SAXSdb — 6qlf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inner kinetochore subunit IML3

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 1–245	未记录	Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4IT3 Crystal Structure of Iml3 from S. cerevisiae 提交 2013-01-17	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–245（245 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；3.75 M sodium formate, 4% 2,5-diaminopentane, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4JE3 An Iml3-Chl4 heterodimer links the core centromere to factors required for accurate chromosome segregation 提交 2013-02-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–242（242 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.35 M lithium citrate, pH 9, 25% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.28 Å R-free 0.211
4KR1 Crystal structure of the kinetechore protein Iml3 from budding yeast 提交 2013-05-16	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–245（245 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；285 K；3M Sodium formate, 100mM Cesium chloride, 3% PEG 4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K	分辨率 2.50 Å R-free 0.262
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 L 2–242（241 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 L 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 L 1–245（245 aa）链 LL 1–245（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPL_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245

Inner kinetochore subunit CHL4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38907

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 1–458	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4JE3 An Iml3-Chl4 heterodimer links the core centromere to factors required for accurate chromosome segregation 提交 2013-02-26	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 361–458（98 aa）片段：UNP residues 361-458	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.35 M lithium citrate, pH 9, 25% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.28 Å R-free 0.211
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 E 1–458（458 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 N 5–451（447 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 N 1–458（458 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 N 1–458（458 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 N 1–458（458 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 N 1–458（458 aa）链 NN 1–458（458 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPN_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458

Inner kinetochore subunit MCM21

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q06675

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 1–368	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–368（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 O 153–364（212 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 O 1–368（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 O 1–368（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 O 1–368（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 O 1–368（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 O 1–368（368 aa）链 OO 1–368（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPO_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–368； UniProt 1–368

Inner kinetochore subunit CTF19

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q02732

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 1–369	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 D 1–369（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 P 97–366（270 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 P 1–369（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 P 1–369（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 P 1–369（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 P 1–369（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 P 1–369（369 aa）链 PP 1–369（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPP_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–369； UniProt 1–369

Inner kinetochore subunit OKP1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53298

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 Q； UniProt 1–406	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 F 1–406（406 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Q 161–391（231 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 Q 161–406（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 Q 1–406（406 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Q 1–406（406 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 Q 1–406（406 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 Q 1–406（406 aa）链 QQ 1–406（406 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8T0P Structure of Cse4 bound to Ame1 and Okp1 提交 2023-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 125–275（151 aa）片段：residues 125-275	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；19% PEG 8000, 0.55 M Lithium sulfate	分辨率 1.73 Å R-free 0.236

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPQ_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–406； UniProt 1–406

Inner kinetochore subunit AME1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38313

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 1–320	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 I 1–324（324 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 U 131–320（190 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 U 166–324（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 U 1–324（324 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 U 1–324（324 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 U 1–324（324 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 U 1–324（324 aa）链 UU 1–324（324 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8T0P Structure of Cse4 bound to Ame1 and Okp1 提交 2023-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 125–231（107 aa）片段：residues 125-231	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；19% PEG 8000, 0.55 M Lithium sulfate	分辨率 1.73 Å R-free 0.236

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPU_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

Inner kinetochore subunit NKP1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12493

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 1–238	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 G 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Y 2–238（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 Y 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 Y 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Y 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 Y 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 Y 1–238（238 aa）链 YY 1–238（238 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NKP1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–238； UniProt 1–238

Inner kinetochore subunit NKP2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q06162

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 Z； UniProt 1–153	未记录	Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6QLF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 J 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Z 3–153（151 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 Z 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 Z 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Z 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 Z 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 Z 1–153（153 aa）链 ZZ 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NKP2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6qlf
沉积日期 deposition_date	2019-01-31
结构标题 title	Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1
关键词 keywords	inner kinetochore, CCAN, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	47.90 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	47.39 Å
零角强度 I(0) i0	515622000.00
分子量 molecular_weight	191500.0 kDa
排除体积 excluded_volume	241910 Å³
包络体积 envelope_volume	362180 Å³
水化壳体积 shell_volume	66146 Å³
包络直径 envelope_diameter	179.2 Å
壳层 Rg shell_rg	48.41 Å
包络 Rg envelope_rg	48.37 Å
形状 Rg shape_rg	47.46 Å
总 Rg total_rg	47.20 Å
总原子数 total_atoms	13501
残基数 n_residues	1783
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	165.0 Å
Rg (实空间) rg_real	48.15 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.93 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.1560e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0040e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	47.91 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	515500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8749
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	50.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.417
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.367
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	55070000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.854; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.970; Smooth: 0.838

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit IML3
分子量 formula_weight	28093.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L
原子数 atom_count	13501

MPYTWKFLGISKQLSLENGIAKLNQLLNLEVDLDIQTIRVPSDPDGGTAADEYIRYEMRLDISNLDEGTYSKFIFLGNSKMEVPMFLCYCGTDNRNEVVLQWLKAEYGVIMWPIKFEQKTMIKLADASIVHVTKENIEQITWFSSKLYFEPETQDKNLRQFSIEIPRESCEGLALGYGNTMHPYNDAIVPYIYNETGMAVERLPLTSVILAGHTKIMRESIVTSTRSLRNRVLAVVLQSIQFTSE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit CHL4
分子量 formula_weight	53538.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MSNELRLEDNYVPTSDTLVVFKQLMKLPVTVLYDLTLSWFAKFGGSFDGDIYLLTETLDLLIEKGVRRNVIVNRILYVYWPDGLNVFQLAEIDCHLMISKPEKFKWLPSKALRGDGKPYVVKLQPAKFIENLQTDLAKIYHCHVYMFKHPSLPVLITRIQLFDSNNLFLSTPNIGSINKESLYNKLDKFQGKPLISRRPYYVAFPLNSPIIFHSVDKDIYARLVLQSISRTISERETIIFKPVQKIPVKSIHNIMTLLGPSRFAESMGPWECYASANFERSPLHDYKKHQGLTGKKVMVREFDDSFLNDDENFYGKEEPEIRRLRLEKNMIKFKGSANGVMDQKYNDLKEFNEHVHNIRNGKKNEDSGEPVYISRYSSLVPIEKVGFTLKNEINSRIITIKLKFNGNDIFGGLHELCDKNLINIDKVPGWLAGENGSFSGTIMNGDFQREQVAKGGLLENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit MCM21
分子量 formula_weight	43028.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSRIDDLQQDIESLLSEINSLEESREKLKAKIKDKRKNEESANPIVQEFEDLFDQFPQLNNFLFNEHPELEETDDKDISRAQADIPATPIPYEPKKRAKLENEEILPEQEWVLKTQPMVQHQMFDPGVADLLDTDILTSPSKRKRKLKIDDISTSDRSELEDYIVLENVYRMFGITFFPLVDPIDLKIKDASGEIFVDREMLGIRLEVFSERTSQFEKPHYVLLKKRIKSNSWFLFKHTIPSFIDVQGIFDDTNGGLVISHDDAYLFAKRVFLQLVEVQKRRQIFKDLEAKKIIHDLDLDLESSMVSFFVKDIKVELFVKQNEIVSCSILDDIHDFSQNNKSKWEIALLGSLDDLELKLNHSFATIFK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit CTF19
分子量 formula_weight	42841.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MDFTSDTTNSHDTSNSHLSLEDAVGTHHAGEADVNIDGDEKQQLSLLDDDQVRALKLQEEKDALLTRRNTLLQEIQTYQNILMKENNSKTKNGDILQNDITQDFLNLISISSSNPNSAISDRKRVERINGLTNLQKELVTKYDTLPLLNMNLRLSYLRDHTYPHLQVSVQSRDRVHNDGIEVLVVNYKFCRNTMNPFEIQFKMFYKFEDSTLLKWEILRISTNVRLKAKQLLATRNFQKCLLSLYEFDKIKSKKTGIFQNLINLLKRKTRCYLMNNSDSLIVERVIREGRLTTIKLQINFIITMPGERGKPRNCFLPMSKISIALWKGGERFNQIDLDEICYGLIKEYGVKTGLKEICNVCLFPDMYAR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit OKP1
分子量 formula_weight	47427.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MAADRDNFLQNIENDSINNGQAMDLSPNRSSSESDSSILMNVNDIKTLRLDVAPEAKSTQSKKSLFYENSDDAEEGEIEERTNKEEGQYHHKGSKQLRFEVGKESTGKLQSHLSDGSATSGEGNVRPWEFRKVIQAEYRERLPRNYELKHWKKPSKIMIGSILRLLETNTVSALDSVFEKYEKEMNQMTHGDNNEVKRIYSKKERLLEIILTKIKKKLRQAKFPSRISERDLDIEYIYSKRQFIQNRYSQELQNNERLEAILSREQNLLEETRKLCMNLKTNNKKRLTEKLIQKDLHPVLNKAMEYTYGLESTNGFMHPDGPVTFRNDSHELNLMLNDPIKSTADVRLDKEEVLSLLPSLKEYTKKSKELKETMGQMISDSHEEEIKEVFVPHHESHQDKTEEDIH

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit AME1
分子量 formula_weight	37081.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MDRDTKLAFRLRGSHSRRTDDIDDDVIVFKTPNAVYREENSPIQSPVQPILSSPKLANSFEFPITTNNVNAQDRHEHGYQPLDAEDYPMIDSENKSLISESPQNVRNDEDLTTRYNFDDIPIRQLSSSITSVTTIDVLSSLFINLFENDLIPQALKDFNKSDDDQFRKLLYKLDLRLFQTISDQMTRDLKDILDINVSNNELCYQLKQVLARKEDLNQQIISVRNEIQELKAGKDWHDLQNEQAKLNDKVKLNKRLNDLTSTLLGKYEGDRKIMSQDSEDDSIRDDSNILDIAHFVDLMDPYNGLLKKINKINENLSNEL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit NKP1
分子量 formula_weight	27006.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MTDTYNSISNFIENELTALLSSDDYLMDDLAGELPNEVCRLLKAQVIEKRKDAMSRGKQDLLSKEIYDNESELRASQSQQIMELVGDIPKYSLGSELRNRVEGEPQSTSIERLIEDVLKLPQMEVADEEEVEVENDLKVLSEYSNLRKDLILKCQALQIGESKLSDILSQTNSINSLTTSIKEASEDDDISEYFATYNGKLVVALEEMKLLLEEAVKTFGNSPEKREKIKKILSELKK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit NKP2
分子量 formula_weight	17877.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MNSEQLLHNYVSDSLLTTLISFQEFKQQLQSYTSDEQQLQHWYELLQARDARVTSELEARIKQFFITLRSRLLRFLESEQLSHSLSLETLIDALYKINDLLQQRLQILDDAIQEKTSELAEFENMVRSPSAGDNAIPGLLQIIQSYINLLEEN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.45 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	465029

fit	/app/data/saxs_computation/ql/6qlf/6qlf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ql/6qlf/6qlf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ql/6qlf/6qlf.dat

Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inner kinetochore subunit IML3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit CHL4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit MCM21

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit CTF19

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit OKP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit AME1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit NKP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inner kinetochore subunit NKP2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)