6m0r

2.7A Yeast Vo state3

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;V-type proton ATPase subunit c' ;

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATL2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–158； UniProt 7–164

;V-type proton ATPase subunit c'' ;

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P23968

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATO_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–198； UniProt 16–213

V0 assembly protein 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P53262

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VOA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–52； UniProt 212–263

V-type proton ATPase subunit e

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q3E7B6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VA0E_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

V-type proton ATPase subunit c

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P25515

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATL1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 F； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 G； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 H； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 I； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 J； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 K； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 L； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

Uncharacterized protein YPR170W-B

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P0C5R9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	YP17B_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–69； UniProt 7–75

V-type proton ATPase subunit d

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32366

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VA0D_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–345； UniProt 1–345

V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32563

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 1	;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PYROPHOSPHATE × 1 (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 water × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VPH1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–825； UniProt 3–827

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6m0r
沉积日期 deposition_date	2020-02-22
结构标题 title	2.7A Yeast Vo state3
关键词 keywords	V-ATPase, Vo sub-complex, CryoEM, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6m0r__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6m0r__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6m0r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.08 Å
Rg（电子密度）	43.91 Å
总 Rg	44.26 Å
原子数	47976
残基数	2915
排除体积	432760 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6m0r__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;V-type proton ATPase subunit c' ;
分子量 formula_weight	16414.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	48160

SNIYAPLYAPFFGFAGCAAAMVLSCLGAAIGTAKSGIGIAGIGTFKPELIMKSLIPVVMSGILAIYGLVVAVLIAGNLSPTEDYTLFNGFMHLSCGLCVGFACLSSGYAIGMVGDVGVRKYMHQPRLFVGIVLILIFSEVLGLYGMIVALILNTRGSE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;V-type proton ATPase subunit c'' ;
分子量 formula_weight	20880.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

SFSHFLYYLVLIVVIVYGLYKLFTGHGSDINFGKFLLRTSPYMWANLGIALCVGLSVVGAAWGIFITGSSMIGAGVRAPRITTKNLISIIFCEVVAIYGLIIAIVFSSKLTVATAENMYSKSNLYTGYSLFWAGITVGASNLICGIAVGITGATAAISDAADSALFVKILVIEIFGSILGLLGLIVGLLMAGKASEFQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	V0 assembly protein 1
分子量 formula_weight	5752.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

DDILSSIWTEGLLMCLIVSALLLFILIVALSWISNLDITYGALEKSTNPIKK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit e
分子量 formula_weight	8186.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MSSFYTVVGVFIVVSAMSVLFWIMAPKNNQAVWRSTVILTLAMMFLMWAITFLCQLHPLVAPRRSDLRPEF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit c
分子量 formula_weight	16254.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H,I,J,K,L

MTELCPVYAPFFGAIGCASAIIFTSLGAAYGTAKSGVGICATCVLRPDLLFKNIVPVIMAGIIAIYGLVVSVLVCYSLGQKQALYTGFIQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGSSQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALLLNSRATQDVV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Uncharacterized protein YPR170W-B
分子量 formula_weight	7487.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

TGKAWCCTVLSAFGVVILSVIAHLFNTNHESFVGSINDPEDGPAVAHTVYLAALVYLVFFVFCGFQVYL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit d
分子量 formula_weight	39822.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MEGVYFNIDNGFIEGVVRGYRNGLLSNNQYINLTQCDTLEDLKLQLSSTDYGNFLSSVSSESLTTSLIQEYASSKLYHEFNYIRDQSSGSTRKFMDYITYGYMIDNVALMITGTIHDRDKGEILQRCHPLGWFDTLPTLSVATDLESLYETVLVDTPLAPYFKNCFDTAEELDDMNIEIIRNKLYKAYLEDFYNFVTEEIPEPAKECMQTLLGFEADRRSINIALNSLQSSDIDPDLKSDLLPNIGKLYPLATFHLAQAQDFEGVRAALANVYEYRGFLETGNLEDHFYQLEMELCRDAFTQQFAISTVWAWMKSKEQEVRNITWIAECIAQNQRERINNYISVY

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform
分子量 formula_weight	94289.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

EKEEAIFRSAEMALVQFYIPQEISRDSAYTLGQLGLVQFRDLNSKVRAFQRTFVNEIRRLDNVERQYRYFYSLLKKHDIKLYEGDTDKYLDGSGELYVPPSGSVIDDYVRNASYLEERLIQMEDATDQIEVQKNDLEQYRFILQSGDEFFLKGDNTDSTSYMDEDMIDANGENIAAAIGASVNYVTGVIARDKVATLEQILWRVLRGNLFFKTVEIEQPVYDVKTREYKHKNAFIVFSHGDLIIKRIRKIAESLDANLYDVDSSNEGRSQQLAKVNKNLSDLYTVLKTTSTTLESELYAIAKELDSWFQDVTREKAIFEILNKSNYDTNRKILIAEGWIPRDELATLQARLGEMIARLGIDVPSIIQVLDTNHTPPTFHRTNKFTAGFQSICDCYGIAQYREINAGLPTIVTFPFMFAIMFGDMGHGFLMTLAALSLVLNEKKINKMKRGEIFDMAFTGRYIILLMGVFSMYTGFLYNDIFSKTMTIFKSGWKWPDHWKKGESITATSVGTYPIGLDWAWHGTENALLFSNSYKMKLSILMGFIHMTYSYFFSLANHLYFNSMIDIIGNFIPGLLFMQGIFGYLSVCIVYKWAVDWVKDGKPAPGLLNMLINMFLSPGTIDDELYPHQAKVQVFLLLMALVCIPWLLLVKPLHFKFTHKKKSHEPLPSTEADASSEDLEAQQLISAMDADDAEEEEVGSGSHGEDFGDIMIHQVIHTIEFCLNCVSHTASYLRLWALSLAHAQLSSVLWTMTIQIAFGFRGFVGVFMTVALFAMWFALTCAVLVLMEGTSAMLHSLRLHWVESMSKFFVGEGLPYEPFAFEYKDM

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 9 Entity 9 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	910.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
分子量 formula_weight	744.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	30

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	PYROPHOSPHATE
分子量 formula_weight	178.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	(6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene
分子量 formula_weight	549.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 13 Entity 13 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	184

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 19 domains

SCOP 2.08 (19 domains)

结构域编号 domain_id	d6m0rb_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.40 — V-type ATP synthase subunit C
超家族 Superfamily superfamily	f.40.1 — V-type ATP synthase subunit C
家族 Family family	f.40.1.1 — V-type ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	d6m0rd1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rd2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6m0re1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0re2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rf1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rf2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rg1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rg2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rh1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rh2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0ri1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0ri2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rj1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rj2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rk1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rk2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rl1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

结构域编号 domain_id	d6m0rl2
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.17 — Transmembrane helix hairpin
超家族 Superfamily superfamily	f.17.1 — Rotary ATPase ring subunits
家族 Family family	f.17.1.1 — F1F0 ATP synthase subunit C or V-type proton ATPase subunit c

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	117948

2.7A Yeast Vo state3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;V-type proton ATPase subunit c' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;V-type proton ATPase subunit c'' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V0 assembly protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit e

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit c

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein YPR170W-B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit d

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6m0r__assembly_1__model_1

6m0r__assembly_1__model_1 | I(q)

6m0r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer