8av6

CryoEM structure of INO80 core nucleosome complex in closed grappler conformation

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RuvB-like helicase

Thermochaetoides thermophila

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	G0RYI5_CHATD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–462； UniProt 1–462 作者链 B； PDB构建体 1–462； UniProt 1–462 作者链 C； PDB构建体 1–462； UniProt 1–462

RuvB-like helicase

Thermochaetoides thermophila

UniProt G0RYC2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	G0RYC2_CHATD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–488； UniProt 1–488 作者链 E； PDB构建体 1–488； UniProt 1–488 作者链 F； PDB构建体 1–488； UniProt 1–488

PAPA-1 domain-containing protein

Thermochaetoides thermophila

UniProt G0RY01

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	G0RY01_CHATD
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–492； UniProt 1–492

YL1_C domain-containing protein

Thermochaetoides thermophila

UniProt G0S590

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	G0S590_CHATD
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–219； UniProt 1–219

DASH complex subunit DAD4

Thermochaetoides thermophila

UniProt G0S589

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	G0S589_CHATD
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–769； UniProt 98–866

Histone H3.2

Homo sapiens

UniProt Q71DI3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H32_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136 作者链 Q； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103 作者链 R； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103

Histone H2A

Homo sapiens

UniProt A0A8C0K5D3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8C0K5D3_CANLU
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–129； UniProt 2–130 作者链 S； PDB构建体 1–129； UniProt 2–130

Histone H2B type 1-C/E/F/G/I

Homo sapiens

UniProt P62807

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	RuvB-like helicase × 3 （G0RYI5） RuvB-like helicase × 3 （G0RYC2） Ino80 × 1 PAPA-1 domain-containing protein × 1 （G0RY01） YL1_C domain-containing protein × 1 （G0S590） DASH complex subunit DAD4 × 1 （G0S589） DNA × 1 DNA (208-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （Q71DI3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A × 2 （A0A8C0K5D3） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2B1C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–125； UniProt 2–126 作者链 T； PDB构建体 1–125； UniProt 2–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8av6
沉积日期 deposition_date	2022-08-26
结构标题 title	CryoEM structure of INO80 core nucleosome complex in closed grappler conformation
关键词 keywords	chromatin remodeler, INO80, Actin-related protein, DNA binding protein; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8av6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8av6__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8av6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	64.33 Å
Rg（电子密度）	63.01 Å
总 Rg	63.25 Å
原子数	45567
残基数	5289
排除体积	791850 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8av6__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	RuvB-like helicase
分子量 formula_weight	50451.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	45567

MVQISEVRGNTRDHRTAAHTHIKGLGLNSSGIAEKQAAGFVGQCAAREACGVVVDLIKAHKMAGRGVLLAGGPGTGKTALALAISQELGTKIPFCPITGSEIYSTEVKKTEVLMENFRRAIGLRVRETKDVYEGEVTEMTPEEAENPLGGYGKTISTLLIGLKSARGQKKLRLDPSIYEAIQKERVQVGDVIYIETNTGACKRVGRSDAYATEFDLEAEEYVPIPKGEVHKKKEIVQDVTLHDLDVANARPQGGQDIISMMGQLMKPKMTEITDKLRMEINKVVQKYINQGVAELIPGVLFIDEAHMLDIECFTYLNKALESPIAPIVVLASNRGIATIRGADDLKAAHGIPPDFLQRLLIIPTHPYEPDEIRRIVRIRAQTEGVQLTDAAVDRVAEHGVRISLRYCLQLLAPASILARVNGRTQVDVQDIAEAEELFLDARRSANILTSTGESGGLHGFIS

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RuvB-like helicase
分子量 formula_weight	53212.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

MAAPLVTSVTETKELRGLNLIAAHSHIRGLGVDADTLEPRPSSQGLVGQEKARKAAAVVLEMIKQGKIAGRAVLIAGPPSTGKTAIAMGMAQSLGQDVPFTTLAASEIFSLEMSKTEALTQAFRKSIGVRIKEESEIMEGEVVEIQIDRSVTGGAKQGKLTIKTTDMEAIYDMGSKMIDAMTKERVMAGDIISIDKSSGKITKLGRSYARSRDYDAMGVDTKFLQCPEGELQKRKEVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFSGDTGEIRSEIRDQINTKVAEWKEEGKAEIVPGVLFIDEVHMLDIECFSYINRALESDLAPIVIMASNRGVSRIRGTDYKSPHGLPLDFLDRVVIINTHPYTPDELRQILSIRAQEEEVDLTPDALALLTKIGQEAGLRYASNLITTSQLIAAKRRAKQVGVEDVQRSFKLFYDPARSVRFVQESEKRLIGNDGVVDFSYQGAAEAAAPTLPAAAPVDPVGGEKMDMS

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Ino80
分子量 formula_weight	210443.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MDHFPTVLQRPPHFDEDGSAGTGRMRSNVVGNGSSNGARDDRGLRGGLRDILNPVGSASQTMPSASHGGTHSTPGTPGAPAPPRPHSSFSLRSPTQTGNHHASPYSAPTSSAAATSSQQPAGACSMLNNPFVTASTPFPPPPLQAPPSLASSRTSPSGLQHPPRSPLHAPPVYYPSDVRDRDLVRDQQTSLSFYDPTTDSKRDRDRERDRERERTGSDPESGAWSTSTQNSPPKIRDSYNYSRSPSFNNSGNYPSATGSYPPRSPVVRPHPAPPAGSMSPSAGSRTVTSPSLRHLAMPSTHSSQSASTVLPPLARTETPAPSARATPASNTPSRASGVMSFSNILSSSEPISKPRPTSPISLDNNPAMVARTEPAERPDKGEKDKKQSRKIIKTRVSDIKSAESTPKMTRKSAVKPETPTMLRIPTKRTANGSMKHKAFSADKEKTIRDIMDQFDYESIDETEFEDELLAWKERARRRRQEMNRRDFIHRQSRRSDFAETEALKLQIHANLGKARYSDLHYDEALQEVREQELWAEKERKKDMQRKRRREKSMAATLEQQAAALQKASQAEDEAERLKYIREAERANKKVQQTKYILQKGIKGPARNLPPIEPNLEGGTMATFSAENMEPGKVKGKGRGGRLKKSKEQKQAEKEQAELAQAAIDAGEEPPSKEETKIRIKLSKAKASAKEEAEKDKENKEPKQPKEPEKPVEEPKDPLELKFQSKGYNQIYDQIWRDLARKDVSKVFRLATDSYATKASNLKKTAILASKEAKRWQLRTNKGTKDLQARAKRVMRDMMGFWKRNEREERDLRKAAERLELENARKEEADREAARQRRKLNFLISQTELYSHFISKKIKTHEVERSTDHPDVATDEKDKIPEPTLNINVPEPTGPIAPKVTDFNSLDFDNEDESALQAAAMANAQNAIAEAQKKAREFNKDETKLDEDGEMNFQHPELTEFEVAQPKLLNCQLKEYQLKGLNWLVNLYEQGINGILADEMGLGKTVQSISVMAYLAERYDIWGPFLVVAPASTLHNWQQEVSKFVPDFKVLPYWGTAADRKVLRKFWDRKHTTYKKDSPFHVMITSYQLVVSDVAYFQKMKWQYMILDEAQAIKSSQSSRWKCLLGFHCRNRLLLTGTPIQNNMQELWALLHFIMPSLFDSHDEFSEWFSKDIESHAQSNTKLNEDQLKRLHMILKPFMLRRVKKHVQKELGDKIEIDVFCELSYRQRAMYQSLRNQISIMDLIEKATVGDNEDSATLMNLVMQFRKVCNHPDLFERADTSSPFFCGHFAETGSFLREGTNVALGYSTRSLVEYRLPRLIWCDGGRLDKPGPGNLVAGFRSKYLNHMMNIWTPENIRSSLEGIENFTWLRFVDTSLQEAYRASHTDVFARAVDLASKQNRLGHMQIVYDEPEDKKWTPVHALFQICERENPKAVAEITTEGVLRDLMNIARVKYRELGLCRLEKAARPRASAPPIEVVCDSRSAVIERENIMFHPAMRKALFGPTPSEIKEASFGPRPVTLYPPRALLPAPDHDKQRFTNITVPSMARFVTDSGKLAKLDELLRELKEGGHRVLLYFQMTRMIDLMEEYLTYRNYKYCRLDGSTKLEDRRDTVADFQTRPEIFIFLLSTRAGGLGINLTTADTVIFYDSDWNPTIDSQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLITRGTIEERIRKRALQKEEVQRVVITGTGSVDFSGRRPPENRNRDIAMWLADDEQAEMIERREKELIESGEYDKIMQQRRKGGKRKRGAANGDTVPSLEDMYHEGEGHFDDNKGSGAATPVDADSLGRGGKRKKAGGSKKAKTTKQRLAIADGEIDDGEIDIDYKDDDDKGTDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PAPA-1 domain-containing protein
分子量 formula_weight	53346.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSTRPRRHAAQRASQAITDLADRDRESDHSHGPISSRMSSFNSSSRSRLPGKGIASVSRSEAGGASDPEHIHLTVKLPSSKLRQATSSSGIKKAGSVGSSSSSSGGGKAAVKRARGGKRSRVLESSEEEEEENEVEVLGDEDEEEEEEEDEIEVREGEGYDEDEEDVEDEDEEMQDLGEEDADGEDDEMDVDAEGEEDADGDVNMDAGVVGARATTVRAVPPAIKVTKPPKESPSNGKAATASKANDNAVPVKRPAPDSDDESLSSLESEPEEEVNVAGGEDAEGEDDDAEGEVDAEGEEEEEEEEIEVADEDAEGEDVEQDEDEDEEEEDDDDEMISRAQTPDMSRLTARQRARLGEASGEYLKLSDEVQSKKHFTAEELSMRRAEMARRRRNLSEKRNEEIKMETVNKLLKKQAPRTTRRAAQAAAAAEEAEEAAKQPKRPDPMMIRWVNNKMGSVVAVPEELLGTHAGVVFGAGPGKGLPAGKMVEEVS

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	YL1_C domain-containing protein
分子量 formula_weight	23127.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MSNPDAQSAQAAHQALVEQLDLHSIHKTFRNPNWRPNQRRNKTIKAILGESQRKEASSTSAVATPRADDNGGGSGADTPANNDNNDGLSTSGTSTPANGNGSGAGTPASNGQPNLAQASRSLQKLVLEKSLASAQAPDKKAANGFASSAPTATYTNIESAPSLAPMKHYCDVTGLPAPYLDPKTRLRYHNKEIFAMIRNLPQGMGEQFLEARGAHTVLK

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DASH complex subunit DAD4
分子量 formula_weight	87773.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MAPSAVAEPPPIPQRDEPWKRLPPPTVYPVKEARFEKYIPPQLDGRERALAQPPGQVAIVIDNGSHSVRAGWNFEDKPRLAIPPIMSKYRDRKMGKTFSFAGSDCYADTTARSHIRNAFEAGTGIVSNWDVMEHVLDYVFVKLGMNECDGAIDMPIVMTEAVANLPYSRKSMSEIIFECYGAPSLVYGIDSLFSFRHNQGQTGLVVSSSYSATHVIPVYNRKALLSQAIRLNWGGWHMAEYMLKLLKLKYYTGFPGKLNSSQTEHMVRDFCYVSLDYDRELAGYLDWTGLEDRERIVQYPYTEEVVVQKTEEELARIAERKKESGRRLQEQAAKMRLERLMKKEQELEYYKDIQRRMQGESKKEIKRLLDEAELKDEAALERVIRDLERSIKRARQKDLGEPEEEEVPDFSLLDVPDDQLDEAGLRQKRQQRLLKSNWEARQRAKAEKEAEKARLAEEARLDEERRKNDLEGWLEEKRQLRLAKLNQLKERERLKADLGNRKSLASQIRMKNIANLASDNPTGSGSRKRRRGGAGADQDDDFGADDADWGVYRSVAIGANKGDDSDDEEGEEDLEAAIRSLENDLLRYDKTFSYDMTLDAQRDWSKSLLHAFRYGPRPFDPSSQAETHRVHLNVERIRVPEVLFQPAAIAGVDQAGLVEIAGDILCQRLPSLPGIQDAPDAFLRDVFLTGGNTLFQNFDERLRQGLMALLPVGAPLRVRRAQDAILDAWRGAAGWACTEEAKAAWITREEYLEKGGEYIKEHDLGNAFA

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA
分子量 formula_weight	69840.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	K

CTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCATGTATTGAACAGCGACCTTGCCGGTGCCAGTCGGATAGTGTTCCGAGCTCCCACTCTAGAGGATCCCCGGGTACCGA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA (208-MER)
分子量 formula_weight	70347.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	L

TCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTGGGAGCTCGGAACACTATCCGACTGGCACCGGCAAGGTCGCTGTTCAATACATGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Histone H3.2
分子量 formula_weight	15289.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,Q

ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11263.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,R

SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Histone H2A
分子量 formula_weight	13990.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,S

SGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Histone H2B type 1-C/E/F/G/I
分子量 formula_weight	13806.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,T

PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.68 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	16287

CryoEM structure of INO80 core nucleosome complex in closed grappler conformation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RuvB-like helicase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like helicase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PAPA-1 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

YL1_C domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DASH complex subunit DAD4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3.2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B type 1-C/E/F/G/I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8av6__assembly_1__model_1

8av6__assembly_1__model_1 | I(q)

8av6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment