SAXSdb — 7bgl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar L-ring protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 78	Flagellar P-ring protein × 26 （P15930） YecR × 26 （A0A745A2I3） (2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid × 26 ;[(3~{R})-1-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-[[(3~{R})-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-(hydroxymethyl)-5-phosphonooxy-4-[(3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxy-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-oxidanyl-4-[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]oxy-2-phosphonooxy-oxan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-tetradecan-3-yl] hexadecanoate ; × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLGH_SALTY
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 B； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 C； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 D； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 E； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 F； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 G； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 H； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 I； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 J； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 K； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 L； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 M； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 N； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 O； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 P； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 Q； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 R； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 S； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 T； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 U； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 V； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 W； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 X； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 Y； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 Z； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232

Flagellar P-ring protein

物种未注明

UniProt P15930

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 78	Flagellar L-ring protein × 26 （P0A1N8） YecR × 26 （A0A745A2I3） (2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid × 26 ;[(3~{R})-1-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-[[(3~{R})-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-(hydroxymethyl)-5-phosphonooxy-4-[(3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxy-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-oxidanyl-4-[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]oxy-2-phosphonooxy-oxan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-tetradecan-3-yl] hexadecanoate ; × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLGI_SALTY
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 b； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 c； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 d； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 e； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 f； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 g； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 h； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 i； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 j； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 k； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 l； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 m； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 n； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 o； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 p； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 q； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 r； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 s； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 t； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 u； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 v； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 w； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 x； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 y； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365 作者链 z； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365

YecR

物种未注明

UniProt A0A745A2I3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 78	Flagellar L-ring protein × 26 （P0A1N8） Flagellar P-ring protein × 26 （P15930） (2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid × 26 ;[(3~{R})-1-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-[[(3~{R})-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-(hydroxymethyl)-5-phosphonooxy-4-[(3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxy-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-oxidanyl-4-[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]oxy-2-phosphonooxy-oxan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-tetradecan-3-yl] hexadecanoate ; × 26	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A745A2I3_SALTI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 10； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 11； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 12； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 13； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 14； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 15； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 16； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 17； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 18； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 19； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 2； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 20； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 21； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 22； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 23； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 24； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 25； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 26； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 3； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 4； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 5； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 6； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 7； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 8； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111 作者链 9； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7bgl
沉积日期 deposition_date	2021-01-07
结构标题 title	Salmonella LP ring 26 mer refined in C26 map
关键词 keywords	bacterial flagellum LP ring salmonella, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7bgl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7bgl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7bgl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	97.01 Å
Rg（电子密度）	95.97 Å
总 Rg	96.04 Å
原子数	126022
残基数	15626
排除体积	2142300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7bgl__assembly_1__model_1`	78-meric （78）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Flagellar L-ring protein
分子量 formula_weight	24726.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z
原子数 atom_count	126022

MQKYALHAYPVMALMVATLTGCAWIPAKPLVQGATTAQPIPGPVPVANGSIFQSAQPINYGYQPLFEDRRPRNIGDTLTIVLQENVSASKSSSANASRDGKTSFGFDTVPRYLQGLFGNSRADMEASGGNSFNGKGGANASNTFSGTLTVTVDQVLANGNLHVVGEKQIAINQGTEFIRFSGVVNPRTISGSNSVPSTQVADARIEYVGNGYINEAQNMGWLQRFFLNLSPM

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Flagellar P-ring protein
分子量 formula_weight	38194.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v,w,x,y,z

MFKALAGIVLALVATLAHAERIRDLTSVQGVRENSLIGYGLVVGLDGTGDQTTQTPFTTQTLNNMLSQLGITVPTGTNMQLKNVAAVMVTASYPPFARQGQTIDVVVSSMGNAKSLRGGTLLMTPLKGVDSQVYALAQGNILVGGAGASAGGSSVQVNQLNGGRITNGAIIERELPTQFGAGNTINLQLNDEDFTMAQQITDAINRARGYGSATALDARTVQVRVPSGNSSQVRFLADIQNMEVNVTPQDAKVVINSRTGSVVMNREVTLDSCAVAQGNLSVTVNRQLNVNQPNTPFGGGQTVVTPQTQIDLRQSGGSLQSVRSSANLNSVVRALNALGATPMDLMSILQSMQSAGCLRAKLEII

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	YecR
分子量 formula_weight	12195.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26

MKSLIFTLSLLALTGCTITRQAQVSEASPISGIVRLTYNQPLFFTSRTDDYVSHGTATRECQQMGYADAVSFGQPVGTCSIYAGSLCLNTRFTLSWQCRGVAVPQIMPLYY

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	(2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid
分子量 formula_weight	222.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	26

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	;[(3~{R})-1-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-[[(3~{R})-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-(hydroxymethyl)-5-phosphonooxy-4-[(3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxy-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-oxidanyl-4-[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]oxy-2-phosphonooxy-oxan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-tetradecan-3-yl] hexadecanoate ;
分子量 formula_weight	2036.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	26

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	31643

Salmonella LP ring 26 mer refined in C26 map

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar L-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Flagellar P-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

YecR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bgl__assembly_1__model_1

7bgl__assembly_1__model_1 | I(q)

7bgl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Salmonella LP ring 26 mer refined in C26 map

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar L-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Flagellar P-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

YecR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bgl__assembly_1__model_1

7bgl__assembly_1__model_1 | I(q)

7bgl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)