8qmo

Cryo-EM structure of the benzo[a]pyrene-bound Hsp90-XAP2-AHR complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 146.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock protein HSP 90-beta

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–724 链 B； UniProt 2–724	未记录	AH receptor-interacting protein × 1 （O00170） Aryl hydrocarbon receptor × 1 （P35869） MOO MOLYBDATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 W62 benzo[a]pyrene × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8QMO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1QZ2 Crystal Structure of FKBP52 C-terminal Domain complex with the C-terminal peptide MEEVD of Hsp90 提交 2003-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 719–723（5 aa）链 H 719–723（5 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；Sodium Citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
1UYM Human Hsp90-beta with PU3 (9-Butyl-8(3,4,5-trimethoxy-benzyl)-9H-purin-6-ylamine) 提交 2004-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–220（220 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-220	未记录	PU3 9-BUTYL-8-(3,4,5-TRIMETHOXYBENZYL)-9H-PURIN-6-AMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；25% PEG MME 2000, 0.1M NA CACODYLATE, PH6.5, 0.2M MGCL2., pH 6.50	分辨率 2.45 Å R-free 0.294
3FWV Crystal Structure of a Redesigned TPR Protein, T-MOD(VMY), in Complex with MEEVF Peptide 提交 2009-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 719–723（5 aa）片段：C-terminal residues	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG MME 2000, 5-10 mM NiCl2, 10% xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.244
3FWV Crystal Structure of a Redesigned TPR Protein, T-MOD(VMY), in Complex with MEEVF Peptide 提交 2009-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 719–723（5 aa）片段：C-terminal residues	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG MME 2000, 5-10 mM NiCl2, 10% xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.244
3NMQ Hsp90b N-terminal domain in complex with EC44, a pyrrolo-pyrimidine methoxypyridine inhibitor 提交 2010-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–223（223 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-223)	未记录	7PP 5-{2-amino-4-chloro-7-[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}-2-methylpent-4-yn-2 -ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；277 K；0.1M Na Cacodylate, 20% PEG 2000 MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.267
3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 284–543（260 aa）片段：middle domain (UNP residues 284-543)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.28 Å R-free 0.217
3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 284–543（260 aa）片段：middle domain (UNP residues 284-543)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.28 Å R-free 0.217
3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 284–543（260 aa）片段：middle domain (UNP residues 284-543)	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.28 Å R-free 0.217
5FWK Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）片段：FULL LENGTH 链 B 1–724（724 aa）片段：FULL LENGTH	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 3.90 Å
5FWL Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
5FWM Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.00 Å
5FWP Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl, 10 mM KCl, 10 mM MgCl2, 20 mM Na2MoO4, 2mM DTT, 0.085mM DDM cryo-EM玻璃化条件 Single blot from 4 to 6 seconds, at 20C；95 K；冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 7.20 Å
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)	未记录	83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.207
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.65 Å R-free 0.226
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）片段：UNP residues 1-218	未记录	KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 1.69 Å R-free 0.197
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–231（231 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol	分辨率 3.09 Å R-free 0.286
6N8Y Hsp90-beta bound to PU-11-trans 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–221（221 aa）	未记录	KFY 9-[(2E)-but-2-en-1-yl]-8-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)methyl]-9H-purin-6-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES pH 6.5, MgCl2, PEG 2000 MME. Incubate with PU-11-trans prior to setup.	分辨率 1.55 Å R-free 0.183
7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–218（218 aa）	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–218（218 aa）	未记录	42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000	分辨率 1.82 Å R-free 0.219
7Z37 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-II) 提交 2022-03-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 AP1 3–724（722 aa）链 BP1 3–724（722 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging	分辨率 3.67 Å
7Z38 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-I) 提交 2022-03-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–724（722 aa）链 B 3–724（722 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging	分辨率 3.16 Å
7ZR0 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E) complex. 提交 2022-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZR5 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(closed) complex 提交 2022-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ZR6 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(open) complex 提交 2022-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7ZUB Cryo-EM structure of the indirubin-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2022-05-12	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MOO MOLYBDATE ION × 2 JY6 (3~{Z})-3-(3-oxidanylidene-1~{H}-indol-2-ylidene)-1~{H}-indol-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8EOA Cryo-EM structure of human HSP90B-AIPL1 complex 提交 2022-10-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM HEPES, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EOB Cryo-EM structure of human HSP90B in the closed state 提交 2022-10-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–724（723 aa）链 B 2–724（723 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25 mM HEPES, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8GAE Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-02-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3UL OF SAMPLE 10C 100% HUMIDITY 30S WAIT TIME 3S BLOT TIME -2 BLOT FORCE	分辨率 3.30 Å
8GFT Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3uL OF SAMPLE, 10C, 100% HUMIDITY, 30S WAIT TIME, 3S BLOT TIME, -2 BLOT FORCE	分辨率 3.80 Å
9D9H Human Hsp90b nucleotide binding domain in complex with BRI2311 提交 2024-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–223（223 aa）片段：nucleotide binding domain	未记录	A1A26 (1P)-3-amino-6-[({1-[(2S)-2-(2,4-difluorophenyl)-2-hydroxy-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propyl]piperidin-4-yl}amino)methyl]-1-(4-phenyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)thieno[2,3-b]pyrazin-2(1H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；21% PEG8000, 0.1M Hepes pH 7.5,1M LiCl	分辨率 1.96 Å R-free 0.208
9D9I Human Hsp90b nucleotide binding domain in complex with BRI2312 提交 2024-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–223（223 aa）片段：nucleotide binding domain	未记录	A1A24 (1P)-3-amino-6-[({1-[(2R)-2-(2,4-difluorophenyl)-2-hydroxy-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propyl]piperidin-4-yl}amino)methyl]-1-(4-phenyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)thieno[2,3-b]pyrazin-2(1H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；21% PEG6000, 0.1M NaCacodylate pH 6.6, 1M Li	分辨率 1.50 Å R-free 0.187
9W5I AGO maturation complex (AMC): AGO2-miRNA duplex in complex with Hsp90 beta and co-chaperone p23 提交 2025-08-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–724（724 aa）链 B 1–724（724 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.63 Å

共 29 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HS90B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 8–730； UniProt 2–724 作者链 B； PDB构建体 8–730； UniProt 2–724

AH receptor-interacting protein

Homo sapiens

UniProt O00170

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–330	未记录	Heat shock protein HSP 90-beta × 2 （P08238） Aryl hydrocarbon receptor × 1 （P35869） MOO MOLYBDATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 W62 benzo[a]pyrene × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QMO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2LKN Solution structure of the PPIase domain of human aryl-hydrocarbon receptor-interacting protein (AIP) 提交 2011-10-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–166（165 aa）片段：PPIase FKBP-type domain containing residues 1-166	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient NMR样品组成 2 mM AIP, 10 mM sodium phosphate, 5 mM DTT, 0.05 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 2 mM [U-15N] AIP, 10 mM sodium phosphate, 5 mM DTT, 0.05 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 2 mM [U-13C; U-15N] AIP, 10 mM sodium phosphate, 5 mM DTT, 0.05 mM sodium azide, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
4AIF AIP TPR domain in complex with human Hsp90 peptide 提交 2012-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 172–315（144 aa）片段：TETRATRICOPEPTIDE DOMAIN, RESIDUES 172-315	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 1% PEG 3350	分辨率 2.01 Å R-free 0.236
4AIF AIP TPR domain in complex with human Hsp90 peptide 提交 2012-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 172–315（144 aa）片段：TETRATRICOPEPTIDE DOMAIN, RESIDUES 172-315	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 1% PEG 3350	分辨率 2.01 Å R-free 0.236
4APO AIP TPR domain in complex with human Tomm20 peptide 提交 2012-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 166–330（165 aa）片段：TETRATRICOPEPTIDE REPEAT DOMAIN, RESIDUES 172-313	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PEG 3350, AMMONIUM SULFATE, BIS-TRIS PH 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.234
4APO AIP TPR domain in complex with human Tomm20 peptide 提交 2012-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 166–330（165 aa）片段：TETRATRICOPEPTIDE REPEAT DOMAIN, RESIDUES 172-313	突变：YES	12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PEG 3350, AMMONIUM SULFATE, BIS-TRIS PH 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.234
7ZUB Cryo-EM structure of the indirubin-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2022-05-12	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–330（330 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MOO MOLYBDATE ION × 2 JY6 (3~{Z})-3-(3-oxidanylidene-1~{H}-indol-2-ylidene)-1~{H}-indol-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AIP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–330； UniProt 1–330

Aryl hydrocarbon receptor

Homo sapiens

UniProt P35869

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 2–437	未记录	Heat shock protein HSP 90-beta × 2 （P08238） AH receptor-interacting protein × 1 （O00170） MOO MOLYBDATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 W62 benzo[a]pyrene × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QMO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5NJ8 Structural basis for aryl hydrocarbon receptor mediated gene activation 提交 2017-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–273（251 aa）	未记录	ER3 ERBIUM (III) ION × 7 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10 mM HEPES/NaOH pH 6.8, 18% PEG3350, 200 mM ammonium formate	分辨率 3.30 Å R-free 0.333
5NJ8 Structural basis for aryl hydrocarbon receptor mediated gene activation 提交 2017-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 23–273（251 aa）	未记录	ER3 ERBIUM (III) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10 mM HEPES/NaOH pH 6.8, 18% PEG3350, 200 mM ammonium formate	分辨率 3.30 Å R-free 0.333
7ZUB Cryo-EM structure of the indirubin-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2022-05-12	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–437（437 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MOO MOLYBDATE ION × 2 JY6 (3~{Z})-3-(3-oxidanylidene-1~{H}-indol-2-ylidene)-1~{H}-indol-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å

共 2 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AHR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 4–439； UniProt 2–437

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8qmo
沉积日期 deposition_date	2023-09-24
结构标题 title	Cryo-EM structure of the benzo[a]pyrene-bound Hsp90-XAP2-AHR complex
关键词 keywords	detoxification, chemical pollutants, exposome, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.97 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.51 Å
零角强度 I(0) i0	584782000.00
分子量 molecular_weight	199350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	249980 Å³
包络体积 envelope_volume	352660 Å³
水化壳体积 shell_volume	68460 Å³
包络直径 envelope_diameter	155.8 Å
壳层 Rg shell_rg	47.60 Å
包络 Rg envelope_rg	42.81 Å
形状 Rg shape_rg	43.52 Å
总 Rg total_rg	43.69 Å
总原子数 total_atoms	26868
残基数 n_residues	1721
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	146.1 Å
Rg (实空间) rg_real	43.98 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.33 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.8480e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1030e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.97 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	584800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8809
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	48.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.333
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.428
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	49180000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.820

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Heat shock protein HSP 90-beta
分子量 formula_weight	84213.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	26960

MHHHHHHPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISNASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIAKSGTKAFMEALQAGADISMIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQYAWESSAGGSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKEREKEISDDEAEEEKGEKEEEDKDDEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDQEELNKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFDLFENKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDSTNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCKLMKEILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGIDEDEVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	AH receptor-interacting protein
分子量 formula_weight	37691.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MADIIARLREDGIQKRVIQEGRGELPDFQDGTKATFHYRTLHSDDEGTVLDDSRARGKPMELIIGKKFKLPVWETIVCTMREGEIAQFLCDIKHVVLYPLVAKSLRNIAVGKDPLEGQRHCCGVAQMREHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLKVESPGTYQQDPWAMTDEEKAKAVPLIHQEGNRLYREGHVKEAAAKYYDAIACLKNLQMKEQPGSPEWIQLDQQITPLLLNYCQCKLVVEEYYEVLDHCSSILNKYDDNVKAYFKRGKAHAAVWNAQEAQADFAKVLELDPALAPVVSRELQALEARIRQKDEEDKARFRGIFSH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Aryl hydrocarbon receptor
分子量 formula_weight	49492.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GAPNSSSANITYASRKRRKPVQKTVKPIPAEGIKSNPSKRHRDRLNTELDRLASLLPFPQDVINKLDKLSVLRLSVSYLRAKSFFDVALKSSPTERNGGQDNCRAANFREGLNLQEGEFLLQALNGFVLVVTTDALVFYASSTIQDYLGFQQSDVIHQSVYELIHTEDRAEFQRQLHWALNPSQCTESGQGIEEATGLPQTVVCYNPDQIPPENSPLMERCFICRLRCLLDNSSGFLAMNFQGKLKYLHGQKKKGKDGSILPPQLALFAIATPLQPPSILEIRTKNFIFRTKHKLDFTPIGCDAKGRIVLGYTEAELCTRGSGYQFIHAADMLYCAESHIRMIKTGESGMIVFRLLTKNNRWTWVQSNARLLYKNGRPDYIIVTQRPLTDEEGTEHLRKRNTKLPFMFTTGEAVLYEATNPFPAIMDPLPLRTKNGTSG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MOLYBDATE ION
分子量 formula_weight	159.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	benzo[a]pyrene
分子量 formula_weight	252.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.76 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	630113

fit	/app/data/saxs_computation/qm/8qmo/8qmo.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qm/8qmo/8qmo.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qm/8qmo/8qmo.dat

Cryo-EM structure of the benzo[a]pyrene-bound Hsp90-XAP2-AHR complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock protein HSP 90-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

AH receptor-interacting protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Aryl hydrocarbon receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)