8ovd

Respiratory supercomplex (III2-IV2) from Mycobacterium smegmatis

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

Mycolicibacterium smegmatis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R050_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 11–278； UniProt 1–268 作者链 O； PDB构建体 11–278； UniProt 1–268

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R051

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R051_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–408； UniProt 1–408 作者链 M； PDB构建体 1–408； UniProt 1–408

Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R052

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R052_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546 作者链 N； PDB构建体 1–546； UniProt 1–546

Probable cytochrome c oxidase subunit 3

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R049

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R049_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 S； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R056

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R056_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 T； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

cytochrome-c oxidase

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R057

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R057_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341 作者链 X； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

Cytochrome c oxidase subunit

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R1B6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R1B6_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 Z； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R1B5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） LpqE protein × 2 （A0R562） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Y4692_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157 作者链 a； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

LpqE protein

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0R562

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Superoxide dismutase [Cu-Zn] × 2 （A0QQQ1） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0R562_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–186； UniProt 1–186 作者链 b； PDB构建体 1–186； UniProt 1–186

Superoxide dismutase [Cu-Zn]

Mycolicibacterium smegmatis

UniProt A0QQQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R050） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （A0R051） Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （A0R052） Transmembrane protein × 2 Probable cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 cytochrome-c oxidase × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） LpqE protein × 2 （A0R562） HEME C × 4 MENAQUINONE-9 × 12 acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2) × 4 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ; × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CARDIOLIPIN × 15 TRIDECANE × 10 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 HEME-A × 4 COPPER (II) ION × 6 MAGNESIUM ION × 2 CALCIUM ION × 2 (2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate × 4 PALMITIC ACID × 4 water × 21	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0QQQ1_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–236； UniProt 1–236 作者链 c； PDB构建体 1–236； UniProt 1–236

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ovd
沉积日期 deposition_date	2023-04-25
结构标题 title	Respiratory supercomplex (III2-IV2) from Mycobacterium smegmatis
关键词 keywords	RESPIRATORY SUPERCOMPLEX, MEMBRANE PROTEIN, ACTINOBACTERIA, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ovd__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ovd__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ovd__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	64.60 Å
Rg（电子密度）	64.19 Å
总 Rg	63.95 Å
原子数	46632
残基数	5532
排除体积	853580 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ovd__assembly_1__model_1`	24-meric （24）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (30)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit
分子量 formula_weight	29109.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,C
原子数 atom_count	47246

MHHHHHHMGSMTSKSRRRLRRRLSAGLLLLIGLAVAGGVAATLTPQPQVAVADESQSALLRTGKQLFETSCVSCHGANLQGVPDRGPSLIGTGEAAVYFQVSTGRMPAMRGEAQAPSKPPHFDESQIDALGAYVQANGGGPTVPRDDHGAVAQESLIGGDVARGGDLFRLNCASCHNFTGKGGALSSGKYAPDLGDANPAQIYTAMLTGPQNMPKFSDRQLTPDEKRDIVAYVRESAETPSYGGYGLGGFGPAPEGMAMWIIGMVAAIGVAMWIGSRA

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit
分子量 formula_weight	44869.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,G

MDRIASMSQDSPDIKGTDAPGQTGVPGQPTDAELAEMSREELVKLGGKIDGVETIFKEPRWPVPGTKAEKRTERLVAYWLMLGGLSGLALLLVFLFWPWEYQPFGSEGEFLYSLATPLYGLTFGLSILSIGIGAVLFQKKFIPEEISVQDRHDGRSPEVHRKTVAANLTDALEGSTLKRRKVIGLSLGIGLGAFGAGTLVAFIGGLIKNPWKPVVPTAEGKKAVLWTSGWTPRFKGETIYLARATGRPGESPFVKMRPEDIDAGGMETVFPWRESDGDGTTVESEHKLTEIAMGVRNPVMLIRIKPADMHRVIKRKGQESFNFGELFAYTKVCSHLGCPSSLYEQQTYRILCPCHQSQFDALEFAKPIFGPAARALAQLPITIDEDGYLVANGDFVEPVGPAFWERKS

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit
分子量 formula_weight	61514.3 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,H

MSPDFAKLAAAQGDAIDSRYHPSAAVRRQLNKVFPTHWSFLLGEIALYSFIILLLTGVWLTLFFDPSMAHVTYDGVYQPLRGVQMSRAYETALDISFEVRGGLFVRQVHHWAALMFAASIMVHLARIFFTGAFRRPREANWVIGSLLLILAMFEGFFGYSLPDDLLSGTGIRAALSGITMGIPVIGTWMHWALFGGDFPGEILIPRLYALHILLIPGIILALIGAHLALVWFQKHTQFPGPGRTETNVVGVRVMPVFAVKSGAFFAMITGVLGLMGGLLTINPIWNLGPYKPSQVSAGSQPDFYMMWTDGLIRLWPAWEFYPFGHTIPQGVWVAVGMGLVFALLIAYPFIEKKVTGDDAHHNLLQRPRDVPVRTAIGSMAIALYLLLTFACMNDIIALKFHISLNATTWIGRIGMVVLPAIVYFVAYRWAISLQRSDREVLEHGVETGIIKRLPHGAYVELHQPLGPVDEHGHPIPLEYAGAPLPKRMNKLGSGGAPGTGSFLFPDPAVEHEALTEAAHASEHKSLTALKEHQDRIHGNGETNGHHKLDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Transmembrane protein
分子量 formula_weight	11329.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,I

MSSTQDRSQLDPEEQPVANTEVERHTGVDVEDVPSAEWGWSHMPIGVMHIGGLLSAAFLLVMMRGNHVGHVEDWFLIGFAAVIVALVGRNWWLRRRGWIR

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Probable cytochrome c oxidase subunit 3
分子量 formula_weight	22196.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,J

MTSAVGTSGTAITSRVHSLNRPNMVSVGTIVWLSSELMFFAGLFAMYFTARAQAGGAWPPEPTELNLALAVPVTLVLIASSFTCQMGVFAAERGDVFGLRRWYVITFLMGLFFVLGQGYEYIHLVEHGTTIPGSAYGSVFYLATGFHGLHVIGGLVAFVLLLARTKMSKFTPAQATAAIVVSYYWHFVDIVWIALFATIYFVR

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide 4
分子量 formula_weight	15177.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,K

MHIEARLFEILTAFFALAAVVYAVLTAMFATGGVEWAGTTALVLTTGLTLITGTFFRFVARRLDTRPEDYEDAEISDGAGELGFFAPHSWWPILISLSFSTAAVGAALWLPWLIAAGVAFVITSVCGLVFEYYWGPEKH

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	64163.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,L

MVAEAPPIGELEARRPFPERMGPKGNLIYKLITTTDHKLIGIMYCVVCFAFFLVGGLMALFMRTELAMPGLQFLSNEQFNQLFTMHGTVMLLFYATPIVFGFANLVLPLQIGAPDVAFPRLNALSFWLFLFGALIAIAGFITPGGAADFGWTAYSPLTDAIHSPGAGGDLWIMGLAVGGLGTILGGVNMITTVVCMRAPGMTMFRMPIFTWNILVTSILVLIAFPILTAALFGLAADRHLGAHIYDPANGGVLLWQHLFWFFGHPEVYIIALPFFGIVSEIFPVFSRKPIFGYTTLIYATLAIAALSVAVWAHHMYATGAVLLPFFSFMTFLIAVPTGIKFFNWIGTMWKGQLTFETPMLFSVGFLITFLLGGLSGVLLASPPLDFHVTDSYFVIAHFHYVLFGTIVFATYAGIYFWFPKMTGRLLDERLGKLHFWLTFIGFHTTFLVQHWLGDEGMPRRYADYLPTDGFTTLNVISTVGAFILGVSMLPFVWNVFKSWRYGEPVTVDDPWGYGNSLEWATSCPPPRHNFTELPRIRSERPAFELHYPHMVERMRAEAHVGRAHHPELETADKSS

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	cytochrome-c oxidase
分子量 formula_weight	38077.5 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,X

MTPRGFRVVALSIVLGGSALLLSGCSWSDALALGWPTGITPEAKLNRELWIGSVIASFAVGAIVWGLIFWTSAFHRKKATDTELPRQFGYNMPLELTLTVIPFLIISVLFYFTVVVQERMMHKDPNPEVVIDVTAFQWNWKFGYQKIAFADGSFDYDGADPERKEAMTSRPEGKDEHGIEKVGPIRGMTPEDRTYLNFDKIETLGTSSEIPVLVLPAGKRIEFVLNSADVIHGFWVPEFLFKRDVLPEPKANNSDNVFQVSEIQQTGAFVGRCTEMCGTFHAMMNFEVRVVEPNDFKAYIDQRNAGKTNAEALAAINQPPLAITTEPFESRRGELVPQASK

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit
分子量 formula_weight	8365.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,Z

MSTALTHGLIGGVPLVLFAVLALIFLTRKGPHPDTYKMSDPWTHAPILWAAEEPREHGHGGHGHDSHGVVIGGGASGKW

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575
分子量 formula_weight	15911.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,a

MASGDIATVANAELDLPYGSALTSSGRISAVTEPGELSVHYPFPTMDLVVLDDALKYGSRAAKARFAVYIGPLGADTAATAREILANVPTPENAVLLAVSPDQRAIEVVYGADVKGRGIESAAPLGVSAAAASFKEGNLIDGLISAVRVMSAGVSPA

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	LpqE protein
分子量 formula_weight	19119.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W,b

MNRFSSRAGLAVCGLATAVALTACSAGQISQTTTQEPAVNGVNAQAGQVSLRNVHLRAPQQTDYVEPGTTVELLFVAANDSTEGSNKLKSITSDVGEVTLTGDSTVPADGVLIVGEPDGQIQAVENAEAADAVTAEVELTKPITNGLLYDFTFTFEDGETTVAVPISAGEQPRRPVPPAGPGSSEH

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Superoxide dismutase [Cu-Zn]
分子量 formula_weight	23232.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.15.1.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,c

MLKPVSVAVLFATPVLALSACSPPGETASSEPGTTPAIWTGSPSPAAPSGEDHGGGHGAGAAGAGETLTAELKTADGTSVATADFQFADGFATVTIETTTPGRLTPGFHGVHIHSVGKCEANSVAPTGGAPGDFNSAGGHFQVSGHSGHPASGDLSSLQVRADGSGKLVTTTDAFTAEDLLDGAKTAIIIHEKADNFANIPPERYQQVNGAPGPDQTTMATGDAGSRVACGVISAG

来源 Source

来源生物 organism	Mycolicibacterium smegmatis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1772
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	MENAQUINONE-9
分子量 formula_weight	785.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	acyl-phosphatidyl-myo-inositol dimannoside (AcPIM2)
分子量 formula_weight	1415.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	;[(2~{R})-3-[[(1~{S},2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-2-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-3,4,5-tris(oxidanyl)-6-(undecanoyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-cyclohexyl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-undecanoyloxy-propyl] (10~{R})-10-methyldodecanoate ;
分子量 formula_weight	1677.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ;
分子量 formula_weight	853.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	(1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate
分子量 formula_weight	564.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	TRIDECANE
分子量 formula_weight	184.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	HEME-A
分子量 formula_weight	852.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	(2S)-1-(hexadecanoyloxy)propan-2-yl (10S)-10-methyloctadecanoate
分子量 formula_weight	595.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	PALMITIC ACID
分子量 formula_weight	256.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

实体 30 Entity 30 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	614

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	208243

Respiratory supercomplex (III2-IV2) from Mycobacterium smegmatis

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable cytochrome c oxidase subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

cytochrome-c oxidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

LpqE protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Superoxide dismutase [Cu-Zn]

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体