7uhy

Human GATOR2 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GATOR complex protein MIOS

Homo sapiens

UniProt Q9NXC5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 GATOR complex protein WDR24 × 2 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 2 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 6 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 2 (P55735) Unknown × 2 Unknown × 2 ZINC ION × 32 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MIO_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 20–894; UniProt 1–875 作者链 B; PDB构建体 20–894; UniProt 1–875

GATOR complex protein WDR24

Homo sapiens

UniProt Q96S15

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 GATOR complex protein MIOS × 4 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR59 × 2 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 6 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 2 (P55735) Unknown × 2 Unknown × 2 ZINC ION × 32 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WDR24_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–790; UniProt 1–790

GATOR complex protein WDR59

Homo sapiens

UniProt Q6PJI9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 GATOR complex protein MIOS × 4 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 2 (Q96S15) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 6 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 2 (P55735) Unknown × 2 Unknown × 2 ZINC ION × 32 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WDR59_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–974; UniProt 1–974

Isoform B of Nucleoporin SEH1

Homo sapiens

UniProt Q96EE3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 GATOR complex protein MIOS × 4 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 2 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 2 (Q6PJI9) Protein SEC13 homolog × 2 (P55735) Unknown × 2 Unknown × 2 ZINC ION × 32 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Protein SEC13 homolog × 1 (P55735) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SEH1_HUMAN
Isoform Q96EE3-1
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–421; UniProt 1–421 作者链 F; PDB构建体 1–421; UniProt 1–421 作者链 G; PDB构建体 1–421; UniProt 1–421

Protein SEC13 homolog

Homo sapiens

UniProt P55735

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 20 GATOR complex protein MIOS × 4 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 2 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 2 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 6 (Q96EE3) Unknown × 2 Unknown × 2 ZINC ION × 32 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 GATOR complex protein MIOS × 2 (Q9NXC5) GATOR complex protein WDR24 × 1 (Q96S15) GATOR complex protein WDR59 × 1 (Q6PJI9) Isoform B of Nucleoporin SEH1 × 3 (Q96EE3) Unknown × 1 Unknown × 1 ZINC ION × 16 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SEC13_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–322; UniProt 1–322

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7uhy
沉积日期 deposition_date2022-03-27
结构标题 titleHuman GATOR2 complex
关键词 keywordsmTOR, GATOR, lysosome, nutrient sensing, complex, zinc finger, ZnF, RING, C2 symmetry, octagon, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7uhy__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7uhy__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7uhy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)92.36 Å
Rg(电子密度)92.27 Å
总 Rg92.48 Å
原子数51810
残基数7314
排除体积903800 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7uhy__assembly_1__model_1 eicosameric (20) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7uhy__assembly_2__model_1 decameric (10) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 7uhy__assembly_3__model_1 decameric (10) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id7uhyA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id7uhyB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
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7. 引用文献 (1)