SAXSdb — 6ul0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	;4-{5-[(1Z)-3-{[2-(3-carboxypropanoyl)-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}prop-1-en-1-yl]-6-methoxy-1-benzothiophen-2-yl}-4-oxobutanoic acid ; × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2R3XZB7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 114–300； UniProt 155–341

fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain

Homo sapiens

UniProt Q12306

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	;4-{5-[(1Z)-3-{[2-(3-carboxypropanoyl)-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}prop-1-en-1-yl]-6-methoxy-1-benzothiophen-2-yl}-4-oxobutanoic acid ; × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMT3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 10–106； UniProt 2–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ul0
沉积日期 deposition_date	2019-10-06
结构标题 title	STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 4
关键词 keywords	;AGONIST, STING (STIMULATOR OF INTERFERON GENES), TRANSMEMBRANE PROTEIN 173 (TMEM173), IMMUNE SYSTEM, IMMUNE SYSTEM-INHIBITOR COMPLEX, IMMUNE SYSTEM-AGONIST COMPLEX ;; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ul0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ul0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ul0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.27 Å
Rg（电子密度）	20.94 Å
总 Rg	21.86 Å
原子数	2936
残基数	354
排除体积	52068 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ul0__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain
分子量 formula_weight	34456.5 kDa
突变 mutation	G230A,R293Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1555

MAHHHHHHGSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLTFLYDGIEIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGENLYFQSVAHGLAWSYYIGYLRLILPELQARIRTYNQHYNNLLRGAVSQRLYILLPLDCGVPDNLSMADPNIRFLDKLPQQTADRAGIKDRVYSNSIYELLENGQRAGTCVLEYATPLQTLFAMSQYSQAGFSREDRLEQAKLFCQTLEDILADAPESQNNCRLIAYQEPADDSSFSLSQEVLRHLRQEEKEEV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;4-{5-[(1Z)-3-{[2-(3-carboxypropanoyl)-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}prop-1-en-1-yl]-6-methoxy-1-benzothiophen-2-yl}-4-oxobutanoic acid ;
分子量 formula_weight	582.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	75

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d6ul0a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.387 — STING C-terminal-like
超家族 Superfamily superfamily	d.387.1 — STING, TM173 CTD-like
家族 Family family	d.387.1.1 — Tyrosinase cofactor MelC1

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晶胞边长 a length_a	98.382 Å
晶胞边长 b length_b	61.473 Å
晶胞边长 c length_c	36.336 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	104.57 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.760 Å
最低分辨率 resolution_low	47.610 Å
R 因子 r_factor	0.2130
R_work r_work	0.2120
R_free r_free	0.2420

STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ul0__assembly_1__model_1

6ul0__assembly_1__model_1 | I(q)

6ul0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

fusion protein of Ubiquitin-like protein SMT3 and Stimulator of interferon protein c-terminal domain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ul0__assembly_1__model_1

6ul0__assembly_1__model_1 | I(q)

6ul0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

7. 引用文献 (1)