8ent

Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 198.5 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-21

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 2 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 30–162	突变：N68Q	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 30–162	突变：N68Q	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
3	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 1 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 30–162	突变：N68Q	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
4	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 30–162	突变：N68Q	Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8ENT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2OQP Solution structure of human interleukin-21 提交 2007-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–155（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM IL21 U-15N, 20mM phosphate, 50mM NaCl, 1mM NaN3 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8mM IL21 U-15N,13C, 20mM phosphate, 50mM NaCl, 1mM NaN3 \| 100% D2O	分辨率未提供
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 23–155（133 aa）片段：unp RESIDUES 23-155	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273

共 2 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL21_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–133； UniProt 30–162 作者链 D； PDB构建体 1–133； UniProt 30–162 作者链 G； PDB构建体 1–133； UniProt 30–162 作者链 J； PDB构建体 1–133； UniProt 30–162

Interleukin-21 receptor

Homo sapiens

UniProt Q9HBE5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 2 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 20–229	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 20–229	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
3	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 1 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 20–229	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
4	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 20–229	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ENT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3TGX IL-21:IL21R complex 提交 2011-08-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 20–232（213 aa）片段：Interleukin 21 receptor extracellular domain	突变：N78Q, N85Q, N106D, N116Q	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.3 K；1,8-1,9 M di-Ammonium sulphate and 0.1 M Sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.3K	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 5 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
4NZD Interleukin 21 receptor 提交 2013-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 20–232（213 aa）链 B 20–232（213 aa）链 C 20–232（213 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NA SODIUM ION × 10 CL CHLORIDE ION × 22 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；5 mg/ml Protein in 10 mM Hepes, 150 mM NaCl, pH7.5 Crystalized in 1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 3% W/V Peg5000 and 0.1 M tris Ph 8.5. Drops were 1:1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.75 Å R-free 0.275
6PLH FAB fragment complexed with C-mannosylated tryptophan peptide 提交 2019-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 202–232（31 aa）片段：UNP Residues 202-232	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% (w/v) polyethylene glycol 1500, 0.1 M succinate-phosphate-glycine, pH 7.0	分辨率 1.60 Å R-free 0.221
7KQ7 Crystal structure of IL21R in complex with an antibody Fab fragment 提交 2020-11-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–233（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；10% PEG MME 5000 and 0.1M MES, pH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 20–228（209 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242

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UniProt名称	IL21R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–210； UniProt 20–229 作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 20–229 作者链 H； PDB构建体 1–210； UniProt 20–229 作者链 K； PDB构建体 1–210； UniProt 20–229

Cytokine receptor common subunit gamma

Homo sapiens

UniProt P31785

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 2 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 55–254	突变：N53Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 55–254	突变：N53Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
3	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 1 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 55–254	突变：N53Q	Interleukin-21 × 1 （Q9HBE4） Interleukin-21 receptor × 1 （Q9HBE5） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ENT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2B5I cytokine receptor complex 提交 2005-09-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 56–254（199 aa）	突变：N53Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；29% Pentaerythritol Ethoxylate 15/4; 50 mM Ammonium Sulfate; 50 mM Bis Tris, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.269
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 23–255（233 aa）	突变：N58Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 23–255（233 aa）	突变：N58Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
3BPL Crystal structure of the IL4-IL4R-Common Gamma ternary complex 提交 2007-12-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 56–254（199 aa）片段：Extracellular domain, residues 56-254	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；10% PEG8K, 8% ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.93 Å R-free 0.297
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 d 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 g 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 j 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 O 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 U 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 X 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QB7 Interleukin-4 mutant RGA bound to cytokine receptor common gamma 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 55–254（200 aa）片段：UNP residues 55-254	突变：N53Q	SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；100 mM (NH4)2SO4, 100 mM Cacodylate, 20% PEG-3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.292
3QB7 Interleukin-4 mutant RGA bound to cytokine receptor common gamma 提交 2011-01-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 55–254（200 aa）片段：UNP residues 55-254	突变：N53Q	SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；100 mM (NH4)2SO4, 100 mM Cacodylate, 20% PEG-3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.292
4GS7 Structure of the Interleukin-15 quaternary complex 提交 2012-08-27	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 55–254（200 aa）	突变：N75Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；298 K；22.5% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS propane, 0.2M sodium acetate, pH 8.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.227
5M5E Crystal structure of a interleukin-2 variant in complex with interleukin-2 receptor 提交 2016-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 23–262（240 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4 CYS CYSTEINE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES, pH 7.0, 2M ammonium sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.235
6OEL Engineered Fab bound to IL-4 receptor 提交 2019-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 61–249（189 aa）片段：UNP residues 61-249	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；22.5% PurePEG (Microlytic), 0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 0.6 M ammonium nitrate	分辨率 3.10 Å R-free 0.256
7S2R nanobody bound to IL-2Rg 提交 2021-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 55–254（200 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；295 K；2M ammonium sulfate, 0.2M BIS-Tris pH5.5	分辨率 2.49 Å R-free 0.271
8EPA Structure of interleukin receptor common gamma chain (IL2Rgamma) in complex with two antibodies 提交 2022-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 23–262（240 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 55–254（200 aa）片段：residues 55-254	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 55–254（200 aa）片段：residues 55-254	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9JQT Structure of interleukin receptor common gamma chain (IL2Rgamma/CD132) in complex with 2D4 提交 2024-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–262（240 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9KMC Cryo-EM structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 and anti-CD25 Fab S417 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 23–255（233 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å

共 13 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	IL2RG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–201； UniProt 55–254 作者链 F； PDB构建体 2–201； UniProt 55–254 作者链 I； PDB构建体 2–201； UniProt 55–254

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ent
沉积日期 deposition_date	2022-09-30
结构标题 title	Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg
关键词 keywords	IL-21, receptor, complex, signaling, CYTOKINE, CYTOKINE-CYTOKINE RECEPTOR complex; CYTOKINE/CYTOKINE RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	55.58 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	55.88 Å
零角强度 I(0) i0	744706000.00
分子量 molecular_weight	224140.0 kDa
排除体积 excluded_volume	278700 Å³
包络体积 envelope_volume	436790 Å³
水化壳体积 shell_volume	67715 Å³
包络直径 envelope_diameter	211.7 Å
壳层 Rg shell_rg	56.38 Å
包络 Rg envelope_rg	54.14 Å
形状 Rg shape_rg	55.82 Å
总 Rg total_rg	56.09 Å
总原子数 total_atoms	15780
残基数 n_residues	1888
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	198.5 Å
Rg (实空间) rg_real	55.87 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.78 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.4470e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6380e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	55.33 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	744100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8531
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	70.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.429
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.202
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	32080000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.803; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.909; Smooth: 0.769

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Interleukin-21
分子量 formula_weight	16704.0 kDa
突变 mutation	N68Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D,G,J
原子数 atom_count	15852

QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIIQVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDSGAPGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Interleukin-21 receptor
分子量 formula_weight	27465.5 kDa
突变 mutation	N78Q, N85Q, N106D, N116Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E,H,K

CPDLVCYTDYLQTVICILEMWNLHPSTLTLTWQDQYEELKDEATSCSLHRSAHNATHATYTCHMDVFHFMADDIFSVQITDQSGQYSQECGSFLLAESIKPAPPFDVTVTFSGQYQISWRSDYEDPAFYMLKGKLQYELQYRNRGDPWAVSPRRKLISVDSRSVSLLPLEFRKDSSYELQVRAGPMPGSSYQGTWSEWSDPVIFQTQSEEKAASGRGLNDIFEAQKIEWHEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytokine receptor common subunit gamma
分子量 formula_weight	24951.8 kDa
突变 mutation	N53Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F,I

PLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWQSSSEPQPTNLTLHYWYKNSDNDKVQKCSHYLFSEEITSGCQLQKKEIHLYQTFVVQLQDPREPRRQATQMLKLQNLVIPWAPENLTLHKLSESQLELNWNNRFLNHCLEHLVQYRTDWDHSWTEQSVDYRHKFSLPSVDGQKRYTFRVRSRFNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTSKENHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	14

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	55

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	66.167 Å
晶胞边长 b length_b	66.464 Å
晶胞边长 c length_c	162.684 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	83.34 °
晶胞夹角 β angle_beta	83.71 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	73.10 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.830 Å
最低分辨率 resolution_low	48.170 Å
R 因子 r_factor	0.2551
R_work r_work	0.2536
R_free r_free	0.2997

fit	/app/data/saxs_computation/en/8ent/8ent.fit
pddf	/app/data/pr_computation/en/8ent/8ent.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/en/8ent/8ent.dat

Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-21

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Interleukin-21 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cytokine receptor common subunit gamma

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)