SAXSdb — 8h96

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 105–1163	未记录	Transducin-like enhancer protein 6 × 1 （Q9WVB3） Oocyte-expressed protein homolog × 1 （Q9CWE6）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8H96	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
12DL Native structure of the cytoplasmic lattice (CPL) asymmetric unit from mouse MII eggs 提交 2026-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric	链 GA 1–1163（1163 aa）链 GB 1–1163（1163 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
24MC Structure of oocyte cytoplasmic lattices 提交 2026-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 P 1–1163（1163 aa）链 S 1–1163（1163 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8H93 Structure of dimeric mouse SCMC core complex 提交 2022-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 105–1163（1059 aa）链 D 105–1163（1059 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
8H94 Structure of mouse SCMC bound with KH domain of FILIA 提交 2022-10-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 105–1163（1059 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8H95 Structure of mouse SCMC bound with full-length FILIA 提交 2022-10-24	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 105–1163（1059 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8XI3 Structure of mouse SCMC-14-3-3gama complex 提交 2023-12-19	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 105–1163（1059 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9L4J Structure of mouse SCMCcore complex contain ZBED3 提交 2024-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 97–1059（963 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25mM Tris pH 8.0, 150mM NaCl,5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Vitrification carried out in argon atmosphere	分辨率 3.00 Å
9SFP Native cytoplasmic lattices from mouse oocytes 提交 2025-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 H 1–1163（1163 aa）链 I 1–1163（1163 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
9W2M Cryo-EM structure of the Cytoplasmic lattice(CPL) from mouse oocyte 提交 2025-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 A 97–1059（963 aa）链 F 97–1059（963 aa）链 a 97–1059（963 aa）链 f 97–1059（963 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9XRL Structure of mouse cytoplasmic lattice (CPL) repeating unit 提交 2025-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：73-meric	链 0 105–1163（1059 aa）链 2 105–1163（1059 aa）链 5 105–1163（1059 aa）链 7 105–1163（1059 aa）链 AB 105–1163（1059 aa）链 y 105–1163（1059 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NALP5_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1059； UniProt 105–1163

Transducin-like enhancer protein 6

Mus musculus

UniProt Q9WVB3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–581	未记录	NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 1 （Q9R1M5） Oocyte-expressed protein homolog × 1 （Q9CWE6）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8H96	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
12DL Native structure of the cytoplasmic lattice (CPL) asymmetric unit from mouse MII eggs 提交 2026-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric	链 HA 1–581（581 aa）链 HB 1–581（581 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
24MC Structure of oocyte cytoplasmic lattices 提交 2026-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 Q 1–581（581 aa）链 T 1–581（581 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8H93 Structure of dimeric mouse SCMC core complex 提交 2022-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–581（581 aa）链 E 1–581（581 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
8H94 Structure of mouse SCMC bound with KH domain of FILIA 提交 2022-10-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–581（581 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8H95 Structure of mouse SCMC bound with full-length FILIA 提交 2022-10-24	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–581（581 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8XI3 Structure of mouse SCMC-14-3-3gama complex 提交 2023-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 48–581（534 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9L4J Structure of mouse SCMCcore complex contain ZBED3 提交 2024-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 155–581（427 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25mM Tris pH 8.0, 150mM NaCl,5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Vitrification carried out in argon atmosphere	分辨率 3.00 Å
9SFP Native cytoplasmic lattices from mouse oocytes 提交 2025-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 W 1–581（581 aa）链 Y 1–581（581 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
9W2M Cryo-EM structure of the Cytoplasmic lattice(CPL) from mouse oocyte 提交 2025-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 B 146–581（436 aa）链 G 146–581（436 aa）链 b 146–581（436 aa）链 g 146–581（436 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9XRL Structure of mouse cytoplasmic lattice (CPL) repeating unit 提交 2025-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：73-meric	链 8 1–581（581 aa）链 AC 1–581（581 aa）链 E 1–581（581 aa）链 I 1–581（581 aa）链 P 1–581（581 aa）链 z 1–581（581 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TLE6_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–581； UniProt 1–581

Oocyte-expressed protein homolog

Mus musculus

UniProt Q9CWE6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–164	未记录	NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 1 （Q9R1M5） Transducin-like enhancer protein 6 × 1 （Q9WVB3）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8H96	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
12DL Native structure of the cytoplasmic lattice (CPL) asymmetric unit from mouse MII eggs 提交 2026-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric	链 IA 1–164（164 aa）链 JA 1–164（164 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
24MC Structure of oocyte cytoplasmic lattices 提交 2026-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 N 1–164（164 aa）链 U 1–164（164 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8H93 Structure of dimeric mouse SCMC core complex 提交 2022-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–164（164 aa）链 F 1–164（164 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
8H94 Structure of mouse SCMC bound with KH domain of FILIA 提交 2022-10-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–164（164 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8H95 Structure of mouse SCMC bound with full-length FILIA 提交 2022-10-24	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–164（164 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8XI3 Structure of mouse SCMC-14-3-3gama complex 提交 2023-12-19	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–164（164 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9L4J Structure of mouse SCMCcore complex contain ZBED3 提交 2024-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 26–114（89 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25mM Tris pH 8.0, 150mM NaCl,5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Vitrification carried out in argon atmosphere	分辨率 3.00 Å
9SFP Native cytoplasmic lattices from mouse oocytes 提交 2025-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 K 1–164（164 aa）链 L 1–164（164 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
9W2M Cryo-EM structure of the Cytoplasmic lattice(CPL) from mouse oocyte 提交 2025-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 C 21–145（125 aa）链 H 21–145（125 aa）链 c 21–145（125 aa）链 h 21–145（125 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9XRL Structure of mouse cytoplasmic lattice (CPL) repeating unit 提交 2025-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：73-meric	链 AH 1–164（164 aa）链 AI 1–164（164 aa）链 AJ 1–164（164 aa）链 AT 1–164（164 aa）链 e 1–164（164 aa）链 g 1–164（164 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	OOEP_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8h96
沉积日期 deposition_date	2022-10-24
结构标题 title	Structure of mouse SCMC core complex
关键词 keywords	oocyte, subcortical, complex, CYTOSOLIC PROTEIN; CYTOSOLIC PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.67 Å
零角强度 I(0) i0	374516000.00
分子量 molecular_weight	158370.0 kDa
排除体积 excluded_volume	199050 Å³
包络体积 envelope_volume	269990 Å³
水化壳体积 shell_volume	60079 Å³
包络直径 envelope_diameter	125.6 Å
壳层 Rg shell_rg	44.05 Å
包络 Rg envelope_rg	36.05 Å
形状 Rg shape_rg	36.64 Å
总 Rg total_rg	37.26 Å
总原子数 total_atoms	11098
残基数 n_residues	1405
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	119.7 Å
Rg (实空间) rg_real	37.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.88 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7450e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.3310e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.40 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	374600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8926
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	48.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.203
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.434
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	136800000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.907; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.892

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5
分子量 formula_weight	119819.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	11098

MGPPEKDSKAILKARGLEEEQKSESTMSPSENVSRAILKDSGSEEVEQASERKMTSPENDSKSIQKDQGPEQEQTSETLQSKEEDEVTEADKDNGGDLQDYKAHVIAKFDTSVDLHYDSPEMKLLSDAFKPYQKTFQPHTIILHGRPGVGKSALARSIVLGWAQGKLFQKMSFVIFFSVREIKWTEKSSLAQLIAKECPDSWDLVTKIMSQPERLLFVIDGLDDMDSVLQHDDMTLSRDWKDEQPIYILMYSLLRKALLPQSFLIITTRNTGLEKLKSMVVSPLYILVEGLSASRRSQLVLENISNESDRIQVFHSLIENHQLFDQCQAPSVCSLVCEALQLQKKLGKRCTLPCQTLTGLYATLVFHQLTLKRPSQSALSQEEQITLVGLCMMAAEGVWTMRSVFYDDDLKNYSLKESEILALFHMNILLQVGHNSEQCYVFSHLSLQDFFAALYYVLEGLEEWNQHFCFIENQRSIMEVKRTDDTRLLGMKRFLFGLMNKDILKTLEVLFEYPVIPTVEQKLQHWVSLIAQQVNGTSPMDTLDAFYCLFESQDEEFVGGALKRFQEVWLLINQKMDLKVSSYCLKHCQNLKAIRVDIRDLLSVDNTLELCPVVTVQETQCKPLLMEWWGNFCSVLGSLRNLKELDLGDSILSQRAMKILCLELRNQSCRIQKLTFKSAEVVSGLKHLWKLLFSNQNLKYLNLGNTPMKDDDMKLACEALKHPKCSVETLRLDSCELTIIGYEMISTLLISTTRLKCLSLAKNRVGVKSMISLGNALSSSMCLLQKLILDNCGLTPASCHLLVSALFSNQNLTHLCLSNNSLGTEGVQQLCQFLRNPECALQRLILNHCNIVDDAYGFLAMRLANNTKLTHLSLTMNPVGDGAMKLLCEALKEPTCYLQELELVDCQLTQNCCEDLACMITTTKHLKSLDLGNNALGDKGVITLCEGLKQSSSSLRRLGLGACKLTSNCCEALSLAISCNPHLNSLNLVKNDFSTSGMLKLCSAFQCPVSNLGIIGLWKQEYYARVRRQLEEVEFVKPHVVIDGDWYASDEDDRNWWKN

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse,house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Transducin-like enhancer protein 6
分子量 formula_weight	65187.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTSHRQSSDTFGGILPSTLSSRYLSIVNQLPEEFSSVVSEMMVHLENIFSLAENFFQAIERFSRTPDLLERNKMSIGVGAEGDSWPCHVSHEAPMGSAQTTENSAKEEDKQVPESAALQHPKFKSTPGPQLPTRRRFLSESDELQDPQPVWDAEPQFCQGFLIQGLWELFMDSRQKNQQEHGGEDSSQESKDSGLCDFKPEPQPRHRNSLSDSADPFLIKSPSALLDYYQEDVSRPQPETQESSGRADKFLKPLSWGSEVLESSCNQPSTALWQLERFTVPQALQKVRVLKHQELLLVVAVSSFTRHVFTCSQSGIKVWNLVNQVAEDRDPESHLKCSVQDNKVYLRTCLLSSNSRTLFAGGYNLPGVIVWDLAAPSLYEKCQLPCEGLSCQALANTKENMALAGFTDGTVRIWDLRTQEIVRNLKGPTNSARNLVVKDDNIWTGGLDACLRCWDLRMAKVSLEHLFQSQIMSLAHSPTEDWLLLGLANGQHCLFNSRKRDQVLTVDTKDNTILGLKFSPNGKWWASVGMGNFITVHSMPTGAKLFQVPEVGPVRCFDMTENGRLIITGSRDCASVYHIKY

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse,house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Oocyte-expressed protein homolog
分子量 formula_weight	18481.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MASHTADADAKPDSDSQKLLNVLPVSLRLRTRPWWFPIQEVSNPLVLYMEAWVAERVIGTDQAEISEIEWMCQALLTVDSVNSGNLAEITIFGQPSAQTRMKNILLNMAAWHKENELQRAVKVKEVEEFLKIRASSILSKLSKKGLKLAGFPLPLEGRETQMES

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse,house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.78 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	276720

fit	/app/data/saxs_computation/h9/8h96/8h96.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h9/8h96/8h96.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h9/8h96/8h96.dat

Structure of mouse SCMC core complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transducin-like enhancer protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Oocyte-expressed protein homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)