7q96

Keap1 compound complex

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 85.0 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Kelch-like ECH-associated protein 1

Homo sapiens

UniProt Q14145

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 321–609 未记录 9P0 4-[(5S,8R)-5-(dimethylcarbamoyl)-8-[[(2S)-1-ethanoylpyrrolidin-2-yl]carbonylamino]-7,11-bis(oxidanylidene)-10-oxa-3-thia-6-azabicyclo[10.4.0]hexadeca-1(16),12,14-trien-16-yl]benzoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals were grown at 20 C in sitting drops using 200 nL of protein (11-13 mg/mL) and 200 nL of well solution (3.7-4.1 M ammonium acetate, 0.09 M sodium acetate pH 4.6 and 10 mM cadmium chloride). 分辨率 2.42 Å R-free 0.217
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 321–609 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Crystals were grown at 20 C in sitting drops using 200 nL of protein (11-13 mg/mL) and 200 nL of well solution (3.7-4.1 M ammonium acetate, 0.09 M sodium acetate pH 4.6 and 10 mM cadmium chloride). 分辨率 2.42 Å R-free 0.217

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 119 个其他 PDB 条目、193 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KEAP1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 7–295; UniProt 321–609 作者链 B; PDB构建体 7–295; UniProt 321–609

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7q96

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7q96
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7q96
沉积日期 deposition_date2021-11-12
结构标题 titleKeap1 compound complex
关键词 keywordsmacrocycle complex, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier26.95
回转半径 Rg (电子) rg_electron26.42
零角强度 I(0) i072011500.00
分子量 molecular_weight62858.0 kDa
排除体积 excluded_volume77181 ų
包络体积 envelope_volume91738 ų
水化壳体积 shell_volume29167 ų
包络直径 envelope_diameter86.9
壳层 Rg shell_rg33.39
包络 Rg envelope_rg26.57
形状 Rg shape_rg26.40
总 Rg total_rg27.19
总原子数 total_atoms4416
残基数 n_residues570
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax85.0
Rg (实空间) rg_real26.99
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.43
I(0) (实空间) i0_real7.2010e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.9950e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal26.98
I(0) (倒空间) i0_reciprocal72010000.0000
解质量估计 total_estimate0.8893
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary28.8
偏度 Skewness skewness0.377
峰度 Kurtosis kurtosis-0.486
角度范围 angular_range— – 0.2950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha16320000.0000
实空间数据点数 n_real_points60
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.896; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.975; Smooth: 0.892

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)