SAXSdb — 7pbx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

60 kDa chaperonin

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	10 kDa chaperonin × 7 （P0A6F9） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CH60_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 Ac； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Ad； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Ai； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Aj； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Ao； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Ap； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Au； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Av； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Ba； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Bb； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Bg； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Bh； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Bm； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525 作者链 Bn； PDB构建体 1–524； UniProt 2–525

10 kDa chaperonin

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P0A6F9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	60 kDa chaperonin × 14 （P0A6F5） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MAGNESIUM ION × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CH10_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Af； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97 作者链 Al； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97 作者链 Ar； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97 作者链 Ax； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97 作者链 Bd； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97 作者链 Bj； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97 作者链 Bp； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7pbx
沉积日期 deposition_date	2021-08-02
结构标题 title	Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("tight" conformation).
关键词 keywords	cryo-EM, chaperonin, GroEL, GroEL-GroES, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7pbx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7pbx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7pbx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	69.10 Å
Rg（电子密度）	68.89 Å
总 Rg	68.92 Å
原子数	59472
残基数	8015
排除体积	1063900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7pbx__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	60 kDa chaperonin
分子量 formula_weight	55220.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ac,Ad,Ai,Aj,Ao,Ap,Au,Av,Ba,Bb,Bg,Bh,Bm,Bn
原子数 atom_count	59472

AAKDVKFGNDARVKMLRGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPTITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKANDAAGDGTTTATVLAQAIITEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAAVEELKALSVPCSDSKAIAQVGTISANSDETVGKLIAEAMDKVGKEGVITVEDGTGLQDELDVVEGMQFDRGYLSPYFINKPETGAVELESPFILLADKKISNIREMLPVLEAVAKAGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIATLTGGTVISEEIGMELEKATLEDLGQAKRVVINKDTTTIIDGVGEEAAIQGRVAQIRQQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGVVAGGGVALIRVASKLADLRGQNEDQNVGIKVALRAMEAPLRQIVLNCGEEPSVVANTVKGGDGNYGYNAATEEYGNMIDMGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLP

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	10 kDa chaperonin
分子量 formula_weight	10400.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Af,Al,Ar,Ax,Bd,Bj,Bp

MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLTGSAAAKSTRGEVLAVGNGRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.43 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	41000

Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("tight" conformation).

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

60 kDa chaperonin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

10 kDa chaperonin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7pbx__assembly_1__model_1

7pbx__assembly_1__model_1 | I(q)

7pbx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("tight" conformation).

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

60 kDa chaperonin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

10 kDa chaperonin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7pbx__assembly_1__model_1

7pbx__assembly_1__model_1 | I(q)

7pbx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)