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8g1q

Co-crystal structure of Compound 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 101.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription activator BRG1

Homo sapiens

UniProt P51532

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1447–1569 未记录 Elongin-B × 1 （Q15370） Elongin-C × 1 （Q15369） von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 （P40337） NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5 分辨率 3.73 Å R-free 0.326

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8G1Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2GRC 1.5 A structure of bromodomain from human BRG1 protein, a central ATPase of SWI/SNF remodeling complex 提交 2006-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1448–1575（128 aa） 片段：bromodomain, residues 1448-1575
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris, 25% w/v PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298.0K
分辨率 1.50 Å R-free 0.264
2H60 Solution Structure of Human Brg1 Bromodomain 提交 2006-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1452–1570（119 aa） 片段：Bromodomain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1
NMR样品组成 1mM Brg1 bromodomain U-15N, 13C; 25mM phosphate buffer; 100mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3UVD Crystal Structure of the bromodomain of human Transcription activator BRG1 (SMARCA4) in complex with N-Methyl-2-pyrrolidone 提交 2011-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1448–1569（122 aa） 片段：unp residues 1448-1569
未记录 MB3 1-methylpyrrolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；28% MMW PEG smear 0.1M Tris.HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.262
5DKD Crystal structure of the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) in complex with PFI-3 chemical probe 提交 2015-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1418–1536（119 aa） 片段：UNP residues 1418-1536
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 5BW (2E)-1-(2-hydroxyphenyl)-3-[(1R,4R)-5-(pyridin-2-yl)-2,5-diazabicyclo[2.2.1]hept-2-yl]prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.2, 0.1 M ammonium acetate, 0.1 M ZnCl2, 15% PEG smear high (mixture from PEG8k to 20k)
分辨率 2.00 Å R-free 0.297
5DKD Crystal structure of the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) in complex with PFI-3 chemical probe 提交 2015-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1418–1536（119 aa） 片段：UNP residues 1418-1536
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 5BW (2E)-1-(2-hydroxyphenyl)-3-[(1R,4R)-5-(pyridin-2-yl)-2,5-diazabicyclo[2.2.1]hept-2-yl]prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.2, 0.1 M ammonium acetate, 0.1 M ZnCl2, 15% PEG smear high (mixture from PEG8k to 20k)
分辨率 2.00 Å R-free 0.297
5EA1 Crystal Structure of SMARCA4 bromodomain in complex with MPD 提交 2015-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1451–1580（130 aa） 片段：Bromodomain, UNP residues 1451-1580
未记录 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG1000 (12.5%), PEG3350 (12.5%), MPD (12.5%)
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
5EA1 Crystal Structure of SMARCA4 bromodomain in complex with MPD 提交 2015-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1451–1580（130 aa） 片段：Bromodomain, UNP residues 1451-1580
未记录 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG1000 (12.5%), PEG3350 (12.5%), MPD (12.5%)
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
5EA1 Crystal Structure of SMARCA4 bromodomain in complex with MPD 提交 2015-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1451–1580（130 aa） 片段：Bromodomain, UNP residues 1451-1580
未记录 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG1000 (12.5%), PEG3350 (12.5%), MPD (12.5%)
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1416–1535（120 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1416–1535（120 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6LTH Structure of human BAF Base module 提交 2020-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ZS2 Crystal Structure of the bromodomain of human transcription activator BRG1 (SMARCA4) in complex with 2-(6-amino-5-(piperazin-1-yl)pyridazin-3-yl)phenol 提交 2020-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1418–1536（119 aa）
未记录 FX5 2-(6-azanyl-5-piperazin-4-ium-1-yl-pyridazin-3-yl)phenol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystallization buffer: 20% medium-molecular-weight PEG smear, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.57 Å R-free 0.215
6ZS2 Crystal Structure of the bromodomain of human transcription activator BRG1 (SMARCA4) in complex with 2-(6-amino-5-(piperazin-1-yl)pyridazin-3-yl)phenol 提交 2020-07-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1418–1536（119 aa）
未记录 FX5 2-(6-azanyl-5-piperazin-4-ium-1-yl-pyridazin-3-yl)phenol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystallization buffer: 20% medium-molecular-weight PEG smear, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.57 Å R-free 0.215
7VDT The motor-nucleosome module of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 A 160–1614（1455 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 A 160–1614（1455 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Y8R The nucleosome-bound human PBAF complex 提交 2022-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8EB1 Chim2 - Intragenic antimicrobial peptide 提交 2022-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 874–878（5 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）PBS 10 mM；压力 1
NMR样品组成 1.28 mM peptide, 32 mM D-98% Dodecylphosphorylcholine-d38, 10 mM PBS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1418–1536（119 aa） 片段：UNP residues 1418-1536
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1418–1536（119 aa） 片段：UNP residues 1418-1536
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1448–1569（122 aa） 片段：UNP residues 1448-1569
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 I 1–1647（1647 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9UX9 local ATPase-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the ADP-BeFx-bound state 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 K 2–1647（1646 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 K 2–1647（1646 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9UXB The apo structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 446–517（72 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9UXC The ADP-bound structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 446–517（72 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1614（1614 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9WC1 The structure of ARP module in ncBAF complex 提交 2025-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–1614（1614 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 25 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMCA4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 2–124； UniProt 1447–1569

Elongin-B

Homo sapiens

UniProt Q15370

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–104 未记录 Transcription activator BRG1 × 1 （P51532） Elongin-C × 1 （Q15369） von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 （P40337） NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5 分辨率 3.73 Å R-free 0.326

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8G1Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LM8 Structure of a HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC Complex 提交 2002-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.236
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
2C9W CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-2 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 1.9A RESOLUTION 提交 2005-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；2M AMSO4 0.2M NACL, 0.1M CACODYLATE PH 6.5 300 NL SITTING DROPS AT 4 DEGREES
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
2IZV CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-4 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 2.55A RESOLUTION 提交 2006-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；150 UL SITTING DROP 2M NACL 10% PEK6K
分辨率 2.55 Å R-free 0.223
2JZ3 SOCS box elonginBC ternary complex 提交 2007-12-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] socs box; 1mM elonginB; 1mM elonginC; 50mM potassium chloride; 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MA9 HIV-1 Vif SOCS-box and Elongin BC solution structure 提交 2013-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Vif SOCS, 0.2 mM Elongin B, 0.2 mM Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 221-338
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 221-338
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 3 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 4 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 e 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 W 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 g 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 m 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 s 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 y 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4WQO Structure of VHL-EloB-EloC-Cul2 提交 2014-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；4M Na formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.249
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5N4W Crystal structure of the Cul2-Rbx1-EloBC-VHL ubiquitin ligase complex 提交 2017-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1 M Tris pH 7.6, 0.15 M ammonium sulphate, 15% polyethyleneglycol 4000 and 3% 1,4-dioxane or 4% acetonitrile. The sample was crystallised in the presence of a 19-mer peptide mimicking the substrate HIF-1alpha - residues 559-577 (DEALAPYIPMDDDFQLRSF, with the mutations L559D and M561A and P564 is hydroxyproline).
分辨率 3.90 Å R-free 0.346
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
6BVB Crystal structure of HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C 提交 2017-12-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；26% (v/v) PEG-3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris. 7 mg/mL protein complex.
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6GFX pVHL:EloB:EloC in complex with modified HIF-1a CODD peptide containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 13a) 提交 2018-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20-22% PEG MME 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M potassium phosphate, 10 mM DTT
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 2 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMR pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M K phosphate pH 6.6, 0.2 M AS, 20% PEG MME 5000, 5% DTT
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6I4X Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with erythropoietin receptor peptide 提交 2018-11-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, ethanol, HEPES, magnesium chloride
分辨率 2.69 Å R-free 0.235
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I7Q Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the C2221 form 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg formate, 50 mM Cystamine, 22 % PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
6I7R Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg Formate, 50mM Cystamine, 22% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6R6H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 8.40 Å
6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 P 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCL 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6R7H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.80 Å
6R7I Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 P 1–106（106 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
6R7N Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6V9H Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9), ElonginB (ELOB), and ElonginC (ELOC) bound to its substrate Brain-type Creatine Kinase (CKB) 提交 2019-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 second blot, blot force 20
分辨率 4.10 Å
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 BBB 1–107（107 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7M6T Crystal structure of SOCS2/ElonginB/ElonginC bound to a non-canonical peptide that enhances phospho-peptide binding 提交 2021-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；2M ammonium sulphate Bis-Tris pH6.5
分辨率 3.19 Å R-free 0.267
7PI4 FAK Protac GSK215 in complex with FAK and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2021-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 BBB 1–105（105 aa）
未记录 7QB (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-(4-(3-methoxy-4-((4-((2-(methylcarbamoyl)phenyl)amino)-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)amino)phenyl)piperazin-1-yl)acetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-((S)-1-(4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05M CaCl, 0.1M MES pH 6.5, 45%v/v, PEG200
分辨率 2.24 Å R-free 0.251
7PLO H. sapiens replisome-CUL2/LRR1 complex 提交 2021-09-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 P 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7UPN Maedi visna virus Vif in complex with CypA and E3 ubiquitin ligase 提交 2022-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7Z6L Crystal structure of PROTAC 5 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 IEI (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[3-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；33% (v/v) glycerol ethoxylate, 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.232
7Z76 Crystal structure of compound 10 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 IFJ (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[(2~{R})-1-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propan-2-yl]oxy-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14.5 % PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 5.8, 100 mM sodium iodide
分辨率 1.32 Å R-free 0.202
7Z77 Crystal structure of compound 6 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 IFF (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]butyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % PEG 3350, 0.1 M BIS_TRIS propane pH 7.5, 200 mM sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLN Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 11 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JI9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-methyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine, PEG8K (9-14%), ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.60 Å R-free 0.334
7ZLO Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 12 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JI0 [4-[(2~{S})-3-[(3-ethyl-4-fluoranyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 2.22 Å R-free 0.250
7ZLP Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 9 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JHR [4-[(2~{S})-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine pH(6.5-7), PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 1.94 Å R-free 0.240
7ZLR Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG8K (9-14%), Ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.01 Å R-free 0.255
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–104（104 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C13 Crystal structure of pVHL:ElonginC:ElonginB complex bound to PROTAC JW48 提交 2022-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 SYF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-(acetamidomethyl)-4-(6,7-dihydro-5~{H}-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18% PEG 3350, HEPES pH7
分辨率 2.30 Å R-free 0.261
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQK pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 30) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–104（104 aa）
链 D 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VYQ (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[2-methyl-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate,10 mM DTT
分辨率 2.62 Å R-free 0.290
8CQL pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-N-((S)-1-(5-Fluoro-2-methoxy-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide (Compound 33) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–104（104 aa）
链 D 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VH3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[5-fluoranyl-2-methoxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.38 Å R-free 0.275
8CX0 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC monomeric complex 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CX1 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 1 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8CX2 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 2 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EBN Structure of KLHDC2-EloB/C tetrameric assembly 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–104（104 aa）
链 E 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；% PEG3350, 0.2 M KSCN, 0.1 M Tris, 0.1M Na/K Tartrate, 2.5% MPD, pH =6.8
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 U 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FVI Human APOBEC3H bound to HIV-1 Vif in complex with CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 y 1–102（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8FVJ Dimeric form of HIV-1 Vif in complex with human CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 3 1–102（102 aa）
链 8 1–102（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8IJ1 Protomer 1 and 2 of the asymmetry trimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complex 提交 2023-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8JAL Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (dimer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAQ Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (tetramer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
8JAR Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAS Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8JAU Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8JAV Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JE1 An asymmetry dimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complexed with BEX2 提交 2023-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8JE2 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B complexed with FNIP1-FLCN 提交 2023-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8OKX Structure of cGAS in complex with SPSB3-ELOBC 提交 2023-03-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PQL K48-linked ubiquitin chain formation with a cullin-RING E3 ligase and Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2-donor UB-acceptor UB-SIL1 peptide 提交 2023-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.76 Å
8Q7R Ubiquitin ligation to substrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2~donor UB-Sil1 peptide 提交 2023-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 U9O 5-azanyl-1-oxidanyl-pentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.71 Å
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–118（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RWZ Open non-crosslinked structure Brd4BD2-MZ1-(NEDD8)-CRL2VHL 提交 2024-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SH2 KLHDC2 in complex with EloB and EloC 提交 2023-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
链 I 1–104（104 aa）
链 K 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
8SZK The cryo-EM structure of PPP2R5A/HIV-1 Vif/CBFb/EloB/EloC complex 提交 2023-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8VL9 Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 8 molecular glue 提交 2024-01-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 A1ACI N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[(4P)-4-(1H-pyrazol-3-yl)naphthalen-1-yl]methyl}-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
8VLB Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 4 molecular glue 提交 2024-01-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8WDK The complex structure of Cul2-VCB-Protac-Wee1 提交 2023-09-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 W6U (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-dimethyl-2-[3-[4-[4-[4-[[3-oxidanylidene-1-[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]-2-prop-2-enyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]amino]phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]propanoylamino]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8WQA Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8WQB Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8WQC cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CDK5R1 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8WQE Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8WQF cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8WQG cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8WQH cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–118（118 aa）
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8Y1U Crystal structure of ASB7-Elongin B/C bound to the LZTS1-degron 提交 2024-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M DL-Malic acid pH7.0, 10% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.243
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9BID human ZYG11B and EloginB/C complex 提交 2024-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9BIE human ZYG11B ElonginB/C complex binding to SARS-CoV2 Orf10 protein 提交 2024-04-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BJ8 human CRL2-ZYG11B complex 提交 2024-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9BJ9 Human CRL-2 ZYG11B binding to human NLRP1 Gly/N degron 提交 2024-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9D1I Structure of Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 0.1M HEPES pH=7.0, 5% Tascsimate pH=7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.189
9D1Y Structure of G75R Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES pH=7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.216
9D1Z Structure of G75Q Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%%KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES 7.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.190
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D8P Focused map of Cryo-EM structure of Ubiquitin C-degron bound to KLHDC10-EloB/C 提交 2024-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9DTY Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 D 1–104（104 aa）
链 H 1–104（104 aa）
链 L 1–104（104 aa）
链 P 1–104（104 aa）
链 T 1–104（104 aa）
链 X 1–104（104 aa）
链 b 1–104（104 aa）
链 f 1–104（104 aa）
链 j 1–104（104 aa）
链 n 1–104（104 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 10 CIT CITRIC ACID × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.26；291 K；2% v/v Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.26, 11.36% w/v PEG3350, 0.1 M barium chloride dihydrate
分辨率 3.19 Å R-free 0.285
9E9V Structural Insights into HIV-1 Vif-Mediated Ubiquitination and Degradation of APOBEC3H 提交 2024-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 m 1–102（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQM Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-21 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1H9F (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[trans-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.285 M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, and 5.9% PEG3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.264
9GIO Crystal structure of the VHL-EloC-EloB complex with a covalent compound bound to C77 of VHL. 提交 2024-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 A1IMD N-[2-(dimethylsulfamoyl)-5-[(1-methylpyrazol-4-yl)methoxy]phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12 % PEG8000 and 100 mM MES buffer (pH 6.5).
分辨率 1.49 Å R-free 0.233
9H30 VHL:ElonginC:ElonginB-PROTAC4 complex 提交 2024-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1ISE N-[5-(1-{2-[4-({[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl]oxy}carbonyl)phenyl]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)pentanoyl]-3-methyl-D-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.7；277 K；9-11% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYO CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P4 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 A1IYN (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[7-(5-bromanyl-4-oxidanylidene-2,3-dihydro-1,3-benzoxazin-2-yl)-4-[cyclopropyl(methyl)amino]-5,6,8,9-tetrahydropyrimido[4,5-d]azepin-2-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 8% ethylene glycol 14% PEG 8K
分辨率 3.74 Å R-free 0.348
9HYP CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P5 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 A1IYM (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]butoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28% PEG 3350 0.2 M potassium thiocyanate 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2Z 7-Hydroxy-4-methoxymethylcoumarin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9J63 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer 提交 2024-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9J64 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer complexed with FNIP1 degron 提交 2024-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9J77 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 1) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9J78 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 2) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
9J79 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B bound with TOM20(tetramer) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 H 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa）
未记录 A1L66 ASP3082 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9LAF Crystal structure of Elongin BC-EPOP peptide 提交 2025-01-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.14 Å R-free 0.231
9LK2 monomeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9LK6 dimeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–118（118 aa）
链 E 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9LKY Dimer of CRL2-FEM1B bound with PLD6 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 X 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 b 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 f 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9N88 PROTAC-induced IRE1 ternary complex 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 68–73（6 aa） 片段：68-73
链 H 68–73（6 aa） 片段：68-73
未记录 A1BWF 3-methyl-N-(5-{4-[(1r,4S)-4-{[7-oxo-8-(propan-2-yl)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]amino}cyclohexyl]piperazin-1-yl}pentanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；I used 0.5 mM BS3 for crosslinking the protein complex, then diluted it to 0.05 mM for grid preparation.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；7 force; 2 s blot time.
分辨率 2.60 Å
9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9OGC Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-185 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 K85 propan-2-yl 3-{3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OGD Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to human ASB8(R197A)-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
9OGE Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-127 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 A1CBC propan-2-yl 3-[3-(3-chlorophenyl)-1H-1,2,4-triazol-1-yl]propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9OGF Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-UTSW1 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 A1CBB propan-2-yl 3-(3-phenyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.21 Å
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBJ 1-(propan-2-yl)-4-[(pyridin-2-yl)methyl]piperazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OMA Cryo-EM structure of PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9OMF Cryo-EM structure of neddylated PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (N8-CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.72 Å
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RWZ ZSWIM8-CUL3 complex bound to AGO2-miR-7-CYRANO 提交 2025-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 1–118（118 aa）
链 C 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；25 mM HEPES, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SV3 Local refinement of EloB/EloC/VHL/CV2a/14-3-3zeta/ERa from pose 1 提交 2025-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 A1JQT ~{N}'-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-~{N}-[(2~{S})-2-[(1~{E},3~{R},4~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{S},14~{S})-14-(methoxymethyl)-3,10-dimethyl-8-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,9-bis(oxidanyl)-6-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradeca-1,6-dienyl]propyl]tridecanediamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9T32 The Cullin 2 RING VHL E3 ligase dimerised by the homoPROTAC CM11 提交 2025-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 A1JTC (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
9T7V Structure of LRRC58-EloB/C-CDO1 in complex with NEDD8-CUL5-RBX2-ARIH2-Ub 提交 2025-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 I 1–118（118 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9UA3 Cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-FEM1C-ELOB-ELOC 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å

共 228 个其他 PDB 条目、478 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELOB_HUMAN
Isoform Q15370-2
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

Elongin-C

Homo sapiens

UniProt Q15369

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 17–112 未记录 Transcription activator BRG1 × 1 （P51532） Elongin-B × 1 （Q15370） von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 （P40337） NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5 分辨率 3.73 Å R-free 0.326

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8G1Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LM8 Structure of a HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC Complex 提交 2002-04-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.236
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
2C9W CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-2 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 1.9A RESOLUTION 提交 2005-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；2M AMSO4 0.2M NACL, 0.1M CACODYLATE PH 6.5 300 NL SITTING DROPS AT 4 DEGREES
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
2IZV CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-4 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 2.55A RESOLUTION 提交 2006-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；150 UL SITTING DROP 2M NACL 10% PEK6K
分辨率 2.55 Å R-free 0.223
2MA9 HIV-1 Vif SOCS-box and Elongin BC solution structure 提交 2013-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 19–109（91 aa） 片段：UNP residues 19-109
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Vif SOCS, 0.2 mM Elongin B, 0.2 mM Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：UNP residues 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 17–112（96 aa） 片段：UNP residues 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–96（96 aa） 片段：17-112
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 3 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Y 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 5 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Z 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 h 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 n 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 t 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 z 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4WQO Structure of VHL-EloB-EloC-Cul2 提交 2014-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa） 片段：UNP residues 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；4M Na formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.249
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5N4W Crystal structure of the Cul2-Rbx1-EloBC-VHL ubiquitin ligase complex 提交 2017-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1 M Tris pH 7.6, 0.15 M ammonium sulphate, 15% polyethyleneglycol 4000 and 3% 1,4-dioxane or 4% acetonitrile. The sample was crystallised in the presence of a 19-mer peptide mimicking the substrate HIF-1alpha - residues 559-577 (DEALAPYIPMDDDFQLRSF, with the mutations L559D and M561A and P564 is hydroxyproline).
分辨率 3.90 Å R-free 0.346
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
6BVB Crystal structure of HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C 提交 2017-12-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；26% (v/v) PEG-3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris. 7 mg/mL protein complex.
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6GFX pVHL:EloB:EloC in complex with modified HIF-1a CODD peptide containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 13a) 提交 2018-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20-22% PEG MME 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M potassium phosphate, 10 mM DTT
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–111（95 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–111（95 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMR pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M K phosphate pH 6.6, 0.2 M AS, 20% PEG MME 5000, 5% DTT
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–111（95 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6I4X Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with erythropoietin receptor peptide 提交 2018-11-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, ethanol, HEPES, magnesium chloride
分辨率 2.69 Å R-free 0.235
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I7R Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 提交 2018-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg Formate, 50mM Cystamine, 22% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Z 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 Q 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCL 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6R7H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 Q 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.80 Å
6R7N Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6V9H Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9), ElonginB (ELOB), and ElonginC (ELOC) bound to its substrate Brain-type Creatine Kinase (CKB) 提交 2019-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 second blot, blot force 20
分辨率 4.10 Å
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 CCC 17–112（96 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7M6T Crystal structure of SOCS2/ElonginB/ElonginC bound to a non-canonical peptide that enhances phospho-peptide binding 提交 2021-03-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；2M ammonium sulphate Bis-Tris pH6.5
分辨率 3.19 Å R-free 0.267
7PLO H. sapiens replisome-CUL2/LRR1 complex 提交 2021-09-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 R 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7UPN Maedi visna virus Vif in complex with CypA and E3 ubiquitin ligase 提交 2022-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7Z6L Crystal structure of PROTAC 5 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 IEI (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[3-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；33% (v/v) glycerol ethoxylate, 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.232
7Z76 Crystal structure of compound 10 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 IFJ (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[(2~{R})-1-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propan-2-yl]oxy-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14.5 % PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 5.8, 100 mM sodium iodide
分辨率 1.32 Å R-free 0.202
7Z77 Crystal structure of compound 6 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 IFF (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]butyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % PEG 3350, 0.1 M BIS_TRIS propane pH 7.5, 200 mM sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLN Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 11 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JI9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-methyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine, PEG8K (9-14%), ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.60 Å R-free 0.334
7ZLO Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 12 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JI0 [4-[(2~{S})-3-[(3-ethyl-4-fluoranyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 2.22 Å R-free 0.250
7ZLP Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 9 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JHR [4-[(2~{S})-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine pH(6.5-7), PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 1.94 Å R-free 0.240
7ZLR Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG8K (9-14%), Ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.01 Å R-free 0.255
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 16–112（97 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 16–112（97 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 16–112（97 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 16–112（97 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C13 Crystal structure of pVHL:ElonginC:ElonginB complex bound to PROTAC JW48 提交 2022-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–112（112 aa）
未记录 SYF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-(acetamidomethyl)-4-(6,7-dihydro-5~{H}-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18% PEG 3350, HEPES pH7
分辨率 2.30 Å R-free 0.261
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQK pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 30) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 E 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VYQ (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[2-methyl-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate,10 mM DTT
分辨率 2.62 Å R-free 0.290
8CQL pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-N-((S)-1-(5-Fluoro-2-methoxy-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide (Compound 33) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 E 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VH3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[5-fluoranyl-2-methoxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.38 Å R-free 0.275
8CX0 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC monomeric complex 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric
链 E 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CX1 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 1 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–112（112 aa）
链 J 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8CX2 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 2 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–112（112 aa）
链 J 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EBN Structure of KLHDC2-EloB/C tetrameric assembly 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 16–112（97 aa）
链 F 16–112（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；% PEG3350, 0.2 M KSCN, 0.1 M Tris, 0.1M Na/K Tartrate, 2.5% MPD, pH =6.8
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 R 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FVI Human APOBEC3H bound to HIV-1 Vif in complex with CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 z 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8FVJ Dimeric form of HIV-1 Vif in complex with human CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 4 17–112（96 aa）
链 9 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–96（96 aa）
未记录 CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–112（112 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–112（112 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8IJ1 Protomer 1 and 2 of the asymmetry trimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complex 提交 2023-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 16–112（97 aa）
链 H 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8JAL Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (dimer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 1–112（112 aa）
链 H 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAQ Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (tetramer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 N 17–112（96 aa）
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
8JAR Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAS Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 N 17–112（96 aa）
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8JAU Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8JAV Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 N 17–112（96 aa）
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JE1 An asymmetry dimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complexed with BEX2 提交 2023-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 16–112（97 aa）
链 H 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8JE2 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B complexed with FNIP1-FLCN 提交 2023-05-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8OKX Structure of cGAS in complex with SPSB3-ELOBC 提交 2023-03-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PQL K48-linked ubiquitin chain formation with a cullin-RING E3 ligase and Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2-donor UB-acceptor UB-SIL1 peptide 提交 2023-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric
链 D 1–112（112 aa）
未记录 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.76 Å
8Q7R Ubiquitin ligation to substrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2~donor UB-Sil1 peptide 提交 2023-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–112（112 aa）
未记录 U9O 5-azanyl-1-oxidanyl-pentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.71 Å
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–112（111 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 17–112（96 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SH2 KLHDC2 in complex with EloB and EloC 提交 2023-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 J 17–112（96 aa）
链 L 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
8SZK The cryo-EM structure of PPP2R5A/HIV-1 Vif/CBFb/EloB/EloC complex 提交 2023-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8VL9 Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 8 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1ACI N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[(4P)-4-(1H-pyrazol-3-yl)naphthalen-1-yl]methyl}-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
8VLB Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 4 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8WDK The complex structure of Cul2-VCB-Protac-Wee1 提交 2023-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–96（96 aa）
未记录 W6U (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-dimethyl-2-[3-[4-[4-[4-[[3-oxidanylidene-1-[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]-2-prop-2-enyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]amino]phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]propanoylamino]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8WQA Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8WQB Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8WQC cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CDK5R1 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8WQE Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8WQF cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8WQG cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8WQH cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 17–112（96 aa）
链 I 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8Y1U Crystal structure of ASB7-Elongin B/C bound to the LZTS1-degron 提交 2024-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M DL-Malic acid pH7.0, 10% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.243
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9BID human ZYG11B and EloginB/C complex 提交 2024-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9BIE human ZYG11B ElonginB/C complex binding to SARS-CoV2 Orf10 protein 提交 2024-04-23 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BJ8 human CRL2-ZYG11B complex 提交 2024-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9BJ9 Human CRL-2 ZYG11B binding to human NLRP1 Gly/N degron 提交 2024-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9D1I Structure of Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 0.1M HEPES pH=7.0, 5% Tascsimate pH=7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.189
9D1Y Structure of G75R Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES pH=7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.216
9D1Z Structure of G75Q Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%%KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES 7.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.190
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D8P Focused map of Cryo-EM structure of Ubiquitin C-degron bound to KLHDC10-EloB/C 提交 2024-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9DTY Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
链 O 17–112（96 aa）
链 S 17–112（96 aa）
链 W 17–112（96 aa）
链 a 17–112（96 aa）
链 e 17–112（96 aa）
链 i 17–112（96 aa）
链 m 17–112（96 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 10 CIT CITRIC ACID × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.26；291 K；2% v/v Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.26, 11.36% w/v PEG3350, 0.1 M barium chloride dihydrate
分辨率 3.19 Å R-free 0.285
9E9V Structural Insights into HIV-1 Vif-Mediated Ubiquitination and Degradation of APOBEC3H 提交 2024-11-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 n 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQM Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-21 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1H9F (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[trans-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.285 M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, and 5.9% PEG3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.264
9H30 VHL:ElonginC:ElonginB-PROTAC4 complex 提交 2024-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1ISE N-[5-(1-{2-[4-({[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl]oxy}carbonyl)phenyl]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)pentanoyl]-3-methyl-D-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.7；277 K；9-11% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYO CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P4 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1IYN (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[7-(5-bromanyl-4-oxidanylidene-2,3-dihydro-1,3-benzoxazin-2-yl)-4-[cyclopropyl(methyl)amino]-5,6,8,9-tetrahydropyrimido[4,5-d]azepin-2-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 8% ethylene glycol 14% PEG 8K
分辨率 3.74 Å R-free 0.348
9HYP CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P5 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1IYM (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]butoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28% PEG 3350 0.2 M potassium thiocyanate 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1L2Z 7-Hydroxy-4-methoxymethylcoumarin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9J63 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer 提交 2024-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 16–112（97 aa）
链 F 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9J64 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer complexed with FNIP1 degron 提交 2024-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9J77 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 1) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9J78 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 2) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
9J79 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B bound with TOM20(tetramer) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 F 17–112（96 aa）
链 L 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1L66 ASP3082 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9LAF Crystal structure of Elongin BC-EPOP peptide 提交 2025-01-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.14 Å R-free 0.231
9LK2 monomeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9LK6 dimeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–112（112 aa）
链 F 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9LKY Dimer of CRL2-FEM1B bound with PLD6 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 a 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 e 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9N88 PROTAC-induced IRE1 ternary complex 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 17–110（94 aa）
链 G 17–110（94 aa）
未记录 A1BWF 3-methyl-N-(5-{4-[(1r,4S)-4-{[7-oxo-8-(propan-2-yl)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]amino}cyclohexyl]piperazin-1-yl}pentanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；I used 0.5 mM BS3 for crosslinking the protein complex, then diluted it to 0.05 mM for grid preparation.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；7 force; 2 s blot time.
分辨率 2.60 Å
9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9OGC Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-185 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 K85 propan-2-yl 3-{3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OGD Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to human ASB8(R197A)-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
9OGE Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-127 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 A1CBC propan-2-yl 3-[3-(3-chlorophenyl)-1H-1,2,4-triazol-1-yl]propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9OGF Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-UTSW1 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 A1CBB propan-2-yl 3-(3-phenyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.21 Å
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBJ 1-(propan-2-yl)-4-[(pyridin-2-yl)methyl]piperazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OMA Cryo-EM structure of PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9OMF Cryo-EM structure of neddylated PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (N8-CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.72 Å
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RWZ ZSWIM8-CUL3 complex bound to AGO2-miR-7-CYRANO 提交 2025-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–112（112 aa）
链 E 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；25 mM HEPES, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SV3 Local refinement of EloB/EloC/VHL/CV2a/14-3-3zeta/ERa from pose 1 提交 2025-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JQT ~{N}'-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-~{N}-[(2~{S})-2-[(1~{E},3~{R},4~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{S},14~{S})-14-(methoxymethyl)-3,10-dimethyl-8-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,9-bis(oxidanyl)-6-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradeca-1,6-dienyl]propyl]tridecanediamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9T32 The Cullin 2 RING VHL E3 ligase dimerised by the homoPROTAC CM11 提交 2025-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 G 17–111（95 aa）
链 J 17–111（95 aa）
未记录 A1JTC (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
9T7V Structure of LRRC58-EloB/C-CDO1 in complex with NEDD8-CUL5-RBX2-ARIH2-Ub 提交 2025-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9UA3 Cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-FEM1C-ELOB-ELOC 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å

共 220 个其他 PDB 条目、467 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELOC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–96； UniProt 17–112

von Hippel-Lindau disease tumor suppressor

Homo sapiens

UniProt P40337

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 56–213 未记录 Transcription activator BRG1 × 1 （P51532） Elongin-B × 1 （Q15370） Elongin-C × 1 （Q15369） NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5 分辨率 3.73 Å R-free 0.326

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8G1Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LM8 Structure of a HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC Complex 提交 2002-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.236
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 52–213（162 aa） 片段：residues 52-213
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 52–213（162 aa） 片段：residues 52-213
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 214–373（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 3 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ACT ACETATE ION × 1 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4WQO Structure of VHL-EloB-EloC-Cul2 提交 2014-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；4M Na formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.249
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5N4W Crystal structure of the Cul2-Rbx1-EloBC-VHL ubiquitin ligase complex 提交 2017-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 V 54–213（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1 M Tris pH 7.6, 0.15 M ammonium sulphate, 15% polyethyleneglycol 4000 and 3% 1,4-dioxane or 4% acetonitrile. The sample was crystallised in the presence of a 19-mer peptide mimicking the substrate HIF-1alpha - residues 559-577 (DEALAPYIPMDDDFQLRSF, with the mutations L559D and M561A and P564 is hydroxyproline).
分辨率 3.90 Å R-free 0.346
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
6BVB Crystal structure of HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C 提交 2017-12-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；26% (v/v) PEG-3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris. 7 mg/mL protein complex.
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6GFX pVHL:EloB:EloC in complex with modified HIF-1a CODD peptide containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 13a) 提交 2018-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20-22% PEG MME 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M potassium phosphate, 10 mM DTT
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 2 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMR pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M K phosphate pH 6.6, 0.2 M AS, 20% PEG MME 5000, 5% DTT
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 8–156（149 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 8–156（149 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6I7Q Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the C2221 form 提交 2018-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg formate, 50 mM Cystamine, 22 % PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
6I7R Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 提交 2018-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg Formate, 50mM Cystamine, 22% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
6R6H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 V 7–154（148 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 8.40 Å
6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCL 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 AAA 59–213（155 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 55–213（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 55–213（159 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 55–213（159 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 55–213（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–160（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–160（160 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 55–213（159 aa）
未记录 WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7PI4 FAK Protac GSK215 in complex with FAK and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2021-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 AAA 59–213（155 aa）
未记录 7QB (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-(4-(3-methoxy-4-((4-((2-(methylcarbamoyl)phenyl)amino)-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)amino)phenyl)piperazin-1-yl)acetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-((S)-1-(4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05M CaCl, 0.1M MES pH 6.5, 45%v/v, PEG200
分辨率 2.24 Å R-free 0.251
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7Z6L Crystal structure of PROTAC 5 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 IEI (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[3-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；33% (v/v) glycerol ethoxylate, 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.232
7Z76 Crystal structure of compound 10 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 IFJ (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[(2~{R})-1-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propan-2-yl]oxy-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14.5 % PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 5.8, 100 mM sodium iodide
分辨率 1.32 Å R-free 0.202
7Z77 Crystal structure of compound 6 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 IFF (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]butyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % PEG 3350, 0.1 M BIS_TRIS propane pH 7.5, 200 mM sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 54–213（160 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C13 Crystal structure of pVHL:ElonginC:ElonginB complex bound to PROTAC JW48 提交 2022-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1–160（160 aa）
未记录 SYF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-(acetamidomethyl)-4-(6,7-dihydro-5~{H}-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18% PEG 3350, HEPES pH7
分辨率 2.30 Å R-free 0.261
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQK pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 30) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 54–213（160 aa）
链 F 54–213（160 aa）
链 I 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VYQ (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[2-methyl-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate,10 mM DTT
分辨率 2.62 Å R-free 0.290
8CQL pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-N-((S)-1-(5-Fluoro-2-methoxy-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide (Compound 33) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 54–213（160 aa）
链 F 54–213（160 aa）
链 I 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VH3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[5-fluoranyl-2-methoxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.38 Å R-free 0.275
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 56–213（158 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 56–213（158 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–213（212 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–213（213 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–213（213 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RWZ Open non-crosslinked structure Brd4BD2-MZ1-(NEDD8)-CRL2VHL 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8VL9 Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 8 molecular glue 提交 2024-01-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 A1ACI N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[(4P)-4-(1H-pyrazol-3-yl)naphthalen-1-yl]methyl}-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
8VLB Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 4 molecular glue 提交 2024-01-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8WDK The complex structure of Cul2-VCB-Protac-Wee1 提交 2023-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 V 59–213（155 aa）
未记录 W6U (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-dimethyl-2-[3-[4-[4-[4-[[3-oxidanylidene-1-[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]-2-prop-2-enyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]amino]phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]propanoylamino]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 55–213（159 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 55–213（159 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TFA trifluoroacetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9DTY Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 B 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 F 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 J 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 N 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 R 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 V 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 Z 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 d 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 h 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 l 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 10 CIT CITRIC ACID × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.26；291 K；2% v/v Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.26, 11.36% w/v PEG3350, 0.1 M barium chloride dihydrate
分辨率 3.19 Å R-free 0.285
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQM Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-21 提交 2024-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1H9F (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[trans-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.285 M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, and 5.9% PEG3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.264
9GIO Crystal structure of the VHL-EloC-EloB complex with a covalent compound bound to C77 of VHL. 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–160（160 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 A1IMD N-[2-(dimethylsulfamoyl)-5-[(1-methylpyrazol-4-yl)methoxy]phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12 % PEG8000 and 100 mM MES buffer (pH 6.5).
分辨率 1.49 Å R-free 0.233
9H30 VHL:ElonginC:ElonginB-PROTAC4 complex 提交 2024-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 A1ISE N-[5-(1-{2-[4-({[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl]oxy}carbonyl)phenyl]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)pentanoyl]-3-methyl-D-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.7；277 K；9-11% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYO CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P4 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 A1IYN (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[7-(5-bromanyl-4-oxidanylidene-2,3-dihydro-1,3-benzoxazin-2-yl)-4-[cyclopropyl(methyl)amino]-5,6,8,9-tetrahydropyrimido[4,5-d]azepin-2-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 8% ethylene glycol 14% PEG 8K
分辨率 3.74 Å R-free 0.348
9HYP CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P5 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 A1IYM (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]butoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28% PEG 3350 0.2 M potassium thiocyanate 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2Z 7-Hydroxy-4-methoxymethylcoumarin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 A1L66 ASP3082 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 R 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Z 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 d 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9N88 PROTAC-induced IRE1 ternary complex 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 61–207（147 aa）
链 F 61–207（147 aa）
未记录 A1BWF 3-methyl-N-(5-{4-[(1r,4S)-4-{[7-oxo-8-(propan-2-yl)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]amino}cyclohexyl]piperazin-1-yl}pentanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；I used 0.5 mM BS3 for crosslinking the protein complex, then diluted it to 0.05 mM for grid preparation.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；7 force; 2 s blot time.
分辨率 2.60 Å
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBJ 1-(propan-2-yl)-4-[(pyridin-2-yl)methyl]piperazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SV3 Local refinement of EloB/EloC/VHL/CV2a/14-3-3zeta/ERa from pose 1 提交 2025-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 54–213（160 aa）
未记录 A1JQT ~{N}'-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-~{N}-[(2~{S})-2-[(1~{E},3~{R},4~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{S},14~{S})-14-(methoxymethyl)-3,10-dimethyl-8-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,9-bis(oxidanyl)-6-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradeca-1,6-dienyl]propyl]tridecanediamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9T32 The Cullin 2 RING VHL E3 ligase dimerised by the homoPROTAC CM11 提交 2025-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 62–202（141 aa）
链 H 62–202（141 aa）
未记录 A1JTC (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å

共 141 个其他 PDB 条目、363 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VHL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 5–162； UniProt 56–213

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8g1q

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8g1q
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8g1q
沉积日期 deposition_date2023-02-02
结构标题 titleCo-crystal structure of Compound 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB
关键词 keywordsTernary Complex, PROTACs, TRANSCRIPTION, gene regulation; GENE REGULATION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier30.44 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron29.99 Å
零角强度 I(0) i038634300.00
分子量 molecular_weight49200.0 kDa
排除体积 excluded_volume61924 ų
包络体积 envelope_volume85020 ų
水化壳体积 shell_volume25331 ų
包络直径 envelope_diameter104.6 Å
壳层 Rg shell_rg34.76 Å
包络 Rg envelope_rg30.02 Å
形状 Rg shape_rg29.98 Å
总 Rg total_rg30.53 Å
总原子数 total_atoms3466
残基数 n_residues433
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax101.1 Å
Rg (实空间) rg_real30.68 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.77 Å
I(0) (实空间) i0_real3.8630e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.8060e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal30.58 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal38630000.0000
解质量估计 total_estimate0.8532
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary27.2 Å
偏度 Skewness skewness0.451
峰度 Kurtosis kurtosis-0.535
角度范围 angular_range— – 0.2600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha6794000.0000
实空间数据点数 n_real_points53
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.835; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.730; Smooth: 0.853
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id8g1qB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
结构域编号 domain_id8g1qC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily780 — von Hippel-Lindau disease tumour suppressor, beta domain
结构域编号 domain_id8g1qC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology750 — Elongin C; Chain C, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — von Hippel-Lindau disease tumour suppressor, alpha domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)