7uxc

cryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 233.6 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase mTOR

Homo sapiens

UniProt P42345

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–2549 未记录 Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 66 个其他 PDB 条目、84 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 MTOR_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–2549; UniProt 1–2549

Target of rapamycin complex subunit LST8

Homo sapiens

UniProt Q9BVC4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–326 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 44 个其他 PDB 条目、52 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 LST8_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–326; UniProt 1–326

Regulatory-associated protein of mTOR

Homo sapiens

UniProt Q8N122

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–1335 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RPTOR_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–1335; UniProt 1–1335

Ras-related GTP-binding protein A

Homo sapiens

UniProt Q7L523

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–313 链 K; UniProt 1–313 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RRAGA_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–313; UniProt 1–313 作者链 K; PDB构建体 1–313; UniProt 1–313

Ras-related GTP-binding protein C

Homo sapiens

UniProt Q9HB90

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–399 链 L; UniProt 1–399 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RRAGC_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–399; UniProt 1–399 作者链 L; PDB构建体 1–399; UniProt 1–399

Ragulator complex protein LAMTOR1

Homo sapiens

UniProt Q6IAA8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–161 链 M; UniProt 1–161 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 LTOR1_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 M; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161

Ragulator complex protein LAMTOR2

Homo sapiens

UniProt Q9Y2Q5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–125 链 N; UniProt 1–125 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 LTOR2_HUMAN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–125; UniProt 1–125 作者链 N; PDB构建体 1–125; UniProt 1–125

Ragulator complex protein LAMTOR3

Homo sapiens

UniProt Q9UHA4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–124 链 O; UniProt 1–124 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 24 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 LTOR3_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124 作者链 O; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124

Ragulator complex protein LAMTOR4

Homo sapiens

UniProt Q0VGL1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 1–99 链 P; UniProt 1–99 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 24 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LTOR4_HUMAN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–99; UniProt 1–99 作者链 P; PDB构建体 1–99; UniProt 1–99

Ragulator complex protein LAMTOR5

Homo sapiens

UniProt O43504

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–91 链 Q; UniProt 1–91 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Transcription factor EB × 1 (P19484) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LTOR5_HUMAN
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–91; UniProt 1–91 作者链 Q; PDB构建体 1–91; UniProt 1–91

Transcription factor EB

Homo sapiens

UniProt P19484

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白拷贝数一致 链 R; UniProt 1–476 未记录 Serine/threonine-protein kinase mTOR × 1 (P42345) Target of rapamycin complex subunit LST8 × 1 (Q9BVC4) Regulatory-associated protein of mTOR × 1 (Q8N122) Ras-related GTP-binding protein A × 2 (Q7L523) Ras-related GTP-binding protein C × 2 (Q9HB90) Ragulator complex protein LAMTOR1 × 2 (Q6IAA8) Ragulator complex protein LAMTOR2 × 2 (Q9Y2Q5) Ragulator complex protein LAMTOR3 × 2 (Q9UHA4) Ragulator complex protein LAMTOR4 × 2 (Q0VGL1) Ragulator complex protein LAMTOR5 × 2 (O43504) IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TFEB_HUMAN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–476; UniProt 1–476

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7uxc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7uxc
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7uxc
沉积日期 deposition_date2022-05-05
结构标题 titlecryo-EM structure of the mTORC1-TFEB-Rag-Ragulator complex with symmetry expansion
关键词 keywordsmTORC1, TFEB, Lysosome biogenesis, Autophagy, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier84.94
回转半径 Rg (电子) rg_electron85.82
零角强度 I(0) i06304360000.00
分子量 molecular_weight677460.0 kDa
排除体积 excluded_volume849790 ų
包络体积 envelope_volume1428400 ų
水化壳体积 shell_volume146070 ų
包络直径 envelope_diameter306.9
壳层 Rg shell_rg71.48
包络 Rg envelope_rg85.33
形状 Rg shape_rg85.80
总 Rg total_rg85.72
总原子数 total_atoms95193
残基数 n_residues5959
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax233.6
Rg (实空间) rg_real81.07
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.92
I(0) (实空间) i0_real6.0490e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2790e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal81.97
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6250000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9149
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary77.9
偏度 Skewness skewness0.360
峰度 Kurtosis kurtosis-0.644
角度范围 angular_range— – 0.0900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9989
最高正则化参数 α highest_alpha259500000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.995; Stabil: 0.978; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.973; Smooth: 0.003

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7uxcD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id7uxcD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily190
结构域编号 domain_id7uxcK01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id7uxcK02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily190

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)