SAXSdb — 7k48

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

Arcobacter butzleri (strain RM4018)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Mu-theraphotoxin-Hs2a × 4 （P83303）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A8EVM5_ARCB4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 370–386； UniProt 1–17 作者链 A； PDB构建体 428–451； UniProt 60–83 作者链 A； PDB构建体 478–611； UniProt 106–239 作者链 B； PDB构建体 370–386； UniProt 1–17 作者链 B； PDB构建体 428–451； UniProt 60–83 作者链 B； PDB构建体 478–611； UniProt 106–239 作者链 C； PDB构建体 370–386； UniProt 1–17 作者链 C； PDB构建体 428–451； UniProt 60–83 作者链 C； PDB构建体 478–611； UniProt 106–239 作者链 D； PDB构建体 370–386； UniProt 1–17 作者链 D； PDB构建体 428–451； UniProt 60–83 作者链 D； PDB构建体 478–611； UniProt 106–239

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

Arcobacter butzleri (strain RM4018)

UniProt P0AEX9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Mu-theraphotoxin-Hs2a × 4 （P83303）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–367； UniProt 27–392 作者链 B； PDB构建体 2–367； UniProt 27–392 作者链 C； PDB构建体 2–367； UniProt 27–392 作者链 D； PDB构建体 2–367； UniProt 27–392

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

Arcobacter butzleri (strain RM4018)

UniProt Q15858

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Mu-theraphotoxin-Hs2a × 4 （P83303）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SCN9A_HUMAN
Isoform	Q15858-3
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 387–427； UniProt 739–779 作者链 A； PDB构建体 452–477； UniProt 805–830 作者链 B； PDB构建体 387–427； UniProt 739–779 作者链 B； PDB构建体 452–477； UniProt 805–830 作者链 C； PDB构建体 387–427； UniProt 739–779 作者链 C； PDB构建体 452–477； UniProt 805–830 作者链 D； PDB构建体 387–427； UniProt 739–779 作者链 D； PDB构建体 452–477； UniProt 805–830

Mu-theraphotoxin-Hs2a

物种未注明

UniProt P83303

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera × 4 （A8EVM5,P0AEX9,Q15858）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TXH4_HAPSC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–35； UniProt 53–87 作者链 F； PDB构建体 1–35； UniProt 53–87 作者链 G； PDB构建体 1–35； UniProt 53–87 作者链 H； PDB构建体 1–35； UniProt 53–87

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7k48
沉积日期 deposition_date	2020-09-15
结构标题 title	Structure of NavAb/Nav1.7-VS2A chimera trapped in the resting state by tarantula toxin m3-Huwentoxin-IV
关键词 keywords	Ion channel, Voltage-gated sodium channel, Gating-modifier toxin, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7k48__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7k48__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7k48__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.76 Å
Rg（电子密度）	35.60 Å
总 Rg	36.30 Å
原子数	8480
残基数	1048
排除体积	156460 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7k48__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera
分子量 formula_weight	68519.1 kDa
突变 mutation	R398A,L506A,M513V
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	8480

MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAMYLAITNIVESSFFTKFITICIVLNTLFMAMEHHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEIILRIYVHRISFFKDPWSLFDFFVVTLSLVELFLADVEGLSVLRSFRLLRLFRAVTAVPQMRKIVSALISVIPGMLSVIALMTLFFYIFAIMATQLFGERFPEWFGTLGESFYTLFQVMTLESWSMGIVRPLMEVYPYAWVFFIPFIFVVTFVMINLVVAIIVDAMAILNQKEEQHIIDEVQSH

来源 Source

来源生物 organism	Arcobacter butzleri (strain RM4018)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	367737
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mu-theraphotoxin-Hs2a
分子量 formula_weight	3999.8 kDa
突变 mutation	E1G, E4G, Y33W
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

GCLGIFKACNPSNDQCCKSSKLVCSRKTRWCKWQI

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	501310

Structure of NavAb/Nav1.7-VS2A chimera trapped in the resting state by tarantula toxin m3-Huwentoxin-IV

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Mu-theraphotoxin-Hs2a

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7k48__assembly_1__model_1

7k48__assembly_1__model_1 | I(q)

7k48__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of NavAb/Nav1.7-VS2A chimera trapped in the resting state by tarantula toxin m3-Huwentoxin-IV

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Ion transport protein,Sodium channel protein type 9 subunit alpha chimera

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mu-theraphotoxin-Hs2a

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7k48__assembly_1__model_1

7k48__assembly_1__model_1 | I(q)

7k48__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)