SAXSdb — 6w3j

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Terminal nucleotidyltransferase 5C

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Serine/threonine-protein kinase PLK4 × 1 （O00444） Centrosomal protein of 192 kDa × 1 （Q8TEP8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TET5C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–347； UniProt 14–358

Serine/threonine-protein kinase PLK4

Homo sapiens

UniProt O00444

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Terminal nucleotidyltransferase 5C × 1 （Q5VWP2） Centrosomal protein of 192 kDa × 1 （Q8TEP8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PLK4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–223； UniProt 585–807

Centrosomal protein of 192 kDa

Homo sapiens

UniProt Q8TEP8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Terminal nucleotidyltransferase 5C × 1 （Q5VWP2） Serine/threonine-protein kinase PLK4 × 1 （O00444）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CE192_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–22； UniProt 217–238

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6w3j
沉积日期 deposition_date	2020-03-09
结构标题 title	Crystal structure of the FAM46C/Plk4/Cep192 complex
关键词 keywords	RNA polymerase, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6w3j__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6w3j__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6w3j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.18 Å
Rg（电子密度）	29.75 Å
总 Rg	30.28 Å
原子数	4608
残基数	571
排除体积	82325 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6w3j__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Terminal nucleotidyltransferase 5C
分子量 formula_weight	40035.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.19
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4608

MAFSVLNWDQVSRLHEVLTEVVPIHGRGNFPTLEITLKDIVQTVRSRLEEAGIKVHDVRLNGSAAGHVLVKDNGLGCKDLDLIFHVALPTEAEFQLVRDVVLCSLLNFLPEGVNKLKISPVTLKEAYVQKLVKVCTDTDRWSLISLSNKNGKNVELKFVDSIRRQFEFSVDSFQIILDSLLFFYDCSNNPISEHFHPTVIGESMYGDFEEAFDHLQNRLIATKNPEEIRGGGLLKYSNLLVRDFRPTDQEEIKTLERYMCSRFFIDFPDILEQQRKLETYLQNHFAEEERSKYDYLMILRRVVNESTVCLMGHERRQTLNLISLLALRVLAEQNIIPSATNVTCYYQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase PLK4
分子量 formula_weight	25869.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.21
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

RTLRSITSPLVAHRLKPIRQKTKKAVVSILDSEEVCVELVKEYASQEYVKEVLQISSDGNTITIYYPNGGRGFPLADRPPSPTDNISRYSFDNLPEKYWRKYQYASRFVQLVRSKSPKITYFTRYAKCILMENSPGADFEVWFYDGVKIHKTEDFIQVIEKTGKSYTLKSESEVNSLKEEIKMYMDHANEGHRICLALESIISEEERKTRSAPFFPIIIGRKP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Centrosomal protein of 192 kDa
分子量 formula_weight	2632.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

IDDEMFYDDHLEAYFEQLAIPG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	88.033 Å
晶胞边长 b length_b	161.449 Å
晶胞边长 c length_c	167.471 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.385 Å
最低分辨率 resolution_low	37.166 Å
R 因子 r_factor	0.2683
R_work r_work	0.2633
R_free r_free	0.3139

Crystal structure of the FAM46C/Plk4/Cep192 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Terminal nucleotidyltransferase 5C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Serine/threonine-protein kinase PLK4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Centrosomal protein of 192 kDa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6w3j__assembly_1__model_1

6w3j__assembly_1__model_1 | I(q)

6w3j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the FAM46C/Plk4/Cep192 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Terminal nucleotidyltransferase 5C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Serine/threonine-protein kinase PLK4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Centrosomal protein of 192 kDa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6w3j__assembly_1__model_1

6w3j__assembly_1__model_1 | I(q)

6w3j__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)