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6o00

apo-LRRC8A in MSP2N2 nanodisc constricted state

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 128.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A

Mus musculus

UniProt Q80WG5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–810 链 B； UniProt 1–810 链 C； UniProt 1–810 链 D； UniProt 1–810 链 E； UniProt 1–810 链 F； UniProt 1–810 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；3 microliter drop size, 3 second blot time 分辨率 4.18 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6O00 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6FNW Structure of a volume-regulated anion channel of the LRRC8 family 提交 2018-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 398–810（413 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；22% PEG 3350, 0.2M Na/K tartrate, 0.1M Bis-Tris propane pH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
6G8Z Structure of the pore domain of homomeric mLRRC8A volume-regulated anion channel at 3.66 A resolution 提交 2018-04-10 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
6G9L Structure of homomeric mLRRC8A volume-regulated anion channel at 5.01 A resolution 提交 2018-04-11 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.01 Å
6G9O Structure of full-length homomeric mLRRC8A volume-regulated anion channel at 4.25 A resolution 提交 2018-04-11 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6NZW LRRC8A-DCPIB in MSP1E3D1 nanodisc constricted state 提交 2019-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 18 L9Y 4-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}butanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter drop size, 3 second blot time
分辨率 3.21 Å
6NZZ LRRC8A-DCPIB in MSP1E3D1 nanodisc expanded state 提交 2019-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 18 L9Y 4-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}butanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliter drop size, 3 second blot time
分辨率 3.32 Å
7M17 SN-407-LRRC8A in MSP1E3D1 lipid nanodiscs (Pose-1) 提交 2021-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18 YNJ 7-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}heptanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH to 7.4 with KOH
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2 microliter drop size, manual wait time of 2 seconds, blot force of 1, 3 second blot time
分辨率 3.65 Å
7M19 SN-407-LRRC8A in MSP1E3D1 lipid nanodiscs (Pose-2) 提交 2021-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18 YNJ 7-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}heptanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH to 7.4 with KOH
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2 microliter drop size, manual wait time of 2 seconds, blot force of 1, 3 second blot time
分辨率 3.69 Å
7P5V Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb1 提交 2021-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 15–808（794 aa）
链 B 15–808（794 aa）
链 C 15–808（794 aa）
链 D 15–808（794 aa）
链 E 15–808（794 aa）
链 F 15–808（794 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.06 Å
7P5W Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb2 提交 2021-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 15–808（794 aa）
链 B 15–808（794 aa）
链 C 15–808（794 aa）
链 D 15–808（794 aa）
链 E 15–808（794 aa）
链 F 15–808（794 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7P5Y Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb3 提交 2021-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 15–808（794 aa）
链 B 15–808（794 aa）
链 C 15–808（794 aa）
链 D 15–808（794 aa）
链 E 15–808（794 aa）
链 F 15–808（794 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.29 Å
7P60 Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb4 at 1:0.5 ratio 提交 2021-07-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7P6K Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb5 提交 2021-07-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–810（810 aa）
链 B 1–810（810 aa）
链 C 1–810（810 aa）
链 D 1–810（810 aa）
链 E 1–810（810 aa）
链 F 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8B41 Structure of heteromeric LRRC8A/C (1:1 co-transfected) Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb1 提交 2022-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–810（809 aa）
链 B 2–810（809 aa）
链 C 2–810（809 aa）
链 D 2–810（809 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8B42 Structure of heteromeric LRRC8A/C Volume-Regulated Anion Channel. 提交 2022-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–810（809 aa）
链 B 2–810（809 aa）
链 C 2–810（809 aa）
链 D 2–810（809 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
8DR8 LRRC8A:C conformation 2 (oblong) top mask 提交 2022-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–71（71 aa）
链 D 91–810（720 aa）
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8DRA LRRC8A:C conformation 2 (oblong) LRR mask 提交 2022-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
8DRE LRRC8A:C conformation 2 (oblong) 提交 2022-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–71（71 aa）
链 D 91–810（720 aa）
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8DRK LRRC8A:C conformation 1 (round) top focus 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–71（71 aa）
链 D 91–810（720 aa）
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8DRN LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 1 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
8DRO LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 2 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.06 Å
8DRQ LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 3 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8DS3 LRRC8A:C conformation 1 (round) 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–71（71 aa）
链 D 91–810（720 aa）
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 21 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8DS9 LRRC8A:C in MSPE3D1 nanodisc top focus 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–71（71 aa）
链 D 91–810（720 aa）
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8DSA LRRC8A:C in MSP1E3D1 nanodisc 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–71（71 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–71（71 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–71（71 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–71（71 aa）
链 D 91–810（720 aa）
链 E 1–71（71 aa）
链 E 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8F74 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 92–810（719 aa）
链 B 1–76（76 aa）
链 B 92–810（719 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 92–810（719 aa）
链 D 1–76（76 aa）
链 D 92–810（719 aa）
链 E 1–76（76 aa）
链 E 92–810（719 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8F75 LRRC8A(T48D):C conformation 2 LRR focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 91–810（720 aa）
链 B 91–810（720 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8F77 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 90–810（721 aa）
链 B 1–76（76 aa）
链 B 90–810（721 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 90–810（721 aa）
链 D 1–76（76 aa）
链 D 90–810（721 aa）
链 E 1–76（76 aa）
链 E 90–810（721 aa）
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8F79 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 90–810（721 aa）
链 B 1–76（76 aa）
链 B 90–810（721 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 90–810（721 aa）
链 D 1–76（76 aa）
链 D 90–810（721 aa）
链 E 1–76（76 aa）
链 E 90–810（721 aa）
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8F7B LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 90–810（721 aa）
链 B 1–76（76 aa）
链 B 90–810（721 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 90–810（721 aa）
链 D 1–76（76 aa）
链 D 90–810（721 aa）
链 E 1–76（76 aa）
链 E 90–810（721 aa）
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8F7D LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 90–810（721 aa）
突变：T48D 突变：T48D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8F7E LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–76（76 aa）
链 B 90–810（721 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 90–810（721 aa）
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
8F7J LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–76（76 aa）
链 E 90–810（721 aa）
突变：T48D 突变：T48D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.32 Å
9DX7 LRRC8A:D Conformation 1 提交 2024-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–76（76 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–76（76 aa）
链 D 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9DXA LRRC8A:D Conformation 2 提交 2024-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–76（76 aa）
链 A 91–810（720 aa）
链 B 1–76（76 aa）
链 B 91–810（720 aa）
链 C 1–76（76 aa）
链 C 91–810（720 aa）
链 D 1–76（76 aa）
链 D 91–810（720 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 35 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LRC8A_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810 作者链 B； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810 作者链 C； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810 作者链 D； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810 作者链 E； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810 作者链 F； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6o00

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6o00
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6o00
沉积日期 deposition_date2019-02-14
结构标题 titleapo-LRRC8A in MSP2N2 nanodisc constricted state
关键词 keywordsIon channel, volume-regulation, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier42.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.99 Å
零角强度 I(0) i0637815000.00
分子量 molecular_weight223100.0 kDa
排除体积 excluded_volume285610 ų
包络体积 envelope_volume403100 ų
水化壳体积 shell_volume80198 ų
包络直径 envelope_diameter130.1 Å
壳层 Rg shell_rg48.45 Å
包络 Rg envelope_rg39.28 Å
形状 Rg shape_rg40.96 Å
总 Rg total_rg41.53 Å
总原子数 total_atoms31470
残基数 n_residues1878
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax128.1 Å
Rg (实空间) rg_real42.46 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.07 Å
I(0) (实空间) i0_real6.3780e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2420e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal42.71 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal638000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8893
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary58.9 Å
偏度 Skewness skewness0.061
峰度 Kurtosis kurtosis-0.536
角度范围 angular_range— – 0.1850 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha72570000.0000
实空间数据点数 n_real_points38
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.951; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.973; Smooth: 0.730
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)