SAXSdb — 6wuc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inner kinetochore subunit MCM16

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit WIP1 × 1 （Q2V2P8） Inner kinetochore subunit CNN1 × 1 （P43618）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPH_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 4–184； UniProt 1–181

Inner kinetochore subunit CTF3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12748

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit WIP1 × 1 （Q2V2P8） Inner kinetochore subunit CNN1 × 1 （P43618）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPI_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 4–736； UniProt 1–733

Inner kinetochore subunit MCM22

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P47167

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） Inner kinetochore subunit WIP1 × 1 （Q2V2P8） Inner kinetochore subunit CNN1 × 1 （P43618）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPK_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 4–242； UniProt 1–239

Inner kinetochore subunit WIP1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q2V2P8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit CNN1 × 1 （P43618）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPW_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 4–92； UniProt 1–89

Inner kinetochore subunit CNN1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P43618

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit WIP1 × 1 （Q2V2P8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CENPT_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6wuc
沉积日期 deposition_date	2020-05-04
结构标题 title	The yeast Ctf3 complex with Cnn1-Wip1
关键词 keywords	kinetochore, cell cycle, chromosome segregation, CCAN; CELL CYCLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6wuc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6wuc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6wuc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.12 Å
Rg（电子密度）	46.46 Å
总 Rg	46.44 Å
原子数	10284
残基数	1266
排除体积	184970 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6wuc__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit MCM16
分子量 formula_weight	21438.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H
原子数 atom_count	10284

SNAMTNSSEKQWERIQQLEKEHVEVYRELLITLDRLYLIRKHNHAVILSHTQQRLLEIRHQLQINLEKTALLIRLLEKPDNTNVLFTKLQNLLEESNSLDYELLQSLGAQSSLHKQLIESRAERDELMSKLIELSSKFPKPTIPPDDSDTAGKQVEVEKENETIQELMIALQIHSGYTNISYTI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit CTF3
分子量 formula_weight	84617.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

SNAMSLILDDIILSLTNANERTPPQALKTTLSLLYEKSKQYGLSSPQLQALVRLLCETSIIDTVTKVYIVENCFLPDGYLTKELLLEIINHLGTPTVFSRYRIQTPPVLQSALCKWLVHVYFLFPVHSEREHNISSSIWLHLWQFSFLQKWITPLVIWQATTPVDVKPWKLSIIKRCAMHPGYRDAPGSATLILQRFQCLVGASSQITESIITINCNRKTLKSHRNLKLDAHFLSILKRILSRAHPANFPADTVQNTIDMYLSEIHQLGADSIYPLRLQSLPEYVPSDSTVSLWDVTSLEQLAQNWPQLHIPNDVDYMMKPSLNSNVLLPRKVMSRDSLKHLYSSIILIKNSRDESSSPYEWCIWQLKRCFAHQIETPQEVIPIIISVSSMDNKLSSRIIQTFCNLKYLKLDELTLKKVCGGILPLWKPELISGTREFFVKFMASIFMWSTRDGHDNNCTFSETCFYVLQMITNWVLDDKLIALGLTLLHDMQSLLTLDKIFNNATSNRFSTMAFISSLDILTQLSKQTKSDYAIQYLIVGPDIMNKVFSSDDPLLLSAACRYLVATKNKLMQYPSTNKFVRMQNQYIMDLTNYLYRNKVLSSKSLFGVSPDFFKQILENLYIPTADFKNAKFFTITGIPALSYICIIILRRLETAENTKIKFTSGIINEETFNNFFRVHHDEIGQHGWIKGVNNIHDLRVKILMHLSNTANPYRDIAAFLFTYLKSLSKYSVQNS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit MCM22
分子量 formula_weight	27874.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

SNAMDVEKDVLDVYIKNLENQIGNKRYFLKQAQGAIDEITKRSLDTEGKPVNSEVFTELLRKPMFFSERADPIGFSLTSNFLSLRAQSSSEWLSLMNDQSVDQKAMLLLQNNINSDLKELLRKLQHQMTIMDSKKQDHAHIRTRKARNKELWDSLADFLKGYLVPNLDDNDESIDSLTNEVMLLMKRLIEHDLNLTLNDFSSKTIPIYRLLLRANIITVIEGSTNPGTKYIKLIDFNETSLT

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit WIP1
分子量 formula_weight	10527.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

SNAMDTEALANYLLRQLSLDAEENKLEDLLQRQNEDQESSQEYNKKLLLACGFQAILRKILLDARTRATAEGLREVYPYHIEAATQAFLDSQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Inner kinetochore subunit CNN1
分子量 formula_weight	41359.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MSTPRKAAGNNENTEVSEIRTPFRERALEEQRLKDEVLIRNTPGYRKLLSASTKSHDILNKDPNEVRSFLQDLSQVLARKSQGNDTTTNKTQARNLIDELAYEESQPEENELLRSRSEKLTDNNIGNETQPDYTSLSQTVFAKLQERDKGLKSRKIDPIIIQDVPTTGHEDELTVHSPDKANSISMEVLRTSPSIGMDQVDEPPVRDPVPISITQQEEPLSEDLPSDDKEETEEAENEDYSFENTSDENLDDIGNDPIRLNVPAVRRSSIKPLQIMDLKHLTRQFLNENRIILPKQTWSTIQEESLNIMDFLKQKIGTLQKQELVDSFIDMGIINNVDDMFELAHELLPLELQSRIESYLF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.23 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	109996

The yeast Ctf3 complex with Cnn1-Wip1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inner kinetochore subunit MCM16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inner kinetochore subunit CTF3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inner kinetochore subunit MCM22

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inner kinetochore subunit WIP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inner kinetochore subunit CNN1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6wuc__assembly_1__model_1

6wuc__assembly_1__model_1 | I(q)

6wuc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)