SAXSdb — 7bfp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrator complex subunit 9

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–658	未记录	Integrator complex subunit 4 × 1 （Q96HW7） Integrator complex subunit 11 × 1 （Q5TA45） Unknown × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.8；150 mM KCl, 20 mM HEPES-KOH pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7BFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 582–658（77 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 582-658)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 582–658（77 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 582-658)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 582–658（77 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 582-658)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 582–658（77 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 582-658)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
7BFQ Structure of the Integrator cleavage module with extended INTS4 and rigid body docked INTS9/11 CTD 提交 2021-01-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–658（658 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
7CUN The structure of human Integrator-PP2A complex 提交 2020-08-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric	链 i 1–658（658 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 I 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8R22 INTS9-INTS11-BRAT1-WDR73 complex 提交 2023-11-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8R23 INTS9-INTS11-BRAT1 complex 提交 2023-11-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
8R2D Integrator cleavage module assembly intermediate 提交 2023-11-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 i 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8RBZ Structure of Integrator-PP2A-SOSS-CTD post-termination complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 i 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8RC4 Structure of Integrator-PP2A complex 提交 2023-12-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 i 1–658（658 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8UIB Structure of the human INTS9-INTS11-BRAT1 complex 提交 2023-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8YJB Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC complex 提交 2024-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric	链 I 1–658（658 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å

共 14 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INT9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–658； UniProt 1–658

Integrator complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q96HW7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–963	未记录	Integrator complex subunit 9 × 1 （Q9NV88） Integrator complex subunit 11 × 1 （Q5TA45） Unknown × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.8；150 mM KCl, 20 mM HEPES-KOH pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7BFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7BFQ Structure of the Integrator cleavage module with extended INTS4 and rigid body docked INTS9/11 CTD 提交 2021-01-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–963（963 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
7CUN The structure of human Integrator-PP2A complex 提交 2020-08-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric	链 d 1–963（963 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 D 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8R2D Integrator cleavage module assembly intermediate 提交 2023-11-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 d 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8RBZ Structure of Integrator-PP2A-SOSS-CTD post-termination complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 d 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8RC4 Structure of Integrator-PP2A complex 提交 2023-12-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 d 1–963（963 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8YJB Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC complex 提交 2024-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric	链 D 1–963（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INT4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 17–979； UniProt 1–963

Integrator complex subunit 11

Homo sapiens

UniProt Q5TA45

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–600	未记录	Integrator complex subunit 9 × 1 （Q9NV88） Integrator complex subunit 4 × 1 （Q96HW7） Unknown × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.8；150 mM KCl, 20 mM HEPES-KOH pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7BFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 491–600（110 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 491-600)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 491–600（110 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 491-600)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 491–600（110 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 491-600)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
5V8W Crystal structure of human Integrator IntS9-IntS11 CTD complex 提交 2017-03-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 491–600（110 aa）片段：C-terminal domain (UNP residues 491-600)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 21-24% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
7BFQ Structure of the Integrator cleavage module with extended INTS4 and rigid body docked INTS9/11 CTD 提交 2021-01-04	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–600（600 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
7CUN The structure of human Integrator-PP2A complex 提交 2020-08-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric	链 k 1–600（600 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 K 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8R22 INTS9-INTS11-BRAT1-WDR73 complex 提交 2023-11-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8R23 INTS9-INTS11-BRAT1 complex 提交 2023-11-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
8R2D Integrator cleavage module assembly intermediate 提交 2023-11-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 k 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8RBZ Structure of Integrator-PP2A-SOSS-CTD post-termination complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 k 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8RC4 Structure of Integrator-PP2A complex 提交 2023-12-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 k 1–600（600 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8UIB Structure of the human INTS9-INTS11-BRAT1 complex 提交 2023-10-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8YJB Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC complex 提交 2024-03-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric	链 K 1–600（600 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å

共 14 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INT11_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 46–645； UniProt 1–600

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7bfp
沉积日期 deposition_date	2021-01-04
结构标题 title	Structure of the Integrator cleavage module with INTS4/9/11
关键词 keywords	;Nuclease, Integrator, 3'-end processing, NUCLEAR PROTEIN ;; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.49 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.52 Å
零角强度 I(0) i0	316309000.00
分子量 molecular_weight	143240.0 kDa
排除体积 excluded_volume	179240 Å³
包络体积 envelope_volume	242490 Å³
水化壳体积 shell_volume	56328 Å³
包络直径 envelope_diameter	115.9 Å
壳层 Rg shell_rg	42.70 Å
包络 Rg envelope_rg	34.47 Å
形状 Rg shape_rg	34.52 Å
总 Rg total_rg	35.08 Å
总原子数 total_atoms	10071
残基数 n_residues	1358
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	109.0 Å
Rg (实空间) rg_real	35.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.57 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1630e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.8770e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.42 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	316300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9021
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	46.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.144
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.509
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	74750000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.946; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.902

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Integrator complex subunit 9
分子量 formula_weight	73891.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	10071

MKLYCLSGHPTLPCNVLKFKSTTIMLDCGLDMTSTLNFLPLPLVQSPRLSNLPGWSLKDGNAFLDKELKECSGHVFVDSVPEFCLPETELIDLSTVDVILISNYHCMMALPYITEHTGFTGTVYATEPTVQIGRLLMEELVNFIERVPKAQSASLWKNKDIQRLLPSPLKDAVEVSTWRRCYTMQEVNSALSKIQLVGYSQKIELFGAVQVTPLSSGYALGSSNWIIQSHYEKVSYVSGSSLLTTHPQPMDQASLKNSDVLVLTGLTQIPTANPDGMVGEFCSNLALTVRNGGNVLVPCYPSGVIYDLLECLYQYIDSAGLSSVPLYFISPVANSSLEFSQIFAEWLCHNKQSKVYLPEPPFPHAELIQTNKLKHYPSIHGDFSNDFRQPCVVFTGHPSLRFGDVVHFMELWGKSSLNTVIFTEPDFSYLEALAPYQPLAMKCIYCPIDTRLNFIQVSKLLKEVQPLHVVCPEQYTQPPPAQSHRMDLMIDCQPPAMSYRRAEVLALPFKRRYEKIEIMPELADSLVPMEIKPGISLATVSAVLHTKDNKHLLQPPPRPAQPTSGKKRKRVSDDVPDCKVLKPLLSGSIPVEQFVQTLEKHGFSDIKVEDTAKGHIVLLQEAETLIQIEEDSTHIICDNDEMLRVRLRDLVLKFLQKF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Integrator complex subunit 4
分子量 formula_weight	110164.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MHHHHHHHHPPSGADPMAAHLKKRVYEEFTKVVQPQEEIATKKLRLTKPSKSAALHIDLCKATSPADALQYLLQFARKPVEAESVEGVVRILLEHYYKENDPSVRLKIASLLGLLSKTAGFSPDCIMDDAINILQNEKSHQVLAQLLDTLLAIGTKLPENQAIQMRLVDVACKHLTDTSHGVRNKCLQLLGNLGSLEKSVTKDAEGLAARDVQKIIGDYFSDQDPRVRTAAIKAMLQLHERGLKLHQTIYNQACKLLSDDYEQVRSAAVQLIWVVSQLYPESIVPIPSSNEEIRLVDDAFGKICHMVSDGSWVVRVQAAKLLGSMEQVSSHFLEQTLDKKLMSDLRRKRTAHERAKELYSSGEFSSGRKWGDDAPKEEVDTGAVNLIESGACGAFVHGLEDEMYEVRIAAVEALCMLAQSSPSFAEKCLDFLVDMFNDEIEEVRLQSIHTMRKISNNITLREDQLDTVLAVLEDSSRDIREALHELLCCTNVSTKEGIHLALVELLKNLTKYPTDRDSIWKCLKFLGSRHPTLVLPLVPELLSTHPFFDTAEPDMDDPAYIAVLVLIFNAAKTCPTMPALFSDHTFRHYAYLRDSLSHLVPALRLPGRKLVSSAVSPSIIPQEDPSQQFLQQSLERVYSLQHLDPQGAQELLEFTIRDLQRLGELQSELAGVADFSATYLRCQLLLIKALQEKLWNVAAPLYLKQSDLASAAAKQIMEETYKMEFMYSGVENKQVVIIHHMRLQAKALQLIVTARTTRGLDPLFGMCEKFLQEVDFFQRYFIADLPHLQDSFVDKLLDLMPRLMTSKPAEVVKILQTMLRQSAFLHLPLPEQIHKASATIIEPAGESDNPLRFTSGLVVALDVDATLEHVQDPQNTVKVQVLYPDGQAQMIHPKPADFRNPGPGRHRLITQVYLSHTAWTEACQVEVRLLLAYNSSARIPKCPWMEGGEMSPQVETSIEGTIPFSKPVKVYIMPKPARR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Integrator complex subunit 11
分子量 formula_weight	72690.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.27.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MDEKTTGWRGGHVVEGLAGELEQLRARLEHHPQGQREPPPSGADPMPEIRVTPLGAGQDVGRSCILVSIAGKNVMLDCGMHMGFNDDRRFPDFSYITQNGRLTDFLDCVIISHFHLDHCGALPYFSEMVGYDGPIYMTHPTQAICPILLEDYRKIAVDKKGEANFFTSQMIKDCMKKVVAVHLHQTVQVDDELEIKAYYAGHVLGAAMFQIKVGSESVVYTGDYNMTPDRHLGAAWIDKCRPNLLITESTYATTIRDSKRCRERDFLKKVHETVERGGKVLIPVFALGRAQELCILLETFWERMNLKVPIYFSTGLTEKANHYYKLFIPWTNQKIRKTFVQRNMFEFKHIKAFDRAFADNPGPMVVFATPGMLHAGQSLQIFRKWAGNEKNMVIMPGYCVQGTVGHKILSGQRKLEMEGRQVLEVKMQVEYMSFSAHADAKGIMQLVGQAEPESVLLVHGEAKKMEFLKQKIEQELRVNCYMPANGETVTLLTSPSIPVGISLGLLKREMAQGLLPEAKKPRLLHGTLIMKDSNFRLVSSEQALKELGLAEHQLRFTCRVHLHDTRKEQETALRVYSHLKSVLKDHCVQHLPDGSVTVESVLLQAAAPSEDPGTKVLLVSWTYQDEELGSFLTSLLKKGLPQAPS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Unknown
分子量 formula_weight	3081.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7bfpA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10890 —

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.560 Å
最低分辨率 resolution_low	3.560 Å
R 因子 r_factor	0.4150
R_work r_work	0.4150
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.56 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	26358

fit	/app/data/saxs_computation/bf/7bfp/7bfp.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bf/7bfp/7bfp.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bf/7bfp/7bfp.dat

Structure of the Integrator cleavage module with INTS4/9/11

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrator complex subunit 9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Integrator complex subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Integrator complex subunit 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)