SAXSdb — 7rzq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	;Spike protein S2' ; × 3 （P0DTC2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2J981_NOSP7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 11–184； UniProt 5–178 作者链 B； PDB构建体 11–184； UniProt 5–178 作者链 C； PDB构建体 11–184； UniProt 5–178

;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

UniProt P0DTC2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPIKE_SARS2
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 186–257； UniProt 917–988 作者链 B； PDB构建体 186–257； UniProt 917–988 作者链 C； PDB构建体 186–257； UniProt 917–988 作者链 D； PDB构建体 2–41； UniProt 1162–1201 作者链 E； PDB构建体 2–41； UniProt 1162–1201 作者链 F； PDB构建体 2–41； UniProt 1162–1201

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7rzq
沉积日期 deposition_date	2021-08-27
结构标题 title	Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex
关键词 keywords	spike, HR1HR2, fusion, scaffold, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7rzq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7rzq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7rzq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.99 Å
Rg（电子密度）	29.65 Å
总 Rg	29.74 Å
原子数	2421
残基数	322
排除体积	43077 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7rzq__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;
分子量 formula_weight	28759.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	2421

MSHHHHHHGSQTLLRNFGNVYDNPVLLDRSVTAPVTEGFNVVLASFQALYLQYQKHHFVVEGSEFYSLHEFFNESYNQVQDHIHEIGERLDGLGGVPVATFSKLAELTCFEQESEGVYSSRQMVENDLAAEQAIIGVIRRQAAQAESLGDRGTRYLYEKILLKTEERAYHLSHFLAKDSLTLGFAYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVE

来源 Source

来源生物 organism	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
通用名 common_name	2019-nCoV, SARS-CoV-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2697049
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;Spike protein S2' ;
分子量 formula_weight	4422.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

GPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQ

来源 Source

来源生物 organism	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
通用名 common_name	2019-nCoV, SARS-CoV-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2697049
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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分辨率 resolution	2.09 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	732037

Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rzq__assembly_1__model_1

7rzq__assembly_1__model_1 | I(q)

7rzq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;SARS-CoV-2 HR1 linked to a scaffold,Spike protein S2' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rzq__assembly_1__model_1

7rzq__assembly_1__model_1 | I(q)

7rzq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)