SAXSdb — 8huj

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic initiation factor 4A-I

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 2 RNA 1 PDB 声明：trimeric（3）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 2–406	未记录	Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 × 1 （Q04637） IRES RNA (J-K-St) × 1 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8HUJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2G9N Structure of the DEAD domain of Human eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A 提交 2006-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–236（217 aa）片段：DEAD domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 200 mM Ammonium Nitrate, 500 mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.257
2G9N Structure of the DEAD domain of Human eukaryotic initiation factor 4A, eIF4A 提交 2006-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 20–236（217 aa）片段：DEAD domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 200 mM Ammonium Nitrate, 500 mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.257
2ZU6 crystal structure of the eIF4A-PDCD4 complex 提交 2008-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 20–406（387 aa）片段：UNP residues 20-406 链 C 20–406（387 aa）片段：UNP residues 20-406	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACY ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；14% MPD, 0.1M Sodium Citrate, pH6.0, 100mM Ammonium acetate, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.294
2ZU6 crystal structure of the eIF4A-PDCD4 complex 提交 2008-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 20–406（387 aa）片段：UNP residues 20-406 链 F 20–406（387 aa）片段：UNP residues 20-406	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACY ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；14% MPD, 0.1M Sodium Citrate, pH6.0, 100mM Ammonium acetate, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.294
3EIQ Crystal structure of Pdcd4-eIF4A 提交 2008-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–406（406 aa）链 D 1–406（406 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris Propane pH6.5, 0.2M sodium citrate, 0.1M taurine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 3.50 Å R-free 0.269
5ZBZ Crystal structure of the DEAD domain of Human eIF4A with sanguinarine 提交 2018-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–238（219 aa）片段：DEAD domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAU 13-methyl[1,3]benzodioxolo[5,6-c][1,3]dioxolo[4,5-i]phenanthridin-13-ium × 1 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Sodium malonate	分辨率 1.31 Å R-free 0.210
5ZC9 Crystal structure of the human eIF4A1-ATP analog-RocA-polypurine RNA complex 提交 2018-02-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 19–406（388 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 RCG (1R,2R,3S,3aR,8bS)-6,8-dimethoxy-3a-(4-methoxyphenyl)-N,N-dimethyl-1,8b-bis(oxidanyl)-3-phenyl-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[b][1]benzofuran-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；80mM HEPES (pH7.5), 1120mM tri-sodium citrate, 100mM ammonium sulfate, 20mM Bis-Tris (pH 6.0), 0.2% (w/v) polyethylene glycol 3350, 40mM lithium chloride	分辨率 2.00 Å R-free 0.231
6ZMW Structure of a human 48S translational initiation complex 提交 2020-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric	链 j 1–406（406 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7PPZ Crystal structure of the Burkholderia Lethal Factor 1 (BLF1) C94S inactive mutant in complex with human eIF4A - Crystal form A 提交 2021-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–406（387 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；0.1 M MES, 50 mM magnesium chloride, 10 % (w/v) 2-propanol, 5 % (w/v) PEG 4000	分辨率 2.52 Å R-free 0.276
7PQ0 Crystal structure of the Burkholderia Lethal Factor 1 (BLF1) C94S inactive mutant in complex with human eIF4A - Crystal form B 提交 2021-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–406（387 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；0.1 M HEPES, 4 % (w/v) PEG 6000	分辨率 3.00 Å R-free 0.230
8OZ0 Structure of a human 48S translation initiation complex with eIF4F and eIF4A 提交 2023-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric	链 1 1–406（406 aa）链 3 1–406（406 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8XXN Cryo-EM structure of the human 43S ribosome with PDCD4 提交 2024-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：50-meric	链 4A 1–406（406 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 23 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9AVR Human eIF4A-1 in complex with AMP-PNP, RNA, and the inhibitor silvestrol 提交 2024-03-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–406（406 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IOD IODIDE ION × 2 A1AG8 silvestrol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2 M sodium iodide, 20% PEG3350	分辨率 1.91 Å R-free 0.197
9BLN The structure of human Pdcd4 bound to the 40S-eIF4A-eIF3-eIF1 complex 提交 2024-04-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：50-meric	链 l 20–406（387 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 88 K POTASSIUM ION × 19 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9DTS Crystal structure of the human eIF4A1/AMPPNP/amidino-rocaglate/polypurine RNA complex 提交 2024-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 21–406（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 A1BB1 (3aR,4R,5S,5aR,10bR)-3a-hydroxy-N,8,10-trimethoxy-5a-(4-methoxyphenyl)-N,2-dimethyl-5-phenyl-3a,4,5,5a-tetrahydro-1H-[1]benzofuro[3',2':1,5]cyclopenta[1,2-d]imidazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；0.2 M ammonium acetate, 8% PEG20000, 10% Hampton Silver Bullet Reagent B5 (0.33% w/v 2,7-naphthalenedisulfonic acid disodium salt, 0.33% w/v azelaic acid, 0.33% w/v trans-cinnamic acid, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)	分辨率 1.69 Å R-free 0.240
9DTS Crystal structure of the human eIF4A1/AMPPNP/amidino-rocaglate/polypurine RNA complex 提交 2024-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 21–406（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 A1BB1 (3aR,4R,5S,5aR,10bR)-3a-hydroxy-N,8,10-trimethoxy-5a-(4-methoxyphenyl)-N,2-dimethyl-5-phenyl-3a,4,5,5a-tetrahydro-1H-[1]benzofuro[3',2':1,5]cyclopenta[1,2-d]imidazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；0.2 M ammonium acetate, 8% PEG20000, 10% Hampton Silver Bullet Reagent B5 (0.33% w/v 2,7-naphthalenedisulfonic acid disodium salt, 0.33% w/v azelaic acid, 0.33% w/v trans-cinnamic acid, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)	分辨率 1.69 Å R-free 0.240
9DTS Crystal structure of the human eIF4A1/AMPPNP/amidino-rocaglate/polypurine RNA complex 提交 2024-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 C 21–406（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 A1BB1 (3aR,4R,5S,5aR,10bR)-3a-hydroxy-N,8,10-trimethoxy-5a-(4-methoxyphenyl)-N,2-dimethyl-5-phenyl-3a,4,5,5a-tetrahydro-1H-[1]benzofuro[3',2':1,5]cyclopenta[1,2-d]imidazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；0.2 M ammonium acetate, 8% PEG20000, 10% Hampton Silver Bullet Reagent B5 (0.33% w/v 2,7-naphthalenedisulfonic acid disodium salt, 0.33% w/v azelaic acid, 0.33% w/v trans-cinnamic acid, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)	分辨率 1.69 Å R-free 0.240
9DTS Crystal structure of the human eIF4A1/AMPPNP/amidino-rocaglate/polypurine RNA complex 提交 2024-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 D 21–406（386 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 A1BB1 (3aR,4R,5S,5aR,10bR)-3a-hydroxy-N,8,10-trimethoxy-5a-(4-methoxyphenyl)-N,2-dimethyl-5-phenyl-3a,4,5,5a-tetrahydro-1H-[1]benzofuro[3',2':1,5]cyclopenta[1,2-d]imidazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；0.2 M ammonium acetate, 8% PEG20000, 10% Hampton Silver Bullet Reagent B5 (0.33% w/v 2,7-naphthalenedisulfonic acid disodium salt, 0.33% w/v azelaic acid, 0.33% w/v trans-cinnamic acid, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)	分辨率 1.69 Å R-free 0.240
9I9F Crystal structure of apoform human eIF4A1 C-terminal domain 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 239–406（168 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；18.5% (w/v) PEG 8000, 0.2M sodium acetate trihydrate, 0.1M MES, pH 6.0	分辨率 2.73 Å R-free 0.294
9I9F Crystal structure of apoform human eIF4A1 C-terminal domain 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 239–406（168 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；18.5% (w/v) PEG 8000, 0.2M sodium acetate trihydrate, 0.1M MES, pH 6.0	分辨率 2.73 Å R-free 0.294
9I9F Crystal structure of apoform human eIF4A1 C-terminal domain 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 239–406（168 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；18.5% (w/v) PEG 8000, 0.2M sodium acetate trihydrate, 0.1M MES, pH 6.0	分辨率 2.73 Å R-free 0.294
9I9G Crystal structure of human eIF4A1 C-terminal domain in complex with hippuristanol 提交 2025-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 239–406（168 aa）	未记录	A1I1L Hippuristanol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；20 % (w/v) PEG 6000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.190

共 15 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IF4A1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 24–428； UniProt 2–406

Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1

Homo sapiens

UniProt Q04637

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 2 RNA 1 PDB 声明：trimeric（3）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 746–992	未记录	Eukaryotic initiation factor 4A-I × 1 （P60842） IRES RNA (J-K-St) × 1 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8HUJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1LJ2 Recognition of eIF4G by Rotavirus NSP3 reveals a basis for mRNA circularization 提交 2002-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 172–199（28 aa）片段：residues 132-159 of AAC82471 链 D 172–199（28 aa）片段：residues 132-159 of AAC82471	未记录	AU GOLD ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；275 K；PEG-MME 550, glucose, theophylline, unbuffered, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 275K	分辨率 2.38 Å R-free 0.272
1UG3 C-terminal portion of human eIF4GI 提交 2003-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1194–1532（339 aa）片段：RESIDUES 1234-1572	突变：L1234S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG MME 5000, 0.1M MES, 0.2M AMMONIUM SULFATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.24 Å R-free 0.292
1UG3 C-terminal portion of human eIF4GI 提交 2003-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1194–1532（339 aa）片段：RESIDUES 1234-1572	突变：L1234S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；30% PEG MME 5000, 0.1M MES, 0.2M AMMONIUM SULFATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.24 Å R-free 0.292
2W97 Crystal Structure of eIF4E Bound to Glycerol and eIF4G1 peptide 提交 2009-01-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 413–426（14 aa）片段：EIF4GI BINDING MOTIF, RESIDUES 413-426 链 F 413–426（14 aa）片段：EIF4GI BINDING MOTIF, RESIDUES 413-426	未记录	MGO [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-3-METHYL-4-OXO-5H-IMIDAZO[4,5-C]PYRIDIN-1-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHOXY-HYDROXY-PHOSPHORYL] PHOSPHONO HYDROGEN PHOSPHATE × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；60% AMMONIUM SULPHATE, 100MM TRIS-HCL PH 8.0, 1% PEG400	分辨率 2.29 Å R-free 0.239
4F02 Crystal structure of the PABP-binding site of eIF4G in complex with RRM1-2 of PABP and poly(A) 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 C 178–203（26 aa）片段：unp residues 178-203	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.03 M Tris, 1.3 M (NH4)2SO4, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
4F02 Crystal structure of the PABP-binding site of eIF4G in complex with RRM1-2 of PABP and poly(A) 提交 2012-05-03	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 F 178–203（26 aa）片段：unp residues 178-203	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；0.03 M Tris, 1.3 M (NH4)2SO4, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5EHC Co-crystal structure of eIF4E with nucleotide mimetic inhibitor. 提交 2015-10-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 609–622（14 aa）片段：eIF4E binding sequence, UNP residues 634-647	未记录	5NX 3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2-azanyl-7-[(3-chlorophenyl)methyl]-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylamino]-4-oxidanyl-cyclobut-3-ene-1,2-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；21-31% PEG 8000, 1???3% (NH4)2SO4, 100 mM HEPES, pH 7.5, 1 round of seeding	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
5T46 Crystal structure of the human eIF4E-eIF4G complex 提交 2016-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 592–653（62 aa）	未记录	MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；293 K；0.1 M Hepes pH 7.25, 25% w/v PEG 6000	分辨率 1.53 Å R-free 0.162
5T46 Crystal structure of the human eIF4E-eIF4G complex 提交 2016-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 592–653（62 aa）	未记录	MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；293 K；0.1 M Hepes pH 7.25, 25% w/v PEG 6000	分辨率 1.53 Å R-free 0.162
5ZK5 Stapled-peptides tailored against initiation of translation 提交 2018-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 609–623（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；30%(w/v) PEG6000, 0.1M Na-Hepes pH 6.5	分辨率 2.25 Å R-free 0.268
6ZMW Structure of a human 48S translational initiation complex 提交 2020-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric	链 g 290–1599（1310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8J7R Cryo-EM structure of the J-K-St region of EMCV IRES in complex with eIF4G-HEAT1 and eIF4A (J-K-St/eIF4G focused) 提交 2023-04-28	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 746–992（247 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8OZ0 Structure of a human 48S translation initiation complex with eIF4F and eIF4A 提交 2023-05-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric	链 2 1–1404（1404 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 10 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IF4G1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 24–270； UniProt 746–992

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8huj
沉积日期 deposition_date	2022-12-24
结构标题 title	Cryo-EM structure of the J-K-St region of EMCV IRES in complex with eIF4G-HEAT1 and eIF4A
关键词 keywords	Translation initiation factors, Translation, RNA binding protein; TRANSLATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.65 Å
零角强度 I(0) i0	250815000.00
分子量 molecular_weight	103890.0 kDa
排除体积 excluded_volume	119970 Å³
包络体积 envelope_volume	177150 Å³
水化壳体积 shell_volume	42733 Å³
包络直径 envelope_diameter	135.3 Å
壳层 Rg shell_rg	40.53 Å
包络 Rg envelope_rg	36.11 Å
形状 Rg shape_rg	36.57 Å
总 Rg total_rg	37.08 Å
总原子数 total_atoms	7142
残基数 n_residues	720
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	127.6 Å
Rg (实空间) rg_real	38.09 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.18 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.5080e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.0650e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	38.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	250800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8842
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	42.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.376
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.357
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9688000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.906; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.801

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Eukaryotic initiation factor 4A-I
分子量 formula_weight	48659.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7143

MGSSHHHHHHHHSSGLEVLFQGPSASQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1
分子量 formula_weight	31786.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MNHKVHHHHHHIEGRHMELGTLEDRGEEDADGSKTQDLFRRVRSILNKLTPQMFQQLMKQVTQLAIDTEERLKGVIDLIFEKAISEPNFSVAYANMCRCLMALKVPTTEKPTVTVNFRKLLLNRCQKEFEKDKDDDEVFEKKQKEMDEAATAEERGRLKEELEEARDIARRRSLGNIKFIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLECLCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKIIKEKKTSSRIRFMLQDVLDLRGSNWVP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	IRES RNA (J-K-St)
分子量 formula_weight	34838.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	C

GGGGCUGAAGGAUGCCCAGAAGGUACCCCAUUGUAUGGGAUCUGAUCUGGGGCCUCGGUGCACAUGCUUUACAUGUGUUUAGUCGAGGUUAAAAAACGUCUAGGCCCC

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.76 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	255256

fit	/app/data/saxs_computation/hu/8huj/8huj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hu/8huj/8huj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hu/8huj/8huj.dat

Cryo-EM structure of the J-K-St region of EMCV IRES in complex with eIF4G-HEAT1 and eIF4A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic initiation factor 4A-I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)