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8hbv

Structure of human UCP1 in the nucleotide-free state

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 98.6 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitochondrial brown fat uncoupling protein 1

Homo sapiens

UniProt P25874

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–307 未记录 Sybody 12F2 × 1 CDL CARDIOLIPIN × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.51 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8HBV Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
12OY Single particle cryo-EM structure of human MTCH2 提交 2026-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 198–217（20 aa）
突变：L199V, A200Y, T226A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES/KOH pH 7.5, 200 mM NaCl, 2 mM Mg Acetate, and 0.07% UDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
12OZ Single particle cryo-EM structure of human MTCH2 (hyperactive mutant F285N F286N) 提交 2026-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 198–217（20 aa）
突变：F285N,F286N,L199V,A200Y,T226A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES/KOH pH 7.5, 200 mM NaCl, 2 mM Mg Acetate, and 0.07% UDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
12PB Single particle cryo-EM structure of human MTCH2 (hyperactive mutant K25E Y235A V238D) 提交 2026-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 198–217（20 aa）
突变：K25E,Y235A,V238D,L199V,A200Y,T226A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES/KOH pH 7.5, 200 mM NaCl, 2 mM Mg Acetate, and 0.07% UDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8G8W Molecular mechanism of nucleotide inhibition of human uncoupling protein 1 提交 2023-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–307（306 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CDL CARDIOLIPIN × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8HBW Structure of human UCP1 in the ATP-bound state 提交 2022-10-31 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–307（307 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CDL CARDIOLIPIN × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.57 Å
8J1N Structure of human UCP1 in the DNP-bound state 提交 2023-04-13 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–307（307 aa）
未记录 DNF 2,4-DINITROPHENOL × 1 CDL CARDIOLIPIN × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
9FZQ Proton conductance by human uncoupling protein 1 is inhibited by both purine and pyrimidine nucleotides 提交 2024-07-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–307（306 aa）
未记录 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CDL CARDIOLIPIN × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UCP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 57–363； UniProt 1–307

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8hbv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8hbv
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8hbv
沉积日期 deposition_date2022-10-31
结构标题 titleStructure of human UCP1 in the nucleotide-free state
关键词 keywordsUCP1, SLC25A7, thermogenin, SLC25, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier26.18 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron25.85 Å
零角强度 I(0) i034981100.00
分子量 molecular_weight46672.0 kDa
排除体积 excluded_volume58860 ų
包络体积 envelope_volume70736 ų
水化壳体积 shell_volume24640 ų
包络直径 envelope_diameter102.6 Å
壳层 Rg shell_rg31.15 Å
包络 Rg envelope_rg26.41 Å
形状 Rg shape_rg25.86 Å
总 Rg total_rg26.41 Å
总原子数 total_atoms3279
残基数 n_residues414
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax98.6 Å
Rg (实空间) rg_real26.46 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.05 Å
I(0) (实空间) i0_real3.4980e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.9640e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal26.37 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal34980000.0000
解质量估计 total_estimate0.7867
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary25.9 Å
偏度 Skewness skewness0.654
峰度 Kurtosis kurtosis0.116
角度范围 angular_range— – 0.3050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4404000.0000
实空间数据点数 n_real_points62
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.562; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.602; Smooth: 0.935
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id8hbvB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)