8hqs

Cryo-EM structure of 8-subunit Smc5/6 head region

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein 5

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q08204

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 (Q12749) DNA repair protein KRE29 × 1 (P40026) Non-structural maintenance of chromosome element 5 × 1 (Q03718) Non-structural maintenance of chromosomes element 1 × 1 (Q07913) Non-structural maintenance of chromosome element 3 × 1 (Q05541) Non-structural maintenance of chromosome element 4 × 1 (P43124) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMC5_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1093; UniProt 1–1093

Structural maintenance of chromosomes protein 6

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12749

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 (Q08204) DNA repair protein KRE29 × 1 (P40026) Non-structural maintenance of chromosome element 5 × 1 (Q03718) Non-structural maintenance of chromosomes element 1 × 1 (Q07913) Non-structural maintenance of chromosome element 3 × 1 (Q05541) Non-structural maintenance of chromosome element 4 × 1 (P43124) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMC6_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–1114; UniProt 1–1114

DNA repair protein KRE29

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P40026

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 (Q08204) Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 (Q12749) Non-structural maintenance of chromosome element 5 × 1 (Q03718) Non-structural maintenance of chromosomes element 1 × 1 (Q07913) Non-structural maintenance of chromosome element 3 × 1 (Q05541) Non-structural maintenance of chromosome element 4 × 1 (P43124) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KRE29_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–464; UniProt 1–464

Non-structural maintenance of chromosome element 5

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q03718

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 (Q08204) Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 (Q12749) DNA repair protein KRE29 × 1 (P40026) Non-structural maintenance of chromosomes element 1 × 1 (Q07913) Non-structural maintenance of chromosome element 3 × 1 (Q05541) Non-structural maintenance of chromosome element 4 × 1 (P43124) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NSE5_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–556; UniProt 1–556

Non-structural maintenance of chromosomes element 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q07913

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 (Q08204) Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 (Q12749) DNA repair protein KRE29 × 1 (P40026) Non-structural maintenance of chromosome element 5 × 1 (Q03718) Non-structural maintenance of chromosome element 3 × 1 (Q05541) Non-structural maintenance of chromosome element 4 × 1 (P43124) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NSE1_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–336; UniProt 1–336

Non-structural maintenance of chromosome element 3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q05541

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 (Q08204) Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 (Q12749) DNA repair protein KRE29 × 1 (P40026) Non-structural maintenance of chromosome element 5 × 1 (Q03718) Non-structural maintenance of chromosomes element 1 × 1 (Q07913) Non-structural maintenance of chromosome element 4 × 1 (P43124) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NSE3_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303

Non-structural maintenance of chromosome element 4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P43124

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 7 Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 (Q08204) Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 (Q12749) DNA repair protein KRE29 × 1 (P40026) Non-structural maintenance of chromosome element 5 × 1 (Q03718) Non-structural maintenance of chromosomes element 1 × 1 (Q07913) Non-structural maintenance of chromosome element 3 × 1 (Q05541) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NSE4_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–402; UniProt 1–402

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8hqs
沉积日期 deposition_date2022-12-14
结构标题 titleCryo-EM structure of 8-subunit Smc5/6 head region
关键词 keywordsCELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8hqs__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8hqs__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8hqs__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)48.21 Å
Rg(电子密度)47.71 Å
总 Rg47.92 Å
原子数19224
残基数2387
排除体积344400 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8hqs__assembly_1__model_1 heptameric (7) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

▶

7. 引用文献 (1)