SAXSdb — 6vqa

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase H+-transporting V1 subunit A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–617 链 B； UniProt 1–617 链 C； UniProt 1–617	未记录	V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P62815） ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 （Q6P503） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （Q6PCU2） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q8R2H0） Effector protein SidK × 3 （Q5ZWW6） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6VQA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
7UZJ Rat Kidney V1 complex with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7UZK Rat Kidney V1 complex lacking subunit H with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 A 1–617（617 aa）链 B 1–617（617 aa）链 C 1–617（617 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 A 1–647（647 aa）链 B 1–647（647 aa）链 C 1–647（647 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 A 1–647（647 aa）链 B 1–647（647 aa）链 C 1–647（647 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 A 1–647（647 aa）链 B 1–647（647 aa）链 C 1–647（647 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 A 1–646（646 aa）链 B 1–646（646 aa）链 C 1–646（646 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D4A133_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617 作者链 B； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617 作者链 C； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617

V-type proton ATPase subunit B, brain isoform

物种未注明

UniProt P62815

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–511 链 E； UniProt 1–511 链 F； UniProt 1–511	未记录	ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 （D4A133） ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 （Q6P503） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （Q6PCU2） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q8R2H0） Effector protein SidK × 3 （Q5ZWW6） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6VQA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
7UZJ Rat Kidney V1 complex with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7UZK Rat Kidney V1 complex lacking subunit H with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 D 1–511（511 aa）链 E 1–511（511 aa）链 F 1–511（511 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATB2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511 作者链 E； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511 作者链 F； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511

ATPase H+-transporting V1 subunit D

物种未注明

UniProt Q6P503

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–247	未记录	ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 （D4A133） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P62815） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （Q6PCU2） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q8R2H0） Effector protein SidK × 3 （Q5ZWW6） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6VQA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
7UZJ Rat Kidney V1 complex with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7UZK Rat Kidney V1 complex lacking subunit H with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 H 1–247（247 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6P503_RAT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–247； UniProt 1–247

V-type proton ATPase subunit E 1

物种未注明

UniProt Q6PCU2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–226 链 J； UniProt 1–226 链 K； UniProt 1–226	未记录	ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 （D4A133） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P62815） ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 （Q6P503） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q8R2H0） Effector protein SidK × 3 （Q5ZWW6） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6VQA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQI Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.30 Å
6VQJ Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.70 Å
6VQK Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.70 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
7UZJ Rat Kidney V1 complex with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7UZK Rat Kidney V1 complex lacking subunit H with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9B8Q Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, peripheral stalks 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 I 1–226（226 aa）链 J 1–226（226 aa）链 K 1–226（226 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATE1_RAT
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226 作者链 J； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226 作者链 K； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226

V-type proton ATPase subunit G

物种未注明

UniProt Q8R2H0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 1–118 链 N； UniProt 1–118 链 O； UniProt 1–118	未记录	ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 （D4A133） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P62815） ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 （Q6P503） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （Q6PCU2） Effector protein SidK × 3 （Q5ZWW6） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6VQA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQI Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.30 Å
6VQJ Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.70 Å
6VQK Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.70 Å
9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9B8Q Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, peripheral stalks 提交 2024-03-31	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 M 1–118（118 aa）链 N 1–118（118 aa）链 O 1–118（118 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8R2H0_RAT
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 N； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 O； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

Effector protein SidK

Legionella pneumophila subsp. pneumophila (strain Philadelphia 1 / ATCC 33152 / DSM 7513)

UniProt Q5ZWW6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 Q； UniProt 1–278 链 R； UniProt 1–278 链 S； UniProt 1–278	片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag	ATPase H+-transporting V1 subunit A × 3 （D4A133） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P62815） ATPase H+-transporting V1 subunit D × 1 （Q6P503） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （Q6PCU2） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q8R2H0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6VQA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 Q 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 R 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 S 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 Q 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 R 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 S 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 Q 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 R 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 S 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ9 Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 1 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 R 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag 链 S 1–278（278 aa）片段：N-terminal fragment with 3x FLAG tag	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6VQB Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 1–278（278 aa）链 R 1–278（278 aa）链 S 1–278（278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 X 1–573（573 aa）链 Y 1–573（573 aa）链 Z 1–573（573 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 X 1–573（573 aa）链 Y 1–573（573 aa）链 Z 1–573（573 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 X 1–573（573 aa）链 Y 1–573（573 aa）链 Z 1–573（573 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7U8O Structure of porcine V-ATPase with mEAK7 and SidK, Rotary state 2 提交 2022-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 Q 1–337（337 aa）链 R 1–337（337 aa）链 S 1–337（337 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7U8P Structure of porcine kidney V-ATPase with SidK, Rotary State 1 提交 2022-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 Q 1–337（337 aa）链 R 1–337（337 aa）链 S 1–337（337 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7U8Q Structure of porcine kidney V-ATPase with SidK, Rotary State 2 提交 2022-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 Q 1–337（337 aa）链 R 1–337（337 aa）链 S 1–337（337 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7U8R Structure of porcine kidney V-ATPase with SidK, Rotary State 3 提交 2022-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 Q 1–337（337 aa）链 R 1–337（337 aa）链 S 1–337（337 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 Q 1–280（280 aa）链 R 1–280（280 aa）链 S 1–280（280 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 Q 1–278（278 aa）链 R 1–278（278 aa）链 S 1–278（278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 Q 1–278（278 aa）链 R 1–278（278 aa）链 S 1–278（278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 Q 1–278（278 aa）链 R 1–278（278 aa）链 S 1–278（278 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
7UZJ Rat Kidney V1 complex with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 Q 1–280（280 aa）链 R 1–280（280 aa）链 S 1–280（280 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7UZK Rat Kidney V1 complex lacking subunit H with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 Q 1–280（280 aa）链 R 1–280（280 aa）链 S 1–280（280 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9B8P Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, V1 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric	链 Q 1–573（573 aa）链 R 1–573（573 aa）链 S 1–573（573 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 Q 1–573（573 aa）链 R 1–573（573 aa）链 S 1–573（573 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 Q 1–573（573 aa）链 R 1–573（573 aa）链 S 1–573（573 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 Q 1–573（573 aa）链 R 1–573（573 aa）链 S 1–573（573 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5ZWW6_LEGPH
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 2–279； UniProt 1–278 作者链 R； PDB构建体 2–279； UniProt 1–278 作者链 S； PDB构建体 2–279； UniProt 1–278

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6vqa
沉积日期 deposition_date	2020-02-04
结构标题 title	Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement)
关键词 keywords	membrane protein complex, rotary atpase, PROTON TRANSPORT; PROTON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	51.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	51.24 Å
零角强度 I(0) i0	3685830000.00
分子量 molecular_weight	514300.0 kDa
排除体积 excluded_volume	646080 Å³
包络体积 envelope_volume	877990 Å³
水化壳体积 shell_volume	133320 Å³
包络直径 envelope_diameter	169.1 Å
壳层 Rg shell_rg	60.79 Å
包络 Rg envelope_rg	51.13 Å
形状 Rg shape_rg	51.23 Å
总 Rg total_rg	51.52 Å
总原子数 total_atoms	36114
残基数 n_residues	4578
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	170.2 Å
Rg (实空间) rg_real	51.48 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.33 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.6860e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.8040e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	51.87 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3688000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8749
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	62.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.169
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.444
角度范围 angular_range	— – 0.1500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	756900000.0000
实空间数据点数 n_real_points	31
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.831; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.947; Smooth: 0.929

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATPase H+-transporting V1 subunit A
分子量 formula_weight	68341.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	36114

MDFSKLPKIRDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWEFIPSKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRSRGSVTYIAPPGNYDASDVVLELEFEGVKEKLSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMISFYDMARRAVETTAQSDNKITWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGEAKIKADYAQLLEDMQNAFRSLED

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit B, brain isoform
分子量 formula_weight	56611.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPMAGAREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFEKNFITQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATPase H+-transporting V1 subunit D
分子量 formula_weight	28359.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSGKDRIEIFPSRMAQTIMKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKIIKEKSEKDLERRRAAGEVMEPANLLAEEKDEDLLFE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit E 1
分子量 formula_weight	26167.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K

MALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPMYKIATKKDVDVQIDLEAYLPEDIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit G
分子量 formula_weight	13690.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N,O

MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVADARKRKARRLKQAKEEAQMEVEQYRREREQEFQSKQQAAMGSQGNLSAEVEQATRRQVQGMQSSQQRNRERVLTQLLGMVCDVRPQVHPNYRITV

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Effector protein SidK
分子量 formula_weight	34693.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,R,S

GMSFIKVGIKMGGLTSEQYHSQVVGKIGYIARCMQTIDPENNLKKIREDYQDVLIWAEKNYRFEEILEASKSGKCPNDLDALSRRSLILQELLRLVSSISPFKMKLDLIESQYEKMKQHVNLWKSDYHVKLNQLNQLTDYLKNAAPTPKNNFLRAMTSVLQMQIAQYGITEDNEGINQLFKLGLHLLAMANEKIDEQYHLFKGYVKDQPEESPFEGILPAEDQKILVKTMIDYAMPKLSSKVLQDKLSALSSSDVLTKTLLDSIDRIVKENEKLNALSKDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Legionella pneumophila subsp. pneumophila (strain Philadelphia 1 / ATCC 33152 / DSM 7513)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	272624
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

CATH v4.4 (9 domains)

结构域编号 domain_id	6vqaA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6vqaA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	6vqaB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6vqaB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	6vqaC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	6vqaC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	6vqaD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12240 —

结构域编号 domain_id	6vqaE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12240 —

结构域编号 domain_id	6vqaF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12240 —

▶

8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	74789

fit	/app/data/saxs_computation/vq/6vqa/6vqa.fit
pddf	/app/data/pr_computation/vq/6vqa/6vqa.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/vq/6vqa/6vqa.dat

Mammalian V-ATPase from rat brain soluble V1 region rotational state 2 with SidK and ADP (from focused refinement)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase H+-transporting V1 subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type proton ATPase subunit B, brain isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATPase H+-transporting V1 subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type proton ATPase subunit E 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type proton ATPase subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Effector protein SidK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

CATH v4.4 (9 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)