7xhn

Structure of human inner kinetochore CCAN-DNA complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Centromere protein O

Homo sapiens

UniProt Q9BU64

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPO_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–300; UniProt 1–300 作者链 o; PDB构建体 1–300; UniProt 1–300

Centromere protein H

Homo sapiens

UniProt Q9H3R5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPH_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–247; UniProt 1–247

Centromere protein I

Homo sapiens

UniProt Q92674

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPI_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–756; UniProt 1–756

Centromere protein K

Homo sapiens

UniProt Q9BS16

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269

Centromere protein L

Homo sapiens

UniProt Q8N0S6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–344; UniProt 1–344

Centromere protein M

Homo sapiens

UniProt Q9NSP4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPM_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180

Centromere protein N

Homo sapiens

UniProt Q96H22

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPN_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–339; UniProt 1–339

Centromere protein P

Homo sapiens

UniProt Q6IPU0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288

Centromere protein S

Homo sapiens

UniProt Q8N2Z9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPS_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138

Centromere protein T

Homo sapiens

UniProt Q96BT3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPT_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–561; UniProt 1–561

CENP-W

Homo sapiens

UniProt Q5EE01

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPW_HUMAN
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 W; PDB构建体 1–88; UniProt 1–88

Centromere protein X

Homo sapiens

UniProt A8MT69

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPX_HUMAN
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81

Centromere protein C

Homo sapiens

UniProt Q03188

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–943; UniProt 1–943 作者链 c; PDB构建体 1–943; UniProt 1–943

Centromere protein Q

Homo sapiens

UniProt Q7L2Z9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein U × 1 (Q71F23) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPQ_HUMAN
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–268; UniProt 1–268

Centromere protein U

Homo sapiens

UniProt Q71F23

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein R × 1 (Q13352) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPU_HUMAN
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–418; UniProt 1–418

Centromere protein R

Homo sapiens

UniProt Q13352

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 18 DNA 2 Centromere protein O × 2 (Q9BU64) Centromere protein H × 1 (Q9H3R5) Centromere protein I × 1 (Q92674) Centromere protein K × 1 (Q9BS16) Centromere protein L × 1 (Q8N0S6) Centromere protein M × 1 (Q9NSP4) Centromere protein N × 1 (Q96H22) Centromere protein P × 1 (Q6IPU0) Centromere protein S × 1 (Q8N2Z9) Centromere protein T × 1 (Q96BT3) CENP-W × 1 (Q5EE01) Centromere protein X × 1 (A8MT69) DNA (25-MER) × 1 DNA (25-MER) × 1 Centromere protein C × 2 (Q03188) Centromere protein Q × 1 (Q7L2Z9) Centromere protein U × 1 (Q71F23) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CENPR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–177; UniProt 1–177

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7xhn
沉积日期 deposition_date2022-04-09
结构标题 titleStructure of human inner kinetochore CCAN-DNA complex
关键词 keywordsCELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7xhn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7xhn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7xhn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)54.63 Å
Rg(电子密度)54.73 Å
总 Rg54.62 Å
原子数23364
残基数2938
排除体积414240 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7xhn__assembly_1__model_1 eicosameric (20) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id7xhnM01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id7xhnS01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
结构域编号 domain_id7xhnW01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology20 — Histone, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Histone, subunit A
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7. 引用文献 (1)