链 2
1–445（445 aa）
链 4
1–445（445 aa）
链 5
1–445（445 aa）
链 7
1–445（445 aa）
链 B
1–445（445 aa）
链 b
1–445（445 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 11 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 TA1 TAXOL × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
共 137 个其他 PDB 条目、159 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | TBB_PIG |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 b； PDB构建体 1–426； UniProt 2–427 |
