SAXSdb — 7ea2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-azacytidine-induced protein 2,RB1-inducible coiled-coil protein 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1490–1594 链 B； UniProt 1490–1594	未记录	P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M phosphate/citrate pH 4.2, 40% PEG300	分辨率 2.14 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7EA2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6DCE X-ray structure of FIP200 claw domain 提交 2018-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1494–1594（101 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.1 M HEPES pH 7.4, 2 M Ammonium sulfate	分辨率 1.56 Å R-free 0.241
6GMA Crystal structure of the FIP200 C-terminal region 提交 2018-05-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1458–1594（137 aa）链 B 1458–1594（137 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1.0 M LiCl, 14% PEG 6000	分辨率 3.20 Å R-free 0.295
6GMA Crystal structure of the FIP200 C-terminal region 提交 2018-05-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1458–1594（137 aa）链 D 1458–1594（137 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1.0 M LiCl, 14% PEG 6000	分辨率 3.20 Å R-free 0.295
6GMA Crystal structure of the FIP200 C-terminal region 提交 2018-05-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1458–1594（137 aa）链 F 1458–1594（137 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 1.0 M LiCl, 14% PEG 6000	分辨率 3.20 Å R-free 0.295
7CZG Crystal structure of FIP200 Claw domain apo form 提交 2020-09-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1490–1594（105 aa）链 C 1490–1594（105 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, Jeffamine ED-2001 pH 7.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.230
7CZG Crystal structure of FIP200 Claw domain apo form 提交 2020-09-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1490–1594（105 aa）链 D 1490–1594（105 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, Jeffamine ED-2001 pH 7.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.230
7CZM Crystal structure of FIP200 Claw/p-OPtineurin LIR complex 提交 2020-09-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1490–1594（105 aa）链 B 1490–1594（105 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Potassium iodide, MES pH 6.5, PEG 4000	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
7D0E Crystal structure of FIP200 Claw/p-CCPG1 FIR2 提交 2020-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1490–1594（105 aa）	未记录	GO9 3-(2-hydroxyethyloxy)-2-[2-(2-hydroxyethyloxy)ethoxymethyl]-2-(2-hydroxyethyloxymethyl)propan-1-ol × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；KCl, Pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH), MES	分辨率 1.40 Å R-free 0.207
7EAA crystal structure of NDP52 SKICH domain in complex with RB1CC1 coiled-coil domain 提交 2021-03-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1286–1395（110 aa）链 D 1286–1395（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M MgCl2, 0.1 M MES pH 6.0, 8% PEG6000	分辨率 2.60 Å R-free 0.253
8SOI Structure of human ULK1 complex core (2:1:1 stoichiometry) 提交 2023-04-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–600（600 aa）链 B 1–600（600 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8SQZ Structure of human ULK1 complex core (2:2:2 stoichiometry) in the PI3KC3-C1 mixture 提交 2023-05-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–640（640 aa）链 B 1–640（640 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8SRM Structure of human ULK1 complex core (2:2:2 stoichiometry) of the ATG13(450-517) mutant 提交 2023-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–640（640 aa）链 B 1–640（640 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.46 Å
8W6B crystal structure of TAX1BP1 SKICH domain in complex with RB1CC1 coiled-coil domain 提交 2023-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1343–1395（53 aa）链 D 1343–1395（53 aa）链 G 1343–1395（53 aa）链 H 1343–1395（53 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；5% (w/v) PEG 4000, 50 mM Magnesium chloride, 100 mM MES at pH 6.5, 10% 2-propanol	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFK Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS123 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.018M magnesium chloride hexahydrate, 0.018M calcium chloride dehydrate, 0.1M imidazole, 0.1M MES, 0.1M monohydrate, 10% v/v MPD, 10% PEG 1000, 10% v/v PEG 3350, pH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8YFL crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122pS123 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% w/v PEG 6000, 0.1M MES, 5% v/v MPD, pH 6.5	分辨率 1.50 Å R-free 0.218
8YFL crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122pS123 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% w/v PEG 6000, 0.1M MES, 5% v/v MPD, pH 6.5	分辨率 1.50 Å R-free 0.218
8YFM Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；25% v/v PEG smear medium, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M ammonium sulfate, pH 5.5	分辨率 1.50 Å R-free 0.209
8YFM Crystal structure of FIP200 claw/TNIP1_FIR_pS122 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；25% v/v PEG smear medium, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M ammonium sulfate, pH 5.5	分辨率 1.50 Å R-free 0.209
8YFN Crystal structure of FIP200 claw in complex with TNIP1_FIR_pS123 peptide with an elongated C terminus 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M imidazole malate, pH 5.5, 42% PEG 600	分辨率 2.30 Å R-free 0.236
8YFN Crystal structure of FIP200 claw in complex with TNIP1_FIR_pS123 peptide with an elongated C terminus 提交 2024-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1490–1594（105 aa）片段：claw domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M imidazole malate, pH 5.5, 42% PEG 600	分辨率 2.30 Å R-free 0.236
9C82 Structure of human ULK1C:PI3KC3-C1 supercomplex 提交 2024-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–640（640 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；added 0.05% (w/v) octylglucopyranoside as surfactant	分辨率 6.84 Å
9D34 FIP200 C-terminal CLAW domain (resid. 1490-1594) in complex with phosphorylated TNIP1 FIP200 interacting peptide 提交 2024-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1490–1594（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Morpheus E4 (12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD, 0.03 M of each ethylene glycol, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5)	分辨率 1.42 Å R-free 0.234
9J54 Crystal structure of FIP200 Claw in complex with ATG16L1 提交 2024-08-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1490–1594（105 aa）链 C 1490–1594（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；10% v/v 2-Propanol, 0.1 M BICINE (pH 8.5), 30% w/v Polyethylene glycol 1500	分辨率 1.61 Å R-free 0.216

共 17 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBCC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 20–124； UniProt 1490–1594 作者链 B； PDB构建体 20–124； UniProt 1490–1594

5-azacytidine-induced protein 2,RB1-inducible coiled-coil protein 1

Homo sapiens

UniProt Q9H6S1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 6–16 链 B； UniProt 6–16	未记录	P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M phosphate/citrate pH 4.2, 40% PEG300	分辨率 2.14 Å R-free 0.232

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7EA2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5EP6 The crystal structure of NAP1 in complex with TBK1 提交 2015-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 215–255（41 aa）片段：UNP RESIDUES 215-255	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；1% w/v Tryptone, 0.05 M HEPES sodium (pH 7.0), 12% w/v PEG 3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.217
5EP6 The crystal structure of NAP1 in complex with TBK1 提交 2015-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 215–255（41 aa）片段：UNP RESIDUES 215-255	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；1% w/v Tryptone, 0.05 M HEPES sodium (pH 7.0), 12% w/v PEG 3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.217
5Z7G Crystal structure of TAX1BP1 SKICH region in complex with NAP1 提交 2018-01-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 33–75（43 aa）链 D 33–75（43 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；PEG 8000, 0.1 M HEPES	分辨率 2.30 Å R-free 0.233
5Z7L Crystal structure of NDP52 SKICH region in complex with NAP1 提交 2018-01-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 33–75（43 aa）片段：UNP residues 33-75 链 D 33–75（43 aa）片段：UNP residues 33-75	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG3350,sodium malonate	分辨率 2.02 Å R-free 0.222

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AZI2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–15； UniProt 6–16 作者链 B； PDB构建体 5–15； UniProt 6–16

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ea2
沉积日期 deposition_date	2021-03-06
结构标题 title	crystal structure of NAP1 FIR in complex with RB1CC1 Claw domain
关键词 keywords	FIR, complex, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.02 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.82 Å
零角强度 I(0) i0	11189500.00
分子量 molecular_weight	25850.0 kDa
排除体积 excluded_volume	32791 Å³
包络体积 envelope_volume	39398 Å³
水化壳体积 shell_volume	17477 Å³
包络直径 envelope_diameter	72.8 Å
壳层 Rg shell_rg	25.35 Å
包络 Rg envelope_rg	19.90 Å
形状 Rg shape_rg	19.77 Å
总 Rg total_rg	20.85 Å
总原子数 total_atoms	1823
残基数 n_residues	218
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	70.0 Å
Rg (实空间) rg_real	21.06 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1190e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5320e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.05 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	11190000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8029
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	22.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.377
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.405
角度范围 angular_range	— – 0.3800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3019000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.834; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.935; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	5-azacytidine-induced protein 2,RB1-inducible coiled-coil protein 1
分子量 formula_weight	13939.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A
原子数 atom_count	1905

GPGSEDDICILNHEKGSGSSRHSEKIAIRDFQVGDLVLIILDERHDNYVLFTVSPTLYFLHSESLPALDLKPGEGASGASRRPWVLGKVMEKEYCQAKKAQNRFKVPLGTKFYRVKAVSWNKKV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	HEXAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	282.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CITRATE ANION
分子量 formula_weight	189.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	66

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	67.620 Å
晶胞边长 b length_b	67.620 Å
晶胞边长 c length_c	247.370 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	hexagonal

分辨率 resolution	2.140 Å
最低分辨率 resolution_low	58.560 Å
R 因子 r_factor	0.2026
R_work r_work	0.2009
R_free r_free	0.2323

fit	/app/data/saxs_computation/ea/7ea2/7ea2.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ea/7ea2/7ea2.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ea/7ea2/7ea2.dat

crystal structure of NAP1 FIR in complex with RB1CC1 Claw domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

5-azacytidine-induced protein 2,RB1-inducible coiled-coil protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

5-azacytidine-induced protein 2,RB1-inducible coiled-coil protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)