7utl

ALTERNATIVE MODELING OF TROPOMYOSIN IN HUMAN CARDIAC THIN FILAMENT IN THE CALCIUM FREE STATE

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Tropomyosin alpha-1 chain × 8 （P09493） Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle × 4 （P45379） Troponin I, cardiac muscle × 2 （P19429） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 2 （P63316） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 18 MAGNESIUM ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 B； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 D； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 F； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 G； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 H； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 I； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 J； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 K； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 L； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 M； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 N； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 O； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 P； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 Q； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 R； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Tropomyosin alpha-1 chain

Homo sapiens

UniProt P09493

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Actin, alpha skeletal muscle × 18 （P68135） Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle × 4 （P45379） Troponin I, cardiac muscle × 2 （P19429） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 2 （P63316） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 18 MAGNESIUM ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPM1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 Z； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 a； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 b； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 g； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 h； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 i； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 j； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284

Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle

Homo sapiens

UniProt P45379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Actin, alpha skeletal muscle × 18 （P68135） Tropomyosin alpha-1 chain × 8 （P09493） Troponin I, cardiac muscle × 2 （P19429） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 2 （P63316） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 18 MAGNESIUM ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNT2_HUMAN
Isoform	P45379-6
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 Y； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 e； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 f； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288

Troponin I, cardiac muscle

Homo sapiens

UniProt P19429

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Actin, alpha skeletal muscle × 18 （P68135） Tropomyosin alpha-1 chain × 8 （P09493） Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle × 4 （P45379） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 2 （P63316） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 18 MAGNESIUM ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNI3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210 作者链 c； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles

Homo sapiens

UniProt P63316

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Actin, alpha skeletal muscle × 18 （P68135） Tropomyosin alpha-1 chain × 8 （P09493） Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle × 4 （P45379） Troponin I, cardiac muscle × 2 （P19429） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 18 MAGNESIUM ION × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 d； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7utl
沉积日期 deposition_date	2022-04-27
最后修订 last_revision	2022-09-21
结构标题 title	ALTERNATIVE MODELING OF TROPOMYOSIN IN HUMAN CARDIAC THIN FILAMENT IN THE CALCIUM FREE STATE
关键词 keywords	TROPONIN, TROPOMYOSIN, ACTIN, THIN FILEMENT, MUSCLE, CONTRACTILE, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7utl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7utl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7utl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	137.30 Å
总 Rg	136.70 Å
原子数	141796
残基数	8954
排除体积	1266500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7utl__assembly_1__model_1`	34-meric （34）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	42110.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R
原子数 atom_count	141796

MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tropomyosin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	32763.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,W,Z,i,j,g,h

MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle
分子量 formula_weight	34659.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,Y,e,f

MSDIEEVVEEYEEEEQEEAAVEEQEEAAEEDAEAEAETEETRAEEDEEEEEAKEAEDGPMEESKPKPRSFMPNLVPPKIPDGERVDFDDIHRKRMEKDLNELQALIEAHFENRKKEEEELVSLKDRIERRRAERAEQQRIRNEREKERQNRLAEERARREEEENRRKAEDEARKKKALSNMMHFGGYIQKQAQTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQSIYNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTRGKAKVTGRWK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Troponin I, cardiac muscle
分子量 formula_weight	24058.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,c

MADGSSDAAREPRPAPAPIRRRSSNYRAYATEPHAKKKSKISASRKLQLKTLLLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRCQPLELAGLGFAELQDLCRQLHARVDKVDEERYDIEAKVTKNITEIADLTQKIFDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALLGARAKESLDLRAHLKQVKKEDTEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFES

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles
分子量 formula_weight	18419.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,d

MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVMMVRCMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLDELKIMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGVE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	6.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	21588

ALTERNATIVE MODELING OF TROPOMYOSIN IN HUMAN CARDIAC THIN FILAMENT IN THE CALCIUM FREE STATE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform 6 of Troponin T, cardiac muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Troponin I, cardiac muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7utl__assembly_1__model_1

7utl__assembly_1__model_1 | I(q)

7utl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (3)