9phc

In vitro reconstituted complex of purified S. pombe large ribosomal subunit and SNOR

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 283.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9phc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9phc
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9phc
沉积日期 deposition_date2025-07-09
结构标题 titleIn vitro reconstituted complex of purified S. pombe large ribosomal subunit and SNOR
关键词 keywords60S, RIBOSOME, large subunit, SNOR, pombe, Yeast, Hibernating, Glucose; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier76.07
回转半径 Rg (电子) rg_electron77.18
零角强度 I(0) i096918000000.00
分子量 molecular_weight1814000.0 kDa
排除体积 excluded_volume1923200 ų
包络体积 envelope_volume3168100 ų
水化壳体积 shell_volume309980 ų
包络直径 envelope_diameter255.8
壳层 Rg shell_rg91.87
包络 Rg envelope_rg77.10
形状 Rg shape_rg77.22
总 Rg total_rg77.16
总原子数 total_atoms122816
残基数 n_residues9665
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax283.2
Rg (实空间) rg_real79.06
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.54
I(0) (实空间) i0_real9.6920e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.9800e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal76.90
I(0) (倒空间) i0_reciprocal97130000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8799
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary94.4
偏度 Skewness skewness0.529
峰度 Kurtosis kurtosis0.358
角度范围 angular_range— – 0.1050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9121
最高正则化参数 α highest_alpha15540000000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.648; Stabil: 0.904; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.947; Smooth: 0.911

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (45)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)