7s3z

Structure of rat neuronal nitric oxide synthase heme domain in complex with N2-((3-((2-aminoquinolin-7-yl)methoxy)phenoxy)methyl)pyridine-2,6-diamine

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 94.1 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nitric oxide synthase, brain

Rattus norvegicus

UniProt P29476

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 297–718 链 B; UniProt 297–718 未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 H4B 5,6,7,8-TETRAHYDROBIOPTERIN × 2 V0P 7-{[3-(2-{[(6-aminopyridin-2-yl)methyl]amino}ethoxy)phenoxy]methyl}quinolin-2-amine × 2 ACT ACETATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;pH 5.8;277 K;20-24% PEG3350, 0.1M MES 0.14-0.20M AMMONIUM ACETATE, 10% ETHYLENE GLYCOL, 30uM SDS, 5 mM GSH 分辨率 1.73 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 348 个其他 PDB 条目、351 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NOS1_RAT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–422; UniProt 297–718 作者链 B; PDB构建体 1–422; UniProt 297–718

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7s3z

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7s3z
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7s3z
沉积日期 deposition_date2021-09-08
结构标题 titleStructure of rat neuronal nitric oxide synthase heme domain in complex with N2-((3-((2-aminoquinolin-7-yl)methoxy)phenoxy)methyl)pyridine-2,6-diamine
关键词 keywordsnitric oxide synthase inhibitor, heme enzyme, OXIDOREDUCTASE, OXIDOREDUCTASE-Inhibitor complex; OXIDOREDUCTASE/Inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier30.10
回转半径 Rg (电子) rg_electron29.37
零角强度 I(0) i0148635000.00
分子量 molecular_weight97665.0 kDa
排除体积 excluded_volume122300 ų
包络体积 envelope_volume148270 ų
水化壳体积 shell_volume41328 ų
包络直径 envelope_diameter97.0
壳层 Rg shell_rg37.55
包络 Rg envelope_rg29.54
形状 Rg shape_rg29.38
总 Rg total_rg30.05
总原子数 total_atoms6881
残基数 n_residues822
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax94.1
Rg (实空间) rg_real30.04
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.51
I(0) (实空间) i0_real1.4860e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.1360e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal30.07
I(0) (倒空间) i0_reciprocal148600000.0000
解质量估计 total_estimate0.9001
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary33.7
偏度 Skewness skewness0.291
峰度 Kurtosis kurtosis-0.501
角度范围 angular_range— – 0.2650 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha45560000.0000
实空间数据点数 n_real_points54
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.924; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.926

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)