7zxe

Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription initiation factor IIB

Homo sapiens

UniProt Q00403

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF2B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–316; UniProt 1–316

TATA-box-binding protein

Homo sapiens

UniProt P20226

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–339; UniProt 1–339

Transcription initiation factor IIA subunit 1

Homo sapiens

UniProt P52655

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF2AA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376

Transcription initiation factor IIA subunit 2

Homo sapiens

UniProt P52657

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2AG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–109; UniProt 1–109

snRNA-activating protein complex subunit 1

Homo sapiens

UniProt Q16533

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNPC1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–368; UniProt 1–368

snRNA-activating protein complex subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q92966

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNPC3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–411; UniProt 1–411

snRNA-activating protein complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q5SXM2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 5 × 1 (O75971) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNPC4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–1469; UniProt 1–1469

snRNA-activating protein complex subunit 5

Homo sapiens

UniProt O75971

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) Non-template strand × 1 TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Template strand × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) snRNA-activating protein complex subunit 1 × 1 (Q16533) snRNA-activating protein complex subunit 3 × 1 (Q92966) snRNA-activating protein complex subunit 4 × 1 (Q5SXM2) ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNPC5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7zxe
沉积日期 deposition_date2022-05-20
结构标题 titleStructure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC)
关键词 keywordsRNA polymerase II, Pol II, PIC, SNAPc, snRNA, U1 promoter, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7zxe__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7zxe__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7zxe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)43.58 Å
Rg(电子密度)43.06 Å
总 Rg43.40 Å
原子数14150
残基数1593
排除体积246070 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7zxe__assembly_1__model_1 decameric (10) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id7zxeM01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
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7. 引用文献 (2)