7w67

The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 81.6 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 380–496 链 A； UniProt 539–598	未记录	Histone-lysine N-methyltransferase 2A × 1 （Q03164） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Histone H3.3C × 1 （Q6NXT2） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.222

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7W67	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3RSN Crystal Structure of the N-terminal region of Human Ash2L 提交 2011-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 96–271（176 aa）片段：Ash2L N-terminal domain, UNP residues 96-271	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris-HCl pH8.5, 20% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.254
3S32 Crystal structure of Ash2L N-terminal domain 提交 2011-05-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 95–280（186 aa）片段：N-terminal domain residues 95-280	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M MgAcetate and 17-20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.45 Å R-free 0.263
3TOJ Structure of the SPRY domain of human Ash2L 提交 2011-09-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 370–496（127 aa）片段：Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617 链 A 539–617（79 aa）片段：Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617 链 B 370–496（127 aa）片段：Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617 链 B 539–617（79 aa）片段：Ash2L SPRY domain, UNP residues 370-496, 539-617	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG4000, 0.15 M Li2SO4, 0.1 M Tris, pH8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.07 Å R-free 0.206
4RIQ Crystal structure of DPY-30 dimerization/docking domain in complex with Ash2L Sdc1-DPY-30 Interacting region (SDI) 提交 2014-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618 链 F 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618 链 L 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618 链 X 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；323 K；0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, 0.1M Tris pH 8.5 and 10 mM spermidine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 323K	分辨率 2.23 Å R-free 0.284
4RIQ Crystal structure of DPY-30 dimerization/docking domain in complex with Ash2L Sdc1-DPY-30 Interacting region (SDI) 提交 2014-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618 链 O 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618 链 R 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618 链 U 603–618（16 aa）片段：UNP residues 603-618	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；323 K；0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, 0.1M Tris pH 8.5 and 10 mM spermidine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 323K	分辨率 2.23 Å R-free 0.284
4X8N Crystal structure of Ash2L SPRY domain in complex with phosphorylated RbBP5 提交 2014-12-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 380–495（116 aa）片段：UNP residues 380-495, 539-598 链 A 539–598（60 aa）片段：UNP residues 380-495, 539-598	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol	分辨率 2.10 Å R-free 0.277
4X8P Crystal structure of Ash2L SPRY domain in complex with RbBP5 提交 2014-12-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 380–495（116 aa）片段：UNP residues 380-495, 539-598 链 A 539–598（60 aa）片段：UNP residues 380-495, 539-598	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol	分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 380–496（117 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598 链 A 539–598（60 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598 链 B 380–496（117 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598 链 B 539–598（60 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598	未记录	ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 380–496（117 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598 链 A 539–598（60 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 380–496（117 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598 链 B 539–598（60 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6L The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L) in complex with RbBP5 and Ash2L 提交 2015-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 380–496（117 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598 链 B 539–598（60 aa）片段：UNP RESIDUES 380-496, 539-598	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；277 K；200mM NaCl, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.213
6E2H Crystal structure of human Ash2L (SPRY domain and SDI motif) in complex with full length DPY-30 提交 2018-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 380–622（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20mM citrate pH 4.7 and polyethylene glycol (PEG) 6000	分辨率 2.24 Å R-free 0.200
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 T 95–628（534 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 T 95–628（534 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 T 95–628（534 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 T 95–628（534 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 T 95–628（534 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 D 2–534（533 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 2–534（533 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 2–534（533 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 2–534（533 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7BRE The crystal structure of MLL2 in complex with ASH2L and RBBP5 提交 2020-03-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 286–402（117 aa）片段：UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504 链 A 445–504（60 aa）片段：UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12%(w/v) Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
7BRE The crystal structure of MLL2 in complex with ASH2L and RBBP5 提交 2020-03-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 286–402（117 aa）片段：UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504 链 D 445–504（60 aa）片段：UNP residues 286-402 and UNP residues 445-504	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12%(w/v) Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 2–534（533 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 2–534（533 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 M 95–628（534 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
7W6A Crystal structure of the MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L complex 提交 2021-12-01	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 380–496（117 aa）链 A 539–598（60 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.21 Å R-free 0.229
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 380–496（117 aa）链 A 539–598（60 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 380–496（117 aa）链 A 539–598（60 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7W6L The crystal structure of MLL3-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 380–496（117 aa）链 A 539–598（60 aa）链 B 380–496（117 aa）链 B 539–598（60 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 10% polyethylene glycol 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.26 Å R-free 0.223
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 T 1–628（628 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 T 1–628（628 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 T 1–628（628 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 T 1–628（628 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 T 1–628（628 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.45 Å

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UniProt名称	ASH2L_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–118； UniProt 380–496 作者链 A； PDB构建体 125–184； UniProt 539–598

Histone-lysine N-methyltransferase 2A

Homo sapiens

UniProt Q03164

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 3813–3969	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Histone H3.3C × 1 （Q6NXT2） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.222

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7W67	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2839–2869（31 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O	分辨率未提供
2J2S Solution structure of the nonmethyl-CpG-binding CXXC domain of the leukaemia-associated MLL histone methyltransferase 提交 2006-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1143–1214（72 aa）片段：RESIDUES 1146-1214	突变：YES	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；290 K NMR样品组成 90% WATER, 10% D2O	分辨率未提供
2JYI Solution structure of MLL CXXC domain 提交 2007-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1147–1203（57 aa）片段：CXXC domain	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2KKF Solution structure of MLL CXXC domain in complex with palindromic CPG DNA 提交 2009-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1147–1203（57 aa）片段：CXXC DOMAIN: UNP RESIDUES 1147-1203	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 Ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC domain-1, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-2, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC domain-3, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-4, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC domain-5, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-6, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] CXXC domain-7, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-8, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2KU7 Solution structure of MLL1 PHD3-Cyp33 RRM chimeric protein 提交 2010-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1585–1628（44 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298.2 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MLL PHD3-Cyp33 RRM, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.4 mM DSS, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2KYU The solution structure of the PHD3 finger of MLL 提交 2010-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1564–1628（65 aa）片段：PHD3 finger (UNP residues 1564-1628)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] PHD3, 100 uM ZINC ION, 25 mM potassium phosphate, 3 mM DTT, 50 mM sodium chloride, 1 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2LXS Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2840–2858（19 aa）片段：UNP RESIDUES 2840-2858	突变：C841A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；300 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-2, 25 mM sodium chloride-3, 50 mM potassium phosphate-4, 1 mM sodium azide-5, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LXT Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2840–2858（19 aa）片段：UNP RESIDUES 2840-2858	突变：C841A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；300 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM entity_2-2, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_3-3, 25 mM sodium chloride-4, 50 mM potassium phosphate-5, 1 mM sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MSR Solution structure of LEDGF/p75 IBD in complex with MLL1 peptide (140-160) 提交 2014-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–160（21 aa）片段：UNP residues 140-160	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）125；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM MLL1_140, 0.5 mM [U-13C; U-15N] IBD, 25 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 0.05 % beta-mercaptoethanol, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2MTN Solution structure of MLL-IBD complex 提交 2014-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 110–160（51 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 50 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2W5Y Binary Complex of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine. 提交 2008-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3785–3969（185 aa）片段：METHYLTRANSFERASE DOMAIN, RESIDUES 3785-3969	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH6.5, 2 % PEG 8000, 30 % 2-METHYL-2,4-PENTANDIOL, pH 6.8	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
2W5Z Ternary Complex of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine and histone peptide. 提交 2008-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3785–3969（185 aa）片段：METHYLTRANSFERASE DOMAIN, RESIDUES 3785-3969	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；0.1 M SODIUM CACODYLATE PH6.8, 2 % PEG 5000, 30 % 2-METHYL-2, 4-PENTANDIOL	分辨率 2.20 Å R-free 0.247
3EG6 Structure of WDR5 bound to MLL1 peptide 提交 2008-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 3762–3773（12 aa）片段：MLL-1 Win motif	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；30% PEG 3350, 30 mM (NH4)2SO4, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.72 Å R-free 0.240
3LQH Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo in the free form 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 A 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.3；293 K；0.1M Sodium acetate, 50 mM NaCl, 15% PEG3350, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.72 Å R-free 0.234
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 A 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 B 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 C 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQJ Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 A 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M Li2SO4, 15% PEG3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.274
3LQJ Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 B 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M Li2SO4, 15% PEG3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.274
3P4F Structural and biochemical insights into MLL1 core complex assembly and regulation. 提交 2010-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 3761–3770（10 aa）片段：unp residues 3761-3770	突变：S3763A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；0.2 M ammonium citrate (buffered with hydrochloric acid/sodium hydroxide to pH 7.0) and 18% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.35 Å R-free 0.249
3U85 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 提交 2011-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 6–25（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；2.3 M NaCl, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
3U85 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 提交 2011-10-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 6–25（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；2.3 M NaCl, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
3U88 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 and LEDGF 提交 2011-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 M 103–153（51 aa）	未记录	CHD CHOLIC ACID × 1 GGB L-CANAVANINE × 4 0BR (4beta,8alpha,9R)-6'-methoxy-10,11-dihydrocinchonan-9-ol × 1 GLV GLYOXYLIC ACID × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.233
3U88 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 and LEDGF 提交 2011-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 N 103–153（51 aa）	未记录	CHD CHOLIC ACID × 1 GGB L-CANAVANINE × 1 0BR (4beta,8alpha,9R)-6'-methoxy-10,11-dihydrocinchonan-9-ol × 1 GLV GLYOXYLIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.233
4ESG X-ray structure of WDR5-MLL1 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 3755–3771（17 aa）片段：UNP residues 3755-3771	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.2；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.2, hanging drop, temperature 294K	分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4ESG X-ray structure of WDR5-MLL1 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 3755–3771（17 aa）片段：UNP residues 3755-3771	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.2；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.2, hanging drop, temperature 294K	分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4GQ6 Human menin in complex with MLL peptide 提交 2012-08-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 6–15（10 aa）片段：unp residues 6-15	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% w/v PEG 3,350. This solution was mixed 1:1 with 2.5mg/mL protein in 50mM Tris-HCl (pH 8.0), NBm1 peptide, 50mM NaCl, and 1mM TCEP. Prior to data collection, crystals were transferred into a cryo-solution containing 20% PEG550 MME and flash-frozen in liquid nitrogen, 1:1 molar ratio with MBM1 peptide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K	分辨率 1.55 Å R-free 0.189
4NW3 Crystal structure of MLL CXXC domain in complex with a CpG DNA 提交 2013-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1147–1204（58 aa）片段：CXXC zinc finger domain (UNP residues 1147-1204)	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG3350, 0.05 M sodium tartrate, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.82 Å R-free 0.266
5F5E The Crystal Structure of MLL1 SET domain with N3816I/Q3867L mutation 提交 2015-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3813–3969（157 aa）片段：MLL1 SET domain (UNP RESIDUES 3813-3969)	突变：N3861I, Q3867L	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；35% Tacsimate, pH 7.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.236
5F6L The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L) in complex with RbBP5 and Ash2L 提交 2015-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 3813–3969（157 aa）片段：UNP RESIDUES 3813-3969	突变：N3861I, Q3867L	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；277 K；200mM NaCl, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.213
5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2839–2869（31 aa）片段：;UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315,UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315 ;	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate 2.3M Ammonium sulphate	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 2839–2869（31 aa）片段：;UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315,UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315 ;	未记录	GOL GLYCEROL × 12 CL CHLORIDE ION × 42	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate 2.3M Ammonium sulphate	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2839–2869（31 aa）片段：;UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315,UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315 ;	未记录	GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate 2.3M Ammonium sulphate	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
6EMQ Solution structure of the LEDGF/p75 IBD - MLL1 (aa 111-160) complex 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 110–160（51 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 arbitrary NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] LEDGF/p75 IBD-MLL1, 50 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6PWW Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5 and WDR5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7RZD CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PEPTIDE 提交 2021-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–755（9 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；18-24%PEG4000, 0.1M SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K	分辨率 1.82 Å R-free 0.236
7RZJ CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE 提交 2021-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；18-24%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 1.80 Å R-free 0.217
7S79 STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC PHOSPHONO-MLL PEPTIDE ANALOG 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）片段：PHOSPHONO-MLL(747-755) PEPTIDE	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.53 Å R-free 0.196
7S7D STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC SULFO-MLL PEPTIDE ANALOG 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）片段：SULFO-MLL(747-755) PEPTIDE	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.56 Å R-free 0.195
7S8A STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE, CUBIC CRYSTAL FORM 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–755（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；35% PEG4000, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2M SODIUM ACETATE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
7S8E STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE AND BOUND GLYCEROL 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.60 Å R-free 0.195
7S8F STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PEPTIDE AND BOUND GLYCEROL 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–755（9 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-26%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.80 Å R-free 0.206
7U5V Crystal structure of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine and Borealin peptide 提交 2022-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3811–3969（159 aa）片段：SET Domain	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；60% Tacsimate pH 7.0	分辨率 2.59 Å R-free 0.304
7W6A Crystal structure of the MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L complex 提交 2021-12-01	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.21 Å R-free 0.229
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7ZEY Complex Cyp33-RRM : MLL1-PHD3 提交 2022-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1564–1627（64 aa）片段：PHD ZINC FINGER (UNP RESIDUES 1564-1627)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7ZEZ Trimolecular complex Cyp33-RRMdelta alpha : MLL1-PHD3 : H3K4me3 提交 2022-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1564–1627（64 aa）片段：PHD ZINC FINGER (UNP RESIDUES 1564-1627)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
9C4S Menin mutant G331R in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.54 Å R-free 0.202
9C4T menin mutant M327I in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.46 Å R-free 0.184
9C4U Menin mutant T349M in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.57 Å R-free 0.197
9C4V Menin mutant G331D in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.47 Å R-free 0.188

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UniProt名称	KMT2A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–158； UniProt 3813–3969

Retinoblastoma-binding protein 5

Homo sapiens

UniProt Q15291

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 330–356	未记录	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone-lysine N-methyltransferase 2A × 1 （Q03164） Histone H3.3C × 1 （Q6NXT2） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.222

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7W67	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3P4F Structural and biochemical insights into MLL1 core complex assembly and regulation. 提交 2010-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 371–381（11 aa）片段：unp residues 371-381	突变：Y381D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；0.2 M ammonium citrate (buffered with hydrochloric acid/sodium hydroxide to pH 7.0) and 18% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.35 Å R-free 0.249
4X8N Crystal structure of Ash2L SPRY domain in complex with phosphorylated RbBP5 提交 2014-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 347–356（10 aa）片段：UNP residues 347-356	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol	分辨率 2.10 Å R-free 0.277
4X8P Crystal structure of Ash2L SPRY domain in complex with RbBP5 提交 2014-12-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 344–355（12 aa）片段：UNP residues 344-355	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol	分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 330–356（27 aa）片段：UNP RESIDUES 330-356 链 F 330–356（27 aa）片段：UNP RESIDUES 330-356	未记录	ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 330–356（27 aa）片段：UNP RESIDUES 330-356	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 330–356（27 aa）片段：UNP RESIDUES 330-356	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.41 Å R-free 0.228
5F6L The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L) in complex with RbBP5 and Ash2L 提交 2015-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 330–356（27 aa）片段：UNP RESIDUES 330-356	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；277 K；200mM NaCl, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.213
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6KM7 The structural basis for the internal interaction in RBBP5 提交 2019-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 10–325（316 aa）链 C 390–480（91 aa）片段：C-terminal distal domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES-Na, pH 7.5, 2% w/v PEG 400, 2.0 M ammonium sulfate	分辨率 1.80 Å R-free 0.194
6KM7 The structural basis for the internal interaction in RBBP5 提交 2019-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–325（316 aa）链 D 390–480（91 aa）片段：C-terminal distal domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.1 M HEPES-Na, pH 7.5, 2% w/v PEG 400, 2.0 M ammonium sulfate	分辨率 1.80 Å R-free 0.194
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6PWW Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5 and WDR5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6PWX Cryo-EM structure of RbBP5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7BRE The crystal structure of MLL2 in complex with ASH2L and RBBP5 提交 2020-03-28	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 330–356（27 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12%(w/v) Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
7BRE The crystal structure of MLL2 in complex with ASH2L and RBBP5 提交 2020-03-28	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 330–356（27 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0, 12%(w/v) Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–538（537 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
7W6A Crystal structure of the MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L complex 提交 2021-12-01	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 330–356（27 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.21 Å R-free 0.229
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 330–356（27 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 330–356（27 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7W6L The crystal structure of MLL3-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 330–356（27 aa）链 F 330–356（27 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 10% polyethylene glycol 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.26 Å R-free 0.223
8DU4 Complex between RbBP5-WDR5 and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-07-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 N 1–538（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.45 Å

共 31 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBBP5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–27； UniProt 330–356

Histone H3.3C

物种未注明

UniProt Q6NXT2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 2–10	未记录	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone-lysine N-methyltransferase 2A × 1 （Q03164） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.222

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7W67	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
21GE Solution structures of BRD9 bromodomain in complex with histone H3 acetyl-lysine 18 (H3K18ac) peptide 提交 2025-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–26（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Null；压力 1 NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
21HJ Solution structures of BRD9 bromodomain in complex with histone H3 lactyl-lysine 18 (H3K18la) peptide 提交 2025-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–26（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1 NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3KV4 Structure of PHF8 in complex with histone H3 提交 2009-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–25（24 aa）片段：UNP Residues 2-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 FE2 FE (II) ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；25% (v/v) polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl, and 0.1 M NaCitrate pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.19 Å R-free 0.255
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–135（135 aa）链 E 1–135（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–10（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–10（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7W6L The crystal structure of MLL3-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 M 2–10（9 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 10% polyethylene glycol 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.26 Å R-free 0.223
8Q1G LSD1-CoREST bound to Acetylated K14 of Histone H3 提交 2023-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–22（21 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartrate 1.2M, ADA 0.1M,	分辨率 2.60 Å R-free 0.255
8Q1H LSD1 Y391K-CoREST bound to Histone H3 N-terminal tail 提交 2023-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–22（21 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartrate 1.2 M, ADA 0.1M	分辨率 2.90 Å R-free 0.254
8Q1J LSD1 Y391K-CoREST bound to Acetylated K14 of Histone H3 提交 2023-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–22（21 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartate 1.2 M, ADA 0.1M	分辨率 2.87 Å R-free 0.272
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 M 1–135（135 aa）链 S 1–135（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8SR6 Crystal structure of legAS4 from Legionella pneumophila subsp. pneumophila with histone H3 (3-17)peptide 提交 2023-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 4–18（15 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris 6.5 and 38% PPG P400	分辨率 2.22 Å R-free 0.230
8T4F Transporter associated with antigen processing (TAP) bound to the 9-mer peptide RRYQKSTEL 提交 2023-06-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 52–60（9 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8VLD Crystal structure of Ash1L PHD finger in complex with histone H3K4me2 提交 2024-01-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 2–12（11 aa）链 T 2–12（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1.6 M sodium citrate pH 6.5	分辨率 1.92 Å R-free 0.249
8VLF Crystal structure of Ash1L PHD finger in complex with histone H3K4me3 提交 2024-01-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 2–13（12 aa）链 T 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1.6 M sodium citrate pH 6.5	分辨率 1.34 Å R-free 0.188
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8ZXC NMR solution structures of ASH1L BRD-PHD domain in complex with H3K4me2 peptide 提交 2024-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1 NMR样品组成 100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
9C0O Crystal structure of DmCfp1 PHD finger bound to H3K4me3 提交 2024-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；15% PEG3350, 0.01M Tris pH8.5, 0.2M Ammonium sulfate	分辨率 1.53 Å R-free 0.194
9DZN KAT6A MYST domain complexed with a H3K14-CoA bisubstrate inhibitor 提交 2024-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–24（19 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL* GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；294.15 K；1.25 M NH4SO4, 0.28 M NaCl, and 0.1 M HEPES pH 6.4	分辨率 1.72 Å R-free 0.245
9IM4 Crystal Structure of AF9 YEATS domain F28R mutant in complex with histone H3K9la 提交 2024-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.1M DL Malic acid pH7.0	分辨率 2.79 Å R-free 0.315
9IM4 Crystal Structure of AF9 YEATS domain F28R mutant in complex with histone H3K9la 提交 2024-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.1M DL Malic acid pH7.0	分辨率 2.79 Å R-free 0.315
9N61 Transporter associated with antigen processing (TAP) bound to the 9-mer peptide RRYQKSTEL and ATP 提交 2025-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 52–60（9 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9V5M The crystal structure of RBBP4-H3 complex 提交 2025-05-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–15（14 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.211

共 22 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H3C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–9； UniProt 2–10

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7w67
沉积日期 deposition_date	2021-12-01
结构标题 title	The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide
关键词 keywords	MLL family methyltransferases, product specificity, F/Y switch, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.30 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.47 Å
零角强度 I(0) i0	28949500.00
分子量 molecular_weight	41391.0 kDa
排除体积 excluded_volume	51748 Å³
包络体积 envelope_volume	63671 Å³
水化壳体积 shell_volume	22320 Å³
包络直径 envelope_diameter	84.0 Å
壳层 Rg shell_rg	31.08 Å
包络 Rg envelope_rg	24.17 Å
形状 Rg shape_rg	24.42 Å
总 Rg total_rg	25.43 Å
总原子数 total_atoms	2909
残基数 n_residues	360
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	81.6 Å
Rg (实空间) rg_real	25.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.8950e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.7740e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	25.35 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	28950000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8803
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.334
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.617
角度范围 angular_range	— – 0.3150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7413000.0000
实空间数据点数 n_real_points	64
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.866; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.883; Smooth: 0.958

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
分子量 formula_weight	20597.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3037

SRVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDVLGFYINLPEDTISGRGSSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone-lysine N-methyltransferase 2A
分子量 formula_weight	18227.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.364,2.1.1.-
突变 mutation	N3861I,Q3867L,C3882SS
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DLPMPMRFRHLKKTSKEAVGVYRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYAGIVIRSILTDKREKYYDSKGIGSSYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNCYSRVINIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Retinoblastoma-binding protein 5
分子量 formula_weight	3255.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

SAFAPDFKELDENVEYEERESEFDIED

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone H3.3C
分子量 formula_weight	1063.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

ARTKQTARK

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
分子量 formula_weight	384.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	128

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	76.150 Å
晶胞边长 b length_b	44.571 Å
晶胞边长 c length_c	121.333 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	108.92 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.194 Å
最低分辨率 resolution_low	31.889 Å
R 因子 r_factor	0.1772
R_work r_work	0.1750
R_free r_free	0.2219

fit	/app/data/saxs_computation/w6/7w67/7w67.fit
pddf	/app/data/pr_computation/w6/7w67/7w67.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/w6/7w67/7w67.dat

The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone-lysine N-methyltransferase 2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Retinoblastoma-binding protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H3.3C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)