7zez

Trimolecular complex Cyp33-RRMdelta alpha : MLL1-PHD3 : H3K4me3

Method: SOLUTION NMR D_max: 57.1 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Isoform 3 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–90	片段：RRM (UNP RESIDUES 1-90)	MLL cleavage product N320 × 1 （Q03164） Histone H3 × 1 （B4E380） ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成：1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成：1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7ZEZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ZMF C domain of human cyclophilin-33(hcyp33) 提交 2005-05-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 137–301（165 aa）片段：residues 137-301	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.88 Å R-free 0.225
2CQB Solution Structure of the RNA recognition motif in Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E 提交 2005-05-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–89（89 aa）片段：RNA recognition motif	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 1.16mM PROTEIN U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCL(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KU7 Solution structure of MLL1 PHD3-Cyp33 RRM chimeric protein 提交 2010-02-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–82（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298.2 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MLL PHD3-Cyp33 RRM, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.4 mM DSS, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2KYX Solution structure of the RRM domain of CYP33 提交 2010-06-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–83（81 aa）片段：UNP Residues 3-83	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K；压力 ambient NMR样品组成 25 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 1 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2R99 Crystal structure of cyclophilin ABH-like domain of human peptidylprolyl isomerase E isoform 1 提交 2007-09-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 131–301（171 aa）片段：Cyclophilin domain: Residues 131-301	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；34% PEG 8000, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.61 Å R-free 0.196
3LPY Crystal structure of the RRM domain of CyP33 提交 2010-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 5–82（78 aa）片段：N-terminal RRM domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes-Na, 2.4 M Ammonium Sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
3LPY Crystal structure of the RRM domain of CyP33 提交 2010-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 5–82（78 aa）片段：N-terminal RRM domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes-Na, 2.4 M Ammonium Sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
3MDF Crystal structure of the RRM domain of Cyclophilin 33 提交 2010-03-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–83（83 aa）片段：RNA-RECOGNITION MOTIF (UNP residues:1-83)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；291 K；0.1 M Hepes and 1.0 M tri-sodium dehydrate citrate pH 7.6, Microcapillary, temperature 291K	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
3MDF Crystal structure of the RRM domain of Cyclophilin 33 提交 2010-03-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–83（83 aa）片段：RNA-RECOGNITION MOTIF (UNP residues:1-83)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；291 K；0.1 M Hepes and 1.0 M tri-sodium dehydrate citrate pH 7.6, Microcapillary, temperature 291K	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
3UCH Crystal structure of a peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E (PPIE) from Homo sapiens at 2.50 A resolution 提交 2011-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 129–301（173 aa）片段：residues 129-301	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0% PEG-1000, 0.1M TRIS pH 7.0, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.214
3UCH Crystal structure of a peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E (PPIE) from Homo sapiens at 2.50 A resolution 提交 2011-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 129–301（173 aa）片段：residues 129-301	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0% PEG-1000, 0.1M TRIS pH 7.0, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.214
5MQF Cryo-EM structure of a human spliceosome activated for step 2 of splicing (C* complex) 提交 2016-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric	链 o 1–301（301 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 1 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.50 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric	链 o 1–301（301 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6ID0 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome prior to Prp43 loaded (ILS1 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：42-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6ID1 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome after Prp43 loaded (ILS2 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：43-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric	链 o 1–301（301 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 o 1–301（301 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7W59 The cryo-EM structure of human pre-C*-I complex 提交 2021-11-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：50-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W5A The cryo-EM structure of human pre-C*-II complex 提交 2021-11-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7ZEV Free form of extended Cyp33-RRM 提交 2022-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–114（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7ZEW Complex Cyp33-RRM : AAUAAA RNA 提交 2022-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–114（114 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM RNA (5'-R(APAPUPAPAPA)-3'), 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM RNA (5'-R(APAPUPAPAPA)-3'), 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7ZEX Complex Cyp33-RRMdelta alpha : UAAUGUCG RNA 提交 2022-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–90（90 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM RNA (5'-R(UPAPAPUPGPUPCPG)-3'), 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM RNA (5'-R(UPAPAPUPGPUPCPG)-3'), 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7ZEY Complex Cyp33-RRM : MLL1-PHD3 提交 2022-03-31	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–114（114 aa）片段：RRM (UNP RESIDUES 1-114)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 CE 1–301（301 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 w 1–301（301 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 5.90 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0U The cryo-EM structure of human Bact-IV complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8I0V The cryo-EM structure of human post-Bact complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 y 1–301（301 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

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UniProt名称	PPIE_HUMAN
Isoform	Q9UNP9-3
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–93； UniProt 1–90

MLL cleavage product N320

Homo sapiens

UniProt Q03164

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1564–1627	片段：PHD ZINC FINGER (UNP RESIDUES 1564-1627)	Isoform 3 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E × 1 （Q9UNP9） Histone H3 × 1 （B4E380） ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成：1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成：1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7ZEZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2839–2869（31 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O	分辨率未提供
2J2S Solution structure of the nonmethyl-CpG-binding CXXC domain of the leukaemia-associated MLL histone methyltransferase 提交 2006-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1143–1214（72 aa）片段：RESIDUES 1146-1214	突变：YES	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；290 K NMR样品组成 90% WATER, 10% D2O	分辨率未提供
2JYI Solution structure of MLL CXXC domain 提交 2007-12-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1147–1203（57 aa）片段：CXXC domain	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2KKF Solution structure of MLL CXXC domain in complex with palindromic CPG DNA 提交 2009-06-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1147–1203（57 aa）片段：CXXC DOMAIN: UNP RESIDUES 1147-1203	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 Ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC domain-1, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-2, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC domain-3, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-4, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] CXXC domain-5, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-6, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] CXXC domain-7, 1 mM DNA (5'-D(DCPDCPDCPDTPDGPDCPDGPDCPDAPDGPDGPDG)-3')-8, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2KU7 Solution structure of MLL1 PHD3-Cyp33 RRM chimeric protein 提交 2010-02-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1585–1628（44 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298.2 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MLL PHD3-Cyp33 RRM, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.4 mM DSS, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2KYU The solution structure of the PHD3 finger of MLL 提交 2010-06-08	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1564–1628（65 aa）片段：PHD3 finger (UNP residues 1564-1628)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；303 K NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] PHD3, 100 uM ZINC ION, 25 mM potassium phosphate, 3 mM DTT, 50 mM sodium chloride, 1 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2LXS Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2840–2858（19 aa）片段：UNP RESIDUES 2840-2858	突变：C841A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；300 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_2-2, 25 mM sodium chloride-3, 50 mM potassium phosphate-4, 1 mM sodium azide-5, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LXT Allosteric communication in the KIX domain proceeds through dynamic re-packing of the hydrophobic core 提交 2012-08-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2840–2858（19 aa）片段：UNP RESIDUES 2840-2858	突变：C841A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；300 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 2 mM entity_2-2, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_3-3, 25 mM sodium chloride-4, 50 mM potassium phosphate-5, 1 mM sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MSR Solution structure of LEDGF/p75 IBD in complex with MLL1 peptide (140-160) 提交 2014-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 140–160（21 aa）片段：UNP residues 140-160	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）125；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM MLL1_140, 0.5 mM [U-13C; U-15N] IBD, 25 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 0.05 % beta-mercaptoethanol, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2MTN Solution structure of MLL-IBD complex 提交 2014-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 110–160（51 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 50 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2W5Y Binary Complex of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine. 提交 2008-12-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3785–3969（185 aa）片段：METHYLTRANSFERASE DOMAIN, RESIDUES 3785-3969	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH6.5, 2 % PEG 8000, 30 % 2-METHYL-2,4-PENTANDIOL, pH 6.8	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
2W5Z Ternary Complex of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine and histone peptide. 提交 2008-12-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3785–3969（185 aa）片段：METHYLTRANSFERASE DOMAIN, RESIDUES 3785-3969	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；0.1 M SODIUM CACODYLATE PH6.8, 2 % PEG 5000, 30 % 2-METHYL-2, 4-PENTANDIOL	分辨率 2.20 Å R-free 0.247
3EG6 Structure of WDR5 bound to MLL1 peptide 提交 2008-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 3762–3773（12 aa）片段：MLL-1 Win motif	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；30% PEG 3350, 30 mM (NH4)2SO4, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.72 Å R-free 0.240
3LQH Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo in the free form 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 A 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.3；293 K；0.1M Sodium acetate, 50 mM NaCl, 15% PEG3350, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.72 Å R-free 0.234
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 A 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 B 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 C 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQJ Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 A 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M Li2SO4, 15% PEG3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.274
3LQJ Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1566–1665（100 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1 链 B 1703–1784（82 aa）片段：Third PHD finger and Bromodomain of MLL1	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M Li2SO4, 15% PEG3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.274
3P4F Structural and biochemical insights into MLL1 core complex assembly and regulation. 提交 2010-10-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 3761–3770（10 aa）片段：unp residues 3761-3770	突变：S3763A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；0.2 M ammonium citrate (buffered with hydrochloric acid/sodium hydroxide to pH 7.0) and 18% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.35 Å R-free 0.249
3U85 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 提交 2011-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 6–25（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；2.3 M NaCl, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
3U85 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 提交 2011-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 6–25（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；2.3 M NaCl, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
3U88 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 and LEDGF 提交 2011-10-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 M 103–153（51 aa）	未记录	CHD CHOLIC ACID × 1 GGB L-CANAVANINE × 4 0BR (4beta,8alpha,9R)-6'-methoxy-10,11-dihydrocinchonan-9-ol × 1 GLV GLYOXYLIC ACID × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.233
3U88 Crystal structure of human menin in complex with MLL1 and LEDGF 提交 2011-10-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 N 103–153（51 aa）	未记录	CHD CHOLIC ACID × 1 GGB L-CANAVANINE × 1 0BR (4beta,8alpha,9R)-6'-methoxy-10,11-dihydrocinchonan-9-ol × 1 GLV GLYOXYLIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；277 K；1.6 M ammonium sulfate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.233
4ESG X-ray structure of WDR5-MLL1 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 3755–3771（17 aa）片段：UNP residues 3755-3771	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.2；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.2, hanging drop, temperature 294K	分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4ESG X-ray structure of WDR5-MLL1 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 3755–3771（17 aa）片段：UNP residues 3755-3771	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.2；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.2, hanging drop, temperature 294K	分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4GQ6 Human menin in complex with MLL peptide 提交 2012-08-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 6–15（10 aa）片段：unp residues 6-15	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% w/v PEG 3,350. This solution was mixed 1:1 with 2.5mg/mL protein in 50mM Tris-HCl (pH 8.0), NBm1 peptide, 50mM NaCl, and 1mM TCEP. Prior to data collection, crystals were transferred into a cryo-solution containing 20% PEG550 MME and flash-frozen in liquid nitrogen, 1:1 molar ratio with MBM1 peptide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K	分辨率 1.55 Å R-free 0.189
4NW3 Crystal structure of MLL CXXC domain in complex with a CpG DNA 提交 2013-12-05	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1147–1204（58 aa）片段：CXXC zinc finger domain (UNP residues 1147-1204)	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG3350, 0.05 M sodium tartrate, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.82 Å R-free 0.266
5F5E The Crystal Structure of MLL1 SET domain with N3816I/Q3867L mutation 提交 2015-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3813–3969（157 aa）片段：MLL1 SET domain (UNP RESIDUES 3813-3969)	突变：N3861I, Q3867L	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；35% Tacsimate, pH 7.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.236
5F6L The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L) in complex with RbBP5 and Ash2L 提交 2015-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 3813–3969（157 aa）片段：UNP RESIDUES 3813-3969	突变：N3861I, Q3867L	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；277 K；200mM NaCl, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.213
5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2839–2869（31 aa）片段：;UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315,UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315 ;	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate 2.3M Ammonium sulphate	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 2839–2869（31 aa）片段：;UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315,UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315 ;	未记录	GOL GLYCEROL × 12 CL CHLORIDE ION × 42	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate 2.3M Ammonium sulphate	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
5SVH Crystal structure of the KIX domain of CBP in complex with a MLL/c-Myb chimera 提交 2016-08-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2839–2869（31 aa）片段：;UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315,UNP Q03164 residues 2839-2869 linked to UNP P01103 residues 291-315 ;	未记录	GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M potassium sulfate 2.3M Ammonium sulphate	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
6EMQ Solution structure of the LEDGF/p75 IBD - MLL1 (aa 111-160) complex 提交 2017-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 110–160（51 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 arbitrary NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] LEDGF/p75 IBD-MLL1, 50 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 3754–3969（216 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6PWW Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5 and WDR5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 3762–3969（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7RZD CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PEPTIDE 提交 2021-08-27	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–755（9 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；18-24%PEG4000, 0.1M SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K	分辨率 1.82 Å R-free 0.236
7RZJ CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE 提交 2021-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；18-24%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 290K	分辨率 1.80 Å R-free 0.217
7S79 STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC PHOSPHONO-MLL PEPTIDE ANALOG 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）片段：PHOSPHONO-MLL(747-755) PEPTIDE	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.53 Å R-free 0.196
7S7D STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH SYNTHETIC SULFO-MLL PEPTIDE ANALOG 提交 2021-09-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）片段：SULFO-MLL(747-755) PEPTIDE	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24% PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.56 Å R-free 0.195
7S8A STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE, CUBIC CRYSTAL FORM 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–755（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；35% PEG4000, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.2M SODIUM ACETATE, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
7S8E STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PHOSPHOPEPTIDE AND BOUND GLYCEROL 提交 2021-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 747–755（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-24%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.60 Å R-free 0.195
7S8F STRUCTURE OF HLA-B*07:02 IN COMPLEX WITH MLL(747-755) PEPTIDE AND BOUND GLYCEROL 提交 2021-09-17	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 747–755（9 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；18-26%PEG4000, 0.1 SODIUM CITRATE, 20% ISOPROPANOL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE	分辨率 1.80 Å R-free 0.206
7U5V Crystal structure of the Mixed Lineage Leukaemia (MLL1) SET Domain with the cofactor product S-Adenosylhomocysteine and Borealin peptide 提交 2022-03-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3811–3969（159 aa）片段：SET Domain	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；60% Tacsimate pH 7.0	分辨率 2.59 Å R-free 0.304
7W67 The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.222
7W6A Crystal structure of the MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L complex 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.21 Å R-free 0.229
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 3813–3969（157 aa）	突变：N3861I,Q3867L,C3882SS	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7ZEY Complex Cyp33-RRM : MLL1-PHD3 提交 2022-03-31	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1564–1627（64 aa）片段：PHD ZINC FINGER (UNP RESIDUES 1564-1627)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9C4S Menin mutant G331R in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.54 Å R-free 0.202
9C4T menin mutant M327I in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.46 Å R-free 0.184
9C4U Menin mutant T349M in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.57 Å R-free 0.197
9C4V Menin mutant G331D in complex with MLL peptide 提交 2024-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–15（12 aa）	突变：C5A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) PEG-3,350	分辨率 1.47 Å R-free 0.188

共 54 个其他 PDB 条目、62 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KMT2A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–64； UniProt 1564–1627

Histone H3

物种未注明

UniProt B4E380

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 2–14	片段：N-TERMINAL TAIL (UNP RESIDUES 2-14) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Isoform 3 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E × 1 （Q9UNP9） MLL cleavage product N320 × 1 （Q03164） ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；310.15 K；离子强度（mmCIF原始值）80；压力 AMBIENT NMR样品组成：1 mM [U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 50 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成：1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成：1 mM PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE E, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE 2A, 1 mM HISTONE H3, 40 mM sodium chloride, 40 mM sodium phosphate, 10 uM zinc chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B4E380_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–13； UniProt 2–14

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7zez
沉积日期 deposition_date	2022-03-31
结构标题 title	Trimolecular complex Cyp33-RRMdelta alpha : MLL1-PHD3 : H3K4me3
关键词 keywords	;RRM, RNA BINDING PROTEIN-STRUCTURAL PROTEIN COMPLEX, HISTONE 3, H3K4me3, EPIGENETIC, MLL1 Transcription regulation, infant leukemia, TRANSCRIPTION ;; TRANSCRIPTION
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	17.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.60 Å
零角强度 I(0) i0	2277610000.00
分子量 molecular_weight	384830.0 kDa
排除体积 excluded_volume	472350 Å³
包络体积 envelope_volume	47373 Å³
水化壳体积 shell_volume	20360 Å³
包络直径 envelope_diameter	68.2 Å
壳层 Rg shell_rg	26.13 Å
包络 Rg envelope_rg	19.98 Å
形状 Rg shape_rg	16.59 Å
总 Rg total_rg	16.75 Å
总原子数 total_atoms	52400
残基数 n_residues	3380
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	57.1 Å
Rg (实空间) rg_real	17.00 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.22 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.2780e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2410e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2278000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6527
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.289
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.315
角度范围 angular_range	— – 0.4650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0076
最高正则化参数 α highest_alpha	1013000.0000
实空间数据点数 n_real_points	77
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.831; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.998

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Isoform 3 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E
分子量 formula_weight	10349.7 kDa
EC 编号 ec_number	5.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	52400

AGHMATTKRVLYVGGLAEEVDDKVLHAAFIPFGDITDIQIPLDYETEKHRGFAFVEFELAEDAAAAIDNMNESELFGRTIRVNLAKPMRIKEG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MLL cleavage product N320
分子量 formula_weight	7437.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

AKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCENLSDEMYEILSNLPESVAYTCVNCTER

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	1407.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

ARTKQTARKSTGG

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7zezA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

fit	/app/data/saxs_computation/ze/7zez/7zez.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ze/7zez/7zez.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ze/7zez/7zez.dat

Trimolecular complex Cyp33-RRMdelta alpha : MLL1-PHD3 : H3K4me3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Isoform 3 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MLL cleavage product N320

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)