7s78

Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hexon protein

物种未注明

UniProt P04133

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1860 Penton protein × 60 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 (P12537) Hexon-interlacing protein × 240 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 120 (P24936) Pre-protein VI × 540 (P24937) Unknown-1 × 60 Unknown-2 × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 155 Penton protein × 5 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 (P12537) Hexon-interlacing protein × 20 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 10 (P24936) Pre-protein VI × 45 (P24937) Unknown-1 × 5 Unknown-2 × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 186 Penton protein × 6 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 (P12537) Hexon-interlacing protein × 24 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 12 (P24936) Pre-protein VI × 54 (P24937) Unknown-1 × 6 Unknown-2 × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CAPSH_ADE05
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 B; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 C; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 D; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 E; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 F; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 G; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 H; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 I; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 J; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 K; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952 作者链 L; PDB构建体 1–952; UniProt 1–952

Penton protein

物种未注明

UniProt P12538

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1860 Hexon protein × 720 (P04133) Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 (P12537) Hexon-interlacing protein × 240 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 120 (P24936) Pre-protein VI × 540 (P24937) Unknown-1 × 60 Unknown-2 × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 155 Hexon protein × 60 (P04133) Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 (P12537) Hexon-interlacing protein × 20 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 10 (P24936) Pre-protein VI × 45 (P24937) Unknown-1 × 5 Unknown-2 × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 186 Hexon protein × 72 (P04133) Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 (P12537) Hexon-interlacing protein × 24 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 12 (P24936) Pre-protein VI × 54 (P24937) Unknown-1 × 6 Unknown-2 × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CAPSP_ADE05
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–571; UniProt 1–571

Pre-hexon-linking protein IIIa

物种未注明

UniProt P12537

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1860 Hexon protein × 720 (P04133) Penton protein × 60 (P12538) Hexon-interlacing protein × 240 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 120 (P24936) Pre-protein VI × 540 (P24937) Unknown-1 × 60 Unknown-2 × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 155 Hexon protein × 60 (P04133) Penton protein × 5 (P12538) Hexon-interlacing protein × 20 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 10 (P24936) Pre-protein VI × 45 (P24937) Unknown-1 × 5 Unknown-2 × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 186 Hexon protein × 72 (P04133) Penton protein × 6 (P12538) Hexon-interlacing protein × 24 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 12 (P24936) Pre-protein VI × 54 (P24937) Unknown-1 × 6 Unknown-2 × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CAP3_ADE05
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–585; UniProt 1–585

Hexon-interlacing protein

物种未注明

UniProt P03281

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1860 Hexon protein × 720 (P04133) Penton protein × 60 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 (P12537) Pre-hexon-linking protein VIII × 120 (P24936) Pre-protein VI × 540 (P24937) Unknown-1 × 60 Unknown-2 × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 155 Hexon protein × 60 (P04133) Penton protein × 5 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 (P12537) Pre-hexon-linking protein VIII × 10 (P24936) Pre-protein VI × 45 (P24937) Unknown-1 × 5 Unknown-2 × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 186 Hexon protein × 72 (P04133) Penton protein × 6 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 (P12537) Pre-hexon-linking protein VIII × 12 (P24936) Pre-protein VI × 54 (P24937) Unknown-1 × 6 Unknown-2 × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CAP9_ADE05
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–140; UniProt 1–140 作者链 Q; PDB构建体 1–140; UniProt 1–140 作者链 R; PDB构建体 1–140; UniProt 1–140 作者链 S; PDB构建体 1–140; UniProt 1–140

Pre-hexon-linking protein VIII

物种未注明

UniProt P24936

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1860 Hexon protein × 720 (P04133) Penton protein × 60 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 (P12537) Hexon-interlacing protein × 240 (P03281) Pre-protein VI × 540 (P24937) Unknown-1 × 60 Unknown-2 × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 155 Hexon protein × 60 (P04133) Penton protein × 5 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 (P12537) Hexon-interlacing protein × 20 (P03281) Pre-protein VI × 45 (P24937) Unknown-1 × 5 Unknown-2 × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 186 Hexon protein × 72 (P04133) Penton protein × 6 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 (P12537) Hexon-interlacing protein × 24 (P03281) Pre-protein VI × 54 (P24937) Unknown-1 × 6 Unknown-2 × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-protein VI × 9 (P24937) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAP8_ADE05
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–227; UniProt 1–227 作者链 V; PDB构建体 1–227; UniProt 1–227

Pre-protein VI

物种未注明

UniProt P24937

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 1860 Hexon protein × 720 (P04133) Penton protein × 60 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 (P12537) Hexon-interlacing protein × 240 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 120 (P24936) Unknown-1 × 60 Unknown-2 × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 155 Hexon protein × 60 (P04133) Penton protein × 5 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 5 (P12537) Hexon-interlacing protein × 20 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 10 (P24936) Unknown-1 × 5 Unknown-2 × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 186 Hexon protein × 72 (P04133) Penton protein × 6 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 6 (P12537) Hexon-interlacing protein × 24 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 12 (P24936) Unknown-1 × 6 Unknown-2 × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 31 Hexon protein × 12 (P04133) Penton protein × 1 (P12538) Pre-hexon-linking protein IIIa × 1 (P12537) Hexon-interlacing protein × 4 (P03281) Pre-hexon-linking protein VIII × 2 (P24936) Unknown-1 × 1 Unknown-2 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAP6_ADE05
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 1; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 2; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 3; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 4; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 W; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 X; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 Y; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 Z; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7s78
沉积日期 deposition_date2021-09-15
结构标题 titleStructure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation
关键词 keywordsAdenovirus, ts1 mutant, minor protein precursors, virus maturation, VIRUS; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7s78__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7s78__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 1012 1013 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7s78__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)384.40 Å
总 Rg384.50 Å
原子数6282840
残基数790920
排除体积110900000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7s78__assembly_1__model_1 1860-meric (1860) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7s78__assembly_2__model_1 31-meric (31) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 7s78__assembly_3__model_1 155-meric (155) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 7s78__assembly_4__model_1 186-meric (186) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 7s78__assembly_5__model_1 31-meric (31) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 引用文献 (1)