7p5y

Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb3

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 201.3 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 15–808 链 B； UniProt 15–808 链 C； UniProt 15–808 链 D； UniProt 15–808 链 E； UniProt 15–808 链 F； UniProt 15–808	未记录	synthetic nanobody Sb3 × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7P5Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6FNW Structure of a volume-regulated anion channel of the LRRC8 family 提交 2018-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 398–810（413 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；22% PEG 3350, 0.2M Na/K tartrate, 0.1M Bis-Tris propane pH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.208
6G8Z Structure of the pore domain of homomeric mLRRC8A volume-regulated anion channel at 3.66 A resolution 提交 2018-04-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
6G9L Structure of homomeric mLRRC8A volume-regulated anion channel at 5.01 A resolution 提交 2018-04-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.01 Å
6G9O Structure of full-length homomeric mLRRC8A volume-regulated anion channel at 4.25 A resolution 提交 2018-04-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
6NZW LRRC8A-DCPIB in MSP1E3D1 nanodisc constricted state 提交 2019-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 18 L9Y 4-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}butanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 microliter drop size, 3 second blot time	分辨率 3.21 Å
6NZZ LRRC8A-DCPIB in MSP1E3D1 nanodisc expanded state 提交 2019-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 18 L9Y 4-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}butanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 microliter drop size, 3 second blot time	分辨率 3.32 Å
6O00 apo-LRRC8A in MSP2N2 nanodisc constricted state 提交 2019-02-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 microliter drop size, 3 second blot time	分辨率 4.18 Å
7M17 SN-407-LRRC8A in MSP1E3D1 lipid nanodiscs (Pose-1) 提交 2021-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18 YNJ 7-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}heptanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH to 7.4 with KOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2 microliter drop size, manual wait time of 2 seconds, blot force of 1, 3 second blot time	分辨率 3.65 Å
7M19 SN-407-LRRC8A in MSP1E3D1 lipid nanodiscs (Pose-2) 提交 2021-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18 YNJ 7-{[(2S)-2-butyl-6,7-dichloro-2-cyclopentyl-1-oxo-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy}heptanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH to 7.4 with KOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2 microliter drop size, manual wait time of 2 seconds, blot force of 1, 3 second blot time	分辨率 3.69 Å
7P5V Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb1 提交 2021-07-15	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 15–808（794 aa）链 B 15–808（794 aa）链 C 15–808（794 aa）链 D 15–808（794 aa）链 E 15–808（794 aa）链 F 15–808（794 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.06 Å
7P5W Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb2 提交 2021-07-15	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 15–808（794 aa）链 B 15–808（794 aa）链 C 15–808（794 aa）链 D 15–808（794 aa）链 E 15–808（794 aa）链 F 15–808（794 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7P60 Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb4 at 1:0.5 ratio 提交 2021-07-15	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7P6K Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb5 提交 2021-07-16	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–810（810 aa）链 B 1–810（810 aa）链 C 1–810（810 aa）链 D 1–810（810 aa）链 E 1–810（810 aa）链 F 1–810（810 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
8B41 Structure of heteromeric LRRC8A/C (1:1 co-transfected) Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb1 提交 2022-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–810（809 aa）链 B 2–810（809 aa）链 C 2–810（809 aa）链 D 2–810（809 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
8B42 Structure of heteromeric LRRC8A/C Volume-Regulated Anion Channel. 提交 2022-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–810（809 aa）链 B 2–810（809 aa）链 C 2–810（809 aa）链 D 2–810（809 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.60 Å
8DR8 LRRC8A:C conformation 2 (oblong) top mask 提交 2022-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–71（71 aa）链 D 91–810（720 aa）链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8DRA LRRC8A:C conformation 2 (oblong) LRR mask 提交 2022-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å
8DRE LRRC8A:C conformation 2 (oblong) 提交 2022-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–71（71 aa）链 D 91–810（720 aa）链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
8DRK LRRC8A:C conformation 1 (round) top focus 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–71（71 aa）链 D 91–810（720 aa）链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 21	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8DRN LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 1 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
8DRO LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 2 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.06 Å
8DRQ LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 3 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8DS3 LRRC8A:C conformation 1 (round) 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–71（71 aa）链 D 91–810（720 aa）链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 21	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8DS9 LRRC8A:C in MSPE3D1 nanodisc top focus 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–71（71 aa）链 D 91–810（720 aa）链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
8DSA LRRC8A:C in MSP1E3D1 nanodisc 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–71（71 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–71（71 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–71（71 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–71（71 aa）链 D 91–810（720 aa）链 E 1–71（71 aa）链 E 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
8F74 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa）链 A 92–810（719 aa）链 B 1–76（76 aa）链 B 92–810（719 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 92–810（719 aa）链 D 1–76（76 aa）链 D 92–810（719 aa）链 E 1–76（76 aa）链 E 92–810（719 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8F75 LRRC8A(T48D):C conformation 2 LRR focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 91–810（720 aa）链 B 91–810（720 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8F77 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa）链 A 90–810（721 aa）链 B 1–76（76 aa）链 B 90–810（721 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 90–810（721 aa）链 D 1–76（76 aa）链 D 90–810（721 aa）链 E 1–76（76 aa）链 E 90–810（721 aa）	突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
8F79 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa）链 A 90–810（721 aa）链 B 1–76（76 aa）链 B 90–810（721 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 90–810（721 aa）链 D 1–76（76 aa）链 D 90–810（721 aa）链 E 1–76（76 aa）链 E 90–810（721 aa）	突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 17	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
8F7B LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa）链 A 90–810（721 aa）链 B 1–76（76 aa）链 B 90–810（721 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 90–810（721 aa）链 D 1–76（76 aa）链 D 90–810（721 aa）链 E 1–76（76 aa）链 E 90–810（721 aa）	突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 17	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
8F7D LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）链 A 90–810（721 aa）	突变：T48D 突变：T48D	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8F7E LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）链 B 90–810（721 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 90–810（721 aa）	突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8F7J LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–76（76 aa）链 E 90–810（721 aa）	突变：T48D 突变：T48D	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.32 Å
9DX7 LRRC8A:D Conformation 1 提交 2024-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–76（76 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–76（76 aa）链 D 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DXA LRRC8A:D Conformation 2 提交 2024-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa）链 A 91–810（720 aa）链 B 1–76（76 aa）链 B 91–810（720 aa）链 C 1–76（76 aa）链 C 91–810（720 aa）链 D 1–76（76 aa）链 D 91–810（720 aa）	未记录	PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 18	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 35 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LRC8A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 15–808； UniProt 15–808 作者链 B； PDB构建体 15–808； UniProt 15–808 作者链 C； PDB构建体 15–808； UniProt 15–808 作者链 D； PDB构建体 15–808； UniProt 15–808 作者链 E； PDB构建体 15–808； UniProt 15–808 作者链 F； PDB构建体 15–808； UniProt 15–808

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7p5y
沉积日期 deposition_date	2021-07-15
结构标题 title	Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb3
关键词 keywords	LRRC8 family, Volume-Regulated Anion Channel, leucine-rich repeat, sybody, cryo-EM, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	64.43 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	63.41 Å
零角强度 I(0) i0	4290930000.00
分子量 molecular_weight	582730.0 kDa
排除体积 excluded_volume	741670 Å³
包络体积 envelope_volume	1156100 Å³
水化壳体积 shell_volume	151700 Å³
包络直径 envelope_diameter	191.5 Å
壳层 Rg shell_rg	67.00 Å
包络 Rg envelope_rg	59.98 Å
形状 Rg shape_rg	63.37 Å
总 Rg total_rg	63.63 Å
总原子数 total_atoms	41106
残基数 n_residues	5028
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	201.3 Å
Rg (实空间) rg_real	63.96 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.48 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.2910e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.0440e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	64.80 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4297000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8661
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	83.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.040
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.633
角度范围 angular_range	— – 0.1200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	257500000.0000
实空间数据点数 n_real_points	25
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.939; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.949; Smooth: 0.489

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A
分子量 formula_weight	94239.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	41106

MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMICLPCKWVTKDSCNDSFRGWAASSPEPTYPNSTVLPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLHWFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVEESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQAKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFALIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDIESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREESSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQRLTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHTAAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDGLRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMVNLTELELIRCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIGNLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAVTANRIEALPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFSTLPPEVKERLWRADKEQA

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	synthetic nanobody Sb3
分子量 formula_weight	16451.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J,K,L

GSSSQVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFPVMNAGMYWYRQAPGKEREWVAAIESEGTSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNVKDVGDNHFPYDYWGQGTQVTVSAGRAGEQKLISEEDLNSAVDHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli MC1061

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	7p5yG01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7p5yH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7p5yI01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7p5yJ01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7p5yK01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	7p5yL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.29 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	73350

fit	/app/data/saxs_computation/p5/7p5y/7p5y.fit
pddf	/app/data/pr_computation/p5/7p5y/7p5y.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/p5/7p5y/7p5y.dat

Structure of homomeric LRRC8A Volume-Regulated Anion Channel in complex with synthetic nanobody Sb3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)