7zi4

Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RuvB-like 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–456； UniProt 1–456 作者链 C； PDB构建体 1–456； UniProt 1–456 作者链 E； PDB构建体 1–456； UniProt 1–456

RuvB-like 2

Homo sapiens

UniProt Q9Y230

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 D； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 F； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463

Chromatin-remodeling ATPase INO80

Homo sapiens

UniProt Q9ULG1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	INO80_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–1556； UniProt 1–1556

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 N； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

INO80 complex subunit B

Homo sapiens

UniProt Q9C086

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IN80B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–356； UniProt 1–356

Actin-related protein 5

Homo sapiens

UniProt Q9H9F9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–607； UniProt 1–607

INO80 complex subunit C

Homo sapiens

UniProt Q6PI98

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IN80C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–192； UniProt 1–192

Histone H3.1

Homo sapiens

UniProt P68431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 M； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H2A type 1-B/E

Homo sapiens

UniProt P04908

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2A1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 O； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

Histone H2B type 1-J

Homo sapiens

UniProt P06899

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （Q9ULG1） Histone H4 × 2 （P62805） INO80 complex subunit B × 1 （Q9C086） Actin-related protein 5 × 1 （Q9H9F9） INO80 complex subunit C × 1 （Q6PI98） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） DNA (158-MER) × 1 DNA (158-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2B1J_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 作者链 P； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7zi4
沉积日期 deposition_date	2022-04-07
结构标题 title	Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome
关键词 keywords	chromatin remodeler, transcription, replication, DNA repair, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7zi4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7zi4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7zi4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.11 Å
Rg（电子密度）	63.55 Å
总 Rg	63.82 Å
原子数	42294
残基数	5000
排除体积	731830 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7zi4__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	RuvB-like 1
分子量 formula_weight	50296.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	42294

MKIEEVKSTTKTQRIASHSHVKGLGLDESGLAKQAASGLVGQENAREACGVIVELIKSKKMAGRAVLLAGPPGTGKTALALAIAQELGSKVPFCPMVGSEVYSTEIKKTEVLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPCETENPMGGYGKTISHVIIGLKTAKGTKQLKLDPSIFESLQKERVEAGDVIYIEANSGAVKRQGRCDTYATEFDLEAEEYVPLPKGDVHKKKEIIQDVTLHDLDVANARPQGGQDILSMMGQLMKPKKTEITDKLRGEINKVVNKYIDQGIAELVPGVLFVDEVHMLDIECFTYLHRALESSIAPIVIFASNRGNCVIRGTEDITSPHGIPLDLLDRVMIIRTMLYTPQEMKQIIKIRAQTEGINISEEALNHLGEIGTKTTLRYSVQLLTPANLLAKINGKDSIEKEHVEEISELFYDAKSSAKILADQQDKYMK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RuvB-like 2
分子量 formula_weight	51222.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

MATVTATTKVPEIRDVTRIERIGAHSHIRGLGLDDALEPRQASQGMVGQLAARRAAGVVLEMIREGKIAGRAVLIAGQPGTGKTAIAMGMAQALGPDTPFTAIAGSEIFSLEMSKTEALTQAFRRSIGVRIKEETEIIEGEVVEIQIDRPATGTGSKVGKLTLKTTEMETIYDLGTKMIESLTKDKVQAGDVITIDKATGKISKLGRSFTRARDYDAMGSQTKFVQCPDGELQKRKEVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIKSEVREQINAKVAEWREEGKAEIIPGVLFIDEVHMLDIESFSFLNRALESDMAPVLIMATNRGITRIRGTSYQSPHGIPIDLLDRLLIVSTTPYSEKDTKQILRIRCEEEDVEMSEDAYTVLTRIGLETSLRYAIQLITAASLVCRKRKGTEVQVDDIKRVYSLFLDESRSTQYMKEYQDAFLFNELKGETMDTS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Chromatin-remodeling ATPase INO80
分子量 formula_weight	177032.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNPLLPQSGDPLIQVKEEPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLKKSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDDDEEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKELQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKAKLKKVKKKRRRDEELSSEESPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANKQKASARNLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQRKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDYDSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNGKLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFVPKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVRWKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMILKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQFRKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRVLSPFAPDYIQRSLFHRKGINEESCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSFPNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEYERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFKPDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASITGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAAYGYNVSKGISASSPLQTSLVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTNPSGGR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11394.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,J

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	INO80 complex subunit B
分子量 formula_weight	38704.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MSKLWRRGSTSGAMEAPEPGEALELSLAGAHGHGVHKKKHKKHKKKHKKKHHQEEDAGPTQPSPAKPQLKLKIKLGGQVLGTKSVPTFTVIPEGPRSPSPLMVVDNEEEPMEGVPLEQYRAWLDEDSNLSPSPLRDLSGGLGGQEEEEEQRWLDALEKGELDDNGDLKKEINERLLTARQRALLQKARSQPSPMLPLPVAEGCPPPALTEEMLLKREERARKRRLQAARRAEEHKNQTIERLTKTAATSGRGGRGGARGERRGGRAAAPAPMVRYCSGAQGSTLSFPPGVPAPTAVSQRPSPSGPPPRCSVPGCPHPRRYACSRTGQALCSLQCYRINLQMRLGGPEGPGSPLLAT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Actin-related protein 5
分子量 formula_weight	68372.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAANVFPFRDARAAPDPVLEAGPVAHGPLPVPLVLDNGSFQVRAGWACPGQDPGPEPRLQFRAVCARGRGGARGASGPQVGNALGSLEPLRWMLRSPFDRNVPVNLELQELLLDYSFQHLGVSSQGCVDHPIVLTEAVCNPLYSRQMMSELLFECYGIPKVAYGIDSLFSFYHNKPKNSMCSGLIISSGYQCTHVLPILEGRLDAKNCKRINLGGSQAAGYLQRLLQLKYPGHLAAITLSRMEEILHEHSYIAEDYVEELHKWRCPDYYENNVHKMQLPFSSKLLGSTLTSEEKQERRQQQLRRLQELNARRREEKLQLDQERLDRLLYVQELLEDGQMDQFHKALIELNMDSPEELQSYIQKLSIAVEQAKQKILQAEVNLEVDVVDSKPETPDLEQLEPSLEDVESMNDFDPLFSEETPGVEKPVTTVQPVFNLAAYHQLFVGTERIRAPEIIFQPSLIGEEQAGIAETLQYILDRYPKDIQEMLVQNVFLTGGNTMYPGMKARMEKELLEMRPFRSSFQVQLASNPVLDAWYGARDWALNHLDDNEVWITRKEYEEKGGEYLKEHCASNIYVPIRLPKQASRSSDAQASSKGSAAGGGGAGEQA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	INO80 complex subunit C
分子量 formula_weight	20672.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MAAQIPIVATTSTPGIVRNSKKRPASPSHNGSSGGGYGASKKKKASASSFAQGISMEAMSENKMVPSEFSTGPVEKAAKPLPFKDPNFVHSGHGGAVAGKKNRTWKNLKQILASERALPWQLNDPNYFSIDAPPSFKPAKKYSDVSGLLANYTDPQSKLRFSTIEEFSYIRRLPSDVVTGYLALRKATSIVP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Histone H3.1
分子量 formula_weight	15437.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,M

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Histone H2A type 1-B/E
分子量 formula_weight	14165.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,O

MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Histone H2B type 1-J
分子量 formula_weight	13935.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,P

MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA (158-MER)
分子量 formula_weight	48569.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	X

CCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCATGTACTCGGGATATTGAT

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA (158-MER)
分子量 formula_weight	48975.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

ATCAATATCCCGAGTACATGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGG

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION
分子量 formula_weight	66.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	156300

Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RuvB-like 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chromatin-remodeling ATPase INO80

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

INO80 complex subunit B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-related protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

INO80 complex subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A type 1-B/E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B type 1-J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体