8etj

Fkbp39 associated 60S nascent ribosome State 2

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

Protein mak16

OrganismNot specified

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	MAK16_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	3
Chains and sequence ranges	Author chain 3； PDBConstruct 1–302； UniProt 1–302

60S ribosomal protein L3-A

OrganismNot specified

UniProt P40372

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL3A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	4
Chains and sequence ranges	Author chain B； PDBConstruct 1–388； UniProt 1–388

60S ribosomal protein L4-B

OrganismNot specified

UniProt Q9P784

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL4B_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	5
Chains and sequence ranges	Author chain C； PDBConstruct 1–363； UniProt 1–363

60S ribosomal protein L6

OrganismNot specified

UniProt P79071

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL6_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	6
Chains and sequence ranges	Author chain E； PDBConstruct 1–195； UniProt 1–195

60S ribosomal protein L7-B

OrganismNot specified

UniProt P25457

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL7B_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	7
Chains and sequence ranges	Author chain F； PDBConstruct 1–250； UniProt 1–250

60S ribosomal protein L8

OrganismNot specified

UniProt O13672

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL8_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	8
Chains and sequence ranges	Author chain G； PDBConstruct 1–259； UniProt 1–259

60S ribosomal protein L9-A

OrganismNot specified

UniProt Q10232

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL9A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	9
Chains and sequence ranges	Author chain H； PDBConstruct 1–190； UniProt 1–190

60S ribosomal protein L13

OrganismNot specified

UniProt O74175

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL13_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	10
Chains and sequence ranges	Author chain L； PDBConstruct 1–208； UniProt 1–208

60S ribosomal protein L14

OrganismNot specified

UniProt O94238

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL14_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	11
Chains and sequence ranges	Author chain M； PDBConstruct 1–134； UniProt 1–134

60S ribosomal protein L15-A

OrganismNot specified

UniProt O74895

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL15A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	12
Chains and sequence ranges	Author chain N； PDBConstruct 1–201； UniProt 1–201

60S ribosomal protein L16-B

OrganismNot specified

UniProt O42991

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL16B_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	13
Chains and sequence ranges	Author chain O； PDBConstruct 1–197； UniProt 1–197

60S ribosomal protein L17-A

OrganismNot specified

UniProt O14339

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL17A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	14
Chains and sequence ranges	Author chain P； PDBConstruct 1–187； UniProt 1–187

60S ribosomal protein L18-A

OrganismNot specified

UniProt Q10192

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL18A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	15
Chains and sequence ranges	Author chain Q； PDBConstruct 1–187； UniProt 1–187

60S ribosomal protein L19-A

OrganismNot specified

UniProt P05734

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL19A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	16
Chains and sequence ranges	Author chain R； PDBConstruct 1–193； UniProt 1–193

60S ribosomal protein L20-A

OrganismNot specified

UniProt P0CT68

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL20A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	17
Chains and sequence ranges	Author chain S； PDBConstruct 1–176； UniProt 1–176

60S ribosomal protein L23-A

OrganismNot specified

UniProt P0CT60

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL23A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	18
Chains and sequence ranges	Author chain V； PDBConstruct 1–139； UniProt 1–139

Ribosome assembly factor mrt4

OrganismNot specified

UniProt Q9USZ6

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	MRT4_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	19
Chains and sequence ranges	Author chain W； PDBConstruct 1–241； UniProt 1–241

60S ribosomal protein L26

OrganismNot specified

UniProt P78946

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL26_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	20
Chains and sequence ranges	Author chain Y； PDBConstruct 1–126； UniProt 1–126

60S ribosomal protein L28-A

OrganismNot specified

UniProt P36585

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL28A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	21
Chains and sequence ranges	Author chain a； PDBConstruct 1–148； UniProt 1–148

Probable nucleolar GTP-binding protein 1

OrganismNot specified

UniProt O94659

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NOG1_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	22
Chains and sequence ranges	Author chain b； PDBConstruct 1–642； UniProt 1–642

60S ribosomal protein L31

OrganismNot specified

UniProt Q9URX6

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL31_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	23
Chains and sequence ranges	Author chain d； PDBConstruct 1–113； UniProt 1–113

60S ribosomal protein L32-A

OrganismNot specified

UniProt P79015

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL32A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	24
Chains and sequence ranges	Author chain e； PDBConstruct 1–127； UniProt 1–127

60S ribosomal protein L33-B

OrganismNot specified

UniProt Q9USG6

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL33B_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	25
Chains and sequence ranges	Author chain f； PDBConstruct 1–108； UniProt 1–108

60S ribosomal protein L35

OrganismNot specified

UniProt O74904

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL35_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	26
Chains and sequence ranges	Author chain h； PDBConstruct 1–122； UniProt 1–122

60S ribosomal protein L36-B

OrganismNot specified

UniProt O94658

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL36B_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	27
Chains and sequence ranges	Author chain i； PDBConstruct 1–99； UniProt 1–99

60S ribosomal protein L37-B

OrganismNot specified

UniProt P05733

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL37B_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	28
Chains and sequence ranges	Author chain j； PDBConstruct 1–91； UniProt 1–91

Ribosome biogenesis protein nsa2

OrganismNot specified

UniProt Q9UU79

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NSA2_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	29
Chains and sequence ranges	Author chain r； PDBConstruct 1–260； UniProt 1–260

GTPase grn1

OrganismNot specified

UniProt O74791

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	GRN1_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	30
Chains and sequence ranges	Author chain s； PDBConstruct 1–470； UniProt 1–470

Ribosome biogenesis protein rlp24

OrganismNot specified

UniProt Q10353

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RLP24_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	31
Chains and sequence ranges	Author chain u； PDBConstruct 1–192； UniProt 1–192

AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1

OrganismNot specified

UniProt O42832

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	SPB1_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	32
Chains and sequence ranges	Author chain w； PDBConstruct 1–802； UniProt 1–802

Eukaryotic translation initiation factor 6

OrganismNot specified

UniProt O94476

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	IF6_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	33
Chains and sequence ranges	Author chain y； PDBConstruct 1–244； UniProt 1–244

UPF0642 protein C32H8.05

OrganismNot specified

UniProt Q96WW3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q9UUC1） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	YNH5_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	34
Chains and sequence ranges	Author chain z； PDBConstruct 1–117； UniProt 1–117

60S ribosomal protein L21-A

OrganismNot specified

UniProt Q9UUC1

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 33 RNA 2	RNA (1758-MER) × 1 RNA (144-MER) × 1 Protein mak16 × 1 （Q9UTE6） 60S ribosomal protein L3-A × 1 （P40372） 60S ribosomal protein L4-B × 1 （Q9P784） 60S ribosomal protein L6 × 1 （P79071） 60S ribosomal protein L7-B × 1 （P25457） 60S ribosomal protein L8 × 1 （O13672） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （Q10232） 60S ribosomal protein L13 × 1 （O74175） 60S ribosomal protein L14 × 1 （O94238） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （O74895） 60S ribosomal protein L16-B × 1 （O42991） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （O14339） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （Q10192） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P05734） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CT68） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CT60） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （Q9USZ6） 60S ribosomal protein L26 × 1 （P78946） 60S ribosomal protein L28-A × 1 （P36585） Probable nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （O94659） 60S ribosomal protein L31 × 1 （Q9URX6） 60S ribosomal protein L32-A × 1 （P79015） 60S ribosomal protein L33-B × 1 （Q9USG6） 60S ribosomal protein L35 × 1 （O74904） 60S ribosomal protein L36-B × 1 （O94658） 60S ribosomal protein L37-B × 1 （P05733） Ribosome biogenesis protein nsa2 × 1 （Q9UU79） GTPase grn1 × 1 （O74791） Ribosome biogenesis protein rlp24 × 1 （Q10353） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1 × 1 （O42832） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （O94476） UPF0642 protein C32H8.05 × 1 （Q96WW3） ZINC ION × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL21A_SCHPO
Isoform	—
PDB entities	35
Chains and sequence ranges	Author chain T； PDBConstruct 1–160； UniProt 1–160

The page prioritizes protein identity, the current assembly, associated components, oligomeric state and cross-PDB links. Chain mapping and sequence ranges are retained as data evidence. Internal IDs, import timestamps and assembly operation expressions are maintenance fields and are not shown here.

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2. Structure Basics 2. Structure Basics

Entry ID entry_id	8etj
Deposition date deposition_date	2022-10-17
Structure title title	Fkbp39 associated 60S nascent ribosome State 2
Keywords keywords	60S Ribosome, nucleophosmin, ribosome biogenesis, fkbp, ribosome; RIBOSOME
Experimental Method method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

This page reads only the latest assembly calculations. Every curve maps to an explicit PDB entry, official biological assembly and coordinate model.

8etj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

Download this curve (.dat)

8etj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 plotted points; both axes use logarithmic scales.

8etj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) will be calculated and displayed separately for the same assembly/model.

Rg（Guinier）	73.51 Å
Rg (electron density)	74.80 Å
Total Rg	74.62 Å
Atom count	79836
Residues	6940
Excluded volume	1265300 Å³
Maximum q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	Structure unit	Oligomeric description	Status	CRYSOL	Actions
1	1	`8etj__assembly_1__model_1`	35-meric （35）	Success	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	View Download

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4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

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5. Entities and Polymers Entities & Polymers (36)

Entity 1 Entity 1 polymer

Description description	RNA (1758-MER)
Molecular weight formula_weight	1129508.0 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	1
Atom count atom_count	79857

AUUUGACCUCAAAUCAGGUAGGACUACGCGCUGAACUUAAGCAUAUCAAUAAGCGCAGGAAAAGAAAAUAACCAUGAUUCCCUCAGUAACGGCGAGUGAAGCGGGAAAAGCUCAAAUUUGAAAUCUGGCAACAUUUCUUUUGUUGUCCGAGUUGUAAUUUCAAGAAGCUGCUUUGAGUGUAGACGAUCGGUCUAAGUUCCUUGGAACAGGACGUCAGAGAGGGUGAGAACCCCGUCUUUGGUCGAUUGGAUAUGCCAUAUAAAGCGCUUUCGAAGAGUCGAGUUGUUUGGGAAUGCAGCUCUAAAUGGGUGGUAAAUUUCAUCUAAAGCUAAAUAUUGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUAGAGUGAUCGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUUAAAUAGUACGUGAAAUUGCUGAAAGGGAAGCAUUGGAAAUCAGUCUUACCUGGGUGAGAUCAGUAGUCUCUUCGCGAGACUAUGCACUCUGAACCUGUGGUAGGUCAGCAUCAGUUUUCGGGGGCGGAAAAAGAAUAAGGGAAGGUGGCUUUCCGGGUUCUGCCUGGGGAGUGUUUAUAGCCCUUGUUGUAAUACGUCCACUGGGGACUGAGGACUGCGGCUUCGUGCCAAGGAUGCUGACAUAAUGGUUUUCAAUGGCCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAGCAUCUAUGCGAGUGUUUGGGUGAUGAAAACCCAUCCGCGAAAUGAAAGUGAAUGCAGGUGGGAACGCCCUUGUGGCGUGCACCAUCGACCGACCCGGAAGUUUGUCAAUGGAAGGGUUUGAGUAAGAGCAUAGCUGUUGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAAUAGGGUGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGUAGAGAUUCUGACGUGCAAAUCGAUCUUCAAAUUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCAGAAACUCAGAUCAGUUUUAUGAGGUAAAGCGAAUGAUUAGAGGUCUUGGGGAAGGAAUUUCCUCAACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAUGUAAGACGCCCUUGUCGCUUAAUUGGACGUGGGCCAUCGAAUGAGAGUUUCUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGAACGUGAGGUUAAGGUGCCGGAAUGUACGCUCAUCAGACACCAGAAAAGGUGUUAGUUCAUCUAGACAGCAGGACGGUGGCCAUGGAAGUCGGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCUGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCUUAAGCGUACUACCCAUACCUCACCGUCUGGGUUAGCUUUGAGAAGCUCAGACGAGUAGGCAGGCGUGGAGGUUUGUGACGAAGCCUUGGGCGUGAGCCUGGGUCGAACAGCCUCUAGUGCAGAUCUUGGUGGAAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGUGGGGAAAGGUUCCAUGUGAACAGCAGUUGGACAUGGGUUAGUCGAUCCUAAGAGAUAGGGAAGCUCCGUAUGAAAGUUGCACGAUUUUUCGUGCCUCCUAUCGAAAGGGAAUCCGGUUAAUAUUCCGGAACCAGAAGGUGGAAUCAACACGGCAACGUAAAUGAAGUUGGAGACGUCGGCGGGAGCCCUGGGAAGAGUUCUCUUUUCUUUUUAACAAACCAUUGAACUACCCUGAAAUCGGUUUAUCCGGAGCUAGGGUAUGGUGUUUGGAAGAGUUCAGCGCCUCAUGCUGAAUCCGGUGCGCUCUCGACGGCCCUUGAAAAUCCAACGGAAGAAUGGACCUUCGGGUCCUUGUUUUCACAUCUGGUCGUACUCAUAACCGCAGCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUAGUUGAUAGAACAAUGUAGAUAAGGGAAGUCGGCAAAAUGGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUAAGGGUUGGGUACGUUGGGCCUUGGAACCUGAACGGUUGCUGGACUGAGCGUGGACCGAUGUCUUUUCUCGCCUUUCGGGGUGAGAAGGGAUGUUGGACCUGCUUGGACCUUGGCGGCCGGGAAGUCCUUGGUCGGGCUUUUCUCCUUCUCGGGGAUUAUGCUCUUACUGGCGUACGUUUAACAACCAACUUAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCUGACUGUCUAAUUAAAACAUAGCAUUGCGAUGGCCAGAAAGUGGUGUUGACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAACUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAAACCACAGCCUGGGGAACGGGCCAGGCAAAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGACAUUGUGAAGAGACAUAGAGGGUGUAGGAUAAGUGGGAGUAUGUUUCGGCAUACGCCGGUGAAAUACCACUACCUUUAUCGUUUCUUUACUUAAUCAAUGAAGCGGAAUUGGGAUUUAUUUCCCAUAUUCUAGCGUUAAAGUUUCUUCGCGAACUGAUCCGCGUUGAUGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCACAUCUGUUAAAAGAUAACGCAGGUGUCCUAAGGGGGACUCAUCGAGAACAGAAAUCUCGAGUAGAAUAAAAGGGUAAAAGUCCCCUUGAUUUUGAUUUUCAGUGUGAAUACAAACCAUGAAAGUGUGGCCUAUCGAUCCUUUGUUCCCUCGAAAUUUGAGGACAGAGGUGCCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUACCGAAGCAGAAUUCGGUAAGCGUUGGAUUGUUCACCCACUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAGUGUCGUCGCAAUGGUAAUUCAACUUAGUACGAGAGGAACCGUUGAUUCAGAUCAUUGGUAUUUGCGGCUGCCUGACAAGGCAAUGCCGCGGAGCUAUCAUCUGCUGGAUAACGGCUGAACGCCUCUAAGCCAGAAUCCGUGCCAGAAAGCGACGAUUUUUUGGUCCGCAUGAUUUAUAUGUAUAAAAAUAGAGGUAGGACUUGUUCCUACUCUCCUGUAUCGUAGAAGAUGGGCGAUGGUUGAUGAAACGGAAGUGUUUUAUUGACUUGUCCAUGAAAUUCCAUUGAAAUCUUGUGCGGAAUCGAAUCCAUUGCAUACGACUUUAAUGUGGAACGGGGUAUUGUAAGCAGUAGAGUAGCCUUGUUGUUACGAUCUGCUGAGAUUAAGCCUUUGUUCCCAAGAUUUG

Entity 2 Entity 2 polymer

Description description	RNA (144-MER)
Molecular weight formula_weight	52880.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	2

AUUAUUUAAAACUUUCAGCAACGGAUCUCUUGGCUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCUUUGGGUUCUACCAAAGGCAUGCCUGUUUGAGUGUCAUU

Entity 3 Entity 3 polymer

Description description	Protein mak16
Molecular weight formula_weight	35686.9 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	3

MQQDEVIWQVVGHEFCSYRIKGEAQNFCRNEYNVTGLCNRQSCPLANSRYATVREDNGKLYLYMKTIERAHFPSKLWQRIKLSKNYAKALEQIDQQLLYWPGRQIHRCKQRLTRLTQYLLKARRLALKHQPALIPIKPKQAHREASRERKALIAAKLEKNIEKELVKRLKSGVYGDQPLNVNEEIWNKVLAAREGLIDEGEEEEEREEAELEFVSDDEDEEEISDLEDWLGSDQSMETSESEEEESSESESDEDEDEDNKGKIRKRKTDDAKKSRKKRAPHIHIEYEQERENEKIPAVQHSW

Entity 4 Entity 4 polymer

Description description	60S ribosomal protein L3-A
Molecular weight formula_weight	43889.8 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	B

MSHCKFEQPRHGSLGFLPRKRASRQRGKVKAFPKDDASKPVHLTAFLGYKAGMTHIVRDLDRPGSKMHKREILEAVTVIETPPMVVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSEEVKRRFYKNWFKSKKKAFTKYAKKYAESTQSINRELERIKKYCSVVRVLAHTQIRKTPLAQKKAHLMEIQVNGGSVADKVEWAREHFEKTVDIKSTFEQNEMIDVIGVTRGKGNEGTTARWGTKRLPRKTHRGLRKVACIGAWHPANVQWTVARAGNAGYMHRTQLNSKIYRIGAGDDAKNASTDFDATEKRITPMGGFVRYGVVENDFVMLNGATPGPVKRVLTLRKSLLTHTSRKALEPVSLKWIDTASKFGHGRFQTPAEAKQFLGTLKKDVA

Entity 5 Entity 5 polymer

Description description	60S ribosomal protein L4-B
Molecular weight formula_weight	39982.3 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	C

MAAARPTVSIYNKDGSVSSETLALPFVFKAPIRPDLVRSVHTAVAKNKRQPYAVSEKAGHQTSAESWGTGRALARIPRVGGGGTHRSGQAAFGNMCRSGRMFAPTKTWRKWHVKVNQNEKRYAIASAVAASGVPSLLLARGHRIEEIPEVPLVVDDAVQSFQKTKEAVALLKEIKAYRDVIKVANSRKLRAGKGKLRNRRHVQRRGPLVVFNEDTGIVKAFRNIPGVEIVNVRRLNLLQLAPGGHLGRFVIWTKSAFGLLDSVFGSTTEVAQLKKNYFLPENIISNADVTRLINSDEIQSIVKAAGPSRVKRAHVQKKNPLKNKAVLSRLNPYAKAYKANVKINSEKTPKAAGEKFLSVLHEN

Entity 6 Entity 6 polymer

Description description	60S ribosomal protein L6
Molecular weight formula_weight	21286.0 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	E

MSTVKVNGAKNGGERMVLPAGEAAAKYYPAYRENVPKKARKAVRPTKLRASLAPGTVCILLAGRFRGKRVVVLSQLEDTLVVTGPYKVNGVPIRRVNHRYVIATSAPKIDVSGVSVEKFTKAYFAKQKRSGPVKKDEAFFAENAPKNALPAERIADQKAVDAKLLPAIKAIPNMKEYLAASFALSNGDRPHLMKF

Entity 7 Entity 7 polymer

Description description	60S ribosomal protein L7-B
Molecular weight formula_weight	28499.3 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	F

MVASSTVPSVASIFAPESLLKKTKAQKQSREQIVAAAAEKKSARQKKRELIAKRAEAYEAEYRAAEREQIELARKARAEGNYFVPHEPKLIFVVRIRGINNIPPKARKIMQLLRLLQINNGIFVKFNKAIKEMLQVVEPYVTYGIPNHKTVRELIYKRGFGKVNKQRIPLSDNAIIEAALGKYSILSVEDLIHEIYTVGPNFKQAANFLWPFKLSSPLGGWRERKFKHFIEGGDAGKRDEHINGLVQKML

Entity 8 Entity 8 polymer

Description description	60S ribosomal protein L8
Molecular weight formula_weight	28659.8 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	G

MAPKSKKVAPSPFAQPKAAKTTKNPLFVSRPRSFGIGQDIQPKRDLSRFVKWPEYIRLQRRRKILNLRLKVPPAIAQFQKTLDKNTATQVFKLLNKYRPETAAEKKQRLVAEAEAVANGKSAQDVSKKPYNVKYGLNHVVALIEAKKAKLVLIASDVDPIELVVFLPALCKKMGVPYAIVKNKARLGTVIHQKTAAVLAVTEVREEDKNELASIVSAVDANFSAKYDESRRKWGGGIMGGKTQALLAKRAKAAAATVRL

Entity 9 Entity 9 polymer

Description description	60S ribosomal protein L9-A
Molecular weight formula_weight	21545.0 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	H

MGRDIYKDETLTIPKGVTVDIKARNVTVTGPRGTLKQNLRHVDIEMKKQGNTIKFIVWHGSRKHNACIRSVYSIINNMIIGVTQGFRYKMRLVYAHFPININLTENGTVVEIRNFLGERITRVIKCLPGVTVSISSAVKDEIILEGNSLENVSQSAANIKQICNVRNKDIRKFLDGIYVSERGNIEELEE

Entity 10 Entity 10 polymer

Description description	60S ribosomal protein L13
Molecular weight formula_weight	23578.1 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	L

MAIHVKGQLPNAHFHKDWQRYVKTWFNQPGRKLRRRQARQTKAAKIAPRPVEAIRPAVKPPTIRYNMKVRAGRGFTLEELKAAGVSRRVASTIGIPVDHRRRNRSEESLQRNVERIKVYLAHLIVFPRKAGQPKKGDATDVSGAEQTDVAAVLPITQEAVEEAKPITEEAKNFNAFSTLSNERAYARYAGARAAFQKKRAEEAEAKKK

Entity 11 Entity 11 polymer

Description description	60S ribosomal protein L14
Molecular weight formula_weight	15241.1 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	M

MEGFKRYVEVGRVVLVTKGEYTGKLAVIVDIVDHKRALIDSPCSEFPRQVIRYGSVVLTHIVMKLPRGARSGIVAKKWKAQDVCNKWASSAWAKKLEAKKVRSQLNDFDRFAVMRLKKQRREQVNVAVAKALKA

Entity 12 Entity 12 polymer

Description description	60S ribosomal protein L15-A
Molecular weight formula_weight	23862.6 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	N

MGAYKYLEELAKKKQSDVNLFLSRVRAWEYRQMNVIHRASRPSRPDKARRLGYKAKQGYVIYRIRVRRGGRKRPVPKGQTYGKPVHQGVNHLKYQRSARCTAEERVGRYCSNLRVLNSYWVNQDATYKFFEVILVDPSHKAIRRDPRINWIVNPVHKHRESRGLTSIGKKSRGIGKGHRFNNSPQHATWLRHNTLSLRRYR

Entity 13 Entity 13 polymer

Description description	60S ribosomal protein L16-B
Molecular weight formula_weight	22215.3 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	O

MSEFQKVVVIDAKGHLLGRLASVVAKQLLGGQKVVVVRCEELNISGHFFRNKLKYLAYLRKACRYNPSRGAFHFRAPSRIFQKAVRGMLPHKTARGQAALEHLQAVEGIPPPFDKQKRVVVPAALRVLRLKPGRKYCTVGRLSSEVGWKYNDIVAKLEERRKVKSAAFYQAKLAKQKKIASAKEASPVNQKLSQFGY

Entity 14 Entity 14 polymer

Description description	60S ribosomal protein L17-A
Molecular weight formula_weight	20854.1 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	P

MVRYSASPALETKCAKARGAYLRTHFKNSREVAFTINGMSLKKAFIFLDNVKEHKQAVPFRRFNGGVGRTAQGKEFGVTQARWPVKSVKFFYDLLKNAEANAEAKGLDMDKLIIKHVQVNAAPKQRRRTYRAHGRVTAYLSSPSHIEIIVAEEEEAVPKANDTVSRVSLKQGAKARNLAARKAITAA

Entity 15 Entity 15 polymer

Description description	60S ribosomal protein L18-A
Molecular weight formula_weight	21240.9 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Q

MGIDIERHHVKKSQRSKPASENVYLKLLVKLYRFLARRTDSRFNKAILKRLFQSKTNRPPISISKIAALTSRKSASSQNKTTVVVGTVTDDERMLTVPKLSIAALRFTKSARARILKAGGEVLTLDQLALRAPTGSNTVLVRGKKHAREAYRHFGFGPHKHKAPYVRSEGRKFERARGRRKSRAFKV

Entity 16 Entity 16 polymer

Description description	60S ribosomal protein L19-A
Molecular weight formula_weight	22783.8 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	R

MANLRTQKRLAASVLKCGKRKVWMDPNEISEISNANSRQNVRKLIKDGLVIRKPNLMHSRFRIRKTHAAKRLGRHTGYGKRKGTAEARMPSAVVWMRRQRVLRRLLRKYRESGKIDKHLYHTLYLEAKGNTFKHKRALIEHIQRAKAEANRTKLIQEQQDARRARAKAARQRRAKAVEEKREQLYTAAEKIEE

Entity 17 Entity 17 polymer

Description description	60S ribosomal protein L20-A
Molecular weight formula_weight	20642.3 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	S

MALKEYQVVGRKVPTEHEPVPKLFRMRLFAPNESVAKSRYWYFLKMINKVKKATGEIVAINEISEPKPLKAKVFGIWIRYDSRSGTHNMYKEFRDTTRVGAVEAMYADMAARHRARFRSIRILKVVEVEKKEDVRRNYVKQLLNPHLKFPLPHRRTGVVGLAGKKVFAPHRPSTFY

Entity 18 Entity 18 polymer

Description description	60S ribosomal protein L23-A
Molecular weight formula_weight	14905.5 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	V

MSRGRGAASGTKYRMTLGLPVQAIMNCADNSGAKNLYIVSVFGTGARLNRLPAASCGDMVLATVKKGKPDLRKKIMPAIVVRQRKAWRRKDGVYLYFEDNAGVIVNPKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGTVV

Entity 19 Entity 19 polymer

Description description	Ribosome assembly factor mrt4
Molecular weight formula_weight	26698.7 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	W

MPKSRRSKVLTLAQTEKKGHEGKAALFSGVQQSLDSFDYMWIFDVTNMRNTYLKRIRDDWKGSRIFMGKTKVMAKALGHTPEEEHAENVSKLTKLLHGAVGLLFTNSKPDEVIGYFESFVQNDFARAGAVAPFTHVIPAGPVYSRAGQIPVEDDILLTHTLEPQVRQLGMPTVLKNGVVTLLADFPLCTEGQQLDSRQTRLLKLFGITAAEFKVGLLGYYSKKGASVEFLQSAPGADEAME

Entity 20 Entity 20 polymer

Description description	60S ribosomal protein L26
Molecular weight formula_weight	14375.9 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Y

MKFSRDVTSSRRKQRKAHFGAPSSVRRVLMSAPLSKELREQYKIRSLPVRRDDQITVIRGSNKGREGKITSVYRKKFLLLIERVTREKANGASAPVGIDASKVVITKLHLDKDRKDLIVRKGGKVE

Entity 21 Entity 21 polymer

Description description	60S ribosomal protein L28-A
Molecular weight formula_weight	16691.5 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	a

MPTHVSKTRKLRGHVSAGHGRIGKHRKHPGGRGKAGGLQHLRSHFDKYHPGYFGKVGMRRFHLMKNPLWRPTVNLDRLWTLLPNEARDKYLGKNTEVAPVINVLQSGYGKVLGKGRLPETPVIVQTRYVSRRAEEKIKQAGGVVELIA

Entity 22 Entity 22 polymer

Description description	Probable nucleolar GTP-binding protein 1
Molecular weight formula_weight	72915.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	b

MATAVFKNITPIPDVNTFLDVVLSRTQRKTPTVIRSGFKISRIRGFYGRKVKFTQDTITEKLDSILQEFPKLNDIHPFHADLLNILYDRDHLKIALSQLSTAKHLVENVARDYIRLLKYGDSLYRCKQLKRAALGRMATIIKRQKSSLEFLEQVRQHLSRLPAIDPNTRTLLVCGYPNVGKSSFMNKVTRAQVDVQPYAFTTKSLFVGHFDYKYLRWQVIDTPGILDHPLEQMNTIEMQSITAMAHLRSAVLYFMDLSEMCGYSVAAQVKLYHSIKPLFANKVTILVLNKIDAMRPEDLDQKNQELLQTIIDDGNVKVVQTSCVQDIGVMDVRTTACEALLAARVEQKLKGSRVNNVLNRIHLAEPAARDEVARPACIPDSVKTRRAYDANDPNRRILARDIEAANGGAGVYNVELRDKYILQDPSWKYDRMPELLDGKNVADFVDPEIEAKLLALDEEEERLEREGYYDSDQEIEDADEEEVLEKASRIREKNKLTMLAARQKKIKNRPVLPRTAGIRTLDELQSSLQSAGLPSDSIEERARSRARTAAANEMADGSGVDLLMNEGEEIRSKSIAPRSQSNRRESGVHAEGARSYADRLARVKQIHRNRMARASESDRHVIAAKPKHLLSGKRGNGKTQRR

Entity 23 Entity 23 polymer

Description description	60S ribosomal protein L31
Molecular weight formula_weight	13290.5 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	d

MANTKKSAINQVVTRDYTIHMHKRLYGVSFKKRAPRAIKEIVAFAQKHMQTKEVRVDPSLNKEVWKRGIRNVPHRLRLRLSRKRSDEDDKALYTYVQAVDVANPKMETTVVEE

Entity 24 Entity 24 polymer

Description description	60S ribosomal protein L32-A
Molecular weight formula_weight	14491.1 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	e

MAAVNIIKKRTKPFKRHQSDRFKRVGESWRKPRGIDSCVRRRFRGTISMPKIGYGNNKKTRYCMPNGLKAFLVRNVSDVELLLMHNKTYAAEIAGNVSARKRVEIVEKARALGVKVTNAGAKVRSQE

Entity 25 Entity 25 polymer

Description description	60S ribosomal protein L33-B
Molecular weight formula_weight	12133.2 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	f

MPAQGHRLYVKAKHLSFQRSKHVIHPGTSIVKIEGCDSKEEAQFYLGKRVCYVYKSSKAVRGSKIRVIWGTIARPHGNSGAVRARFVHNLPAKTFGSSLRVMLYPSNI

Entity 26 Entity 26 polymer

Description description	60S ribosomal protein L35
Molecular weight formula_weight	14333.9 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	h

MALKTFELRKQSQENLAEQLQELRQELASLRVQKIAGGSGSKLSKIKTTRKDIARILTVINESNRLAAREAYKNKKYIPLDLRQKKTRAIRRALTPYEQSRKTLKQIKKERYFPLRKYALKA

Entity 27 Entity 27 polymer

Description description	60S ribosomal protein L36-B
Molecular weight formula_weight	11287.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	i

MAPGLVVGLNKGKTLTKRQLPERPSRRKGHLSKRTAFVRSIVREVAGFAPYERRVMELIRNSQDKRARKLAKKRLGTLKRAKGKIEELTSVIQSSRLAH

Entity 28 Entity 28 polymer

Description description	60S ribosomal protein L37-B
Molecular weight formula_weight	10112.8 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	j

MTKGTQSFGMRHNKSHTICRRCGKRSFHIQKSTCACCGYPAAKTRSYNWGAKAKRRRTTGTGRMSYLKKVHRSFKNGFRSGKPAAAVAASA

Entity 29 Entity 29 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein nsa2
Molecular weight formula_weight	29765.5 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	r

MPQNEYIEESIRKHGRRFDHEERKRKKAAREAHDASLYAQKTRGIKAKLYQEKRRKEKIQMKKTIKQHEERNATQRGSDAQTQGAVPTYLLDREQESQAKMLSSAVKQKRKEKAAKYSVPLPQVRGVAEEEMFKVIRTGKSKKNSWKRMITKATFVGDGFTRRPVKYERFIRPMALRQKKANVTHKELGVTMQLPIIGVKKNPQSPTYTQLGVLTKGTVIEVNVSELGLVTSGGKVVWGKYAQITNNPELDGCVNALLLT

Entity 30 Entity 30 polymer

Description description	GTPase grn1
Molecular weight formula_weight	52510.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	s

MVSLKKKSKRRTTRLRSRIEKKAAESKRKQKRADKKNPQWKSRIPKDPGIPNSFPYKDKILAEIEEQKRIREEEKLARRASGQVDAAMEEEDAVDENGSLMISKIAEAAQASNPDDEEEFVMEEDNLGEAPLLVDSESYEASVKADTSRKAYDKEFKKVVEASDVILYVLDARDPEGTRSKDVERQVLASSAEEKRLIFVINKIDLVPSEVLNKWVTYLRNFFPTIPMRSASGSGNSNLKHQSASASSTISNLLKSLKSYSAKKKLKSSLTVGVIGYPNVGKSSVINALVNRSANGRSAPCPAGNVAGMTTSLREVKLDNKLRLVDSPGIVFPSSDSKDDLYRLVMLNAVSSTKVDDPVAVASYILQFLSRVPGQLERMFQRYELPPLLNTSDIDTATDFLVNIARKRGRLGRGGIPNLNAAANIVINDWHAGRIEWWAEPEVINEKNSSEVQDTQIVTEWAKEFDLNDF

Entity 31 Entity 31 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein rlp24
Molecular weight formula_weight	22323.9 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	u

MRVHTCYFCSGPVYPGHGIMFVRNDSKVFRFCRSKCHKNFKMKRNPRKVAWTKAYRKAHGKEMVYDTALAVTAARRNVPVRYDRNVIATTLNAMKRVSQVHAKRERLFYKKRLAGKRAQELQEAQKLIAQNVPQFTEPEGEVETAEVQEPQIVSDEEYTMEEEVAEPVKIPVLAKKRKNKKSRNSSSAMQMD

Entity 32 Entity 32 polymer

Description description	AdoMet-dependent rRNA methyltransferase spb1
Molecular weight formula_weight	91055.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.-
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	w

MGKSQKKTAKGRLDKWYKLAKEQGYRSRAAFKLVQLNQKYSFLEKAKVIIDLCAAPGGWLQVASKTCKPGSLIVGVDLAPIKPIPNCHTFVEDITSDKCRSQLRGYLKTWKADVVLHDGAPNVGSAWLQDAYGQAQLVLMSMKLACEFLVAGGTFVTKVFRSRDYNNLLWVFKQLFNKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGYKAPKKLDPRFTDPRTVFEEVQEPVTNVDAKVFHPEKRKRSREGYADDDYTLHKTVLASEFVTANDPIQILGTSAEIVFPKDDEECQRLYNLDVTTEEILLCCSDLQVLGKKEFRDILRWRLKIRDEMGIGKKVEDEQKTVVEEIPEMDEEERLDQELQDLSEAERVKLKRERRKANQRKQREIVRMQMGMLAPMDIGLEHEAMGEDSLFGLATAEKHGLKELENGTLPVTESVDEEVSTDNEVEYDSDDERDRLEADLDSMYSDYTKRKAESDVKYRVKKARGDLDDEEWNGIDNGTESDDSQIAETNFATPDKDRLTTSLLDKGSTKDGLSRKARMFFDQDIFDGIEDADADVEIMSMNRAAIKKREAELASQNNDDGSKGDQSEDSNDHIEVVPVASAHDEDDDWNSDSDNDENNVEIVTAEAMTLAQDIASRRKSKADLIDEGYNRWSFQSKEGLPDWFLDEETTVNKPNKPITKEAVLALREKMKALNARPIKKVLEAQGRKKMRTIKRLQRVAKKAEGISESGDMTESEKAKEISRLVSRATKSKPKAKPTLVVAKGPNKGLKSRPKGVKGKYKMVDSRMKKDLRAQKRLAKKGRR

Entity 33 Entity 33 polymer

Description description	Eukaryotic translation initiation factor 6
Molecular weight formula_weight	26251.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	y

MALRAQFENSNEIGVFSNLTNSYALVALGGSENFYSVFEAELGDVVPVVHTTIGGTRIIGRLTCGNRKGLLVPSSTTDNELQHLRNSLPDPVKIQRVDERLSALGNIVACNDYVALVHPDIERETEEIIADVLDVEVFRQTVAGNVLTGSYCALSNQGALVHPRTSIQEQDELSSLLQVPLVAGTINRGSDVIGAGLVVNDWCAFAGLDTTATELAVCESIFKLQDAQPSAIISNRDTLVESYT

Entity 34 Entity 34 polymer

Description description	UPF0642 protein C32H8.05
Molecular weight formula_weight	13328.2 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	z

MAKSARSKSIRRNKKVLRENVFQPVIDERTKRLSAHLRDQVNDLTKSSSSKEEGIADNSLKEVSSSEVSDNVGMEVDQPKVSTSGPRDNNRNKWAKKHLKKGKRAKNSNFSKFLKKK

Entity 35 Entity 35 polymer

Description description	60S ribosomal protein L21-A
Molecular weight formula_weight	18418.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	T

MPHSYGIRARTRYTFQRGFREHGQIRLSTYLKTYKVGDIVDIKVNGAVQKGMPHKYYHGKTGVVYNVTQSSVGVLIYKVVGNRYMEKRVNVRIEHVKHSKCRQDFLDRVKANEAKRKEAKAQGKTVQLRRQPAPPAKAHFVSTENNEPVTLHPVAYDTTI

Entity 36 Entity 36 non-polymer

Description description	ZINC ION
Molecular weight formula_weight	65.4 kDa
Source method src_method	syn
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▼

6. Fold Classification (SCOP + CATH) 7 domains

CATH v4.4 (7 domains)

Domain ID domain_id	8etj301
Class class	3 — Alpha Beta
Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
Topology topology	390 — Enolase-like; domain 1
Homologous superfamily homologous superfamily	110 —

Domain ID domain_id	8etjN01
Class class	3 — Alpha Beta
Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
Topology topology	1120 — Ribosomal protein L15e
Homologous superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L15

Domain ID domain_id	8etjR01
Class class	1 — Mainly Alpha
Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
Topology topology	1650 — 50s Ribosomal Protein L19e, Chain O, domain 1
Homologous superfamily homologous superfamily	10 —

Domain ID domain_id	8etjW01
Class class	3 — Alpha Beta
Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
Homologous superfamily homologous superfamily	1730 — Ribosomal protein L10, N-terminal RNA-binding domain

Domain ID domain_id	8etjW02
Class class	3 — Alpha Beta
Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
Topology topology	105 — Molybdopterin biosynthesis moea protein, domain 2
Homologous superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L10, N-terminal fragment, domain II

Domain ID domain_id	8etjb01
Class class	1 — Mainly Alpha
Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
Homologous superfamily homologous superfamily	1190 —

Domain ID domain_id	8etjb02
Class class	3 — Alpha Beta
Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
Topology topology	50 — Rossmann fold
Homologous superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

▶

Unit-cell length a length_a	1.000 Å
Unit-cell length b length_b	1.000 Å
Unit-cell length c length_c	1.000 Å
Unit-cell angle α angle_alpha	90.00 °
Unit-cell angle β angle_beta	90.00 °
Unit-cell angle γ angle_gamma	90.00 °
Molecules per unit cell Z z_pdb	—

Space group space_group	P 1
Space-group number int_tables_number	1
Crystal system crystal_system	—

Resolution resolution	3.20 Å
Resolution测定Method resolution_method	—
颗粒数 num_particles	22000

Fkbp39 associated 60S nascent ribosome State 2

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

Protein mak16

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L3-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L4-B

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L6

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L7-B

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L8

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L9-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L13

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L14

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L15-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer