SAXSdb — 6x5z

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Tropomyosin alpha-1 chain × 2 （P09493） Myosin-7 × 3 （Q9BE39） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_CHICK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 B； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Tropomyosin alpha-1 chain

Homo sapiens

UniProt P09493

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Actin, alpha skeletal muscle × 3 （P68139） Myosin-7 × 3 （Q9BE39） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPM1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 P； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284

Myosin-7

物种未注明

UniProt Q9BE39

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Actin, alpha skeletal muscle × 3 （P68139） Tropomyosin alpha-1 chain × 2 （P09493） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYH7_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–850； UniProt 1–850 作者链 G； PDB构建体 1–850； UniProt 1–850 作者链 J； PDB构建体 1–850； UniProt 1–850

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6x5z
沉积日期 deposition_date	2020-05-27
结构标题 title	Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State
关键词 keywords	myosin, tropomyosin, actin, cardiac, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6x5z__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6x5z__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6x5z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	62.52 Å
Rg（电子密度）	63.06 Å
总 Rg	62.99 Å
原子数	28416
残基数	3554
排除体积	506500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6x5z__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	42097.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A,C
原子数 atom_count	28416

MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tropomyosin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	32763.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P

MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Myosin-7
分子量 formula_weight	97446.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,D,J

MVDAEMAAFGEAAPYLRKSEKERLEAQTRPFDLKKDVFVPDDKEEFVKATILSREGGKVTAETEHGKTVTVKEDQVLQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLYNLKERYASWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYNAEVVAAYRGKKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFAVIAAIGDRSKKEQATGKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVIFQLKAERDYHIFYQILSNKKPELLDMLLITNNPYDYAFISQGETTVASIDDAEELMATDNAFDVLGFTTEEKNSMYKLTGAIMHFGNMKFKLKQREEQAEPDGTEEADKSAYLMGLNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQNVQQVVYAKGALAKAVYERMFNWMVTRINATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLQACIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLFDNHLGKSSNFQKPRNIKGKPEAHFSLIHYAGTVDYNIIGWLQKNKDPLNETVVDLYKKSSLKMLSSLFANYAGFDTPIEKGKGKAKKGSSFQTVSALHRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKSPGVIDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFRQRYRILNPAAIPEGQFIDSRKGAEKLLGSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDERLSRIITRIQAQSRGVLSRMEFKKLLERRDSLLIIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEIA

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.24 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	32158

Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6x5z__assembly_1__model_1

6x5z__assembly_1__model_1 | I(q)

6x5z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6x5z__assembly_1__model_1

6x5z__assembly_1__model_1 | I(q)

6x5z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)